RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os09g02700 View Network
Names	Os09g0115400 protein (Poly(A)-binding protein) (Putative poly(A)-binding protein) (cDNA clone:J013116F07, full insert sequence)
Function	polyadenylate-binding protein, putative, expressed
Attributes	Length: 663 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 71630.3 pI: 6.7958 Subcellular Location (predicted): Chloroplast
Gene Model	LOC_Os09g02700.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os11g24560 LOC_Os11g01190 LOC_Os11g40510 LOC_Os12g39070 LOC_Os10g02630 LOC_Os10g30100 LOC_Os12g34510 LOC_Os10g39410 LOC_Os12g13950 LOC_Os09g29630 LOC_Os09g36440 LOC_Os09g34970 LOC_Os10g29560 LOC_Os10g41410 LOC_Os09g38020 LOC_Os09g02810 LOC_Os11g43620 LOC_Os11g37080 LOC_Os12g21700 LOC_Os12g43120 LOC_Os11g07500 LOC_Os10g39820 LOC_Os12g06870 LOC_Os12g06890 LOC_Os10g35550 LOC_Os10g35000 LOC_Os09g26340 LOC_Os12g04180 LOC_Os09g32680 LOC_Os09g36920 LOC_Os10g38900 LOC_Os11g19250 LOC_Os11g29400 LOC_Os09g21110 LOC_Os12g38380 LOC_Os09g37510 LOC_Os09g10720 LOC_Os09g02700 LOC_Os10g35280 LOC_Os11g03430 LOC_Os11g19100 LOC_Os07g12320 LOC_Os07g33340 LOC_Os01g48980 LOC_Os04g32930 LOC_Os07g34740 LOC_Os01g72790 LOC_Os01g57110 LOC_Os06g48310 LOC_Os07g44620 LOC_Os01g29070 LOC_Os02g52250 LOC_Os02g48840 LOC_Os05g49250 LOC_Os02g42860 LOC_Os02g57220 LOC_Os02g14780 LOC_Os01g70570 LOC_Os03g64080 LOC_Os05g38740 LOC_Os06g41750 LOC_Os02g57640 LOC_Os05g05230 LOC_Os07g40580 LOC_Os02g48000 LOC_Os04g51370 LOC_Os02g37880 LOC_Os03g60930 LOC_Os03g09140 LOC_Os01g71230 LOC_Os03g44200 LOC_Os07g13280 LOC_Os02g27950 LOC_Os07g36940 LOC_Os02g57390 LOC_Os08g38570 LOC_Os06g08770 LOC_Os04g52960 LOC_Os06g02620 LOC_Os05g47890 LOC_Os05g37390 LOC_Os02g36360 LOC_Os01g41630 LOC_Os05g13630 LOC_Os02g39030 LOC_Os05g39050 LOC_Os01g64690 LOC_Os07g36140 LOC_Os03g52750 LOC_Os03g63720 LOC_Os05g45890 LOC_Os05g02400 LOC_Os07g33330 LOC_Os03g46770 LOC_Os02g12850 LOC_Os05g38530 LOC_Os02g52140 LOC_Os04g25360 LOC_Os04g36810 LOC_Os08g23120 LOC_Os05g44320 LOC_Os01g06010 LOC_Os02g04050 LOC_Os02g01740 LOC_Os02g45940 LOC_Os03g03390 LOC_Os04g43140 LOC_Os01g61930 LOC_Os01g69130 LOC_Os01g02090 LOC_Os01g48920 LOC_Os06g04300 LOC_Os01g15310 LOC_Os03g49210 LOC_Os08g05840 LOC_Os07g39870 LOC_Os08g08200 LOC_Os02g47150 LOC_Os01g51200 LOC_Os07g40510 LOC_Os06g43790 LOC_Os01g05970 LOC_Os03g61920 LOC_Os05g46550 LOC_Os01g01150 LOC_Os01g08770 LOC_Os01g69110 LOC_Os02g54120 LOC_Os06g02144 LOC_Os05g49230 LOC_Os04g57150 LOC_Os04g33040 LOC_Os01g56620 LOC_Os03g43020 LOC_Os08g08830 LOC_Os02g39300 LOC_Os01g61920 LOC_Os05g06840 LOC_Os02g55370 LOC_Os05g29010 LOC_Os04g49420 LOC_Os01g56980 LOC_Os05g43570 LOC_Os03g08010 LOC_Os04g28090 LOC_Os04g59494 LOC_Os03g08640 LOC_Os07g41180 LOC_Os03g02780 LOC_Os02g58090 LOC_Os03g07080 LOC_Os03g49580 LOC_Os03g42900 LOC_Os01g40610 LOC_Os05g08360 