RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os04g45930 View Network
Names	OSJNBb0038F03.1 protein (OSJNBb0103I08.18 protein) (Os04g0543200 protein) (cDNA clone:J033076A11, full insert sequence) (cDNA clone:J033085H02, full insert sequence)
Function	RNA recognition motif containing protein, expressed
Attributes	Length: 775 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 86649.4 pI: 5.61 Subcellular Location (predicted): Chloroplast Nucleus
Gene Model	LOC_Os04g45930.1 LOC_Os04g45930.2 LOC_Os04g45930.3

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os04g54940 LOC_Os09g39420 LOC_Os10g39410 LOC_Os07g40580 LOC_Os05g46270 LOC_Os04g49420 LOC_Os05g01020 LOC_Os06g08800 LOC_Os04g46450 LOC_Os07g25016 LOC_Os11g40510 LOC_Os09g19560 LOC_Os07g22220 LOC_Os06g36160 LOC_Os05g24970 LOC_Os04g54340 LOC_Os05g06350 LOC_Os09g26340 LOC_Os09g21760 LOC_Os10g33770 LOC_Os10g32880 LOC_Os05g39050 LOC_Os05g38740 LOC_Os05g08360 LOC_Os11g07500 LOC_Os08g08080 LOC_Os07g42950 LOC_Os07g43360 LOC_Os10g34670 LOC_Os07g36940 LOC_Os12g31380 LOC_Os06g16280 LOC_Os09g38020 LOC_Os07g07240 LOC_Os07g31340 LOC_Os08g09350 LOC_Os04g45930 LOC_Os09g24404 LOC_Os05g13630 LOC_Os12g41250 LOC_Os07g33340 LOC_Os07g03160 LOC_Os11g37080 LOC_Os11g40150 LOC_Os07g33330 LOC_Os07g42180 LOC_Os09g02700 LOC_Os12g30060 LOC_Os09g30412 LOC_Os05g05860 LOC_Os11g01420 LOC_Os10g34380 LOC_Os07g10250 LOC_Os05g48030 LOC_Os12g41400 LOC_Os11g34305 LOC_Os06g08480 LOC_Os10g30100 LOC_Os07g30980 LOC_Os12g38380 LOC_Os04g54330 LOC_Os07g29360 LOC_Os07g13280 LOC_Os09g34010 LOC_Os11g34350 LOC_Os11g19100 LOC_Os07g36500 LOC_Os05g41510 LOC_Os09g02284 LOC_Os08g01070 LOC_Os01g62230 LOC_Os01g49290 LOC_Os01g69970 LOC_Os04g16776 LOC_Os02g39890 LOC_Os01g05420 LOC_Os02g12850 LOC_Os01g43030 LOC_Os02g13530 LOC_Os03g36780 LOC_Os03g10990 LOC_Os01g08560 LOC_Os01g65220 LOC_Os03g53190 LOC_Os02g29464 LOC_Os02g30730 LOC_Os03g02780 LOC_Os04g16814 LOC_Os03g22740 LOC_Os02g53230 LOC_Os02g13990 LOC_Os04g04320 LOC_Os01g61920 LOC_Os03g53700 LOC_Os02g33450 LOC_Os01g59140 LOC_Os03g29470 LOC_Os01g05970 LOC_Os02g39350 LOC_Os04g45930 LOC_Os03g22570 LOC_Os02g31150 LOC_Os01g06010 LOC_Os04g25550 LOC_Os02g55300 LOC_Os02g06500 LOC_Os01g16190 LOC_Os03g51540 LOC_Os02g58020 LOC_Os01g15310 LOC_Os03g53720 LOC_Os03g61560 LOC_Os04g40740 LOC_Os03g26440 LOC_Os03g43020 LOC_Os03g61110 LOC_Os03g25260 LOC_Os01g68810 LOC_Os01g36890 LOC_Os02g52140 LOC_Os02g45940 LOC_Os04g42380 LOC_Os03g16110 LOC_Os03g23020 LOC_Os01g10050 LOC_Os04g09800 LOC_Os01g36920 LOC_Os01g72790 LOC_Os01g70060 LOC_Os03g42900

