RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os07g08330 View Network
Names	Os07g0180900 protein (Fragment)
Function	ribosomal protein L4, putative, expressed
Attributes	Length: 406 Status: Fragment Existence: Predicted Molecular Weight: 44738.9 pI: 11.2263 Subcellular Location (adjusted): Cytosol Chloroplast
Gene Model	LOC_Os07g08330.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os11g16480 LOC_Os11g29190 LOC_Os10g40140 LOC_Os09g08430 LOC_Os11g11070 LOC_Os10g42320 LOC_Os11g38949 LOC_Os08g37780 LOC_Os11g03400 LOC_Os07g46370 LOC_Os12g31840 LOC_Os11g11390 LOC_Os12g42150 LOC_Os11g24560 LOC_Os09g16380 LOC_Os10g34750 LOC_Os08g43170 LOC_Os10g17280 LOC_Os12g36950 LOC_Os10g28040 LOC_Os10g21910 LOC_Os07g22700 LOC_Os09g31180 LOC_Os09g29630 LOC_Os11g04070 LOC_Os07g33340 LOC_Os12g07350 LOC_Os07g36940 LOC_Os11g34350 LOC_Os09g39220 LOC_Os12g03090 LOC_Os10g32920 LOC_Os07g26740 LOC_Os11g06750 LOC_Os10g41410 LOC_Os07g33997 LOC_Os09g16330 LOC_Os11g48020 LOC_Os07g34740 LOC_Os07g10350 LOC_Os09g32532 LOC_Os12g34510 LOC_Os09g27420 LOC_Os12g38000 LOC_Os07g10720 LOC_Os09g30412 LOC_Os07g33898 LOC_Os10g27190 LOC_Os07g29360 LOC_Os10g42790 LOC_Os09g38030 LOC_Os08g02860 LOC_Os07g42450 LOC_Os11g38959 LOC_Os07g43980 LOC_Os09g33780 LOC_Os10g01540 LOC_Os07g33330 LOC_Os07g44620 LOC_Os09g26340 LOC_Os12g42370 LOC_Os09g30150 LOC_Os12g38380 LOC_Os07g25440 LOC_Os07g44790 LOC_Os07g36500 LOC_Os09g36440 LOC_Os11g37080 LOC_Os07g33921 LOC_Os12g42140 LOC_Os07g40930 LOC_Os09g37860 LOC_Os07g38760 LOC_Os07g39870 LOC_Os08g41300 LOC_Os09g18320 LOC_Os08g05490 LOC_Os08g38720 LOC_Os12g39070 LOC_Os08g34720 LOC_Os08g32650 LOC_Os08g37350 LOC_Os09g02810 LOC_Os08g45040 LOC_Os12g29580 LOC_Os09g08910 LOC_Os08g23110 LOC_Os09g21110 LOC_Os07g31340 LOC_Os07g47580 LOC_Os08g23710 LOC_Os12g13950 LOC_Os10g32820 LOC_Os07g33880 LOC_Os07g36140 LOC_Os09g24220 LOC_Os07g49520 LOC_Os12g07300 LOC_Os08g05850 LOC_Os08g08200 LOC_Os11g20384 LOC_Os08g23320 LOC_Os08g08830 LOC_Os08g05890 LOC_Os11g01420 LOC_Os11g43620 LOC_Os11g34305 LOC_Os07g45360 LOC_Os07g40580 LOC_Os07g46660 LOC_Os08g31810 LOC_Os07g42950 LOC_Os09g19734 LOC_Os09g32976 LOC_Os11g07500 LOC_Os12g30540 LOC_Os07g41180 LOC_Os09g03890 LOC_Os07g47420 LOC_Os10g31520 LOC_Os07g08330 LOC_Os08g45010 LOC_Os10g39410 LOC_Os09g38020 LOC_Os07g33979 LOC_Os07g12250 LOC_Os09g07510 LOC_Os10g35280 LOC_Os10g29560 LOC_Os09g39590 LOC_Os01g45190 LOC_Os02g49270 LOC_Os03g25450 LOC_Os03g18570 LOC_Os01g08200 LOC_Os06g14190 LOC_Os03g42900 LOC_Os01g57930 LOC_Os03g32526 LOC_Os01g51200 LOC_Os04g31950 LOC_Os05g38810 