LOC_Os08g17820 LOC_Os08g45040 LOC_Os04g40840 LOC_Os02g53230 LOC_Os08g09350 LOC_Os01g70060 LOC_Os02g42040 LOC_Os01g71960 LOC_Os06g30320 LOC_Os05g51700 LOC_Os02g39800 LOC_Os01g23630 LOC_Os04g54330 LOC_Os03g53190 LOC_Os02g49610 LOC_Os03g02680 LOC_Os07g33360 LOC_Os07g27930 LOC_Os01g68940 LOC_Os03g22740 LOC_Os02g47410 LOC_Os03g08020 LOC_Os07g10350 LOC_Os01g73880 LOC_Os07g07220 LOC_Os04g53370 LOC_Os03g32526 LOC_Os07g03160 LOC_Os02g19210 LOC_Os03g56800 LOC_Os04g04320 LOC_Os01g07080 LOC_Os03g64190 LOC_Os05g48422 LOC_Os02g39350 LOC_Os03g63590 LOC_Os04g45930 LOC_Os02g58020 LOC_Os08g05850 LOC_Os06g11170 LOC_Os04g41490 LOC_Os02g39890 LOC_Os03g22570 LOC_Os03g50380 LOC_Os03g52340 LOC_Os03g25450 LOC_Os06g49510 LOC_Os03g09920 LOC_Os04g40740 LOC_Os04g02820 LOC_Os06g21470 LOC_Os05g30940 LOC_Os01g05950 LOC_Os07g31370 LOC_Os03g61110 LOC_Os02g34570 LOC_Os04g20220 LOC_Os03g08050 LOC_Os01g16190 LOC_Os03g58720 LOC_Os01g32750 LOC_Os01g62230 LOC_Os02g13990 LOC_Os01g08200 LOC_Os06g37440 LOC_Os02g58410 LOC_Os06g36770 LOC_Os06g48750 LOC_Os09g02700 LOC_Os03g16860 LOC_Os01g68950 LOC_Os07g47500 LOC_Os07g31340 LOC_Os03g37330 LOC_Os07g38760 LOC_Os01g72980 LOC_Os03g15810 LOC_Os07g36500 LOC_Os04g22240 LOC_Os06g38470 LOC_Os05g07050 LOC_Os05g41060 LOC_Os07g02350 LOC_Os02g31150 LOC_Os08g37780 LOC_Os03g19960 LOC_Os01g34614 LOC_Os07g46660 LOC_Os07g19494 LOC_Os02g55300 LOC_Os03g62640

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os11g24560  LOC_Os11g01190  LOC_Os11g40510  LOC_Os12g39070  LOC_Os10g02630  LOC_Os10g30100
LOC_Os12g34510  LOC_Os10g39410  LOC_Os12g13950  LOC_Os09g29630  LOC_Os09g36440  LOC_Os09g34970
LOC_Os10g29560  LOC_Os10g41410  LOC_Os09g38020  LOC_Os09g02810  LOC_Os11g43620  LOC_Os11g37080
LOC_Os12g21700  LOC_Os12g43120  LOC_Os11g07500  LOC_Os10g39820  LOC_Os12g06870  LOC_Os12g06890
LOC_Os10g35550  LOC_Os10g35000  LOC_Os09g26340  LOC_Os12g04180  LOC_Os09g32680  LOC_Os09g36920
LOC_Os10g38900  LOC_Os11g19250  LOC_Os11g29400  LOC_Os09g21110  LOC_Os12g38380  LOC_Os09g37510
LOC_Os09g10720  LOC_Os09g02700  LOC_Os10g35280  LOC_Os11g03430  LOC_Os11g19100  LOC_Os07g12320
LOC_Os07g33340   LOC_Os01g48980   LOC_Os04g32930   LOC_Os07g34740   LOC_Os01g72790   LOC_Os01g57110
LOC_Os06g48310   LOC_Os07g44620   LOC_Os01g29070   LOC_Os02g52250   LOC_Os02g48840   LOC_Os05g49250
LOC_Os02g42860   LOC_Os02g57220   LOC_Os02g14780   LOC_Os01g70570   LOC_Os03g64080   LOC_Os05g38740
LOC_Os06g41750   LOC_Os02g57640   LOC_Os05g05230   LOC_Os07g40580   LOC_Os02g48000   LOC_Os04g51370
LOC_Os02g37880   LOC_Os03g60930   LOC_Os03g09140   LOC_Os01g71230   LOC_Os03g44200   LOC_Os07g13280
LOC_Os02g27950   LOC_Os07g36940   LOC_Os02g57390   LOC_Os08g38570   LOC_Os06g08770   LOC_Os04g52960
LOC_Os06g02620   LOC_Os05g47890   LOC_Os05g37390   LOC_Os02g36360   LOC_Os01g41630   LOC_Os05g13630
