RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os12g07050 View Network
Names	Os12g0168200 protein (Ssu72-like protein, expressed) (cDNA clone:J023025N02, full insert sequence)
Function	RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase ssu72, putative, expressed
Attributes	Length: 201 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 23044.3 pI: 5.9579 Subcellular Location (predicted): Mitochondria
Gene Model	LOC_Os12g07050.1 LOC_Os12g07050.2 LOC_Os12g07050.3

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g07050 LOC_Os12g38970 LOC_Os12g35030 LOC_Os12g08280 LOC_Os12g13390 LOC_Os08g08830 LOC_Os07g42600 LOC_Os03g46480 LOC_Os12g07050 LOC_Os03g54091 LOC_Os05g22260 LOC_Os03g07850 LOC_Os01g73310 LOC_Os08g23320 LOC_Os05g31000 LOC_Os10g29560 LOC_Os05g05860 LOC_Os08g39500 LOC_Os03g25260 LOC_Os02g46150 LOC_Os01g34390 LOC_Os04g53760 LOC_Os04g46450 LOC_Os08g05830 LOC_Os01g68320 LOC_Os07g32800 LOC_Os05g51490 LOC_Os03g63590 LOC_Os06g21390 LOC_Os03g02680 LOC_Os05g13300 LOC_Os06g21470 LOC_Os03g09140 LOC_Os09g12710 LOC_Os04g56160 LOC_Os09g06560 LOC_Os02g44510 LOC_Os04g56800 LOC_Os07g15880 LOC_Os03g59470 LOC_Os11g03400 LOC_Os02g12360 LOC_Os05g32430 LOC_Os03g44484 LOC_Os08g09320 LOC_Os01g72790 LOC_Os09g36440 LOC_Os07g49320 LOC_Os01g39260 LOC_Os04g33060 LOC_Os03g16920 LOC_Os09g24440 LOC_Os11g04220 LOC_Os01g70060 LOC_Os04g38610 LOC_Os06g04500 LOC_Os07g49300 LOC_Os12g03090 LOC_Os03g21620 LOC_Os03g22340 LOC_Os10g35580 LOC_Os10g36880 LOC_Os03g16110 LOC_Os05g44310 LOC_Os03g14260 LOC_Os07g22220 LOC_Os03g63940 LOC_Os03g53190 LOC_Os05g46570 LOC_Os03g06760 LOC_Os01g72220 LOC_Os04g54940 LOC_Os06g08480 LOC_Os01g49290 LOC_Os02g13990 LOC_Os02g13110 LOC_Os10g41520 LOC_Os09g39590 LOC_Os05g28290 LOC_Os07g43060 LOC_Os07g31370 LOC_Os01g62440 LOC_Os05g32600 LOC_Os10g41450 LOC_Os03g55280 LOC_Os04g52940 LOC_Os05g48422 LOC_Os02g42040 LOC_Os02g39550 LOC_Os05g08360

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g07050  LOC_Os12g38970  LOC_Os12g35030  LOC_Os12g08280  LOC_Os12g13390  LOC_Os08g08830
LOC_Os07g42600   LOC_Os03g46480   LOC_Os12g07050   LOC_Os03g54091   LOC_Os05g22260   LOC_Os03g07850
LOC_Os01g73310   LOC_Os08g23320   LOC_Os05g31000   LOC_Os10g29560   LOC_Os05g05860   LOC_Os08g39500
LOC_Os03g25260   LOC_Os02g46150   LOC_Os01g34390   LOC_Os04g53760   LOC_Os04g46450   LOC_Os08g05830
LOC_Os01g68320   LOC_Os07g32800   LOC_Os05g51490   LOC_Os03g63590   LOC_Os06g21390   LOC_Os03g02680
LOC_Os05g13300   LOC_Os06g21470   LOC_Os03g09140   LOC_Os09g12710   LOC_Os04g56160   LOC_Os09g06560
LOC_Os02g44510   LOC_Os04g56800   LOC_Os07g15880   LOC_Os03g59470   LOC_Os11g03400   LOC_Os02g12360
LOC_Os05g32430   LOC_Os03g44484   LOC_Os08g09320   LOC_Os01g72790   LOC_Os09g36440   LOC_Os07g49320
LOC_Os01g39260   LOC_Os04g33060   LOC_Os03g16920   LOC_Os09g24440   LOC_Os11g04220   LOC_Os01g70060
LOC_Os04g38610   LOC_Os06g04500   LOC_Os07g49300   LOC_Os12g03090   LOC_Os03g21620   LOC_Os03g22340
LOC_Os10g35580   LOC_Os10g36880   LOC_Os03g16110   LOC_Os05g44310   LOC_Os03g14260   LOC_Os07g22220
LOC_Os03g63940   LOC_Os03g53190   LOC_Os05g46570   LOC_Os03g06760   LOC_Os01g72220   LOC_Os04g54940
LOC_Os06g08480   LOC_Os01g49290   LOC_Os02g13990   LOC_Os02g13110   LOC_Os10g41520   LOC_Os09g39590
LOC_Os05g28290   LOC_Os07g43060   LOC_Os07g31370   LOC_Os01g62440   LOC_Os05g32600   LOC_Os10g41450
LOC_Os03g55280   LOC_Os04g52940   LOC_Os05g48422   LOC_Os02g42040   LOC_Os02g39550   LOC_Os05g08360

Database Links
UniprotKB	Q2QX64
Ensembl	LOC_Os12g07050.1
Refseq	NP_001066253.1
EMBL	DP000011 AP008218 AK069543
KEGG	osa:4351607 dosa:Os12t0168200-01