{ "genes": [ "0610005C13Rik", "1500015O10Rik", "1600029D21Rik", "1700025G04Rik", "2200002D01Rik", "2610203C20Rik", "2700033N17Rik", "2810417H13Rik", "4931406C07Rik", "6330403K07Rik", "8430408G22Rik", "9130206I24Rik", "9230105E05Rik", "Aadac", "Aadat", "Abcg2", "Acaa1b", "Acadm", "Ace", "Ace2", "Ackr3", "Acsm1", "Acsm2", "Acta2", "Actb", "Acy1", "Adamts5", "Adcy4", "Adh1", "Afap1l1", "Agxt2", "AI314831", "AI838599", "Ak4", "Akap12", "Akr1b3", "Akt3", "Alcam", "Aldh1a2", "Aldh1a3", "Aldh1l1", "Aldob", "Alx1", "Amn", "Angptl2", "Anks4b", "Anln", "Ano1", "Anxa1", "Anxa3", "Aplnr", "Apoc1", "Apoe", "Apom", "Aqp1", "Aqp2", "Aqp3", "Aqp4", "Arhgap11a", "Arhgap28", "Arhgef25", "Arl4a", "Aspa", "Aspm", "Ass1", "Atad2", "Atp1a1", "Atp1b1", "Atp6v0d2", "Atp6v1a", "Atp6v1b1", "Atp6v1c2", "Atp6v1g3", "Basp1", "BC021785", "BC028528", "Bgn", "Birc5", "Btc", "Btnl9", "C1ra", "C1s", "C330027C09Rik", "C430049B03Rik", "Cacna2d2", "Calb1", "Calcrl", "Cald1", "Calm2", "Calml4", "Car12", "Car2", "Casc5", "Cav1", "Cbfa2t3", "Cblb", "Ccdc80", "Ccna2", "Ccnb1", "Ccnb2", "Ccnd1", "Ccnd2", "Cd248", "Cd34", "Cd38", "Cd55", "Cd59a", "Cd59b", "Cd93", "Cd97", "Cda", "Cdc14a", "Cdc20", "Cdc42ep3", "Cdh11", "Cdh4", "Cdh5", "Cdk1", "Cdkn1a", "Cdkn1c", "Celf4", "Cenpa", "Cenpe", "Cenpf", "Cenph", "Cenpj", "Cep55", "Cers6", "Cfh", "Cfi", "Chchd10", "Chst1", "Cideb", "Cited1", "Ckap2", "Ckap2l", "Clca1", "Clcn5", "Cldn10", "Cldn11", "Cldn14", "Cldn16", "Cldn2", "Cldn5", "Clec14a", "Clec1a", "Clic5", "Clu", "Cml1", "Cmtm3", "Cndp2", "Cnn2", "Cnrip1", "Col12a1", "Col14a1", "Col15a1", "Col1a1", "Col1a2", "Col3a1", "Col4a3", "Col5a1", "Col5a2", "Col6a1", "Colec12", "Coro2b", "Cox4i1", "Cox6c", "Cox7b", "Cpb2", "Cpe", "Cped1", "Cpm", "Crip1", "Cryab", "Cryl1", "Crym", "Csad", "Csrp1", "Ctgf", "Cthrc1", "Ctla2a", "Cttnbp2", "Cubn", "Cxcl12", "Cxcl14", "Cxcr4", "Cxx1a", "Cxx1b", "Cxx1c", "Cygb", "Cyp2d26", "Cyp2j5", "Cyp4a10", "Cyr61", "Dab2", "Dak", "Dao", "Dbi", "Dclk1", "Dcn", "Ddn", "Defb1", "Defb19", "Defb25", "Defb29", "Dkk1", "Dkk2", "Dkk3", "Dlc1", "Dll1", "Dnm3os", "Dok4", "Dpp4", "Dpysl3", "Dusp1", "Dusp3", "Eaf2", "Ebf1", "Ecm1", "Ecscr", "Edn1", "Ednrb", "Efnb1", "Efnb2", "Egfl6", "Egfl7", "Egln3", "Egr1", "Ehd2", "Ehd3", "Ehd4", "Ehf", "Elavl4", "Elk3", "Eltd1", "Emcn", "Emilin1", "Emp3", "Emx1", "Emx2", "Eng", "Enpep", "Epas1", "Epb4.1l2", "Epha4", "Epha7", "Erg", "Esam", "Esco2", "Ets1", "F2r", "Fabp3", "Fabp4", "Fabp5", "Fads3", "Fam101b", "Fam105a", "Fam111a", "Fam132a", "Fam167b", "Fam212a", "Fam46a", "Fam64a", "Fam65a", "Fblim1", "Fbln1", "Fbln2", "Fbln5", "Fbn1", "Fbp1", "Fbp2", "Fbxo5", "Fgd5", "Fgf9", "Fhl2", "Fibin", "Filip1l", "Fli1", "Flna", "Flrt2", "Flrt3", "Flt1", "Fmo1", "Fmo2", "Fn1", "Folr1", "Foxc2", "Foxi1", "Foxq1", "Frem1", "Frmd6", "Fstl1", "Fut9", "Fxyd1", "Fxyd2", "Fxyd4", "Fxyd5", "Fxyd6", "G0s2", "Gadd45a", "Gas1", "Gas2", "Gata3", "Gatm", "Gchfr", "Gcnt1", "Gdnf", "Gfod2", "Gfra1", "Ggt1", "Gimap1", "Gimap4", "Gimap5", "Gimap6", "Gimap9", "Gja3", "Gja4", "Glipr2", "Glyat", "Gm10184", "Gm10259", "Gm10639", "Gm10664", "Gm10681", "Gm12326", "Gm16010", "Gm20748", "Gm266", "Gm26771", "Gm26924", "Gm4450", "Gm5424", "Gm7092", "Gm7325", "Gnb4", "Gng11", "Gng2", "Gngt2", "Golim4", "Golm1", "Gpc1", "Gpihbp1", "Gpm6a", "Gpr116", "Gpx3", "Gpx6", "Grap", "Gria3", "Grrp1", "Gsn", "Gss", "Gsta2", "Gsta3", "Guca2a", "Guca2b", "Gucy1a3", "Gucy1b3", "Gyk", "H19", "H2afz", "H2-D1", "Hao2", "Hba-a1", "Hba-a2", "Hbb-bs", "Hbb-bt", "Hbegf", "Hdc", "Heg1", "Hexb", "Heyl", "Hhex", "Hic1", "Hist1h1b", "Hist1h1e", "Hist1h2ab", "Hist1h2ac", "Hist1h2ad", "Hist1h2ae", "Hist1h2af", "Hist1h2ah", "Hist1h2ai", "Hist1h2ak", "Hist1h2an", "Hist1h2ao", "Hist1h2ap", "Hist1h2bc", "Hist3h2ba", "Hmcn1", "Hmgb2", "Hmgcs2", "Hmmr", "Hmx2", "Hnf4a", "Hopx", "Hoxa11", "Hoxc10", "Hoxc8", "Hpgd", "Hrsp12", "Hs3st3b1", "Hs3st6", "Hsd11b2", "Hsd3b4", "Hsd3b6", "Hspa12a", "Hspb1", "Hykk", "Icam2", "Id1", "Id3", "Idh1", "Ier3", "Ifi203", "Ifitm1", "Ifitm3", "Igf1", "Igf2", "Igfbp2", "Igfbp3", "Igfbp5", "Igfbp7", "Il33", "Ildr2", "Incenp", "Ipo11", "Iqcg", "Iqgap2", "Irx1", "Irx2", "Irx3", "Itga4", "Itga8", "Itga9", "Itm2b", "Junb", "Kank3", "Kap", "Kcnj15", "Kctd12b", "Kdr", "Keg1", "Kif11", "Kif20b", "Kif23", "Kif2c", "Kif4", "Kit", "Kitl", "Kl", "Klf2", "Klf4", "Klf6", "Klhl13", "Klk1", "Kng1", "Kng2", "Knstrn", "Krt18", "Krt19", "Krt23", "Lactb2", "Lama4", "Lbh", "Lcn2", "Ldb2", "Ldhb", "Lef1", "Leprel2", "Lfng", "Lgals1", "Lgals3", "Lgals9", "Lhfp", "Lhx1", "Lix1", "Lmo2", "Lox", "Loxl1", "Loxl2", "Lpar4", "Lpl", "Lrp1", "Lrp2", "Lrpap1", "Lrrc17", "Lrrfip1", "Lrriq1", "Lsp1", "Ltbp4", "Ly6a", "Ly6c1", "Maf", "Mafb", "Maged2", "Malat1", "Map1b", "Mapt", "Marcks", "Mcam", "Mcoln3", "Med24", "Mef2c", "Meg3", "Meis1", "Meis2", "Mep1a", "Mep1b", "Mest", "Metrnl", "Mettl7b", "Mfap2", "Mfap4", "Mfge8", "Mgp", "Mical1", "Miox", "Mki67", "Mmp2", "Mmp23", "Mmrn2", "Mndal", "Mns1", "Mpv17l", "Msn", "Msrb3", "Mt1", "Mt2", "mt-Atp6", "mt-Co1", "mt-Co3", "mt-Cytb", "mt-Nd1", "mt-Nd2", "mt-Nd4", "mt-Nd5", "mt-Rnr1", "mt-Rnr2", "Mxd3", "Mycn", "Myct1", "Myh11", "Myl9", "Mylk", "Myo1b", "Napsa", "Ncapg", "Ndc80", "Ndnf", "Ndrg1", "Nebl", "Nes", "Nexn", "Nfia", "Nid1", "Nid2", "Nipal1", "Nkd1", "Nme4", "Nnat", "Nostrin", "Nox4", "Npb", "Nphs1", "Nphs2", "Npl", "Npnt", "Npr1", "Npr3", "Npy", "Nr2f1", "Nrp1", "Nrp2", "Ntm", "Nts", "Nudt13", "Nudt4", "Nuf2", "Nupr1", "Nusap1", "Ogn", "Olfml3", "Optn", "Oraov1", "Osr2", "Palld", "Palm3", "Pappa", "Pappa2", "Pard3b", "Pbk", "Pcdh17", "Pcdh18", "Pck1", "Pcolce", "Pcp4", "Pcsk5", "Pcx", "Pdgfra", "Pdgfrb", "Pdlim1", "Pdlim2", "Pdzk1", "Pdzrn3", "Pecam1", "Penk", "Pfn2", "Pgam2", "Phactr1", "Phlda1", "Piezo2", "Pitpnm2", "Pla2g4a", "Pla2g7", "Plac8", "Plac9b", "Plat", "Plau", "Plcb1", "Plekhh2", "Plk2", "Plod2", "Plvap", "Pmp22", "Podxl", "Postn", "Ppap2a", "Ppap2b", "Ppfibp2", "Ppp1r16b", "Ppp1r1a", "Prc1", "Prex2", "Prkcdbp", "Prlr", "Procr", "Pros1", "Prr15", "Prss23", "Psen2", "Pter", "Ptger1", "Ptgis", "Pth1r", "Ptma", "Ptn", "Ptp4a3", "Ptprb", "Ptpro", "Ptrf", "Pttg1", "Pvalb", "R3hdml", "Rab3b", "Ramp2", "Ramp3", "Ranbp3l", "Rarres2", "Rasgrp2", "Rasgrp3", "Rasip1", "Rasl11a", "Rasl11b", "Rassf10", "Rbp1", "Rcan2", "Ren1", "Rgcc", "Rgs2", "Rgs3", "Rgs5", "Rhbg", "Rhcg", "Rhoj", "Rhpn1", "Rnase4", "Rnf150", "Rnf152", "Rnf186", "Robo2", "Robo4", "Rora", "RP23-103I12.13", "RP23-45G16.5", "Rpl32", "Rprm", "Rps26", "Rps26-ps1", "Rsad2", "Rspo1", "Rspo3", "S100a10", "S100