LOC_Os02g39030   LOC_Os05g39050   LOC_Os01g64690   LOC_Os07g36140   LOC_Os03g52750   LOC_Os03g63720
LOC_Os05g45890   LOC_Os05g02400   LOC_Os07g33330   LOC_Os03g46770   LOC_Os02g12850   LOC_Os05g38530
LOC_Os02g52140   LOC_Os04g25360   LOC_Os04g36810   LOC_Os08g23120   LOC_Os05g44320   LOC_Os01g06010
LOC_Os02g04050   LOC_Os02g01740   LOC_Os02g45940   LOC_Os03g03390   LOC_Os04g43140   LOC_Os01g61930
LOC_Os01g69130   LOC_Os01g02090   LOC_Os01g48920   LOC_Os06g04300   LOC_Os01g15310   LOC_Os03g49210
LOC_Os08g05840   LOC_Os07g39870   LOC_Os08g08200   LOC_Os02g47150   LOC_Os01g51200   LOC_Os07g40510
LOC_Os06g43790   LOC_Os01g05970   LOC_Os03g61920   LOC_Os05g46550   LOC_Os01g01150   LOC_Os01g08770
LOC_Os01g69110   LOC_Os02g54120   LOC_Os06g02144   LOC_Os05g49230   LOC_Os04g57150   LOC_Os04g33040
LOC_Os01g56620   LOC_Os03g43020   LOC_Os08g08830   LOC_Os02g39300   LOC_Os01g61920   LOC_Os05g06840
LOC_Os02g55370   LOC_Os05g29010   LOC_Os04g49420   LOC_Os01g56980   LOC_Os05g43570   LOC_Os03g08010
LOC_Os04g28090   LOC_Os04g59494   LOC_Os03g08640   LOC_Os07g41180   LOC_Os03g02780   LOC_Os02g58090
LOC_Os03g07080   LOC_Os03g49580   LOC_Os03g42900   LOC_Os01g40610   LOC_Os05g08360   LOC_Os08g17820
LOC_Os08g45040   LOC_Os04g40840   LOC_Os02g53230   LOC_Os08g09350   LOC_Os01g70060   LOC_Os02g42040
LOC_Os01g71960   LOC_Os06g30320   LOC_Os05g51700   LOC_Os02g39800   LOC_Os01g23630   LOC_Os04g54330
LOC_Os03g53190   LOC_Os02g49610   LOC_Os03g02680   LOC_Os07g33360   LOC_Os07g27930   LOC_Os01g68940
LOC_Os03g22740   LOC_Os02g47410   LOC_Os03g08020   LOC_Os07g10350   LOC_Os01g73880   LOC_Os07g07220
LOC_Os04g53370   LOC_Os03g32526   LOC_Os07g03160   LOC_Os02g19210   LOC_Os03g56800   LOC_Os04g04320
LOC_Os01g07080   LOC_Os03g64190   LOC_Os05g48422   LOC_Os02g39350   LOC_Os03g63590   LOC_Os04g45930
LOC_Os02g58020   LOC_Os08g05850   LOC_Os06g11170   LOC_Os04g41490   LOC_Os02g39890   LOC_Os03g22570
LOC_Os03g50380   LOC_Os03g52340   LOC_Os03g25450   LOC_Os06g49510   LOC_Os03g09920   LOC_Os04g40740
LOC_Os04g02820   LOC_Os06g21470   LOC_Os05g30940   LOC_Os01g05950   LOC_Os07g31370   LOC_Os03g61110
LOC_Os02g34570   LOC_Os04g20220   LOC_Os03g08050   LOC_Os01g16190   LOC_Os03g58720   LOC_Os01g32750
LOC_Os01g62230   LOC_Os02g13990   LOC_Os01g08200   LOC_Os06g37440   LOC_Os02g58410   LOC_Os06g36770
LOC_Os06g48750   LOC_Os09g02700   LOC_Os03g16860   LOC_Os01g68950   LOC_Os07g47500   LOC_Os07g31340
LOC_Os03g37330   LOC_Os07g38760   LOC_Os01g72980   LOC_Os03g15810   LOC_Os07g36500   LOC_Os04g22240
LOC_Os06g38470   LOC_Os05g07050   LOC_Os05g41060   LOC_Os07g02350   LOC_Os02g31150   LOC_Os08g37780
LOC_Os03g19960   LOC_Os01g34614   LOC_Os07g46660   LOC_Os07g19494   LOC_Os02g55300   LOC_Os03g62640

Database Links
UniprotKB	Q6YYV1
Ensembl	LOC_Os09g02700.1
Refseq	NP_001062583.1
EMBL	EU267994 AP005569 AP008215 AK067816 CM000146
KEGG	osa:4346409 dosa:Os09t0115400-01