RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os10g41450 View Network
Names	Mediator complex subunit SOH1, putative, expressed (Os10g0564100 protein) (Putative uncharacterized protein OSJNBa0027P10.17) (cDNA clone:J023012G10, full insert sequence)
Function	mediator of RNA polymerase II transcription subunit 31, putative, expressed
Attributes	Length: 203 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 22740.3 pI: 9.7528 Subcellular Location (predicted): Cytosol Nucleus
Gene Model	LOC_Os10g41450.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g30060 LOC_Os11g13540 LOC_Os10g42250 LOC_Os11g03430 LOC_Os10g41520 LOC_Os12g43100 LOC_Os12g12860 LOC_Os11g34200 LOC_Os12g07050 LOC_Os10g42950 LOC_Os02g45180 LOC_Os01g68760 LOC_Os02g12794 LOC_Os04g46450 LOC_Os08g29500 LOC_Os09g06560 LOC_Os06g11370 LOC_Os04g36700 LOC_Os02g10050 LOC_Os03g13970 LOC_Os06g47840 LOC_Os06g42720 LOC_Os05g48030 LOC_Os03g01230 LOC_Os04g48410 LOC_Os02g32570 LOC_Os03g10990 LOC_Os01g48280 LOC_Os03g46390 LOC_Os03g63430 LOC_Os09g15320 LOC_Os03g28140 LOC_Os03g07080 LOC_Os06g44030 LOC_Os03g53960 LOC_Os03g44484 LOC_Os09g32680 LOC_Os04g54350 LOC_Os03g57790 LOC_Os01g63940 LOC_Os06g43790 LOC_Os10g26660 LOC_Os04g56640 LOC_Os06g37180 LOC_Os05g05860 LOC_Os04g54340 LOC_Os02g14860 LOC_Os01g01960 LOC_Os01g47600 LOC_Os03g53190 LOC_Os01g10280 LOC_Os07g36130 LOC_Os06g10620 LOC_Os01g12560 LOC_Os02g58220 LOC_Os10g31940 LOC_Os05g43770 LOC_Os08g09320 LOC_Os10g10990 LOC_Os06g02570 LOC_Os02g37920 LOC_Os09g35920 LOC_Os03g10750 LOC_Os02g51780 LOC_Os02g30624 LOC_Os07g10600 LOC_Os03g57760 LOC_Os09g19560 LOC_Os06g04580 LOC_Os03g29470 LOC_Os07g46660 LOC_Os04g09860 LOC_Os03g08050 LOC_Os03g56820 LOC_Os02g39830 LOC_Os01g01120 LOC_Os07g30240 LOC_Os03g49730 LOC_Os03g08640 LOC_Os05g46330 LOC_Os02g55300 LOC_Os02g53500 LOC_Os05g29010 LOC_Os10g28040 LOC_Os07g07240 LOC_Os01g68940 LOC_Os04g40290 LOC_Os07g03160 LOC_Os08g39140 LOC_Os07g41180 LOC_Os08g08040 LOC_Os10g35290 LOC_Os05g06700 LOC_Os03g15810 LOC_Os02g53230 LOC_Os04g01970 LOC_Os01g68770 LOC_Os02g56270 LOC_Os03g05300 LOC_Os02g39800 LOC_Os06g06510 LOC_Os04g40840 LOC_Os10g34670 LOC_Os09g36440 LOC_Os04g57370 LOC_Os09g02284 LOC_Os07g43060 LOC_Os08g38570 LOC_Os03g51140 LOC_Os01g60410 LOC_Os06g38470 LOC_Os01g48210 LOC_Os02g12800 LOC_Os02g26440 LOC_Os02g29464 LOC_Os09g21770 LOC_Os08g39160 LOC_Os03g43020 LOC_Os02g54120 LOC_Os02g56130 LOC_Os02g53520 LOC_Os04g50660 LOC_Os01g15490 LOC_Os06g47320 LOC_Os02g02510

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g30060  LOC_Os11g13540  LOC_Os10g42250  LOC_Os11g03430  LOC_Os10g41520  LOC_Os12g43100
LOC_Os12g12860  LOC_Os11g34200  LOC_Os12g07050  LOC_Os10g42950  LOC_Os02g45180   LOC_Os01g68760
LOC_Os02g12794   LOC_Os04g46450   LOC_Os08g29500   LOC_Os09g06560   LOC_Os06g11370   LOC_Os04g36700
LOC_Os02g10050   LOC_Os03g13970   LOC_Os06g47840   LOC_Os06g42720   LOC_Os05g48030   LOC_Os03g01230
LOC_Os04g48410   LOC_Os02g32570   LOC_Os03g10990   LOC_Os01g48280   LOC_Os03g46390   LOC_Os03g63430
LOC_Os09g15320   LOC_Os03g28140   LOC_Os03g07080   LOC_Os06g44030   LOC_Os03g53960   LOC_Os03g44484
LOC_Os09g32680   LOC_Os04g54350   LOC_Os03g57790   LOC_Os01g63940   LOC_Os06g43790   LOC_Os10g26660
LOC_Os04g56640   LOC_Os06g37180   LOC_Os05g05860   LOC_Os04g54340   LOC_Os02g14860   LOC_Os01g01960
LOC_Os01g47600   LOC_Os03g53190   LOC_Os01g10280   LOC_Os07g36130   LOC_Os06g10620   LOC_Os01g12560
LOC_Os02g58220   LOC_Os10g31940   LOC_Os05g43770   LOC_Os08g09320   LOC_Os10g10990   LOC_Os06g02570
LOC_Os02g37920   LOC_Os09g35920   LOC_Os03g10750   LOC_Os02g51780   LOC_Os02g30624   LOC_Os07g10600
LOC_Os03g57760   LOC_Os09g19560   LOC_Os06g04580   LOC_Os03g29470   LOC_Os07g46660   LOC_Os04g09860
LOC_Os03g08050   LOC_Os03g56820   LOC_Os02g39830   LOC_Os01g01120   LOC_Os07g30240   LOC_Os03g49730
LOC_Os03g08640   LOC_Os05g46330   LOC_Os02g55300   LOC_Os02g53500   LOC_Os05g29010   LOC_Os10g28040
LOC_Os07g07240   LOC_Os01g68940   LOC_Os04g40290   LOC_Os07g03160   LOC_Os08g39140   LOC_Os07g41180
LOC_Os08g08040   LOC_Os10g35290   LOC_Os05g06700   LOC_Os03g15810   LOC_Os02g53230   LOC_Os04g01970
LOC_Os01g68770   LOC_Os02g56270   LOC_Os03g05300   LOC_Os02g39800   LOC_Os06g06510   LOC_Os04g40840
LOC_Os10g34670   LOC_Os09g36440   LOC_Os04g57370   LOC_Os09g02284   LOC_Os07g43060   LOC_Os08g38570
LOC_Os03g51140   LOC_Os01g60410   LOC_Os06g38470   LOC_Os01g48210   LOC_Os02g12800   LOC_Os02g26440
LOC_Os02g29464   LOC_Os09g21770   LOC_Os08g39160   LOC_Os03g43020   LOC_Os02g54120   LOC_Os02g56130
LOC_Os02g53520   LOC_Os04g50660   LOC_Os01g15490   LOC_Os06g47320   LOC_Os02g02510

Database Links
UniprotKB	Q336R8
Ensembl	LOC_Os10g41450.1
Refseq	NP_001065408.1
EMBL	AC084763 DP000086 AP008216 AK069258
KEGG	osa:4349407 dosa:Os10t0564100-01