RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os10g35550 View Network
Names	Putative pre-mRNA splicing factor (U5 snRNP-associated 102 kDa protein, putative, expressed)
Function	pre-mRNA-processing factor 6, putative, expressed
Attributes	Length: 1040 Status: Complete Existence: Predicted Molecular Weight: 115066 pI: 7.7298 Subcellular Location (predicted): Cytosol
Gene Model	LOC_Os10g35550.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os11g01380 LOC_Os10g42430 LOC_Os12g06670 LOC_Os11g19220 LOC_Os12g42140 LOC_Os11g09280 LOC_Os11g29400 LOC_Os11g01420 LOC_Os10g35550 LOC_Os12g06490 LOC_Os11g43620 LOC_Os11g26850 LOC_Os11g38810 LOC_Os12g42876 LOC_Os11g01510 LOC_Os10g39120 LOC_Os12g03190 LOC_Os05g48450 LOC_Os10g07994 LOC_Os05g43576 LOC_Os09g20820 LOC_Os03g17700 LOC_Os02g35060 LOC_Os03g29740 LOC_Os03g04410 LOC_Os02g03440 LOC_Os04g46890 LOC_Os01g63270 LOC_Os03g55280 LOC_Os04g36810 LOC_Os09g27420 LOC_Os02g38920 LOC_Os03g38980 LOC_Os02g48620 LOC_Os09g37230 LOC_Os01g16900 LOC_Os02g32490 LOC_Os02g01740 LOC_Os06g14510 LOC_Os05g32310 LOC_Os08g08080 LOC_Os08g42560 LOC_Os04g31950 LOC_Os05g49800 LOC_Os02g58090 LOC_Os03g23909 LOC_Os05g44210 LOC_Os10g32550 LOC_Os02g41590 LOC_Os09g38030 LOC_Os09g07500 LOC_Os02g37430 LOC_Os04g04320 LOC_Os06g46770 LOC_Os01g27990 LOC_Os03g61640 LOC_Os06g37180 LOC_Os09g07830 LOC_Os06g44370 LOC_Os02g30624 LOC_Os01g64690 LOC_Os01g50760 LOC_Os03g20560 LOC_Os07g40580 LOC_Os10g35550 LOC_Os02g13990 LOC_Os01g62870 LOC_Os02g04660 LOC_Os06g37440 LOC_Os06g43760 LOC_Os01g10290 LOC_Os05g42424 LOC_Os05g24970 LOC_Os09g21760 LOC_Os06g07860 LOC_Os03g05730 LOC_Os02g14780 LOC_Os08g09940 LOC_Os02g02780 LOC_Os05g07050 LOC_Os01g46070 LOC_Os03g45320 LOC_Os10g11140 LOC_Os07g04850 LOC_Os02g46130 LOC_Os09g24250 LOC_Os03g53650 LOC_Os04g56160 LOC_Os01g72890 LOC_Os06g48750 LOC_Os07g22700 LOC_Os08g09200 LOC_Os01g16520 LOC_Os02g05330 LOC_Os10g34520 LOC_Os07g42600 LOC_Os01g16540 LOC_Os07g13280 LOC_Os07g10256 LOC_Os08g10570 LOC_Os02g42860 LOC_Os03g61710 LOC_Os08g08040 LOC_Os02g01250 LOC_Os09g02700 LOC_Os10g32880 LOC_Os03g50850 LOC_Os07g07220 LOC_Os06g06090 LOC_Os03g13760 LOC_Os10g10244 LOC_Os01g53890 LOC_Os08g05850 LOC_Os02g10070 LOC_Os09g30412 LOC_Os02g05310 LOC_Os04g38870 LOC_Os03g23950 LOC_Os03g48850 LOC_Os09g20590 LOC_Os02g06640 LOC_Os09g34040 LOC_Os03g15700 LOC_Os01g09460 LOC_Os06g07960 LOC_Os03g56460 LOC_Os05g01440 LOC_Os02g30730 LOC_Os06g15990 LOC_Os05g46580 LOC_Os05g05230 LOC_Os01g33080 LOC_Os06g22140 LOC_Os02g48740 LOC_Os02g52940 LOC_Os01g15310 LOC_Os04g02820 LOC_Os08g44770 LOC_Os04g11880 LOC_Os06g02144 LOC_Os05g44340 LOC_Os01g12730 LOC_Os01g13460 LOC_Os02g04480