LOC_Os03g10340 LOC_Os05g22260 LOC_Os03g50090 LOC_Os03g37970 LOC_Os03g60939 LOC_Os05g14550 LOC_Os05g46550 LOC_Os01g48920 LOC_Os05g23940 LOC_Os06g09570 LOC_Os04g55260 LOC_Os01g10050 LOC_Os05g06840 LOC_Os04g53370 LOC_Os03g44900 LOC_Os01g72220 LOC_Os03g19960 LOC_Os01g62350 LOC_Os03g18080 LOC_Os01g23630 LOC_Os01g33030 LOC_Os03g22740 LOC_Os03g40180 LOC_Os02g06592 LOC_Os05g51500 LOC_Os04g20220 LOC_Os05g30940 LOC_Os01g29070 LOC_Os05g42300 LOC_Os01g32880 LOC_Os03g29740 LOC_Os06g46770 LOC_Os01g61920 LOC_Os03g18550 LOC_Os02g45940 LOC_Os02g49610 LOC_Os03g38000 LOC_Os01g59990 LOC_Os05g19370 LOC_Os01g72790 LOC_Os04g43140 LOC_Os06g02620 LOC_Os02g52940 LOC_Os05g44320 LOC_Os03g22890 LOC_Os02g52920 LOC_Os05g23600 LOC_Os01g68950 LOC_Os02g39300 LOC_Os01g14040 LOC_Os04g58710 LOC_Os03g05980 LOC_Os04g55040 LOC_Os01g34200 LOC_Os02g12800 LOC_Os01g74410 LOC_Os01g32750 LOC_Os02g08190 LOC_Os02g18380 LOC_Os01g16190 LOC_Os03g40110 LOC_Os04g32330 LOC_Os03g17310 LOC_Os03g29540 LOC_Os02g54110 LOC_Os01g49350 LOC_Os02g38300 LOC_Os01g49290 LOC_Os04g01130 LOC_Os06g48355 LOC_Os01g05950 LOC_Os06g04450 LOC_Os05g11770 LOC_Os01g62230 LOC_Os03g59590 LOC_Os03g47730 LOC_Os06g36770 LOC_Os06g50050 LOC_Os04g11880 LOC_Os01g43020 LOC_Os03g13370 LOC_Os03g04750 LOC_Os04g33750 LOC_Os02g40880 LOC_Os02g02530 LOC_Os03g02150 LOC_Os04g46310 LOC_Os02g04050 LOC_Os06g04600 LOC_Os05g37330 LOC_Os03g23950 LOC_Os04g35700 LOC_Os04g39700 LOC_Os01g41630 LOC_Os02g25060 LOC_Os02g30050 LOC_Os04g28180 LOC_Os02g40000 LOC_Os05g22940 LOC_Os02g49590 LOC_Os05g27940 LOC_Os06g36160 LOC_Os06g43790 LOC_Os01g22010 LOC_Os02g50760 LOC_Os05g48422 LOC_Os03g22180 LOC_Os03g31090 LOC_Os01g40280 LOC_Os06g36680 LOC_Os04g49420 LOC_Os01g48960 LOC_Os01g43030 LOC_Os01g68940 LOC_Os04g43540 LOC_Os02g56960 LOC_Os05g41060 LOC_Os01g05670 LOC_Os02g01350 LOC_Os03g10510 LOC_Os05g38740 LOC_Os02g28810 LOC_Os03g04590 LOC_Os01g64090 LOC_Os01g10820 LOC_Os05g42424 LOC_Os01g56980 LOC_Os02g37870 LOC_Os05g28510 LOC_Os03g14260 LOC_Os01g69920 LOC_Os02g26850 LOC_Os06g07580 LOC_Os03g28400 LOC_Os03g44200 LOC_Os06g35050 LOC_Os02g44810 LOC_Os06g29844 LOC_Os05g45310 LOC_Os03g60930 LOC_Os04g25360 LOC_Os06g04280 LOC_Os03g29460 LOC_Os02g27760 LOC_Os03g07080 LOC_Os03g02480 LOC_Os02g52860 LOC_Os04g04020 LOC_Os03g23020 LOC_Os05g38400 LOC_Os01g02090 LOC_Os06g01980 LOC_Os05g38520 LOC_Os02g14059 LOC_Os04g54330 LOC_Os04g42270 LOC_Os03g21940 LOC_Os03g51900 LOC_Os02g56014 LOC_Os02g23890 LOC_Os03g22350 LOC_Os06g48350 LOC_Os06g02510 LOC_Os03g58720 LOC_Os03g42770 LOC_Os04g46050 LOC_Os02g47140 LOC_Os04g58830 