RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os08g31810 View Network
Names	Os08g0412200 protein (Putative RNA binding protein) (cDNA clone:001-031-A04, full insert sequence) (cDNA clone:006-307-B02, full insert sequence) (cDNA clone:J033051M06, full insert sequence)
Function	RNA recognition motif containing protein, putative, expressed
Attributes	Length: 215 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 25104.1 pI: 10.7339 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os08g31810.1 LOC_Os08g31810.2 LOC_Os08g31810.3

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g07300 LOC_Os12g42150 LOC_Os12g07680 LOC_Os11g11390 LOC_Os09g34010 LOC_Os12g05430 LOC_Os08g39140 LOC_Os12g03090 LOC_Os08g45040 LOC_Os09g37860 LOC_Os11g01074 LOC_Os09g12270 LOC_Os09g18320 LOC_Os11g37080 LOC_Os11g07500 LOC_Os08g31810 LOC_Os11g03400 LOC_Os10g10434 LOC_Os09g02810 LOC_Os08g32090 LOC_Os09g32976 LOC_Os10g35280 LOC_Os10g30100 LOC_Os12g29660 LOC_Os11g06750 LOC_Os10g31864 LOC_Os11g01420 LOC_Os10g31520 LOC_Os08g39820 LOC_Os11g16480 LOC_Os10g27174 LOC_Os10g34670 LOC_Os10g25110 LOC_Os12g04010 LOC_Os10g32920 LOC_Os04g51630 LOC_Os02g38060 LOC_Os08g09350 LOC_Os01g33050 LOC_Os03g02420 LOC_Os07g36940 LOC_Os02g37870 LOC_Os02g56960 LOC_Os02g13530 LOC_Os07g47420 LOC_Os07g30300 LOC_Os03g60930 LOC_Os07g12250 LOC_Os06g36170 LOC_Os07g47710 LOC_Os03g22350 LOC_Os06g02510 LOC_Os03g51900 LOC_Os02g54700 LOC_Os03g25450 LOC_Os01g72790 LOC_Os03g59310 LOC_Os02g40514 LOC_Os02g49270 LOC_Os01g59730 LOC_Os06g30320 LOC_Os01g07080 LOC_Os03g08020 LOC_Os03g22880 LOC_Os07g10350 LOC_Os06g36160 LOC_Os01g40250 LOC_Os03g22180 LOC_Os07g47580 LOC_Os04g36890 LOC_Os03g22570 LOC_Os03g06760 LOC_Os01g27730 LOC_Os05g32580 LOC_Os03g58810 LOC_Os01g73310 LOC_Os03g22320 LOC_Os03g26440 LOC_Os02g30050 LOC_Os03g09920 LOC_Os05g13630 LOC_Os04g56670 LOC_Os01g62350 LOC_Os07g42950 LOC_Os03g08010 LOC_Os07g16950 LOC_Os07g19190 LOC_Os07g25440 LOC_Os08g31810 LOC_Os04g56350 LOC_Os01g68310 LOC_Os03g36780 LOC_Os07g40930 LOC_Os05g08360 LOC_Os04g46310 LOC_Os04g43140 LOC_Os02g54110 LOC_Os01g67134 LOC_Os02g49610 LOC_Os01g49290 LOC_Os06g08800 LOC_Os04g38610 LOC_Os01g65220 LOC_Os07g44620 LOC_Os02g49780 LOC_Os01g38970 LOC_Os03g21940 LOC_Os02g48660 LOC_Os02g49360 LOC_Os01g70060 LOC_Os04g28180 LOC_Os03g58720 LOC_Os02g39030 LOC_Os03g19960 LOC_Os08g02410 LOC_Os06g48750 LOC_Os06g04600 LOC_Os07g41180 LOC_Os06g01980 LOC_Os02g14059 LOC_Os03g61560 LOC_Os05g05220 LOC_Os05g30420 LOC_Os01g59990 LOC_Os04g50990 LOC_Os02g47140 LOC_Os03g37970 LOC_Os01g64090 LOC_Os04g42380 LOC_Os02g51490 LOC_Os07g31340 LOC_Os07g36254 LOC_Os04g53770 LOC_Os05g38520 LOC_Os07g22534 LOC_Os01g54870 LOC_Os02g42040 LOC_Os05g30880 LOC_Os07g42180 LOC_Os02g30730 LOC_Os08g23710 LOC_Os03g49210 LOC_Os03g04590 LOC_Os03g08050 LOC_Os01g04730 LOC_Os03g29460 LOC_Os05g02400 LOC_Os04g30730 LOC_Os02g39350 LOC_Os01g13730 LOC_Os02g40880 LOC_Os08g02400 LOC_Os03g63730 LOC_Os02g12850 LOC_Os03g14260 LOC_Os02g50830 LOC_Os07g46660 LOC_Os05g49230 LOC_Os07g08330 LOC_Os01g33030 LOC_Os04g39700 LOC_Os03g23020 LOC_Os02g05330 LOC_Os06g49140 LOC_Os08g05880 LOC_Os04g43540 LOC_Os04g52960 LOC_Os03g22740 LOC_Os04g51700 LOC_Os03g10340 LOC_Os06g09570 LOC_Os03g40110 LOC_Os05g48422 LOC_Os03g42770 LOC_Os02g28810 LOC_Os08g08080 LOC_Os07g29320 LOC_Os04g58830 LOC_Os03g13800 LOC_Os02g18380 LOC_Os04g42270

