RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os03g42900 View Network
Names	KH domain containing protein, expressed (Putative RNA binding protein) (cDNA clone:J013114H09, full insert sequence)
Function	KH domain containing protein, putative, expressed
Attributes	Length: 511 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 54819.9 pI: 4.5491 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os03g42900.1 LOC_Os03g42900.2

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os07g43360 LOC_Os12g34062 LOC_Os11g36150 LOC_Os03g45170 LOC_Os08g09690 LOC_Os07g10720 LOC_Os08g25460 LOC_Os07g08330 LOC_Os05g05240 LOC_Os09g25314 LOC_Os04g59560 LOC_Os05g38530 LOC_Os03g43890 LOC_Os04g49420 LOC_Os08g01070 LOC_Os06g07210 LOC_Os05g14550 LOC_Os07g10256 LOC_Os07g09450 LOC_Os10g34520 LOC_Os11g34350 LOC_Os09g16380 LOC_Os12g06870 LOC_Os08g36420 LOC_Os06g29180 LOC_Os06g02550 LOC_Os04g37690 LOC_Os05g38740 LOC_Os12g37840 LOC_Os04g42380 LOC_Os04g48410 LOC_Os08g08830 LOC_Os04g38870 LOC_Os07g10250 LOC_Os07g43120 LOC_Os04g56640 LOC_Os11g43620 LOC_Os12g30540 LOC_Os12g38000 LOC_Os09g30150 LOC_Os08g43190 LOC_Os07g07010 LOC_Os12g04240 LOC_Os11g08940 LOC_Os05g22260 LOC_Os03g55270 LOC_Os07g01150 LOC_Os08g01920 LOC_Os08g01750 LOC_Os08g15450 LOC_Os04g42270 LOC_Os12g38380 LOC_Os03g61210 LOC_Os03g50390 LOC_Os04g04320 LOC_Os12g32640 LOC_Os05g49830 LOC_Os05g05860 LOC_Os04g11880 LOC_Os06g29080 LOC_Os06g37080 LOC_Os05g48450 LOC_Os05g15160 LOC_Os11g28980 LOC_Os09g16330 LOC_Os04g36720 LOC_Os05g03430 LOC_Os04g43650 LOC_Os03g63300 LOC_Os03g55280 LOC_Os12g41930 LOC_Os04g42490 LOC_Os04g37580 LOC_Os07g30980 LOC_Os03g53760 LOC_Os04g20220 LOC_Os09g31130 LOC_Os10g38278 LOC_Os03g61100 LOC_Os04g52690 LOC_Os08g05590 LOC_Os07g38220 LOC_Os05g50840 LOC_Os11g04070 LOC_Os10g28040 LOC_Os06g10650 LOC_Os03g50510 LOC_Os07g01930 LOC_Os05g08410 LOC_Os07g43060 LOC_Os04g23890 LOC_Os03g57760 LOC_Os03g60939 LOC_Os06g47300 LOC_Os09g28940 LOC_Os11g48080 LOC_Os04g36058 LOC_Os08g40110 LOC_Os03g64190 LOC_Os09g32680 LOC_Os09g21210 LOC_Os05g32180 LOC_Os04g38610 LOC_Os10g41150 LOC_Os05g44350 LOC_Os09g20660 LOC_Os04g53210 LOC_Os04g51370 LOC_Os03g50380 LOC_Os07g37790 LOC_Os06g51250 LOC_Os07g09010 LOC_Os05g46270 LOC_Os07g37640 LOC_Os04g48930 LOC_Os07g31140 LOC_Os03g49710 LOC_Os04g33750 LOC_Os03g60400 LOC_Os06g08380 LOC_Os04g22860 LOC_Os11g04954 LOC_Os05g19970 LOC_Os05g05230 LOC_Os09g02700 LOC_Os10g39410 LOC_Os05g17830 LOC_Os03g53400 LOC_Os12g01922 LOC_Os06g03540 LOC_Os04g55960 LOC_Os11g11390 LOC_Os06g51270 LOC_Os10g08940 LOC_Os05g10770 