RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os07g31370 View Network
Names	GTP-binding protein Rab6 (Os07g0496000 protein)
Function	ras-related protein, putative, expressed
Attributes	Length: 209 Status: Complete Existence: Inferred from homology Molecular Weight: 22945.2 pI: 8.1699 Subcellular Location (predicted): Mitochondria
Gene Model	LOC_Os07g31370.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os10g39620 LOC_Os08g09320 LOC_Os08g05890 LOC_Os07g48920 LOC_Os12g38000 LOC_Os11g48030 LOC_Os08g43640 LOC_Os09g08660 LOC_Os09g01640 LOC_Os07g46660 LOC_Os07g37790 LOC_Os08g05840 LOC_Os11g06890 LOC_Os08g19830 LOC_Os12g07730 LOC_Os11g24560 LOC_Os10g42950 LOC_Os11g32280 LOC_Os12g35360 LOC_Os12g31640 LOC_Os12g07350 LOC_Os09g30412 LOC_Os10g10990 LOC_Os10g10500 LOC_Os10g35580 LOC_Os08g33082 LOC_Os08g17600 LOC_Os07g41180 LOC_Os09g38530 LOC_Os10g28040 LOC_Os12g38970 LOC_Os08g15040 LOC_Os09g12570 LOC_Os11g42790 LOC_Os12g43940 LOC_Os08g34970 LOC_Os08g21760 LOC_Os08g44090 LOC_Os09g07900 LOC_Os11g07870 LOC_Os11g43950 LOC_Os11g07922 LOC_Os10g32880 LOC_Os09g34970 LOC_Os08g31840 LOC_Os09g21770 LOC_Os12g19549 LOC_Os11g07930 LOC_Os12g37590 LOC_Os09g39420 LOC_Os08g08080 LOC_Os07g43120 LOC_Os09g34040 LOC_Os12g07950 LOC_Os07g43360 LOC_Os10g40140 LOC_Os09g36920 LOC_Os10g30100 LOC_Os10g34670 LOC_Os08g31460 LOC_Os08g36440 LOC_Os12g41400 LOC_Os08g39140 LOC_Os08g08040 LOC_Os08g09200 LOC_Os09g02700 LOC_Os08g18110 LOC_Os12g35030 LOC_Os08g25010 LOC_Os10g31000 LOC_Os10g41520 LOC_Os08g44770 LOC_Os12g07050 LOC_Os08g01070 LOC_Os12g08740 LOC_Os09g02170 LOC_Os10g21910 LOC_Os09g28900 LOC_Os11g20384 LOC_Os09g11450 LOC_Os12g42876 LOC_Os10g42420 LOC_Os09g37000 LOC_Os09g02284 LOC_Os09g06560 LOC_Os09g27960 LOC_Os12g27070 LOC_Os11g43640 LOC_Os03g51430 LOC_Os03g42320 LOC_Os05g05260 LOC_Os05g48620 LOC_Os03g28140 LOC_Os03g58700 LOC_Os02g03450 LOC_Os03g64190 LOC_Os02g51770 LOC_Os01g18860 LOC_Os01g47540 LOC_Os03g08050 LOC_Os03g50740 LOC_Os05g12330 LOC_Os02g57854 LOC_Os01g60360 LOC_Os01g48920 LOC_Os03g63410 LOC_Os03g09140 LOC_Os01g73310 LOC_Os07g20544 LOC_Os01g60410 LOC_Os01g12880 LOC_Os03g17990 LOC_Os03g27450 LOC_Os06g29790 LOC_Os04g31950 LOC_Os06g48570 LOC_Os05g13630 LOC_Os03g51140 LOC_Os05g38530 LOC_Os04g58350 LOC_Os04g23890 LOC_Os01g23630 LOC_Os07g16970 LOC_Os01g70060 LOC_Os07g19494 LOC_Os02g57660 LOC_Os01g56620 LOC_Os03g18080 LOC_Os02g07750 LOC_Os02g50620 LOC_Os06g07210 LOC_Os02g04160 LOC_Os02g42040 LOC_Os05g19270 LOC_Os05g41210 LOC_Os07g07040 LOC_Os01g01080 LOC_Os04g52340 LOC_Os01g61710 LOC_Os02g50760 LOC_Os01g71710 LOC_Os03g25260 LOC_Os03g50350 LOC_Os04g13470 LOC_Os02g58510 LOC_Os03g07850 LOC_Os05g24594 LOC_Os01g23590 LOC_Os03g43020 LOC_Os02g07870 LOC_Os01g03020 LOC_Os03g50390 LOC_Os02g55950 LOC_Os04g54330 