RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os06g04580 View Network
Names	Os06g0137300 protein (Putative TAF14b)
Function	transcription factor TFIIF, putative, expressed
Attributes	Length: 317 Status: Complete Existence: Predicted Molecular Weight: 34916.5 pI: 6.611 Subcellular Location (predicted): Chloroplast Nucleus
Gene Model	LOC_Os06g04580.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g30060 LOC_Os07g32400 LOC_Os07g03160 LOC_Os08g09320 LOC_Os06g08770 LOC_Os07g36130 LOC_Os09g33980 LOC_Os08g05890 LOC_Os08g02860 LOC_Os09g32680 LOC_Os10g41520 LOC_Os12g35030 LOC_Os09g21770 LOC_Os08g08060 LOC_Os07g22220 LOC_Os07g08170 LOC_Os06g44030 LOC_Os09g06560 LOC_Os09g01640 LOC_Os09g39420 LOC_Os07g37640 LOC_Os06g07878 LOC_Os07g30300 LOC_Os12g37590 LOC_Os12g38970 LOC_Os07g45064 LOC_Os07g30980 LOC_Os07g31370 LOC_Os10g41450 LOC_Os08g08080 LOC_Os10g34670 LOC_Os06g06090 LOC_Os12g08740 LOC_Os07g06980 LOC_Os09g38020 LOC_Os08g38570 LOC_Os10g35580 LOC_Os07g46660 LOC_Os07g41800 LOC_Os06g43790 LOC_Os06g04580 LOC_Os11g42160 LOC_Os06g38470 LOC_Os07g41180 LOC_Os07g32480 LOC_Os12g09000 LOC_Os10g28040 LOC_Os12g43940 LOC_Os08g08220 LOC_Os07g30240 LOC_Os07g43360 LOC_Os01g43030 LOC_Os04g48410 LOC_Os03g51550 LOC_Os02g55300 LOC_Os03g28140 LOC_Os05g01500 LOC_Os04g40940 LOC_Os04g01970 LOC_Os03g57450 LOC_Os05g32720 LOC_Os03g57210 LOC_Os04g46450 LOC_Os02g49590 LOC_Os02g57690 LOC_Os03g25260 LOC_Os04g40840 LOC_Os04g36810 LOC_Os04g53760 LOC_Os03g46390 LOC_Os02g02510 LOC_Os03g29470 LOC_Os03g57790 LOC_Os01g72790 LOC_Os01g48210 LOC_Os03g19059 LOC_Os02g15220 LOC_Os03g18080 LOC_Os05g19270 LOC_Os05g46270 LOC_Os04g54330 LOC_Os03g61110 LOC_Os03g53190 LOC_Os02g14860 LOC_Os05g46330 LOC_Os04g39040 LOC_Os01g39260 LOC_Os01g62820 LOC_Os03g06200 LOC_Os03g15810 LOC_Os01g01960 LOC_Os04g01130 LOC_Os01g73310 LOC_Os03g43020 LOC_Os04g38870 LOC_Os02g51490 LOC_Os04g09860 LOC_Os01g23630 LOC_Os02g14110 LOC_Os01g60410 LOC_Os04g40830 LOC_Os02g43920 LOC_Os03g07080 LOC_Os01g47600 LOC_Os03g32590 LOC_Os05g48030 LOC_Os06g04580 LOC_Os02g39800 LOC_Os02g32490 LOC_Os03g57760 LOC_Os03g53960 LOC_Os03g51600 LOC_Os03g04980 LOC_Os02g30624 LOC_Os02g13990 LOC_Os03g10990 LOC_Os03g07850 LOC_Os02g39890

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g30060  LOC_Os07g32400  LOC_Os07g03160  LOC_Os08g09320  LOC_Os06g08770  LOC_Os07g36130
LOC_Os09g33980  LOC_Os08g05890  LOC_Os08g02860  LOC_Os09g32680  LOC_Os10g41520  LOC_Os12g35030
LOC_Os09g21770  LOC_Os08g08060  LOC_Os07g22220  LOC_Os07g08170  LOC_Os06g44030  LOC_Os09g06560
LOC_Os09g01640  LOC_Os09g39420  LOC_Os07g37640  LOC_Os06g07878  LOC_Os07g30300  LOC_Os12g37590
LOC_Os12g38970  LOC_Os07g45064  LOC_Os07g30980  LOC_Os07g31370  LOC_Os10g41450  LOC_Os08g08080
LOC_Os10g34670  LOC_Os06g06090  LOC_Os12g08740  LOC_Os07g06980  LOC_Os09g38020  LOC_Os08g38570
LOC_Os10g35580  LOC_Os07g46660  LOC_Os07g41800  LOC_Os06g43790  LOC_Os06g04580  LOC_Os11g42160
LOC_Os06g38470  LOC_Os07g41180  LOC_Os07g32480  LOC_Os12g09000  LOC_Os10g28040  LOC_Os12g43940
LOC_Os08g08220  LOC_Os07g30240  LOC_Os07g43360  LOC_Os01g43030   LOC_Os04g48410   LOC_Os03g51550
LOC_Os02g55300   LOC_Os03g28140   LOC_Os05g01500   LOC_Os04g40940   LOC_Os04g01970   LOC_Os03g57450
LOC_Os05g32720   LOC_Os03g57210   LOC_Os04g46450   LOC_Os02g49590   LOC_Os02g57690   LOC_Os03g25260
LOC_Os04g40840   LOC_Os04g36810   LOC_Os04g53760   LOC_Os03g46390   LOC_Os02g02510   LOC_Os03g29470
LOC_Os03g57790   LOC_Os01g72790   LOC_Os01g48210   LOC_Os03g19059   LOC_Os02g15220   LOC_Os03g18080
LOC_Os05g19270   LOC_Os05g46270   LOC_Os04g54330   LOC_Os03g61110   LOC_Os03g53190   LOC_Os02g14860
LOC_Os05g46330   LOC_Os04g39040   LOC_Os01g39260   LOC_Os01g62820   LOC_Os03g06200   LOC_Os03g15810
LOC_Os01g01960   LOC_Os04g01130   LOC_Os01g73310   LOC_Os03g43020   LOC_Os04g38870   LOC_Os02g51490
LOC_Os04g09860   LOC_Os01g23630   LOC_Os02g14110   LOC_Os01g60410   LOC_Os04g40830   LOC_Os02g43920
LOC_Os03g07080   LOC_Os01g47600   LOC_Os03g32590   LOC_Os05g48030   LOC_Os06g04580   LOC_Os02g39800
LOC_Os02g32490   LOC_Os03g57760   LOC_Os03g53960   LOC_Os03g51600   LOC_Os03g04980   LOC_Os02g30624
LOC_Os02g13990   LOC_Os03g10990   LOC_Os03g07850   LOC_Os02g39890

Database Links
UniprotKB	Q5VPH6
Ensembl	LOC_Os06g04580.1
Refseq	NP_001056732.1
EMBL	AP003526 AP003708 AP008212
KEGG	osa:4340047 dosa:Os06t0137300-01