生物信息学 Bioinformatics

教材目录

第一章:生物信息学概念及发展历史

第一节 生物信息学的基本概念

第二节 生物信息学的发展历史与趋势

第三节 生物信息学的研究领域

第四节 生物信息学的算法基础

第五节 生物信息学的机遇与挑战

思考与练习

参考文献

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第二章:生物统计学基础

第一节 生物统计简介

第二节 参数估计和假设检验

第三节 统计模型

第四节 高维统计方法

第五节 统计学习基础

第六节 统计因果推断

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第三章:深度学习与人工智能

第一节 人工智能

第二节 机器学习

第三节 深度学习

第四节 深度学习在生物信息学中的应用

第五节 未来展望

参考文献

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第四章:生物信息资源

第一节 生物数据库简介

第二节 国际主要数据中心

第三节 代表性生物数据库

第四节 生物数据库发展趋势

参考文献

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第五章:序列比对与分析

第1节 序列特征解析

第2节 序列比对和分析

第3节 分子进化和发育树构建

参考文献

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第六章:基因组学及宏基因组学

第一节 基因组学概述

第二节 基因组的组装、预测和注释

第三节 序列变异检测原理与技术

第四节 宏基因组学

参考文献

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第七章:转录组学

第一节 转录组数据的基础分析

第二节 转录组学数据功能分析

第三节 非编码RNA

第四节 单细胞转录组学

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第八章:转录调控与表观遗传

第一节 转录调控与表观遗传概述

第二节 转录调控分析

第三节 DNA 甲基化组学数据分析

第四节 组蛋白修饰组学数据分析

第五节 染色质结构组学数据分析

第六节 表观转录组学数据分析

第七节 总结及展望

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第九章:蛋白质与代谢组学

第一节 蛋白质组学概述

第二节 蛋白质结构分析

第三节 蛋白质分子动力学模拟

第四节 蛋白质功能预测与分析

第五节 代谢组学

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第十章:表型组学

第一节 表型组学概述

第二节 表型组的测量技术

第三节 表型组的数据分析

第四节 细胞与类器官表型组学

第五节 人类表型组

第六节 动植物表型组

第七节 未来展望

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第十一章:系统生物学

第一节 系统生物学的概述

第二节 生物网络类型及数据资源

第三节 网络生物学及网络特征

第四节 生物网络的构建

第五节 生物系统建模

第六节 总结

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第十二章:生物信息学的应用

第一节 精准医学

第二节 智能药学

第三节 智能育种

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第十三章:生物信息学编程

第一节 概述

第二节 生物信息学数据分析流程搭建

第三节 数据库开发基础

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