RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os01g13460 View Network
Names	Os01g0235700 protein (cDNA clone:J013000P13, full insert sequence) (cDNA clone:J023047M20, full insert sequence)
Function	helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed
Attributes	Length: 618 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 66982.3 pI: 6.6213 Subcellular Location (predicted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os01g13460.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os10g34710 LOC_Os02g04050 LOC_Os05g46230 LOC_Os03g22190 LOC_Os12g06670 LOC_Os02g42200 LOC_Os03g63920 LOC_Os03g22880 LOC_Os02g04270 LOC_Os08g43540 LOC_Os06g31210 LOC_Os09g10960 LOC_Os06g06090 LOC_Os09g36830 LOC_Os07g12320 LOC_Os07g45360 LOC_Os02g21970 LOC_Os07g42180 LOC_Os10g32550 LOC_Os01g67740 LOC_Os03g26970 LOC_Os06g40600 LOC_Os10g10990 LOC_Os08g15040 LOC_Os11g16540 LOC_Os10g02630 LOC_Os03g42750 LOC_Os03g61920 LOC_Os06g16280 LOC_Os10g31864 LOC_Os10g35280 LOC_Os03g19960 LOC_Os06g38470 LOC_Os02g30800 LOC_Os06g02620 LOC_Os02g52370 LOC_Os03g18420 LOC_Os09g37230 LOC_Os01g63710 LOC_Os02g36974 LOC_Os09g30412 LOC_Os06g22070 LOC_Os06g36700 LOC_Os02g08360 LOC_Os04g48060 LOC_Os08g05840 LOC_Os02g51430 LOC_Os01g69210 LOC_Os03g57340 LOC_Os03g22690 LOC_Os06g07878 LOC_Os05g03430 LOC_Os12g07720 LOC_Os06g17840 LOC_Os03g42220 LOC_Os05g16660 LOC_Os01g73310 LOC_Os07g49150 LOC_Os04g47120 LOC_Os02g14059 LOC_Os02g04490 LOC_Os02g01740 LOC_Os07g38970 LOC_Os05g23600 LOC_Os05g05860 LOC_Os04g27850 LOC_Os09g36440 LOC_Os05g06260 LOC_Os02g14130 LOC_Os01g49690 LOC_Os11g36390 LOC_Os05g46780 LOC_Os07g36470 LOC_Os07g48960 LOC_Os05g05470 LOC_Os01g72790 LOC_Os11g08080 LOC_Os12g36170 LOC_Os03g53960 LOC_Os06g07978 LOC_Os08g22864 LOC_Os02g57590 LOC_Os08g09350 LOC_Os10g28040 LOC_Os06g29080 LOC_Os03g12450 LOC_Os03g50980 LOC_Os05g39850 LOC_Os08g43640 LOC_Os02g54254 LOC_Os02g10640 LOC_Os04g58630 LOC_Os07g44360 LOC_Os03g51600 LOC_Os01g49680 LOC_Os08g41730 LOC_Os07g05960 LOC_Os08g04280 LOC_Os04g17050 LOC_Os04g53220 LOC_Os01g42010 LOC_Os06g07630 LOC_Os07g08170 LOC_Os09g26180 LOC_Os02g06500 LOC_Os12g38110 LOC_Os02g11830 LOC_Os02g14929 LOC_Os09g09360 LOC_Os04g42330 LOC_Os04g56480 LOC_Os03g42050 LOC_Os07g49260 LOC_Os03g50885 LOC_Os07g08820 LOC_Os12g39070 LOC_Os02g02780 LOC_Os06g06030 LOC_Os07g41580 LOC_Os10g26050 LOC_Os10g21910 LOC_Os10g10434 LOC_Os05g49770 LOC_Os05g19270 LOC_Os06g48640 LOC_Os07g10150 LOC_Os06g44030 LOC_Os04g31000 LOC_Os02g36710 LOC_Os09g24220 LOC_Os03g59020 LOC_Os02g43470 LOC_Os01g32870 LOC_Os11g14220 LOC_Os01g72880 LOC_Os06g08770 LOC_Os07g12110 LOC_Os03g18160 LOC_Os05g06690 LOC_Os06g43570 LOC_Os05g38150 LOC_Os05g05780 LOC_Os01g68324 LOC_Os07g27180 LOC_Os07g08729 LOC_Os04g43140 LOC_Os07g37640 LOC_Os05g23610 LOC_Os09g25550 LOC_Os11g26910 LOC_Os12g30020 LOC_Os02g10790 LOC_Os02g54340 LOC_Os09g32800 LOC_Os05g07050 LOC_Os12g09120 LOC_Os08g42600 LOC_Os12g13320 LOC_Os03g57870 LOC_Os11g24450 LOC_Os10g34670 LOC_Os12g37400 LOC_Os08g44830 LOC_Os07g27140 LOC_Os04g46310 LOC_Os03g51550 LOC_Os02g50370 LOC_Os01g16900 LOC_Os06g19730 LOC_Os09g02810 LOC_Os12g08800 LOC_Os03g50540 LOC_Os11g40140 LOC_Os02g22780 LOC_Os01g59600 LOC_Os07g22950 LOC_Os03g44150 LOC_Os04g46620 LOC_Os06g46770 LOC_Os02g56300 LOC_Os10g35550 LOC_Os05g43610 LOC_Os05g06450 LOC_Os01g22490 LOC_Os09g33986 LOC_Os12g33958 LOC_Os03g17700 LOC_Os01g07280 LOC_Os01g06600 LOC_Os01g13430 LOC_Os01g09580 LOC_Os01g08850