LOC_Os05g02240 LOC_Os04g20280 LOC_Os03g60740 LOC_Os05g30530 LOC_Os03g49480 LOC_Os04g46050 LOC_Os05g48320 LOC_Os05g39050 LOC_Os12g31480 LOC_Os03g62730 LOC_Os04g47240 LOC_Os11g24560 LOC_Os07g13270 LOC_Os03g52400 LOC_Os05g42300 LOC_Os05g49300 LOC_Os05g11770 LOC_Os11g34305 LOC_Os10g33770 LOC_Os05g07050 LOC_Os09g26340 LOC_Os07g03690 LOC_Os10g30090 LOC_Os12g31920 LOC_Os05g46550 LOC_Os04g40830 LOC_Os03g60650 LOC_Os08g40610 LOC_Os03g54790 LOC_Os04g28180 LOC_Os10g34120 LOC_Os09g20090 LOC_Os12g43700 LOC_Os08g19830 LOC_Os09g36920 LOC_Os09g34040 LOC_Os06g27890 LOC_Os04g52340 LOC_Os05g27940 LOC_Os06g30970 LOC_Os10g40590 LOC_Os07g12770 LOC_Os07g30300 LOC_Os07g42950 LOC_Os05g01020 LOC_Os06g36160 LOC_Os12g29760 LOC_Os10g11200 LOC_Os08g28840 LOC_Os12g42850 LOC_Os07g19460 LOC_Os09g38020 LOC_Os04g32070 LOC_Os07g45310 LOC_Os11g40510 LOC_Os05g06450 LOC_Os06g22919 LOC_Os12g34144 LOC_Os10g27190 LOC_Os09g10720 LOC_Os04g56160 LOC_Os05g28950 LOC_Os05g47446 LOC_Os05g24594 LOC_Os12g33924 LOC_Os07g42600 LOC_Os05g38520 LOC_Os06g09850 LOC_Os06g02510 LOC_Os12g40560 LOC_Os06g42860 LOC_Os03g60260 LOC_Os08g21840 LOC_Os06g08564 LOC_Os04g53760 LOC_Os07g12150 LOC_Os12g19549 LOC_Os05g43570 LOC_Os07g01020 LOC_Os11g39670 LOC_Os03g50330 LOC_Os05g25850 LOC_Os06g09170 LOC_Os07g36500 LOC_Os08g37350 LOC_Os10g21234 LOC_Os11g17610 LOC_Os05g05200 LOC_Os07g36940 LOC_Os12g44330 LOC_Os06g38930 LOC_Os04g45950 LOC_Os07g12830 LOC_Os08g23440 LOC_Os11g48020 LOC_Os03g42900 LOC_Os04g35060 LOC_Os09g33450 LOC_Os07g46370 LOC_Os03g49770 LOC_Os04g17064 LOC_Os09g39230 LOC_Os11g16580 LOC_Os05g24770 LOC_Os12g08800 LOC_Os08g44260 LOC_Os07g46660 LOC_Os07g43020 LOC_Os07g06590 LOC_Os03g50980 LOC_Os04g45930 LOC_Os05g37390 LOC_Os01g60660 LOC_Os02g48350 LOC_Os03g20560 LOC_Os02g55980 LOC_Os01g57073 LOC_Os01g60260 LOC_Os03g22570 LOC_Os01g16970 LOC_Os01g34870 LOC_Os01g40280 LOC_Os03g03430 LOC_Os01g02090 LOC_Os02g55880 LOC_Os02g42860 LOC_Os02g37880 LOC_Os01g62440 LOC_Os01g51200 LOC_Os03g10930 LOC_Os02g33140 LOC_Os02g47850 LOC_Os01g46580 LOC_Os03g16110 LOC_Os03g11720 LOC_Os03g23950 LOC_Os03g05300 LOC_Os02g01740 LOC_Os01g07730 LOC_Os01g73514 LOC_Os02g02890 LOC_Os03g07450 LOC_Os03g01810 LOC_Os03g24900 LOC_Os01g67134 LOC_Os02g54900 LOC_Os02g55300 LOC_Os02g57390 LOC_Os02g29464 LOC_Os02g46350 LOC_Os01g48810 LOC_Os03g24580 LOC_Os01g64680 LOC_Os02g51770 LOC_Os03g26970 LOC_Os03g18550 LOC_Os01g15310 LOC_Os03g10340 LOC_Os02g45180 LOC_Os01g61920 LOC_Os03g26450 LOC_Os02g45940 LOC_Os02g04160 LOC_Os02g40870 LOC_Os01g73880 LOC_Os03g27450 LOC_Os01g61710 