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os11g01380  LOC_Os10g42430  LOC_Os12g06670  LOC_Os11g19220  LOC_Os12g42140  LOC_Os11g09280
LOC_Os11g29400  LOC_Os11g01420  LOC_Os10g35550  LOC_Os12g06490  LOC_Os11g43620  LOC_Os11g26850
LOC_Os11g38810  LOC_Os12g42876  LOC_Os11g01510  LOC_Os10g39120  LOC_Os12g03190  LOC_Os05g48450
LOC_Os10g07994   LOC_Os05g43576   LOC_Os09g20820   LOC_Os03g17700   LOC_Os02g35060   LOC_Os03g29740
LOC_Os03g04410   LOC_Os02g03440   LOC_Os04g46890   LOC_Os01g63270   LOC_Os03g55280   LOC_Os04g36810
LOC_Os09g27420   LOC_Os02g38920   LOC_Os03g38980   LOC_Os02g48620   LOC_Os09g37230   LOC_Os01g16900
LOC_Os02g32490   LOC_Os02g01740   LOC_Os06g14510   LOC_Os05g32310   LOC_Os08g08080   LOC_Os08g42560
LOC_Os04g31950   LOC_Os05g49800   LOC_Os02g58090   LOC_Os03g23909   LOC_Os05g44210   LOC_Os10g32550
LOC_Os02g41590   LOC_Os09g38030   LOC_Os09g07500   LOC_Os02g37430   LOC_Os04g04320   LOC_Os06g46770
LOC_Os01g27990   LOC_Os03g61640   LOC_Os06g37180   LOC_Os09g07830   LOC_Os06g44370   LOC_Os02g30624
LOC_Os01g64690   LOC_Os01g50760   LOC_Os03g20560   LOC_Os07g40580   LOC_Os10g35550   LOC_Os02g13990
LOC_Os01g62870   LOC_Os02g04660   LOC_Os06g37440   LOC_Os06g43760   LOC_Os01g10290   LOC_Os05g42424
LOC_Os05g24970   LOC_Os09g21760   LOC_Os06g07860   LOC_Os03g05730   LOC_Os02g14780   LOC_Os08g09940
LOC_Os02g02780   LOC_Os05g07050   LOC_Os01g46070   LOC_Os03g45320   LOC_Os10g11140   LOC_Os07g04850
LOC_Os02g46130   LOC_Os09g24250   LOC_Os03g53650   LOC_Os04g56160   LOC_Os01g72890   LOC_Os06g48750
LOC_Os07g22700   LOC_Os08g09200   LOC_Os01g16520   LOC_Os02g05330   LOC_Os10g34520   LOC_Os07g42600
LOC_Os01g16540   LOC_Os07g13280   LOC_Os07g10256   LOC_Os08g10570   LOC_Os02g42860   LOC_Os03g61710
LOC_Os08g08040   LOC_Os02g01250   LOC_Os09g02700   LOC_Os10g32880   LOC_Os03g50850   LOC_Os07g07220
LOC_Os06g06090   LOC_Os03g13760   LOC_Os10g10244   LOC_Os01g53890   LOC_Os08g05850   LOC_Os02g10070
LOC_Os09g30412   LOC_Os02g05310   LOC_Os04g38870   LOC_Os03g23950   LOC_Os03g48850   LOC_Os09g20590
LOC_Os02g06640   LOC_Os09g34040   LOC_Os03g15700   LOC_Os01g09460   LOC_Os06g07960   LOC_Os03g56460
LOC_Os05g01440   LOC_Os02g30730   LOC_Os06g15990   LOC_Os05g46580   LOC_Os05g05230   LOC_Os01g33080
LOC_Os06g22140   LOC_Os02g48740   LOC_Os02g52940   LOC_Os01g15310   LOC_Os04g02820   LOC_Os08g44770
LOC_Os04g11880   LOC_Os06g02144   LOC_Os05g44340   LOC_Os01g12730   LOC_Os01g13460   LOC_Os02g04480

Database Links
UniprotKB	Q8W3F7
Ensembl	LOC_Os10g35550.1
EMBL	AC068923 DP000086
KEGG	osa:4349020 dosa:Os10t0498600-01