RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os07g25440 View Network
Names	Os07g0435400 protein (cDNA clone:J013096A10, full insert sequence)
Function	WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed
Attributes	Length: 679 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 77221.7 pI: 6.1521 Subcellular Location (predicted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os07g25440.1 LOC_Os07g25440.2

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g44330 LOC_Os07g36140 LOC_Os12g21890 LOC_Os09g37860 LOC_Os07g46660 LOC_Os10g42950 LOC_Os11g03990 LOC_Os11g26850 LOC_Os10g22520 LOC_Os11g06750 LOC_Os07g41180 LOC_Os12g29660 LOC_Os08g09200 LOC_Os12g42150 LOC_Os09g08910 LOC_Os10g40140 LOC_Os08g31810 LOC_Os07g47420 LOC_Os07g47580 LOC_Os07g40930 LOC_Os12g07950 LOC_Os10g41960 LOC_Os12g12860 LOC_Os10g22570 LOC_Os11g04180 LOC_Os11g29400 LOC_Os09g02810 LOC_Os12g09000 LOC_Os08g44260 LOC_Os07g29320 LOC_Os08g05850 LOC_Os09g20820 LOC_Os12g03822 LOC_Os07g44620 LOC_Os12g06810 LOC_Os11g01420 LOC_Os11g41160 LOC_Os10g32550 LOC_Os12g42876 LOC_Os09g12270 LOC_Os10g35280 LOC_Os12g34510 LOC_Os08g32090 LOC_Os07g25440 LOC_Os07g44710 LOC_Os09g33980 LOC_Os10g25110 LOC_Os08g05890 LOC_Os01g33030 LOC_Os03g51900 LOC_Os01g59360 LOC_Os01g68950 LOC_Os03g08020 LOC_Os03g22350 LOC_Os03g16030 LOC_Os05g02400 LOC_Os02g49610 LOC_Os04g25550 LOC_Os03g45320 LOC_Os01g68940 LOC_Os03g08050 LOC_Os03g04410 LOC_Os03g16130 LOC_Os01g33050 LOC_Os07g19190 LOC_Os04g34984 LOC_Os04g53770 LOC_Os05g04550 LOC_Os05g05470 LOC_Os04g43140 LOC_Os04g36890 LOC_Os05g47980 LOC_Os01g71960 LOC_Os03g60930 LOC_Os03g02980 LOC_Os03g02260 LOC_Os03g16860 LOC_Os02g53420 LOC_Os06g30320 LOC_Os01g64970 LOC_Os05g48422 LOC_Os03g58720 LOC_Os04g58580 LOC_Os01g16520 LOC_Os02g49270 LOC_Os03g58810 LOC_Os03g19960 LOC_Os03g22740 LOC_Os05g30420 LOC_Os01g27730 LOC_Os02g37870 LOC_Os04g54330 LOC_Os07g10350 LOC_Os06g14510 LOC_Os07g08330 LOC_Os05g42300 LOC_Os05g13950 LOC_Os03g16020 LOC_Os02g21970 LOC_Os06g04600 LOC_Os06g01934 LOC_Os03g54780 LOC_Os07g12320 LOC_Os03g49210 LOC_Os04g42270 LOC_Os04g56350 LOC_Os01g05500 LOC_Os01g54870 LOC_Os03g56460 LOC_Os03g25450 LOC_Os01g07080 LOC_Os03g61560 LOC_Os02g51590 LOC_Os03g16110 LOC_Os06g02144 LOC_Os05g08360 LOC_Os03g59020 LOC_Os03g05730 LOC_Os03g23020 LOC_Os03g53190 LOC_Os06g09570 LOC_Os02g12850 LOC_Os07g02350 LOC_Os02g39030 LOC_Os07g25440 LOC_Os05g38530 LOC_Os06g01980 LOC_Os03g08010 LOC_Os01g71230 LOC_Os02g34600

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g44330  LOC_Os07g36140  LOC_Os12g21890  LOC_Os09g37860  LOC_Os07g46660  LOC_Os10g42950
LOC_Os11g03990  LOC_Os11g26850  LOC_Os10g22520  LOC_Os11g06750  LOC_Os07g41180  LOC_Os12g29660
LOC_Os08g09200  LOC_Os12g42150  LOC_Os09g08910  LOC_Os10g40140  LOC_Os08g31810  LOC_Os07g47420
LOC_Os07g47580  LOC_Os07g40930  LOC_Os12g07950  LOC_Os10g41960  LOC_Os12g12860  LOC_Os10g22570
LOC_Os11g04180  LOC_Os11g29400  LOC_Os09g02810  LOC_Os12g09000  LOC_Os08g44260  LOC_Os07g29320
LOC_Os08g05850  LOC_Os09g20820  LOC_Os12g03822  LOC_Os07g44620  LOC_Os12g06810  LOC_Os11g01420
LOC_Os11g41160  LOC_Os10g32550  LOC_Os12g42876  LOC_Os09g12270  LOC_Os10g35280  LOC_Os12g34510
LOC_Os08g32090  LOC_Os07g25440  LOC_Os07g44710  LOC_Os09g33980  LOC_Os10g25110  LOC_Os08g05890
LOC_Os01g33030   LOC_Os03g51900   LOC_Os01g59360   LOC_Os01g68950   LOC_Os03g08020   LOC_Os03g22350
LOC_Os03g16030   LOC_Os05g02400   LOC_Os02g49610   LOC_Os04g25550   LOC_Os03g45320   LOC_Os01g68940
LOC_Os03g08050   LOC_Os03g04410   LOC_Os03g16130   LOC_Os01g33050   LOC_Os07g19190   LOC_Os04g34984
LOC_Os04g53770   LOC_Os05g04550   LOC_Os05g05470   LOC_Os04g43140   LOC_Os04g36890   LOC_Os05g47980
LOC_Os01g71960   LOC_Os03g60930   LOC_Os03g02980   LOC_Os03g02260   LOC_Os03g16860   LOC_Os02g53420
LOC_Os06g30320   LOC_Os01g64970   LOC_Os05g48422   LOC_Os03g58720   LOC_Os04g58580   LOC_Os01g16520
LOC_Os02g49270   LOC_Os03g58810   LOC_Os03g19960   LOC_Os03g22740   LOC_Os05g30420   LOC_Os01g27730
LOC_Os02g37870   LOC_Os04g54330   LOC_Os07g10350   LOC_Os06g14510   LOC_Os07g08330   LOC_Os05g42300
LOC_Os05g13950   LOC_Os03g16020   LOC_Os02g21970   LOC_Os06g04600   LOC_Os06g01934   LOC_Os03g54780
LOC_Os07g12320   LOC_Os03g49210   LOC_Os04g42270   LOC_Os04g56350   LOC_Os01g05500   LOC_Os01g54870
LOC_Os03g56460   LOC_Os03g25450   LOC_Os01g07080   LOC_Os03g61560   LOC_Os02g51590   LOC_Os03g16110
LOC_Os06g02144   LOC_Os05g08360   LOC_Os03g59020   LOC_Os03g05730   LOC_Os03g23020   LOC_Os03g53190
LOC_Os06g09570   LOC_Os02g12850   LOC_Os07g02350   LOC_Os02g39030   LOC_Os07g25440   LOC_Os05g38530
LOC_Os06g01980   LOC_Os03g08010   LOC_Os01g71230   LOC_Os02g34600

Database Links
UniprotKB	Q0D6V7
Ensembl	LOC_Os07g25440.1
Refseq	NP_001059502.1
EMBL	AP008213 AK111603 CM000144
KEGG	osa:4343071 dosa:Os07t0435400-01