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os10g34710  LOC_Os02g04050  LOC_Os05g46230  LOC_Os03g22190  LOC_Os12g06670  LOC_Os02g42200
LOC_Os03g63920  LOC_Os03g22880  LOC_Os02g04270  LOC_Os08g43540  LOC_Os06g31210  LOC_Os09g10960
LOC_Os06g06090  LOC_Os09g36830  LOC_Os07g12320  LOC_Os07g45360  LOC_Os02g21970  LOC_Os07g42180
LOC_Os10g32550  LOC_Os01g67740  LOC_Os03g26970  LOC_Os06g40600  LOC_Os10g10990  LOC_Os08g15040
LOC_Os11g16540  LOC_Os10g02630  LOC_Os03g42750  LOC_Os03g61920  LOC_Os06g16280  LOC_Os10g31864
LOC_Os10g35280  LOC_Os03g19960  LOC_Os06g38470  LOC_Os02g30800  LOC_Os06g02620  LOC_Os02g52370
LOC_Os03g18420  LOC_Os09g37230  LOC_Os01g63710  LOC_Os02g36974  LOC_Os09g30412  LOC_Os06g22070
LOC_Os06g36700  LOC_Os02g08360  LOC_Os04g48060  LOC_Os08g05840  LOC_Os02g51430  LOC_Os01g69210
LOC_Os03g57340  LOC_Os03g22690  LOC_Os06g07878  LOC_Os05g03430  LOC_Os12g07720  LOC_Os06g17840
LOC_Os03g42220  LOC_Os05g16660  LOC_Os01g73310  LOC_Os07g49150  LOC_Os04g47120  LOC_Os02g14059
LOC_Os02g04490  LOC_Os02g01740  LOC_Os07g38970  LOC_Os05g23600  LOC_Os05g05860  LOC_Os04g27850
LOC_Os09g36440  LOC_Os05g06260  LOC_Os02g14130  LOC_Os01g49690  LOC_Os11g36390  LOC_Os05g46780
LOC_Os07g36470  LOC_Os07g48960  LOC_Os05g05470  LOC_Os01g72790  LOC_Os11g08080  LOC_Os12g36170
LOC_Os03g53960  LOC_Os06g07978  LOC_Os08g22864  LOC_Os02g57590  LOC_Os08g09350  LOC_Os10g28040
LOC_Os06g29080  LOC_Os03g12450  LOC_Os03g50980  LOC_Os05g39850  LOC_Os08g43640  LOC_Os02g54254
LOC_Os02g10640  LOC_Os04g58630  LOC_Os07g44360  LOC_Os03g51600  LOC_Os01g49680  LOC_Os08g41730
LOC_Os07g05960  LOC_Os08g04280  LOC_Os04g17050  LOC_Os04g53220  LOC_Os01g42010  LOC_Os06g07630
LOC_Os07g08170  LOC_Os09g26180  LOC_Os02g06500  LOC_Os12g38110  LOC_Os02g11830  LOC_Os02g14929
LOC_Os09g09360  LOC_Os04g42330  LOC_Os04g56480  LOC_Os03g42050  LOC_Os07g49260  LOC_Os03g50885
LOC_Os07g08820  LOC_Os12g39070  LOC_Os02g02780  LOC_Os06g06030  LOC_Os07g41580  LOC_Os10g26050
LOC_Os10g21910  LOC_Os10g10434  LOC_Os05g49770  LOC_Os05g19270  LOC_Os06g48640  LOC_Os07g10150
LOC_Os06g44030  LOC_Os04g31000  LOC_Os02g36710  LOC_Os09g24220  LOC_Os03g59020  LOC_Os02g43470
LOC_Os01g32870  LOC_Os11g14220  LOC_Os01g72880  LOC_Os06g08770  LOC_Os07g12110  LOC_Os03g18160
LOC_Os05g06690  LOC_Os06g43570  LOC_Os05g38150  LOC_Os05g05780  LOC_Os01g68324  LOC_Os07g27180
LOC_Os07g08729  LOC_Os04g43140  LOC_Os07g37640  LOC_Os05g23610  LOC_Os09g25550  LOC_Os11g26910
LOC_Os12g30020  LOC_Os02g10790  LOC_Os02g54340  LOC_Os09g32800  LOC_Os05g07050  LOC_Os12g09120
LOC_Os08g42600  LOC_Os12g13320  LOC_Os03g57870  LOC_Os11g24450  LOC_Os10g34670  LOC_Os12g37400
LOC_Os08g44830  LOC_Os07g27140  LOC_Os04g46310  LOC_Os03g51550  LOC_Os02g50370  LOC_Os01g16900
LOC_Os06g19730  LOC_Os09g02810  LOC_Os12g08800  LOC_Os03g50540  LOC_Os11g40140  LOC_Os02g22780
LOC_Os01g59600  LOC_Os07g22950  LOC_Os03g44150  LOC_Os04g46620  LOC_Os06g46770  LOC_Os02g56300
LOC_Os10g35550  LOC_Os05g43610  LOC_Os05g06450  LOC_Os01g22490  LOC_Os09g33986  LOC_Os12g33958
LOC_Os03g17700  LOC_Os01g07280   LOC_Os01g06600   LOC_Os01g13430   LOC_Os01g09580   LOC_Os01g08850

Database Links
UniprotKB	Q0JP90
Ensembl	LOC_Os01g13460.1
Refseq	NP_001042524.1
EMBL	AP008207 AK064943 AK121013
KEGG	osa:4327781 dosa:Os01t0235700-01