LOC_Os01g64690 LOC_Os06g41750 LOC_Os01g67250 LOC_Os05g51700 LOC_Os01g08540 LOC_Os04g42380 LOC_Os02g51150 LOC_Os04g52200 LOC_Os06g07120 LOC_Os01g67960 LOC_Os03g18580 LOC_Os02g13530 LOC_Os02g33140 LOC_Os02g39800 LOC_Os01g54870 LOC_Os01g06010 LOC_Os06g01934 LOC_Os03g51140 LOC_Os03g02780 LOC_Os07g01150 LOC_Os02g01490 LOC_Os02g13110 LOC_Os03g48930 LOC_Os02g30624 LOC_Os05g07050 LOC_Os03g49210 LOC_Os01g08770 LOC_Os03g36930 LOC_Os01g71230 LOC_Os01g69130 LOC_Os02g06640 LOC_Os05g39050 LOC_Os01g62840 LOC_Os06g01390 LOC_Os04g40730 LOC_Os01g01120 LOC_Os06g08480 LOC_Os05g32580 LOC_Os03g13970 LOC_Os02g48660 LOC_Os05g28280 LOC_Os01g07080 LOC_Os06g21470 LOC_Os02g06500 LOC_Os04g28420 LOC_Os03g52750 LOC_Os04g50990 LOC_Os01g04730 LOC_Os01g25880 LOC_Os03g08440 LOC_Os01g13430 LOC_Os05g02400 LOC_Os02g55260 LOC_Os07g08330 LOC_Os04g30730 LOC_Os01g15310 LOC_Os01g59730 LOC_Os04g30800 LOC_Os05g04510 LOC_Os01g27730 LOC_Os03g63730 LOC_Os07g01870 LOC_Os03g62730 LOC_Os01g01060 LOC_Os02g57070 LOC_Os02g12850 LOC_Os02g32690 LOC_Os03g61560 LOC_Os01g52490 LOC_Os04g56350 LOC_Os01g51010 LOC_Os05g30530 LOC_Os01g05970 LOC_Os03g58810

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os11g16480  LOC_Os11g29190  LOC_Os10g40140  LOC_Os09g08430  LOC_Os11g11070  LOC_Os10g42320
LOC_Os11g38949  LOC_Os08g37780  LOC_Os11g03400  LOC_Os07g46370  LOC_Os12g31840  LOC_Os11g11390
LOC_Os12g42150  LOC_Os11g24560  LOC_Os09g16380  LOC_Os10g34750  LOC_Os08g43170  LOC_Os10g17280
LOC_Os12g36950  LOC_Os10g28040  LOC_Os10g21910  LOC_Os07g22700  LOC_Os09g31180  LOC_Os09g29630
LOC_Os11g04070  LOC_Os07g33340  LOC_Os12g07350  LOC_Os07g36940  LOC_Os11g34350  LOC_Os09g39220
LOC_Os12g03090  LOC_Os10g32920  LOC_Os07g26740  LOC_Os11g06750  LOC_Os10g41410  LOC_Os07g33997
LOC_Os09g16330  LOC_Os11g48020  LOC_Os07g34740  LOC_Os07g10350  LOC_Os09g32532  LOC_Os12g34510
LOC_Os09g27420  LOC_Os12g38000  LOC_Os07g10720  LOC_Os09g30412  LOC_Os07g33898  LOC_Os10g27190
LOC_Os07g29360  LOC_Os10g42790  LOC_Os09g38030  LOC_Os08g02860  LOC_Os07g42450  LOC_Os11g38959
LOC_Os07g43980  LOC_Os09g33780  LOC_Os10g01540  LOC_Os07g33330  LOC_Os07g44620  LOC_Os09g26340
LOC_Os12g42370  LOC_Os09g30150  LOC_Os12g38380  LOC_Os07g25440  LOC_Os07g44790  LOC_Os07g36500
LOC_Os09g36440  LOC_Os11g37080  LOC_Os07g33921  LOC_Os12g42140  LOC_Os07g40930  LOC_Os09g37860
LOC_Os07g38760  LOC_Os07g39870  LOC_Os08g41300  LOC_Os09g18320  LOC_Os08g05490  LOC_Os08g38720
LOC_Os12g39070  LOC_Os08g34720  LOC_Os08g32650  LOC_Os08g37350  LOC_Os09g02810  LOC_Os08g45040
