RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os10g31520 View Network
Names	KRR1 small subunit processome component (KRR-R motif-containing protein 1)
Function	Required for 40S ribosome biogenesis. Involved in nucleolar processing of pre-18S ribosomal RNA and ribosome assembly (By similarity).
Attributes	Length: 396 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 45188.1 pI: 10.2853 Subcellular Location (predicted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os10g31520.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os11g29190 LOC_Os10g31520 LOC_Os12g04010 LOC_Os11g19100 LOC_Os11g04070 LOC_Os12g06910 LOC_Os10g39820 LOC_Os10g32920 LOC_Os11g01420 LOC_Os10g41520 LOC_Os12g06890 LOC_Os12g07300 LOC_Os02g28810 LOC_Os08g08040 LOC_Os01g59730 LOC_Os01g68940 LOC_Os03g08440 LOC_Os07g45360 LOC_Os08g02400 LOC_Os09g32976 LOC_Os02g42040 LOC_Os08g23710 LOC_Os07g42450 LOC_Os02g18830 LOC_Os04g42380 LOC_Os03g22880 LOC_Os01g66520 LOC_Os02g49610 LOC_Os01g49290 LOC_Os03g29460 LOC_Os05g42424 LOC_Os01g08770 LOC_Os05g27940 LOC_Os03g22570 LOC_Os02g56960 LOC_Os10g31520 LOC_Os04g42270 LOC_Os03g46490 LOC_Os06g43690 LOC_Os09g34010 LOC_Os05g41100 LOC_Os05g30530 LOC_Os03g25260 LOC_Os07g30300 LOC_Os02g33140 LOC_Os08g02410 LOC_Os03g42770 LOC_Os03g19960 LOC_Os02g05330 LOC_Os03g57340 LOC_Os05g08360 LOC_Os09g35670 LOC_Os08g39820 LOC_Os05g41220 LOC_Os04g50660 LOC_Os07g12320 LOC_Os02g54110 LOC_Os03g61680 LOC_Os03g10340 LOC_Os02g01350 LOC_Os04g38610 LOC_Os01g72790 LOC_Os04g56670 LOC_Os03g25450 LOC_Os03g18570 LOC_Os08g31840 LOC_Os03g61560 LOC_Os08g08080 LOC_Os03g05720 LOC_Os02g07070 LOC_Os07g46760 LOC_Os03g04590 LOC_Os01g13730 LOC_Os01g34200 LOC_Os03g21530 LOC_Os01g01060 LOC_Os02g39350 LOC_Os02g14059 LOC_Os04g33750 LOC_Os08g31810 LOC_Os03g38000 LOC_Os03g52470 LOC_Os09g07120 LOC_Os01g68310 LOC_Os04g46310 LOC_Os06g03780 LOC_Os03g40110 LOC_Os06g46770 LOC_Os05g13630 LOC_Os03g53700 LOC_Os06g48750 LOC_Os01g68950 LOC_Os07g10350 LOC_Os03g18580 LOC_Os05g30420 LOC_Os03g58810 LOC_Os05g44320 LOC_Os05g46550 LOC_Os02g27760 LOC_Os07g22950 LOC_Os06g37440 LOC_Os07g31340 LOC_Os02g50370 LOC_Os02g06640 LOC_Os09g18320 LOC_Os05g14590 LOC_Os08g25010 LOC_Os07g34740 LOC_Os04g28180 LOC_Os07g20580 LOC_Os07g08330 LOC_Os03g26440 LOC_Os07g10720 LOC_Os09g07900 LOC_Os01g49330 LOC_Os01g40250 LOC_Os03g09920

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os11g29190  LOC_Os10g31520  LOC_Os12g04010  LOC_Os11g19100  LOC_Os11g04070  LOC_Os12g06910
LOC_Os10g39820  LOC_Os10g32920  LOC_Os11g01420  LOC_Os10g41520  LOC_Os12g06890  LOC_Os12g07300
LOC_Os02g28810   LOC_Os08g08040   LOC_Os01g59730   LOC_Os01g68940   LOC_Os03g08440   LOC_Os07g45360
LOC_Os08g02400   LOC_Os09g32976   LOC_Os02g42040   LOC_Os08g23710   LOC_Os07g42450   LOC_Os02g18830
LOC_Os04g42380   LOC_Os03g22880   LOC_Os01g66520   LOC_Os02g49610   LOC_Os01g49290   LOC_Os03g29460
LOC_Os05g42424   LOC_Os01g08770   LOC_Os05g27940   LOC_Os03g22570   LOC_Os02g56960   LOC_Os10g31520
LOC_Os04g42270   LOC_Os03g46490   LOC_Os06g43690   LOC_Os09g34010   LOC_Os05g41100   LOC_Os05g30530
LOC_Os03g25260   LOC_Os07g30300   LOC_Os02g33140   LOC_Os08g02410   LOC_Os03g42770   LOC_Os03g19960
LOC_Os02g05330   LOC_Os03g57340   LOC_Os05g08360   LOC_Os09g35670   LOC_Os08g39820   LOC_Os05g41220
LOC_Os04g50660   LOC_Os07g12320   LOC_Os02g54110   LOC_Os03g61680   LOC_Os03g10340   LOC_Os02g01350
LOC_Os04g38610   LOC_Os01g72790   LOC_Os04g56670   LOC_Os03g25450   LOC_Os03g18570   LOC_Os08g31840
LOC_Os03g61560   LOC_Os08g08080   LOC_Os03g05720   LOC_Os02g07070   LOC_Os07g46760   LOC_Os03g04590
LOC_Os01g13730   LOC_Os01g34200   LOC_Os03g21530   LOC_Os01g01060   LOC_Os02g39350   LOC_Os02g14059
LOC_Os04g33750   LOC_Os08g31810   LOC_Os03g38000   LOC_Os03g52470   LOC_Os09g07120   LOC_Os01g68310
LOC_Os04g46310   LOC_Os06g03780   LOC_Os03g40110   LOC_Os06g46770   LOC_Os05g13630   LOC_Os03g53700
LOC_Os06g48750   LOC_Os01g68950   LOC_Os07g10350   LOC_Os03g18580   LOC_Os05g30420   LOC_Os03g58810
LOC_Os05g44320   LOC_Os05g46550   LOC_Os02g27760   LOC_Os07g22950   LOC_Os06g37440   LOC_Os07g31340
LOC_Os02g50370   LOC_Os02g06640   LOC_Os09g18320   LOC_Os05g14590   LOC_Os08g25010   LOC_Os07g34740
LOC_Os04g28180   LOC_Os07g20580   LOC_Os07g08330   LOC_Os03g26440   LOC_Os07g10720   LOC_Os09g07900
LOC_Os01g49330   LOC_Os01g40250   LOC_Os03g09920

Database Links
UniprotKB	Q7XDT2
Ensembl	LOC_Os10g31520.1
Refseq	NP_001064737.1
EMBL	DP000086 AP008216 AK070158 CM000147
KEGG	osa:4348775 dosa:Os10t0452800-01