RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os01g15310 View Network
Names	Probable U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4
Function	Binds specifically to the 3'-terminal U-tract of U6 snRNA (By similarity).
Attributes	Length: 148 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 15727.8 pI: 10.6382 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os01g15310.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os07g07220 LOC_Os10g32880 LOC_Os08g05850 LOC_Os03g20560 LOC_Os02g04480 LOC_Os02g05310 LOC_Os02g52940 LOC_Os05g27940 LOC_Os05g24970 LOC_Os07g10256 LOC_Os03g08050 LOC_Os08g02130 LOC_Os01g62840 LOC_Os11g07280 LOC_Os04g33060 LOC_Os03g16130 LOC_Os03g21950 LOC_Os07g33330 LOC_Os10g07994 LOC_Os10g07270 LOC_Os02g14860 LOC_Os05g48320 LOC_Os05g30940 LOC_Os02g38200 LOC_Os01g49290 LOC_Os02g55300 LOC_Os04g46890 LOC_Os06g14620 LOC_Os03g18580 LOC_Os09g39420 LOC_Os02g01250 LOC_Os02g42860 LOC_Os07g41180 LOC_Os10g39820 LOC_Os01g15310 LOC_Os12g03190 LOC_Os03g12300 LOC_Os01g61814 LOC_Os08g05840 LOC_Os01g16540 LOC_Os01g73310 LOC_Os03g23909 LOC_Os03g02980 LOC_Os10g41520 LOC_Os05g32310 LOC_Os03g08020 LOC_Os05g47630 LOC_Os04g04320 LOC_Os03g42900 LOC_Os03g61640 LOC_Os04g02820 LOC_Os06g02510 LOC_Os07g04850 LOC_Os09g02700 LOC_Os03g60400 LOC_Os03g15700 LOC_Os08g09320 LOC_Os02g14059 LOC_Os09g33500 LOC_Os03g50350 LOC_Os10g34520 LOC_Os04g31950 LOC_Os05g07050 LOC_Os05g01020 LOC_Os08g05530 LOC_Os11g20384 LOC_Os01g73880 LOC_Os12g31000 LOC_Os04g36810 LOC_Os05g51650 LOC_Os03g29740 LOC_Os09g07500 LOC_Os03g05730 LOC_Os01g18670 LOC_Os03g46490 LOC_Os02g39350 LOC_Os08g23710 LOC_Os03g09140 LOC_Os07g10250 LOC_Os03g18310 LOC_Os02g30624 LOC_Os06g47350 LOC_Os10g40780 LOC_Os03g08440 LOC_Os01g70060 LOC_Os04g53760 LOC_Os08g08080 LOC_Os11g32240 LOC_Os07g31370 LOC_Os07g31340 LOC_Os04g52340 LOC_Os01g39260 LOC_Os09g32976 LOC_Os02g52390 LOC_Os04g42010 LOC_Os09g36920 LOC_Os09g21760 LOC_Os03g18080 LOC_Os07g36940 LOC_Os04g45930 LOC_Os10g15390 LOC_Os02g37430 LOC_Os11g40510 LOC_Os03g08010 LOC_Os01g71960 LOC_Os03g64190 LOC_Os03g27210 LOC_Os08g08040 LOC_Os03g18570 LOC_Os05g13630 LOC_Os07g37790 LOC_Os12g30540 LOC_Os02g56210 LOC_Os06g45710 LOC_Os10g27174 LOC_Os11g01154 LOC_Os07g46660 LOC_Os09g33980 LOC_Os03g50850 LOC_Os02g39550 LOC_Os02g14780 LOC_Os10g35550 LOC_Os02g13130 LOC_Os03g22610 LOC_Os03g37970 LOC_Os07g08330 LOC_Os12g01160 LOC_Os04g39700 LOC_Os02g51780 LOC_Os01g64690 LOC_Os03g13760 LOC_Os02g01740 LOC_Os02g30730 LOC_Os05g44210 LOC_Os07g42450 LOC_Os02g39700 LOC_Os01g01960 LOC_Os01g15310 LOC_Os01g06020 LOC_Os01g02090 LOC_Os01g04260