LOC_Os03g11440 LOC_Os02g49590 LOC_Os03g36730 LOC_Os03g09920 LOC_Os01g16910 LOC_Os02g04480 LOC_Os02g14059 LOC_Os02g57660 LOC_Os03g02780 LOC_Os01g61814 LOC_Os03g10510 LOC_Os01g64970 LOC_Os01g18860 LOC_Os01g64650 LOC_Os02g32690 LOC_Os03g16860 LOC_Os01g19170 LOC_Os01g60410 LOC_Os01g16520 LOC_Os02g18830 LOC_Os01g59730 LOC_Os03g07080 LOC_Os03g18570 LOC_Os01g11300 LOC_Os02g52860 LOC_Os02g24612 LOC_Os02g52140 LOC_Os01g10050 LOC_Os02g57640 LOC_Os01g32660 LOC_Os03g21550 LOC_Os01g60360 LOC_Os01g04260 LOC_Os02g45650 LOC_Os02g13530 LOC_Os03g37970 LOC_Os01g60120 LOC_Os01g40840 LOC_Os01g50010 LOC_Os02g38840 LOC_Os03g08230 LOC_Os01g51220 LOC_Os01g42950 LOC_Os03g08010 LOC_Os03g04430 LOC_Os02g58640 LOC_Os01g64770 LOC_Os03g25450 LOC_Os03g08020 LOC_Os01g56320 LOC_Os03g08050 LOC_Os03g18160 LOC_Os03g26090 LOC_Os01g48210 LOC_Os02g27760 LOC_Os02g55260 LOC_Os01g63270 LOC_Os03g02480 LOC_Os03g04950 LOC_Os01g57260 LOC_Os01g58240 LOC_Os03g13040 LOC_Os02g05630 LOC_Os01g71710 LOC_Os01g63940 LOC_Os01g55360 LOC_Os01g08400 LOC_Os03g16130 LOC_Os02g28810 LOC_Os01g45274 LOC_Os01g54870 LOC_Os01g47070 LOC_Os02g01490 LOC_Os03g42900 LOC_Os01g62350 LOC_Os01g62080 LOC_Os01g54010 LOC_Os03g18580 LOC_Os02g34600

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os07g43360  LOC_Os12g34062  LOC_Os11g36150  LOC_Os03g45170  LOC_Os08g09690  LOC_Os07g10720
LOC_Os08g25460  LOC_Os07g08330  LOC_Os05g05240  LOC_Os09g25314  LOC_Os04g59560  LOC_Os05g38530
LOC_Os03g43890  LOC_Os04g49420  LOC_Os08g01070  LOC_Os06g07210  LOC_Os05g14550  LOC_Os07g10256
LOC_Os07g09450  LOC_Os10g34520  LOC_Os11g34350  LOC_Os09g16380  LOC_Os12g06870  LOC_Os08g36420
LOC_Os06g29180  LOC_Os06g02550  LOC_Os04g37690  LOC_Os05g38740  LOC_Os12g37840  LOC_Os04g42380
LOC_Os04g48410  LOC_Os08g08830  LOC_Os04g38870  LOC_Os07g10250  LOC_Os07g43120  LOC_Os04g56640
LOC_Os11g43620  LOC_Os12g30540  LOC_Os12g38000  LOC_Os09g30150  LOC_Os08g43190  LOC_Os07g07010
LOC_Os12g04240  LOC_Os11g08940  LOC_Os05g22260  LOC_Os03g55270  LOC_Os07g01150  LOC_Os08g01920
LOC_Os08g01750  LOC_Os08g15450  LOC_Os04g42270  LOC_Os12g38380  LOC_Os03g61210  LOC_Os03g50390
LOC_Os04g04320  LOC_Os12g32640  LOC_Os05g49830  LOC_Os05g05860  LOC_Os04g11880  LOC_Os06g29080
LOC_Os06g37080  LOC_Os05g48450  LOC_Os05g15160  LOC_Os11g28980  LOC_Os09g16330  LOC_Os04g36720
LOC_Os05g03430  LOC_Os04g43650  LOC_Os03g63300  LOC_Os03g55280  LOC_Os12g41930  LOC_Os04g42490
LOC_Os04g37580  LOC_Os07g30980  LOC_Os03g53760  LOC_Os04g20220  LOC_Os09g31130  LOC_Os10g38278
