RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os07g40580 View Network
Names	Os07g0597000 protein (Translation initiation factor 5A) (cDNA clone:001-045-E11, full insert sequence)
Function	eukaryotic translation initiation factor 5A, putative, expressed
Attributes	Length: 161 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 17457.7 pI: 6.1472 Subcellular Location (predicted): Cytosol
Gene Model	LOC_Os07g40580.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os07g46750 LOC_Os08g06600 LOC_Os07g47710 LOC_Os07g40580 LOC_Os09g02700 LOC_Os10g28040 LOC_Os09g32976 LOC_Os07g42300 LOC_Os07g46660 LOC_Os11g20384 LOC_Os10g35550 LOC_Os12g38000 LOC_Os08g23710 LOC_Os12g43100 LOC_Os11g04070 LOC_Os11g05562 LOC_Os07g48780 LOC_Os09g37120 LOC_Os12g41400 LOC_Os08g45040 LOC_Os12g39070 LOC_Os10g41960 LOC_Os07g41180 LOC_Os07g46500 LOC_Os09g39500 LOC_Os11g06750 LOC_Os01g68950 LOC_Os02g43920 LOC_Os02g33140 LOC_Os04g45930 LOC_Os03g56390 LOC_Os07g22600 LOC_Os04g33750 LOC_Os01g01700 LOC_Os01g08560 LOC_Os07g40580 LOC_Os03g31090 LOC_Os01g16190 LOC_Os05g30530 LOC_Os03g08020 LOC_Os01g16240 LOC_Os01g70810 LOC_Os02g54700 LOC_Os02g50760 LOC_Os01g03070 LOC_Os06g46770 LOC_Os03g18510 LOC_Os05g42424 LOC_Os01g32660 LOC_Os01g68940 LOC_Os06g05660 LOC_Os02g21970 LOC_Os03g21550 LOC_Os03g08010 LOC_Os03g21940 LOC_Os04g42090 LOC_Os03g13170 LOC_Os04g56646 LOC_Os01g04814 LOC_Os05g41900 LOC_Os03g18080 LOC_Os03g60400 LOC_Os03g36780 LOC_Os07g04240 LOC_Os04g42095 LOC_Os07g08729 LOC_Os04g39700 LOC_Os04g01590 LOC_Os03g20370 LOC_Os03g52970 LOC_Os06g47840 LOC_Os01g73880 LOC_Os02g48620 LOC_Os04g02820 LOC_Os01g61814 LOC_Os03g05300 LOC_Os07g08330 LOC_Os03g08050 LOC_Os02g06640 LOC_Os02g51780 LOC_Os02g27760 LOC_Os02g58020 LOC_Os07g10720 LOC_Os03g46770 LOC_Os01g51200 LOC_Os01g37800 LOC_Os02g47870 LOC_Os05g41210 LOC_Os02g29464

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os07g46750  LOC_Os08g06600  LOC_Os07g47710  LOC_Os07g40580  LOC_Os09g02700  LOC_Os10g28040
LOC_Os09g32976  LOC_Os07g42300  LOC_Os07g46660  LOC_Os11g20384  LOC_Os10g35550  LOC_Os12g38000
LOC_Os08g23710  LOC_Os12g43100  LOC_Os11g04070  LOC_Os11g05562  LOC_Os07g48780  LOC_Os09g37120
LOC_Os12g41400  LOC_Os08g45040  LOC_Os12g39070  LOC_Os10g41960  LOC_Os07g41180  LOC_Os07g46500
LOC_Os09g39500  LOC_Os11g06750  LOC_Os01g68950   LOC_Os02g43920   LOC_Os02g33140   LOC_Os04g45930
LOC_Os03g56390   LOC_Os07g22600   LOC_Os04g33750   LOC_Os01g01700   LOC_Os01g08560   LOC_Os07g40580
LOC_Os03g31090   LOC_Os01g16190   LOC_Os05g30530   LOC_Os03g08020   LOC_Os01g16240   LOC_Os01g70810
LOC_Os02g54700   LOC_Os02g50760   LOC_Os01g03070   LOC_Os06g46770   LOC_Os03g18510   LOC_Os05g42424
LOC_Os01g32660   LOC_Os01g68940   LOC_Os06g05660   LOC_Os02g21970   LOC_Os03g21550   LOC_Os03g08010
LOC_Os03g21940   LOC_Os04g42090   LOC_Os03g13170   LOC_Os04g56646   LOC_Os01g04814   LOC_Os05g41900
LOC_Os03g18080   LOC_Os03g60400   LOC_Os03g36780   LOC_Os07g04240   LOC_Os04g42095   LOC_Os07g08729
LOC_Os04g39700   LOC_Os04g01590   LOC_Os03g20370   LOC_Os03g52970   LOC_Os06g47840   LOC_Os01g73880
LOC_Os02g48620   LOC_Os04g02820   LOC_Os01g61814   LOC_Os03g05300   LOC_Os07g08330   LOC_Os03g08050
LOC_Os02g06640   LOC_Os02g51780   LOC_Os02g27760   LOC_Os02g58020   LOC_Os07g10720   LOC_Os03g46770
LOC_Os01g51200   LOC_Os01g37800   LOC_Os02g47870   LOC_Os05g41210   LOC_Os02g29464

Database Links
UniprotKB	Q84ZK1
Ensembl	LOC_Os07g40580.1
Refseq	NP_001060174.1
EMBL	AP004275 AP008213 AK062134
KEGG	osa:4343796 dosa:Os07t0597000-01