LOC_Os06g43210 LOC_Os01g32880 LOC_Os04g01970 LOC_Os03g01216 LOC_Os03g20460 LOC_Os01g64690 LOC_Os04g56730 LOC_Os06g49460 LOC_Os01g64650 LOC_Os01g37800 LOC_Os03g44200 LOC_Os07g29360 LOC_Os03g08010 LOC_Os07g07240 LOC_Os03g42770 LOC_Os05g51490 LOC_Os04g30730 LOC_Os05g19970 LOC_Os02g13640 LOC_Os06g07878 LOC_Os02g16550 LOC_Os06g08770 LOC_Os01g12730 LOC_Os05g47980 LOC_Os05g01020 LOC_Os01g62244 LOC_Os03g26440 LOC_Os06g37440 LOC_Os07g03160 LOC_Os07g27310 LOC_Os02g45180 LOC_Os04g48410 LOC_Os04g37690 LOC_Os06g41590 LOC_Os05g27320 LOC_Os03g46390 LOC_Os05g05740 LOC_Os03g46090 LOC_Os02g34510 LOC_Os04g54940 LOC_Os03g03710 LOC_Os05g32600 LOC_Os01g61930 LOC_Os05g05200 LOC_Os03g04410 LOC_Os02g14860 LOC_Os03g24900 LOC_Os03g15650 LOC_Os02g10060 LOC_Os03g56460 LOC_Os03g17790 LOC_Os06g21390 LOC_Os07g10600 LOC_Os01g01312 LOC_Os01g56980 LOC_Os06g04580 LOC_Os03g45920 LOC_Os03g05300 LOC_Os01g01960 LOC_Os04g28180 LOC_Os05g38610 LOC_Os03g16860 LOC_Os03g10990 LOC_Os03g12710 LOC_Os07g06980 LOC_Os03g08140 LOC_Os01g48210 LOC_Os01g05500 LOC_Os06g11790 LOC_Os05g41220 LOC_Os01g33040 LOC_Os05g32720 LOC_Os01g55300 LOC_Os01g48280 LOC_Os01g61860 LOC_Os06g04500 LOC_Os05g28950 LOC_Os01g60440 LOC_Os03g16110 LOC_Os07g10150 LOC_Os03g51540 LOC_Os03g57450 LOC_Os05g46560 LOC_Os03g15590 LOC_Os02g28810 LOC_Os06g11640 LOC_Os05g06350 LOC_Os03g23909 LOC_Os04g46450 LOC_Os01g56550 LOC_Os05g44310 LOC_Os01g15310 LOC_Os01g74460 LOC_Os02g51780 LOC_Os03g53700 LOC_Os01g08400 LOC_Os01g16540 LOC_Os03g20340 LOC_Os01g67740 LOC_Os01g74180 LOC_Os03g08300 LOC_Os02g27110 LOC_Os07g22220 LOC_Os01g64280 LOC_Os01g40840 LOC_Os02g01740 LOC_Os06g02570 LOC_Os05g08970 LOC_Os03g01810 LOC_Os07g30300 LOC_Os01g51220 LOC_Os04g55040 LOC_Os03g63710 LOC_Os03g53190 LOC_Os06g43790 LOC_Os07g28940 LOC_Os03g03150 LOC_Os06g40630 LOC_Os05g43570 LOC_Os04g58800 LOC_Os03g56820 LOC_Os03g44780 LOC_Os03g63940 LOC_Os04g55210 LOC_Os04g38610 LOC_Os03g08020 LOC_Os07g02350 LOC_Os05g13330 LOC_Os01g54010 LOC_Os01g60660 LOC_Os05g36150 LOC_Os03g18510 LOC_Os03g22690 LOC_Os04g52940 LOC_Os01g56590 LOC_Os04g36810 LOC_Os03g10340 LOC_Os04g37950 LOC_Os02g05630 LOC_Os04g09860 LOC_Os01g62080 LOC_Os04g36560 LOC_Os06g30970 LOC_Os02g27950 LOC_Os03g57790 LOC_Os02g39890 LOC_Os04g26841 LOC_Os03g17020 LOC_Os04g56510 LOC_Os02g55880 LOC_Os06g38470 LOC_Os03g63400 LOC_Os01g11300 LOC_Os02g30050 LOC_Os06g07978 LOC_Os07g08170 LOC_Os04g11880 LOC_Os01g04260 LOC_Os06g14510 LOC_Os04g20220 LOC_Os01g73760 LOC_Os01g27630 LOC_Os03g53720 LOC_Os03g28960 LOC_Os02g30624 LOC_Os03g30460 LOC_Os06g08480 LOC_Os05g33390 LOC_Os01g73230 LOC_Os05g48030 LOC_Os02g11830 LOC_Os05g45420 LOC_Os01g72205

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os10g39620  LOC_Os08g09320  LOC_Os08g05890  LOC_Os07g48920  LOC_Os12g38000  LOC_Os11g48030
