RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os08g08040 View Network
Names	Os08g0177700 protein (Putative snRNP splicing factor-related)
Function	LSM domain containing protein, expressed
Attributes	Length: 99 Status: Complete Existence: Predicted Molecular Weight: 10594.1 pI: 4.6052 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os08g08040.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os10g31520 LOC_Os12g06870 LOC_Os10g34670 LOC_Os12g04290 LOC_Os09g39420 LOC_Os11g32240 LOC_Os12g43940 LOC_Os10g30100 LOC_Os09g33980 LOC_Os11g01450 LOC_Os12g34510 LOC_Os10g32880 LOC_Os08g08040 LOC_Os10g34520 LOC_Os09g12710 LOC_Os09g04210 LOC_Os08g36420 LOC_Os12g21890 LOC_Os09g06560 LOC_Os11g45250 LOC_Os08g08080 LOC_Os10g41520 LOC_Os10g35550 LOC_Os09g28590 LOC_Os11g34860 LOC_Os11g40150 LOC_Os11g43620 LOC_Os12g41930 LOC_Os11g34305 LOC_Os10g41450 LOC_Os11g04180 LOC_Os12g08740 LOC_Os11g01154 LOC_Os10g28040 LOC_Os08g09320 LOC_Os12g01160 LOC_Os12g07350 LOC_Os09g24404 LOC_Os11g20689 LOC_Os10g31000 LOC_Os11g20384 LOC_Os08g25090 LOC_Os08g42600 LOC_Os09g07500 LOC_Os10g35580 LOC_Os01g62230 LOC_Os03g02830 LOC_Os03g26440 LOC_Os02g33450 LOC_Os04g43922 LOC_Os03g51140 LOC_Os03g13760 LOC_Os03g18080 LOC_Os02g44810 LOC_Os03g50740 LOC_Os05g33390 LOC_Os03g53720 LOC_Os07g04850 LOC_Os03g09860 LOC_Os07g43360 LOC_Os06g07878 LOC_Os02g30730 LOC_Os04g40840 LOC_Os03g22350 LOC_Os01g01960 LOC_Os07g46540 LOC_Os05g14550 LOC_Os04g48410 LOC_Os05g13630 LOC_Os05g32310 LOC_Os07g42180 LOC_Os08g05850 LOC_Os07g25016 LOC_Os02g14860 LOC_Os01g60410 LOC_Os05g51650 LOC_Os04g41490 LOC_Os01g60360 LOC_Os08g08040 LOC_Os01g73880 LOC_Os06g09850 LOC_Os06g05660 LOC_Os03g36780 LOC_Os02g29464 LOC_Os02g42860 LOC_Os02g57070 LOC_Os02g39800 LOC_Os03g53190 LOC_Os04g02820 LOC_Os01g27730 LOC_Os05g24970 LOC_Os01g43030 LOC_Os02g01740 LOC_Os08g02130 LOC_Os07g44060 LOC_Os04g01130 LOC_Os01g73310 LOC_Os05g11980 LOC_Os04g54940 LOC_Os05g22260 LOC_Os07g10256 LOC_Os03g50850 LOC_Os03g46390 LOC_Os03g22880 LOC_Os06g07978 LOC_Os05g30420 LOC_Os03g07080 LOC_Os03g09140 LOC_Os03g23909 LOC_Os08g05530 LOC_Os01g13150 LOC_Os07g07220 LOC_Os06g49870 LOC_Os02g13990 LOC_Os07g13270 LOC_Os03g16670 LOC_Os02g39700 LOC_Os03g53700 LOC_Os02g53420 LOC_Os04g26841 LOC_Os04g54330 LOC_Os04g16776 LOC_Os03g44900 LOC_Os05g44320 LOC_Os02g10060 LOC_Os07g38420 LOC_Os03g15700 LOC_Os04g36810 LOC_Os02g01250 LOC_Os06g37440 LOC_Os07g06980 LOC_Os07g49260 LOC_Os07g25420 LOC_Os05g48030 LOC_Os01g64690 LOC_Os04g52340 LOC_Os06g44030 LOC_Os04g46620 LOC_Os02g26660 LOC_Os02g58020 LOC_Os02g47350 LOC_Os03g43890 LOC_Os05g06350 LOC_Os07g37790 LOC_Os02g35100 LOC_Os03g15810 LOC_Os07g31370 LOC_Os04g53760 LOC_Os01g15310 LOC_Os04g32330 LOC_Os03g37970 LOC_Os07g46750 LOC_Os06g43680 LOC_Os03g50090 LOC_Os03g57450 LOC_Os02g30624 LOC_Os03g55280 LOC_Os02g55300 LOC_Os04g31950 LOC_Os03g60130 LOC_Os04g39040 LOC_Os05g46270 LOC_Os07g36140 LOC_Os04g38610 LOC_Os01g13430 LOC_Os04g42010 LOC_Os03g61640 LOC_Os06g45710 LOC_Os04g37950 LOC_Os04g04320 LOC_Os02g52510 LOC_Os04g46190 LOC_Os04g54340 LOC_Os04g16814 LOC_Os04g46890 LOC_Os01g61430 LOC_Os03g38980 LOC_Os07g30980 LOC_Os07g29320 LOC_Os01g23590 LOC_Os06g08480 LOC_Os01g33040 LOC_Os05g05780 LOC_Os01g16190 LOC_Os01g06010 LOC_Os05g03610 LOC_Os05g07050 LOC_Os04g20220 LOC_Os06g30970 LOC_Os03g22570 LOC_Os05g01020 LOC_Os03g57760 LOC_Os07g03160 LOC_Os01g71710 LOC_Os06g02510 LOC_Os01g05970 LOC_Os08g05840 LOC_Os03g02260