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os07g07220  LOC_Os10g32880  LOC_Os08g05850  LOC_Os03g20560  LOC_Os02g04480  LOC_Os02g05310
LOC_Os02g52940  LOC_Os05g27940  LOC_Os05g24970  LOC_Os07g10256  LOC_Os03g08050  LOC_Os08g02130
LOC_Os01g62840  LOC_Os11g07280  LOC_Os04g33060  LOC_Os03g16130  LOC_Os03g21950  LOC_Os07g33330
LOC_Os10g07994  LOC_Os10g07270  LOC_Os02g14860  LOC_Os05g48320  LOC_Os05g30940  LOC_Os02g38200
LOC_Os01g49290  LOC_Os02g55300  LOC_Os04g46890  LOC_Os06g14620  LOC_Os03g18580  LOC_Os09g39420
LOC_Os02g01250  LOC_Os02g42860  LOC_Os07g41180  LOC_Os10g39820  LOC_Os01g15310  LOC_Os12g03190
LOC_Os03g12300  LOC_Os01g61814  LOC_Os08g05840  LOC_Os01g16540  LOC_Os01g73310  LOC_Os03g23909
LOC_Os03g02980  LOC_Os10g41520  LOC_Os05g32310  LOC_Os03g08020  LOC_Os05g47630  LOC_Os04g04320
LOC_Os03g42900  LOC_Os03g61640  LOC_Os04g02820  LOC_Os06g02510  LOC_Os07g04850  LOC_Os09g02700
LOC_Os03g60400  LOC_Os03g15700  LOC_Os08g09320  LOC_Os02g14059  LOC_Os09g33500  LOC_Os03g50350
LOC_Os10g34520  LOC_Os04g31950  LOC_Os05g07050  LOC_Os05g01020  LOC_Os08g05530  LOC_Os11g20384
LOC_Os01g73880  LOC_Os12g31000  LOC_Os04g36810  LOC_Os05g51650  LOC_Os03g29740  LOC_Os09g07500
LOC_Os03g05730  LOC_Os01g18670  LOC_Os03g46490  LOC_Os02g39350  LOC_Os08g23710  LOC_Os03g09140
LOC_Os07g10250  LOC_Os03g18310  LOC_Os02g30624  LOC_Os06g47350  LOC_Os10g40780  LOC_Os03g08440
LOC_Os01g70060  LOC_Os04g53760  LOC_Os08g08080  LOC_Os11g32240  LOC_Os07g31370  LOC_Os07g31340
LOC_Os04g52340  LOC_Os01g39260  LOC_Os09g32976  LOC_Os02g52390  LOC_Os04g42010  LOC_Os09g36920
LOC_Os09g21760  LOC_Os03g18080  LOC_Os07g36940  LOC_Os04g45930  LOC_Os10g15390  LOC_Os02g37430
LOC_Os11g40510  LOC_Os03g08010  LOC_Os01g71960  LOC_Os03g64190  LOC_Os03g27210  LOC_Os08g08040
LOC_Os03g18570  LOC_Os05g13630  LOC_Os07g37790  LOC_Os12g30540  LOC_Os02g56210  LOC_Os06g45710
LOC_Os10g27174  LOC_Os11g01154  LOC_Os07g46660  LOC_Os09g33980  LOC_Os03g50850  LOC_Os02g39550
LOC_Os02g14780  LOC_Os10g35550  LOC_Os02g13130  LOC_Os03g22610  LOC_Os03g37970  LOC_Os07g08330
LOC_Os12g01160  LOC_Os04g39700  LOC_Os02g51780  LOC_Os01g64690  LOC_Os03g13760  LOC_Os02g01740
LOC_Os02g30730  LOC_Os05g44210  LOC_Os07g42450  LOC_Os02g39700  LOC_Os01g01960   LOC_Os01g15310
LOC_Os01g06020   LOC_Os01g02090   LOC_Os01g04260

Database Links
UniprotKB	Q9LGE6
Ensembl	LOC_Os01g15310.1
Refseq	NP_001042629.1
EMBL	AP002525
KEGG	osa:4326227 dosa:Os01t0256900-01