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os04g54940  LOC_Os09g39420  LOC_Os10g39410  LOC_Os07g40580  LOC_Os05g46270  LOC_Os04g49420
LOC_Os05g01020  LOC_Os06g08800  LOC_Os04g46450  LOC_Os07g25016  LOC_Os11g40510  LOC_Os09g19560
LOC_Os07g22220  LOC_Os06g36160  LOC_Os05g24970  LOC_Os04g54340  LOC_Os05g06350  LOC_Os09g26340
LOC_Os09g21760  LOC_Os10g33770  LOC_Os10g32880  LOC_Os05g39050  LOC_Os05g38740  LOC_Os05g08360
LOC_Os11g07500  LOC_Os08g08080  LOC_Os07g42950  LOC_Os07g43360  LOC_Os10g34670  LOC_Os07g36940
LOC_Os12g31380  LOC_Os06g16280  LOC_Os09g38020  LOC_Os07g07240  LOC_Os07g31340  LOC_Os08g09350
LOC_Os04g45930  LOC_Os09g24404  LOC_Os05g13630  LOC_Os12g41250  LOC_Os07g33340  LOC_Os07g03160
LOC_Os11g37080  LOC_Os11g40150  LOC_Os07g33330  LOC_Os07g42180  LOC_Os09g02700  LOC_Os12g30060
LOC_Os09g30412  LOC_Os05g05860  LOC_Os11g01420  LOC_Os10g34380  LOC_Os07g10250  LOC_Os05g48030
LOC_Os12g41400  LOC_Os11g34305  LOC_Os06g08480  LOC_Os10g30100  LOC_Os07g30980  LOC_Os12g38380
LOC_Os04g54330  LOC_Os07g29360  LOC_Os07g13280  LOC_Os09g34010  LOC_Os11g34350  LOC_Os11g19100
LOC_Os07g36500  LOC_Os05g41510  LOC_Os09g02284  LOC_Os08g01070  LOC_Os01g62230   LOC_Os01g49290
LOC_Os01g69970   LOC_Os04g16776   LOC_Os02g39890   LOC_Os01g05420   LOC_Os02g12850   LOC_Os01g43030
LOC_Os02g13530   LOC_Os03g36780   LOC_Os03g10990   LOC_Os01g08560   LOC_Os01g65220   LOC_Os03g53190
LOC_Os02g29464   LOC_Os02g30730   LOC_Os03g02780   LOC_Os04g16814   LOC_Os03g22740   LOC_Os02g53230
LOC_Os02g13990   LOC_Os04g04320   LOC_Os01g61920   LOC_Os03g53700   LOC_Os02g33450   LOC_Os01g59140
LOC_Os03g29470   LOC_Os01g05970   LOC_Os02g39350   LOC_Os04g45930   LOC_Os03g22570   LOC_Os02g31150
LOC_Os01g06010   LOC_Os04g25550   LOC_Os02g55300   LOC_Os02g06500   LOC_Os01g16190   LOC_Os03g51540
LOC_Os02g58020   LOC_Os01g15310   LOC_Os03g53720   LOC_Os03g61560   LOC_Os04g40740   LOC_Os03g26440
LOC_Os03g43020   LOC_Os03g61110   LOC_Os03g25260   LOC_Os01g68810   LOC_Os01g36890   LOC_Os02g52140
LOC_Os02g45940   LOC_Os04g42380   LOC_Os03g16110   LOC_Os03g23020   LOC_Os01g10050   LOC_Os04g09800
LOC_Os01g36920   LOC_Os01g72790   LOC_Os01g70060   LOC_Os03g42900

Database Links
UniprotKB	Q7X6J4
Ensembl	LOC_Os04g45930.1 LOC_Os04g45930.2 LOC_Os04g45930.3
Refseq	NP_001053453.1
EMBL	AP008210 AK101961 AK102135 AL606695 AL606728
KEGG	osa:4336550 dosa:Os04t0543200-01