RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os05g08360 View Network
Names	Os05g0176000 protein (Fragment)
Function	rRNA 2-O-methyltransferase fibrillarin 2, putative, expressed
Attributes	Length: 310 Status: Fragment Existence: Predicted Molecular Weight: 32573.1 pI: 10.8081 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os05g08360.1 LOC_Os05g08360.2

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os11g06750 LOC_Os11g19250 LOC_Os09g29630 LOC_Os11g38949 LOC_Os11g11070 LOC_Os07g36140 LOC_Os07g32430 LOC_Os10g32880 LOC_Os06g11370 LOC_Os08g18110 LOC_Os08g05880 LOC_Os12g42140 LOC_Os07g10350 LOC_Os06g48750 LOC_Os07g48920 LOC_Os11g11390 LOC_Os12g34510 LOC_Os07g31340 LOC_Os07g34740 LOC_Os07g33340 LOC_Os08g08080 LOC_Os07g20580 LOC_Os05g39960 LOC_Os05g51500 LOC_Os12g04010 LOC_Os06g37440 LOC_Os08g33082 LOC_Os05g22920 LOC_Os10g31520 LOC_Os07g41180 LOC_Os12g38000 LOC_Os12g03090 LOC_Os09g18320 LOC_Os09g37000 LOC_Os06g14190 LOC_Os07g12320 LOC_Os12g15420 LOC_Os08g37780 LOC_Os12g07300 LOC_Os11g24560 LOC_Os07g19494 LOC_Os08g31810 LOC_Os09g37860 LOC_Os09g35670 LOC_Os09g02810 LOC_Os10g08940 LOC_Os05g42300 LOC_Os09g08430 LOC_Os06g09570 LOC_Os07g41190 LOC_Os05g13630 LOC_Os07g38760 LOC_Os09g36920 LOC_Os05g30940 LOC_Os07g44790 LOC_Os11g16480 LOC_Os09g38030 LOC_Os05g19370 LOC_Os06g46770 LOC_Os10g35280 LOC_Os09g19560 LOC_Os09g02700 LOC_Os12g41930 LOC_Os12g21890 LOC_Os05g30530 LOC_Os08g09350 LOC_Os06g47350 LOC_Os06g43690 LOC_Os06g04300 LOC_Os10g08930 LOC_Os11g10100 LOC_Os11g48020 LOC_Os12g29660 LOC_Os07g01150 LOC_Os06g02510 LOC_Os05g49230 LOC_Os07g08030 LOC_Os07g46760 LOC_Os08g02410 LOC_Os10g39820 LOC_Os06g08480 LOC_Os05g44320 LOC_Os11g03400 LOC_Os11g38959 LOC_Os07g01870 LOC_Os07g25440 LOC_Os05g47980 LOC_Os12g06910 LOC_Os08g43640 LOC_Os07g46660 LOC_Os06g08800 LOC_Os07g19190 LOC_Os05g41100 LOC_Os11g37080 LOC_Os06g43790 LOC_Os05g48422 LOC_Os12g42150 LOC_Os07g36940 LOC_Os06g03780 LOC_Os05g42424 LOC_Os05g27940 LOC_Os07g10720 LOC_Os05g08360 LOC_Os10g25110 LOC_Os08g02400 LOC_Os12g07050 LOC_Os10g27190 LOC_Os05g46570 LOC_Os07g03160 LOC_Os07g44620 LOC_Os05g01990 LOC_Os01g68950 LOC_Os04g56670 LOC_Os03g25450 LOC_Os02g49270 LOC_Os01g67134 LOC_Os03g52470 LOC_Os03g22570 LOC_Os02g40514 LOC_Os02g27760 LOC_Os01g32750 LOC_Os03g14530 LOC_Os02g28810 LOC_Os02g52140 LOC_Os04g50660 LOC_Os02g54700 LOC_Os01g43030 LOC_Os02g53500 LOC_Os01g27990 LOC_Os03g61560 LOC_Os01g72790 LOC_Os01g64690 LOC_Os01g59730 LOC_Os02g03080 LOC_Os04g48930 LOC_Os03g58810 LOC_Os04g54330 LOC_Os03g19960 LOC_Os02g01350 LOC_Os02g14860 LOC_Os01g68940 LOC_Os03g26630 LOC_Os02g06640 LOC_Os03g21990 LOC_Os03g22740 LOC_Os02g53230 