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g07300  LOC_Os12g42150  LOC_Os12g07680  LOC_Os11g11390  LOC_Os09g34010  LOC_Os12g05430
LOC_Os08g39140  LOC_Os12g03090  LOC_Os08g45040  LOC_Os09g37860  LOC_Os11g01074  LOC_Os09g12270
LOC_Os09g18320  LOC_Os11g37080  LOC_Os11g07500  LOC_Os08g31810  LOC_Os11g03400  LOC_Os10g10434
LOC_Os09g02810  LOC_Os08g32090  LOC_Os09g32976  LOC_Os10g35280  LOC_Os10g30100  LOC_Os12g29660
LOC_Os11g06750  LOC_Os10g31864  LOC_Os11g01420  LOC_Os10g31520  LOC_Os08g39820  LOC_Os11g16480
LOC_Os10g27174  LOC_Os10g34670  LOC_Os10g25110  LOC_Os12g04010  LOC_Os10g32920  LOC_Os04g51630
LOC_Os02g38060   LOC_Os08g09350   LOC_Os01g33050   LOC_Os03g02420   LOC_Os07g36940   LOC_Os02g37870
LOC_Os02g56960   LOC_Os02g13530   LOC_Os07g47420   LOC_Os07g30300   LOC_Os03g60930   LOC_Os07g12250
LOC_Os06g36170   LOC_Os07g47710   LOC_Os03g22350   LOC_Os06g02510   LOC_Os03g51900   LOC_Os02g54700
LOC_Os03g25450   LOC_Os01g72790   LOC_Os03g59310   LOC_Os02g40514   LOC_Os02g49270   LOC_Os01g59730
LOC_Os06g30320   LOC_Os01g07080   LOC_Os03g08020   LOC_Os03g22880   LOC_Os07g10350   LOC_Os06g36160
LOC_Os01g40250   LOC_Os03g22180   LOC_Os07g47580   LOC_Os04g36890   LOC_Os03g22570   LOC_Os03g06760
LOC_Os01g27730   LOC_Os05g32580   LOC_Os03g58810   LOC_Os01g73310   LOC_Os03g22320   LOC_Os03g26440
LOC_Os02g30050   LOC_Os03g09920   LOC_Os05g13630   LOC_Os04g56670   LOC_Os01g62350   LOC_Os07g42950
LOC_Os03g08010   LOC_Os07g16950   LOC_Os07g19190   LOC_Os07g25440   LOC_Os08g31810   LOC_Os04g56350
LOC_Os01g68310   LOC_Os03g36780   LOC_Os07g40930   LOC_Os05g08360   LOC_Os04g46310   LOC_Os04g43140
LOC_Os02g54110   LOC_Os01g67134   LOC_Os02g49610   LOC_Os01g49290   LOC_Os06g08800   LOC_Os04g38610
LOC_Os01g65220   LOC_Os07g44620   LOC_Os02g49780   LOC_Os01g38970   LOC_Os03g21940   LOC_Os02g48660
LOC_Os02g49360   LOC_Os01g70060   LOC_Os04g28180   LOC_Os03g58720   LOC_Os02g39030   LOC_Os03g19960
LOC_Os08g02410   LOC_Os06g48750   LOC_Os06g04600   LOC_Os07g41180   LOC_Os06g01980   LOC_Os02g14059
LOC_Os03g61560   LOC_Os05g05220   LOC_Os05g30420   LOC_Os01g59990   LOC_Os04g50990   LOC_Os02g47140
LOC_Os03g37970   LOC_Os01g64090   LOC_Os04g42380   LOC_Os02g51490   LOC_Os07g31340   LOC_Os07g36254
LOC_Os04g53770   LOC_Os05g38520   LOC_Os07g22534   LOC_Os01g54870   LOC_Os02g42040   LOC_Os05g30880
LOC_Os07g42180   LOC_Os02g30730   LOC_Os08g23710   LOC_Os03g49210   LOC_Os03g04590   LOC_Os03g08050
LOC_Os01g04730   LOC_Os03g29460   LOC_Os05g02400   LOC_Os04g30730   LOC_Os02g39350   LOC_Os01g13730
LOC_Os02g40880   LOC_Os08g02400   LOC_Os03g63730   LOC_Os02g12850   LOC_Os03g14260   LOC_Os02g50830
LOC_Os07g46660   LOC_Os05g49230   LOC_Os07g08330   LOC_Os01g33030   LOC_Os04g39700   LOC_Os03g23020
LOC_Os02g05330   LOC_Os06g49140   LOC_Os08g05880   LOC_Os04g43540   LOC_Os04g52960   LOC_Os03g22740
LOC_Os04g51700   LOC_Os03g10340   LOC_Os06g09570   LOC_Os03g40110   LOC_Os05g48422   LOC_Os03g42770
LOC_Os02g28810   LOC_Os08g08080   LOC_Os07g29320   LOC_Os04g58830   LOC_Os03g13800   LOC_Os02g18380
LOC_Os04g42270

Database Links
UniprotKB	Q6Z568
Ensembl	LOC_Os08g31810.1 LOC_Os08g31810.2 LOC_Os08g31810.3
Refseq	NP_001061793.1
EMBL	AP005158 AP008214 AK059631 AK099367 AK104578 CM000145
KEGG	osa:4345558 dosa:Os08t0412200-01