LOC_Os12g29580  LOC_Os09g08910  LOC_Os08g23110  LOC_Os09g21110  LOC_Os07g31340  LOC_Os07g47580
LOC_Os08g23710  LOC_Os12g13950  LOC_Os10g32820  LOC_Os07g33880  LOC_Os07g36140  LOC_Os09g24220
LOC_Os07g49520  LOC_Os12g07300  LOC_Os08g05850  LOC_Os08g08200  LOC_Os11g20384  LOC_Os08g23320
LOC_Os08g08830  LOC_Os08g05890  LOC_Os11g01420  LOC_Os11g43620  LOC_Os11g34305  LOC_Os07g45360
LOC_Os07g40580  LOC_Os07g46660  LOC_Os08g31810  LOC_Os07g42950  LOC_Os09g19734  LOC_Os09g32976
LOC_Os11g07500  LOC_Os12g30540  LOC_Os07g41180  LOC_Os09g03890  LOC_Os07g47420  LOC_Os10g31520
LOC_Os07g08330  LOC_Os08g45010  LOC_Os10g39410  LOC_Os09g38020  LOC_Os07g33979  LOC_Os07g12250
LOC_Os09g07510  LOC_Os10g35280  LOC_Os10g29560  LOC_Os09g39590  LOC_Os01g45190   LOC_Os02g49270
LOC_Os03g25450   LOC_Os03g18570   LOC_Os01g08200   LOC_Os06g14190   LOC_Os03g42900   LOC_Os01g57930
LOC_Os03g32526   LOC_Os01g51200   LOC_Os04g31950   LOC_Os05g38810   LOC_Os03g10340   LOC_Os05g22260
LOC_Os03g50090   LOC_Os03g37970   LOC_Os03g60939   LOC_Os05g14550   LOC_Os05g46550   LOC_Os01g48920
LOC_Os05g23940   LOC_Os06g09570   LOC_Os04g55260   LOC_Os01g10050   LOC_Os05g06840   LOC_Os04g53370
LOC_Os03g44900   LOC_Os01g72220   LOC_Os03g19960   LOC_Os01g62350   LOC_Os03g18080   LOC_Os01g23630
LOC_Os01g33030   LOC_Os03g22740   LOC_Os03g40180   LOC_Os02g06592   LOC_Os05g51500   LOC_Os04g20220
LOC_Os05g30940   LOC_Os01g29070   LOC_Os05g42300   LOC_Os01g32880   LOC_Os03g29740   LOC_Os06g46770
LOC_Os01g61920   LOC_Os03g18550   LOC_Os02g45940   LOC_Os02g49610   LOC_Os03g38000   LOC_Os01g59990
LOC_Os05g19370   LOC_Os01g72790   LOC_Os04g43140   LOC_Os06g02620   LOC_Os02g52940   LOC_Os05g44320
LOC_Os03g22890   LOC_Os02g52920   LOC_Os05g23600   LOC_Os01g68950   LOC_Os02g39300   LOC_Os01g14040
LOC_Os04g58710   LOC_Os03g05980   LOC_Os04g55040   LOC_Os01g34200   LOC_Os02g12800   LOC_Os01g74410
LOC_Os01g32750   LOC_Os02g08190   LOC_Os02g18380   LOC_Os01g16190   LOC_Os03g40110   LOC_Os04g32330
LOC_Os03g17310   LOC_Os03g29540   LOC_Os02g54110   LOC_Os01g49350   LOC_Os02g38300   LOC_Os01g49290
LOC_Os04g01130   LOC_Os06g48355   LOC_Os01g05950   LOC_Os06g04450   LOC_Os05g11770   LOC_Os01g62230
LOC_Os03g59590   LOC_Os03g47730   LOC_Os06g36770   LOC_Os06g50050   LOC_Os04g11880   LOC_Os01g43020
LOC_Os03g13370   LOC_Os03g04750   LOC_Os04g33750   LOC_Os02g40880   LOC_Os02g02530   LOC_Os03g02150
LOC_Os04g46310   LOC_Os02g04050   LOC_Os06g04600   LOC_Os05g37330   LOC_Os03g23950   LOC_Os04g35700
LOC_Os04g39700   LOC_Os01g41630   LOC_Os02g25060   LOC_Os02g30050   LOC_Os04g28180   LOC_Os02g40000