LOC_Os01g59500 LOC_Os02g26850 LOC_Os01g16190 LOC_Os02g18830 LOC_Os03g22880 LOC_Os02g57660 LOC_Os01g34200 LOC_Os01g51390 LOC_Os01g36920 LOC_Os04g34450 LOC_Os01g68310 LOC_Os01g36890 LOC_Os01g13730 LOC_Os01g40250 LOC_Os01g49330 LOC_Os02g49610 LOC_Os04g45930 LOC_Os03g05980 LOC_Os04g33750 LOC_Os03g61790 LOC_Os02g50370 LOC_Os01g33050 LOC_Os03g50090 LOC_Os03g28400 LOC_Os02g42230 LOC_Os03g26440 LOC_Os04g47240 LOC_Os04g50990 LOC_Os01g64090 LOC_Os02g14059 LOC_Os01g10820 LOC_Os04g46310 LOC_Os05g05260 LOC_Os01g59930 LOC_Os01g09890 LOC_Os03g18570 LOC_Os03g49210 LOC_Os02g04710 LOC_Os04g04320 LOC_Os03g10990 LOC_Os02g04560 LOC_Os02g57040 LOC_Os02g47140 LOC_Os01g49290 LOC_Os01g08770 LOC_Os03g21530 LOC_Os02g34600 LOC_Os02g48660 LOC_Os03g64190 LOC_Os01g60660 LOC_Os04g42270 LOC_Os02g35160 LOC_Os03g19059 LOC_Os05g01020 LOC_Os02g02360 LOC_Os04g35090 LOC_Os02g42040 LOC_Os02g55260 LOC_Os03g40180 LOC_Os01g01510 LOC_Os03g13800 LOC_Os02g37870 LOC_Os03g37970 LOC_Os01g73880 LOC_Os04g52960 LOC_Os02g06500 LOC_Os01g64970 LOC_Os02g05330 LOC_Os03g58720 LOC_Os01g61930 LOC_Os03g42770 LOC_Os04g59494 LOC_Os02g33140 LOC_Os04g42380 LOC_Os03g05720 LOC_Os03g22350 LOC_Os04g28180 LOC_Os03g60930 LOC_Os03g18580 LOC_Os03g23909 LOC_Os02g54110 LOC_Os05g08360 LOC_Os03g40110 LOC_Os03g58340 LOC_Os05g05660 LOC_Os04g43140

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os11g06750  LOC_Os11g19250  LOC_Os09g29630  LOC_Os11g38949  LOC_Os11g11070  LOC_Os07g36140
LOC_Os07g32430  LOC_Os10g32880  LOC_Os06g11370  LOC_Os08g18110  LOC_Os08g05880  LOC_Os12g42140
LOC_Os07g10350  LOC_Os06g48750  LOC_Os07g48920  LOC_Os11g11390  LOC_Os12g34510  LOC_Os07g31340
LOC_Os07g34740  LOC_Os07g33340  LOC_Os08g08080  LOC_Os07g20580  LOC_Os05g39960  LOC_Os05g51500
LOC_Os12g04010  LOC_Os06g37440  LOC_Os08g33082  LOC_Os05g22920  LOC_Os10g31520  LOC_Os07g41180
LOC_Os12g38000  LOC_Os12g03090  LOC_Os09g18320  LOC_Os09g37000  LOC_Os06g14190  LOC_Os07g12320
LOC_Os12g15420  LOC_Os08g37780  LOC_Os12g07300  LOC_Os11g24560  LOC_Os07g19494  LOC_Os08g31810
LOC_Os09g37860  LOC_Os09g35670  LOC_Os09g02810  LOC_Os10g08940  LOC_Os05g42300  LOC_Os09g08430
LOC_Os06g09570  LOC_Os07g41190  LOC_Os05g13630  LOC_Os07g38760  LOC_Os09g36920  LOC_Os05g30940
LOC_Os07g44790  LOC_Os11g16480  LOC_Os09g38030  LOC_Os05g19370  LOC_Os06g46770  LOC_Os10g35280
LOC_Os09g19560  LOC_Os09g02700  LOC_Os12g41930  LOC_Os12g21890  LOC_Os05g30530  LOC_Os08g09350
LOC_Os06g47350  LOC_Os06g43690  LOC_Os06g04300  LOC_Os10g08930  LOC_Os11g10100  LOC_Os11g48020
LOC_Os12g29660  LOC_Os07g01150  LOC_Os06g02510  LOC_Os05g49230  LOC_Os07g08030  LOC_Os07g46760