LOC_Os03g61100  LOC_Os04g52690  LOC_Os08g05590  LOC_Os07g38220  LOC_Os05g50840  LOC_Os11g04070
LOC_Os10g28040  LOC_Os06g10650  LOC_Os03g50510  LOC_Os07g01930  LOC_Os05g08410  LOC_Os07g43060
LOC_Os04g23890  LOC_Os03g57760  LOC_Os03g60939  LOC_Os06g47300  LOC_Os09g28940  LOC_Os11g48080
LOC_Os04g36058  LOC_Os08g40110  LOC_Os03g64190  LOC_Os09g32680  LOC_Os09g21210  LOC_Os05g32180
LOC_Os04g38610  LOC_Os10g41150  LOC_Os05g44350  LOC_Os09g20660  LOC_Os04g53210  LOC_Os04g51370
LOC_Os03g50380  LOC_Os07g37790  LOC_Os06g51250  LOC_Os07g09010  LOC_Os05g46270  LOC_Os07g37640
LOC_Os04g48930  LOC_Os07g31140  LOC_Os03g49710  LOC_Os04g33750  LOC_Os03g60400  LOC_Os06g08380
LOC_Os04g22860  LOC_Os11g04954  LOC_Os05g19970  LOC_Os05g05230  LOC_Os09g02700  LOC_Os10g39410
LOC_Os05g17830  LOC_Os03g53400  LOC_Os12g01922  LOC_Os06g03540  LOC_Os04g55960  LOC_Os11g11390
LOC_Os06g51270  LOC_Os10g08940  LOC_Os05g10770  LOC_Os05g02240  LOC_Os04g20280  LOC_Os03g60740
LOC_Os05g30530  LOC_Os03g49480  LOC_Os04g46050  LOC_Os05g48320  LOC_Os05g39050  LOC_Os12g31480
LOC_Os03g62730  LOC_Os04g47240  LOC_Os11g24560  LOC_Os07g13270  LOC_Os03g52400  LOC_Os05g42300
LOC_Os05g49300  LOC_Os05g11770  LOC_Os11g34305  LOC_Os10g33770  LOC_Os05g07050  LOC_Os09g26340
LOC_Os07g03690  LOC_Os10g30090  LOC_Os12g31920  LOC_Os05g46550  LOC_Os04g40830  LOC_Os03g60650
LOC_Os08g40610  LOC_Os03g54790  LOC_Os04g28180  LOC_Os10g34120  LOC_Os09g20090  LOC_Os12g43700
LOC_Os08g19830  LOC_Os09g36920  LOC_Os09g34040  LOC_Os06g27890  LOC_Os04g52340  LOC_Os05g27940
LOC_Os06g30970  LOC_Os10g40590  LOC_Os07g12770  LOC_Os07g30300  LOC_Os07g42950  LOC_Os05g01020
LOC_Os06g36160  LOC_Os12g29760  LOC_Os10g11200  LOC_Os08g28840  LOC_Os12g42850  LOC_Os07g19460
LOC_Os09g38020  LOC_Os04g32070  LOC_Os07g45310  LOC_Os11g40510  LOC_Os05g06450  LOC_Os06g22919
LOC_Os12g34144  LOC_Os10g27190  LOC_Os09g10720  LOC_Os04g56160  LOC_Os05g28950  LOC_Os05g47446
LOC_Os05g24594  LOC_Os12g33924  LOC_Os07g42600  LOC_Os05g38520  LOC_Os06g09850  LOC_Os06g02510
LOC_Os12g40560  LOC_Os06g42860  LOC_Os03g60260  LOC_Os08g21840  LOC_Os06g08564  LOC_Os04g53760
LOC_Os07g12150  LOC_Os12g19549  LOC_Os05g43570  LOC_Os07g01020  LOC_Os11g39670  LOC_Os03g50330
LOC_Os05g25850  LOC_Os06g09170  LOC_Os07g36500  LOC_Os08g37350  LOC_Os10g21234  LOC_Os11g17610
LOC_Os05g05200  LOC_Os07g36940  LOC_Os12g44330  LOC_Os06g38930  LOC_Os04g45950  LOC_Os07g12830
LOC_Os08g23440  LOC_Os11g48020  LOC_Os03g42900  LOC_Os04g35060  LOC_Os09g33450  LOC_Os07g46370
LOC_Os03g49770  LOC_Os04g17064  LOC_Os09g39230  LOC_Os11g16580  LOC_Os05g24770  LOC_Os12g08800