LOC_Os05g22940   LOC_Os02g49590   LOC_Os05g27940   LOC_Os06g36160   LOC_Os06g43790   LOC_Os01g22010
LOC_Os02g50760   LOC_Os05g48422   LOC_Os03g22180   LOC_Os03g31090   LOC_Os01g40280   LOC_Os06g36680
LOC_Os04g49420   LOC_Os01g48960   LOC_Os01g43030   LOC_Os01g68940   LOC_Os04g43540   LOC_Os02g56960
LOC_Os05g41060   LOC_Os01g05670   LOC_Os02g01350   LOC_Os03g10510   LOC_Os05g38740   LOC_Os02g28810
LOC_Os03g04590   LOC_Os01g64090   LOC_Os01g10820   LOC_Os05g42424   LOC_Os01g56980   LOC_Os02g37870
LOC_Os05g28510   LOC_Os03g14260   LOC_Os01g69920   LOC_Os02g26850   LOC_Os06g07580   LOC_Os03g28400
LOC_Os03g44200   LOC_Os06g35050   LOC_Os02g44810   LOC_Os06g29844   LOC_Os05g45310   LOC_Os03g60930
LOC_Os04g25360   LOC_Os06g04280   LOC_Os03g29460   LOC_Os02g27760   LOC_Os03g07080   LOC_Os03g02480
LOC_Os02g52860   LOC_Os04g04020   LOC_Os03g23020   LOC_Os05g38400   LOC_Os01g02090   LOC_Os06g01980
LOC_Os05g38520   LOC_Os02g14059   LOC_Os04g54330   LOC_Os04g42270   LOC_Os03g21940   LOC_Os03g51900
LOC_Os02g56014   LOC_Os02g23890   LOC_Os03g22350   LOC_Os06g48350   LOC_Os06g02510   LOC_Os03g58720
LOC_Os03g42770   LOC_Os04g46050   LOC_Os02g47140   LOC_Os04g58830   LOC_Os01g64690   LOC_Os06g41750
LOC_Os01g67250   LOC_Os05g51700   LOC_Os01g08540   LOC_Os04g42380   LOC_Os02g51150   LOC_Os04g52200
LOC_Os06g07120   LOC_Os01g67960   LOC_Os03g18580   LOC_Os02g13530   LOC_Os02g33140   LOC_Os02g39800
LOC_Os01g54870   LOC_Os01g06010   LOC_Os06g01934   LOC_Os03g51140   LOC_Os03g02780   LOC_Os07g01150
LOC_Os02g01490   LOC_Os02g13110   LOC_Os03g48930   LOC_Os02g30624   LOC_Os05g07050   LOC_Os03g49210
LOC_Os01g08770   LOC_Os03g36930   LOC_Os01g71230   LOC_Os01g69130   LOC_Os02g06640   LOC_Os05g39050
LOC_Os01g62840   LOC_Os06g01390   LOC_Os04g40730   LOC_Os01g01120   LOC_Os06g08480   LOC_Os05g32580
LOC_Os03g13970   LOC_Os02g48660   LOC_Os05g28280   LOC_Os01g07080   LOC_Os06g21470   LOC_Os02g06500
LOC_Os04g28420   LOC_Os03g52750   LOC_Os04g50990   LOC_Os01g04730   LOC_Os01g25880   LOC_Os03g08440
LOC_Os01g13430   LOC_Os05g02400   LOC_Os02g55260   LOC_Os07g08330   LOC_Os04g30730   LOC_Os01g15310
LOC_Os01g59730   LOC_Os04g30800   LOC_Os05g04510   LOC_Os01g27730   LOC_Os03g63730   LOC_Os07g01870
LOC_Os03g62730   LOC_Os01g01060   LOC_Os02g57070   LOC_Os02g12850   LOC_Os02g32690   LOC_Os03g61560
LOC_Os01g52490   LOC_Os04g56350   LOC_Os01g51010   LOC_Os05g30530   LOC_Os01g05970   LOC_Os03g58810

Database Links
UniprotKB	Q0D868
Refseq	NP_001059041.2
EMBL	AP008213
KEGG	osa:4342563 dosa:Os07t0180900-01