a14", "S100a16", "S100a6", "S100g", "S1pr1", "S1pr3", "Sat1", "Scg5", "Schip1", "Scnn1b", "Scnn1g", "Sct", "Sdk2", "Sdpr", "Sec14l1", "Sema3a", "Sema3c", "Sema3d", "Sema3g", "Sema6d", "Sepp1", "Serpina6", "Serpinb6b", "Serpinb9", "Serpine2", "Serpinf2", "Serping1", "Sfrp1", "Sfrp2", "Sgip1", "Sgk1", "Sgol2", "Sh3kbp1", "Shisa3", "Slc12a1", "Slc12a2", "Slc12a3", "Slc16a12", "Slc17a1", "Slc22a1", "Slc22a12", "Slc22a19", "Slc22a2", "Slc22a6", "Slc23a1", "Slc25a5", "Slc26a4", "Slc27a2", "Slc2a2", "Slc34a1", "Slc34a2", "Slc3a1", "Slc43a3", "Slc47a1", "Slc4a4", "Slc5a1", "Slc5a8", "Slc6a18", "Slc6a6", "Slc9a3r2", "Slco1a6", "Slfn5", "Slfn9", "Smc4", "Smim1", "Smoc2", "Snai2", "Sncaip", "Sod3", "Sostdc1", "Sox17", "Sox9", "Sparc", "Sparcl1", "Spink3", "Spink8", "Spock2", "Spp1", "Spp2", "Spry4", "Srgap1", "Srgn", "Stc1", "Stmn2", "Sult1d1", "Susd3", "Syn3", "Synpo", "Tacc3", "Tacstd2", "Tagln", "Tbc1d31", "Tbx3", "Tcf21", "Tchh", "Tek", "Tenm4", "Tgfb1i1", "Tgfb2", "Tgfbi", "Thbd", "Thbs1", "Thsd4", "Thsd7a", "Tie1", "Timp3", "Tinag", "Tinagl1", "Tm4sf1", "Tmem100", "Tmem150a", "Tmem150c", "Tmem174", "Tmem204", "Tmem213", "Tmem27", "Tmem37", "Tmem47", "Tmem52b", "Tmem54", "Tmem8", "Tmem88", "Tmigd1", "Tmod3", "Tmsb10", "Tmsb4x", "Tnc", "Tnnt1", "Top2a", "Tpm1", "Tpm2", "Tpx2", "Tril", "Trim7", "Trp53i11", "Tshz2", "Tspan2", "Tspan5", "Ttc36", "Tubb5", "Tubb6", "Uaca", "Ube2c", "Uchl1", "Umod", "Uncx", "Ushbp1", "Vamp5", "Vcam1", "Vcan", "Vegfa", "Vim", "Vps51", "Wfdc15b", "Wfdc2", "Wipf1", "Wisp1", "Wnk1", "Wnt11", "Wnt4", "Wt1", "Zcchc24", "Zcwpw1", "Zdbf2", "Zeb1", "Zeb2", "Zfp820" ], "denoising": true, "decoder_feed_batch": "nonlinear", "latent_module": { "cat_dim": 20, "multiclass_adversarial": false, "cat_merge": false, "min_silhouette": 0.0, "patience": 10, "latent_dim": 10, "h_dim": 128, "depth": 1, "dropout": 0.0, "lambda_reg": 0.001, "fine_tune": false, "deviation_reg": 0.0, "class": "Cell_BLAST.latent.CatGau", "name": "CatGau" }, "prob_module": { "h_dim": 128, "depth": 1, "dropout": 0.0, "lambda_reg": 0.0, "fine_tune": false, "deviation_reg": 0.0, "class": "Cell_BLAST.prob.NB", "name": "NB" }, "rmbatch_modules": [] }