LOC_Os08g43640  LOC_Os09g08660  LOC_Os09g01640  LOC_Os07g46660  LOC_Os07g37790  LOC_Os08g05840
LOC_Os11g06890  LOC_Os08g19830  LOC_Os12g07730  LOC_Os11g24560  LOC_Os10g42950  LOC_Os11g32280
LOC_Os12g35360  LOC_Os12g31640  LOC_Os12g07350  LOC_Os09g30412  LOC_Os10g10990  LOC_Os10g10500
LOC_Os10g35580  LOC_Os08g33082  LOC_Os08g17600  LOC_Os07g41180  LOC_Os09g38530  LOC_Os10g28040
LOC_Os12g38970  LOC_Os08g15040  LOC_Os09g12570  LOC_Os11g42790  LOC_Os12g43940  LOC_Os08g34970
LOC_Os08g21760  LOC_Os08g44090  LOC_Os09g07900  LOC_Os11g07870  LOC_Os11g43950  LOC_Os11g07922
LOC_Os10g32880  LOC_Os09g34970  LOC_Os08g31840  LOC_Os09g21770  LOC_Os12g19549  LOC_Os11g07930
LOC_Os12g37590  LOC_Os09g39420  LOC_Os08g08080  LOC_Os07g43120  LOC_Os09g34040  LOC_Os12g07950
LOC_Os07g43360  LOC_Os10g40140  LOC_Os09g36920  LOC_Os10g30100  LOC_Os10g34670  LOC_Os08g31460
LOC_Os08g36440  LOC_Os12g41400  LOC_Os08g39140  LOC_Os08g08040  LOC_Os08g09200  LOC_Os09g02700
LOC_Os08g18110  LOC_Os12g35030  LOC_Os08g25010  LOC_Os10g31000  LOC_Os10g41520  LOC_Os08g44770
LOC_Os12g07050  LOC_Os08g01070  LOC_Os12g08740  LOC_Os09g02170  LOC_Os10g21910  LOC_Os09g28900
LOC_Os11g20384  LOC_Os09g11450  LOC_Os12g42876  LOC_Os10g42420  LOC_Os09g37000  LOC_Os09g02284
LOC_Os09g06560  LOC_Os09g27960  LOC_Os12g27070  LOC_Os11g43640  LOC_Os03g51430   LOC_Os03g42320
LOC_Os05g05260   LOC_Os05g48620   LOC_Os03g28140   LOC_Os03g58700   LOC_Os02g03450   LOC_Os03g64190
LOC_Os02g51770   LOC_Os01g18860   LOC_Os01g47540   LOC_Os03g08050   LOC_Os03g50740   LOC_Os05g12330
LOC_Os02g57854   LOC_Os01g60360   LOC_Os01g48920   LOC_Os03g63410   LOC_Os03g09140   LOC_Os01g73310
LOC_Os07g20544   LOC_Os01g60410   LOC_Os01g12880   LOC_Os03g17990   LOC_Os03g27450   LOC_Os06g29790
LOC_Os04g31950   LOC_Os06g48570   LOC_Os05g13630   LOC_Os03g51140   LOC_Os05g38530   LOC_Os04g58350
LOC_Os04g23890   LOC_Os01g23630   LOC_Os07g16970   LOC_Os01g70060   LOC_Os07g19494   LOC_Os02g57660
LOC_Os01g56620   LOC_Os03g18080   LOC_Os02g07750   LOC_Os02g50620   LOC_Os06g07210   LOC_Os02g04160
LOC_Os02g42040   LOC_Os05g19270   LOC_Os05g41210   LOC_Os07g07040   LOC_Os01g01080   LOC_Os04g52340
LOC_Os01g61710   LOC_Os02g50760   LOC_Os01g71710   LOC_Os03g25260   LOC_Os03g50350   LOC_Os04g13470
LOC_Os02g58510   LOC_Os03g07850   LOC_Os05g24594   LOC_Os01g23590   LOC_Os03g43020   LOC_Os02g07870
LOC_Os01g03020   LOC_Os03g50390   LOC_Os02g55950   LOC_Os04g54330   LOC_Os06g43210   LOC_Os01g32880
LOC_Os04g01970   LOC_Os03g01216   LOC_Os03g20460   LOC_Os01g64690   LOC_Os04g56730   LOC_Os06g49460
LOC_Os01g64650   LOC_Os01g37800   LOC_Os03g44200   LOC_Os07g29360   LOC_Os03g08010   LOC_Os07g07240
LOC_Os03g42770   LOC_Os05g51490   LOC_Os04g30730   LOC_Os05g19970   LOC_Os02g13640   LOC_Os06g07878