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os10g31520  LOC_Os12g06870  LOC_Os10g34670  LOC_Os12g04290  LOC_Os09g39420  LOC_Os11g32240
LOC_Os12g43940  LOC_Os10g30100  LOC_Os09g33980  LOC_Os11g01450  LOC_Os12g34510  LOC_Os10g32880
LOC_Os08g08040  LOC_Os10g34520  LOC_Os09g12710  LOC_Os09g04210  LOC_Os08g36420  LOC_Os12g21890
LOC_Os09g06560  LOC_Os11g45250  LOC_Os08g08080  LOC_Os10g41520  LOC_Os10g35550  LOC_Os09g28590
LOC_Os11g34860  LOC_Os11g40150  LOC_Os11g43620  LOC_Os12g41930  LOC_Os11g34305  LOC_Os10g41450
LOC_Os11g04180  LOC_Os12g08740  LOC_Os11g01154  LOC_Os10g28040  LOC_Os08g09320  LOC_Os12g01160
LOC_Os12g07350  LOC_Os09g24404  LOC_Os11g20689  LOC_Os10g31000  LOC_Os11g20384  LOC_Os08g25090
LOC_Os08g42600  LOC_Os09g07500  LOC_Os10g35580  LOC_Os01g62230   LOC_Os03g02830   LOC_Os03g26440
LOC_Os02g33450   LOC_Os04g43922   LOC_Os03g51140   LOC_Os03g13760   LOC_Os03g18080   LOC_Os02g44810
LOC_Os03g50740   LOC_Os05g33390   LOC_Os03g53720   LOC_Os07g04850   LOC_Os03g09860   LOC_Os07g43360
LOC_Os06g07878   LOC_Os02g30730   LOC_Os04g40840   LOC_Os03g22350   LOC_Os01g01960   LOC_Os07g46540
LOC_Os05g14550   LOC_Os04g48410   LOC_Os05g13630   LOC_Os05g32310   LOC_Os07g42180   LOC_Os08g05850
LOC_Os07g25016   LOC_Os02g14860   LOC_Os01g60410   LOC_Os05g51650   LOC_Os04g41490   LOC_Os01g60360
LOC_Os08g08040   LOC_Os01g73880   LOC_Os06g09850   LOC_Os06g05660   LOC_Os03g36780   LOC_Os02g29464
LOC_Os02g42860   LOC_Os02g57070   LOC_Os02g39800   LOC_Os03g53190   LOC_Os04g02820   LOC_Os01g27730
LOC_Os05g24970   LOC_Os01g43030   LOC_Os02g01740   LOC_Os08g02130   LOC_Os07g44060   LOC_Os04g01130
LOC_Os01g73310   LOC_Os05g11980   LOC_Os04g54940   LOC_Os05g22260   LOC_Os07g10256   LOC_Os03g50850
LOC_Os03g46390   LOC_Os03g22880   LOC_Os06g07978   LOC_Os05g30420   LOC_Os03g07080   LOC_Os03g09140
LOC_Os03g23909   LOC_Os08g05530   LOC_Os01g13150   LOC_Os07g07220   LOC_Os06g49870   LOC_Os02g13990
LOC_Os07g13270   LOC_Os03g16670   LOC_Os02g39700   LOC_Os03g53700   LOC_Os02g53420   LOC_Os04g26841
LOC_Os04g54330   LOC_Os04g16776   LOC_Os03g44900   LOC_Os05g44320   LOC_Os02g10060   LOC_Os07g38420
LOC_Os03g15700   LOC_Os04g36810   LOC_Os02g01250   LOC_Os06g37440   LOC_Os07g06980   LOC_Os07g49260
LOC_Os07g25420   LOC_Os05g48030   LOC_Os01g64690   LOC_Os04g52340   LOC_Os06g44030   LOC_Os04g46620
LOC_Os02g26660   LOC_Os02g58020   LOC_Os02g47350   LOC_Os03g43890   LOC_Os05g06350   LOC_Os07g37790
LOC_Os02g35100   LOC_Os03g15810   LOC_Os07g31370   LOC_Os04g53760   LOC_Os01g15310   LOC_Os04g32330
LOC_Os03g37970   LOC_Os07g46750   LOC_Os06g43680   LOC_Os03g50090   LOC_Os03g57450   LOC_Os02g30624
LOC_Os03g55280   LOC_Os02g55300   LOC_Os04g31950   LOC_Os03g60130   LOC_Os04g39040   LOC_Os05g46270
LOC_Os07g36140   LOC_Os04g38610   LOC_Os01g13430   LOC_Os04g42010   LOC_Os03g61640   LOC_Os06g45710
LOC_Os04g37950   LOC_Os04g04320   LOC_Os02g52510   LOC_Os04g46190   LOC_Os04g54340   LOC_Os04g16814
LOC_Os04g46890   LOC_Os01g61430   LOC_Os03g38980   LOC_Os07g30980   LOC_Os07g29320   LOC_Os01g23590
LOC_Os06g08480   LOC_Os01g33040   LOC_Os05g05780   LOC_Os01g16190   LOC_Os01g06010   LOC_Os05g03610
LOC_Os05g07050   LOC_Os04g20220   LOC_Os06g30970   LOC_Os03g22570   LOC_Os05g01020   LOC_Os03g57760
LOC_Os07g03160   LOC_Os01g71710   LOC_Os06g02510   LOC_Os01g05970   LOC_Os08g05840   LOC_Os03g02260

Database Links
UniprotKB	Q6ZBS1
Ensembl	LOC_Os08g08040.1
Refseq	NP_001061124.1
EMBL	AP003878 AP004619 AP008214
KEGG	osa:4344803 dosa:Os08t0177700-01