LOC_Os08g02410  LOC_Os10g39820  LOC_Os06g08480  LOC_Os05g44320  LOC_Os11g03400  LOC_Os11g38959
LOC_Os07g01870  LOC_Os07g25440  LOC_Os05g47980  LOC_Os12g06910  LOC_Os08g43640  LOC_Os07g46660
LOC_Os06g08800  LOC_Os07g19190  LOC_Os05g41100  LOC_Os11g37080  LOC_Os06g43790  LOC_Os05g48422
LOC_Os12g42150  LOC_Os07g36940  LOC_Os06g03780  LOC_Os05g42424  LOC_Os05g27940  LOC_Os07g10720
LOC_Os05g08360  LOC_Os10g25110  LOC_Os08g02400  LOC_Os12g07050  LOC_Os10g27190  LOC_Os05g46570
LOC_Os07g03160  LOC_Os07g44620  LOC_Os05g01990   LOC_Os01g68950   LOC_Os04g56670   LOC_Os03g25450
LOC_Os02g49270   LOC_Os01g67134   LOC_Os03g52470   LOC_Os03g22570   LOC_Os02g40514   LOC_Os02g27760
LOC_Os01g32750   LOC_Os03g14530   LOC_Os02g28810   LOC_Os02g52140   LOC_Os04g50660   LOC_Os02g54700
LOC_Os01g43030   LOC_Os02g53500   LOC_Os01g27990   LOC_Os03g61560   LOC_Os01g72790   LOC_Os01g64690
LOC_Os01g59730   LOC_Os02g03080   LOC_Os04g48930   LOC_Os03g58810   LOC_Os04g54330   LOC_Os03g19960
LOC_Os02g01350   LOC_Os02g14860   LOC_Os01g68940   LOC_Os03g26630   LOC_Os02g06640   LOC_Os03g21990
LOC_Os03g22740   LOC_Os02g53230   LOC_Os01g59500   LOC_Os02g26850   LOC_Os01g16190   LOC_Os02g18830
LOC_Os03g22880   LOC_Os02g57660   LOC_Os01g34200   LOC_Os01g51390   LOC_Os01g36920   LOC_Os04g34450
LOC_Os01g68310   LOC_Os01g36890   LOC_Os01g13730   LOC_Os01g40250   LOC_Os01g49330   LOC_Os02g49610
LOC_Os04g45930   LOC_Os03g05980   LOC_Os04g33750   LOC_Os03g61790   LOC_Os02g50370   LOC_Os01g33050
LOC_Os03g50090   LOC_Os03g28400   LOC_Os02g42230   LOC_Os03g26440   LOC_Os04g47240   LOC_Os04g50990
LOC_Os01g64090   LOC_Os02g14059   LOC_Os01g10820   LOC_Os04g46310   LOC_Os05g05260   LOC_Os01g59930
LOC_Os01g09890   LOC_Os03g18570   LOC_Os03g49210   LOC_Os02g04710   LOC_Os04g04320   LOC_Os03g10990
LOC_Os02g04560   LOC_Os02g57040   LOC_Os02g47140   LOC_Os01g49290   LOC_Os01g08770   LOC_Os03g21530
LOC_Os02g34600   LOC_Os02g48660   LOC_Os03g64190   LOC_Os01g60660   LOC_Os04g42270   LOC_Os02g35160
LOC_Os03g19059   LOC_Os05g01020   LOC_Os02g02360   LOC_Os04g35090   LOC_Os02g42040   LOC_Os02g55260
LOC_Os03g40180   LOC_Os01g01510   LOC_Os03g13800   LOC_Os02g37870   LOC_Os03g37970   LOC_Os01g73880
LOC_Os04g52960   LOC_Os02g06500   LOC_Os01g64970   LOC_Os02g05330   LOC_Os03g58720   LOC_Os01g61930
LOC_Os03g42770   LOC_Os04g59494   LOC_Os02g33140   LOC_Os04g42380   LOC_Os03g05720   LOC_Os03g22350
LOC_Os04g28180   LOC_Os03g60930   LOC_Os03g18580   LOC_Os03g23909   LOC_Os02g54110   LOC_Os05g08360
LOC_Os03g40110   LOC_Os03g58340   LOC_Os05g05660   LOC_Os04g43140

Database Links
UniprotKB	C7J2A5
Refseq	NP_001174240.1
EMBL	AP008211
KEGG	osa:9266224 dosa:Os05t0176000-01