LOC_Os02g16550   LOC_Os06g08770   LOC_Os01g12730   LOC_Os05g47980   LOC_Os05g01020   LOC_Os01g62244
LOC_Os03g26440   LOC_Os06g37440   LOC_Os07g03160   LOC_Os07g27310   LOC_Os02g45180   LOC_Os04g48410
LOC_Os04g37690   LOC_Os06g41590   LOC_Os05g27320   LOC_Os03g46390   LOC_Os05g05740   LOC_Os03g46090
LOC_Os02g34510   LOC_Os04g54940   LOC_Os03g03710   LOC_Os05g32600   LOC_Os01g61930   LOC_Os05g05200
LOC_Os03g04410   LOC_Os02g14860   LOC_Os03g24900   LOC_Os03g15650   LOC_Os02g10060   LOC_Os03g56460
LOC_Os03g17790   LOC_Os06g21390   LOC_Os07g10600   LOC_Os01g01312   LOC_Os01g56980   LOC_Os06g04580
LOC_Os03g45920   LOC_Os03g05300   LOC_Os01g01960   LOC_Os04g28180   LOC_Os05g38610   LOC_Os03g16860
LOC_Os03g10990   LOC_Os03g12710   LOC_Os07g06980   LOC_Os03g08140   LOC_Os01g48210   LOC_Os01g05500
LOC_Os06g11790   LOC_Os05g41220   LOC_Os01g33040   LOC_Os05g32720   LOC_Os01g55300   LOC_Os01g48280
LOC_Os01g61860   LOC_Os06g04500   LOC_Os05g28950   LOC_Os01g60440   LOC_Os03g16110   LOC_Os07g10150
LOC_Os03g51540   LOC_Os03g57450   LOC_Os05g46560   LOC_Os03g15590   LOC_Os02g28810   LOC_Os06g11640
LOC_Os05g06350   LOC_Os03g23909   LOC_Os04g46450   LOC_Os01g56550   LOC_Os05g44310   LOC_Os01g15310
LOC_Os01g74460   LOC_Os02g51780   LOC_Os03g53700   LOC_Os01g08400   LOC_Os01g16540   LOC_Os03g20340
LOC_Os01g67740   LOC_Os01g74180   LOC_Os03g08300   LOC_Os02g27110   LOC_Os07g22220   LOC_Os01g64280
LOC_Os01g40840   LOC_Os02g01740   LOC_Os06g02570   LOC_Os05g08970   LOC_Os03g01810   LOC_Os07g30300
LOC_Os01g51220   LOC_Os04g55040   LOC_Os03g63710   LOC_Os03g53190   LOC_Os06g43790   LOC_Os07g28940
LOC_Os03g03150   LOC_Os06g40630   LOC_Os05g43570   LOC_Os04g58800   LOC_Os03g56820   LOC_Os03g44780
LOC_Os03g63940   LOC_Os04g55210   LOC_Os04g38610   LOC_Os03g08020   LOC_Os07g02350   LOC_Os05g13330
LOC_Os01g54010   LOC_Os01g60660   LOC_Os05g36150   LOC_Os03g18510   LOC_Os03g22690   LOC_Os04g52940
LOC_Os01g56590   LOC_Os04g36810   LOC_Os03g10340   LOC_Os04g37950   LOC_Os02g05630   LOC_Os04g09860
LOC_Os01g62080   LOC_Os04g36560   LOC_Os06g30970   LOC_Os02g27950   LOC_Os03g57790   LOC_Os02g39890
LOC_Os04g26841   LOC_Os03g17020   LOC_Os04g56510   LOC_Os02g55880   LOC_Os06g38470   LOC_Os03g63400
LOC_Os01g11300   LOC_Os02g30050   LOC_Os06g07978   LOC_Os07g08170   LOC_Os04g11880   LOC_Os01g04260
LOC_Os06g14510   LOC_Os04g20220   LOC_Os01g73760   LOC_Os01g27630   LOC_Os03g53720   LOC_Os03g28960
LOC_Os02g30624   LOC_Os03g30460   LOC_Os06g08480   LOC_Os05g33390   LOC_Os01g73230   LOC_Os05g48030
LOC_Os02g11830   LOC_Os05g45420   LOC_Os01g72205

Database Links
UniprotKB	Q8H4Q9
Ensembl	LOC_Os07g31370.1
Refseq	NP_001059699.1
EMBL	AP003956 AP008213
KEGG	osa:4343293 dosa:Os07t0496000-01