LOC_Os08g44260  LOC_Os07g46660  LOC_Os07g43020  LOC_Os07g06590  LOC_Os03g50980  LOC_Os04g45930
LOC_Os05g37390  LOC_Os01g60660   LOC_Os02g48350   LOC_Os03g20560   LOC_Os02g55980   LOC_Os01g57073
LOC_Os01g60260   LOC_Os03g22570   LOC_Os01g16970   LOC_Os01g34870   LOC_Os01g40280   LOC_Os03g03430
LOC_Os01g02090   LOC_Os02g55880   LOC_Os02g42860   LOC_Os02g37880   LOC_Os01g62440   LOC_Os01g51200
LOC_Os03g10930   LOC_Os02g33140   LOC_Os02g47850   LOC_Os01g46580   LOC_Os03g16110   LOC_Os03g11720
LOC_Os03g23950   LOC_Os03g05300   LOC_Os02g01740   LOC_Os01g07730   LOC_Os01g73514   LOC_Os02g02890
LOC_Os03g07450   LOC_Os03g01810   LOC_Os03g24900   LOC_Os01g67134   LOC_Os02g54900   LOC_Os02g55300
LOC_Os02g57390   LOC_Os02g29464   LOC_Os02g46350   LOC_Os01g48810   LOC_Os03g24580   LOC_Os01g64680
LOC_Os02g51770   LOC_Os03g26970   LOC_Os03g18550   LOC_Os01g15310   LOC_Os03g10340   LOC_Os02g45180
LOC_Os01g61920   LOC_Os03g26450   LOC_Os02g45940   LOC_Os02g04160   LOC_Os02g40870   LOC_Os01g73880
LOC_Os03g27450   LOC_Os01g61710   LOC_Os03g11440   LOC_Os02g49590   LOC_Os03g36730   LOC_Os03g09920
LOC_Os01g16910   LOC_Os02g04480   LOC_Os02g14059   LOC_Os02g57660   LOC_Os03g02780   LOC_Os01g61814
LOC_Os03g10510   LOC_Os01g64970   LOC_Os01g18860   LOC_Os01g64650   LOC_Os02g32690   LOC_Os03g16860
LOC_Os01g19170   LOC_Os01g60410   LOC_Os01g16520   LOC_Os02g18830   LOC_Os01g59730   LOC_Os03g07080
LOC_Os03g18570   LOC_Os01g11300   LOC_Os02g52860   LOC_Os02g24612   LOC_Os02g52140   LOC_Os01g10050
LOC_Os02g57640   LOC_Os01g32660   LOC_Os03g21550   LOC_Os01g60360   LOC_Os01g04260   LOC_Os02g45650
LOC_Os02g13530   LOC_Os03g37970   LOC_Os01g60120   LOC_Os01g40840   LOC_Os01g50010   LOC_Os02g38840
LOC_Os03g08230   LOC_Os01g51220   LOC_Os01g42950   LOC_Os03g08010   LOC_Os03g04430   LOC_Os02g58640
LOC_Os01g64770   LOC_Os03g25450   LOC_Os03g08020   LOC_Os01g56320   LOC_Os03g08050   LOC_Os03g18160
LOC_Os03g26090   LOC_Os01g48210   LOC_Os02g27760   LOC_Os02g55260   LOC_Os01g63270   LOC_Os03g02480
LOC_Os03g04950   LOC_Os01g57260   LOC_Os01g58240   LOC_Os03g13040   LOC_Os02g05630   LOC_Os01g71710
LOC_Os01g63940   LOC_Os01g55360   LOC_Os01g08400   LOC_Os03g16130   LOC_Os02g28810   LOC_Os01g45274
LOC_Os01g54870   LOC_Os01g47070   LOC_Os02g01490   LOC_Os03g42900   LOC_Os01g62350   LOC_Os01g62080
LOC_Os01g54010   LOC_Os03g18580   LOC_Os02g34600

Database Links
UniprotKB	Q10GH8
Ensembl	LOC_Os03g42900.1
EMBL	AC092390 DP000009 AK067707 CM000140
KEGG	osa:4333505 dosa:Os03t0627500-01