RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os03g57760 View Network
Names	25.3 kDa vesicle transport protein, putative, expressed (Putative vesicle trafficking protein) (cDNA, clone: J100078I24, full insert sequence)
Function	25 kDa vesicle transport protein, putative, expressed
Attributes	Length: 219 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 25425.5 pI: 9.5174 Subcellular Location (predicted): Cytosol Mitochondria
Gene Model	LOC_Os03g57760.1 LOC_Os03g57760.2

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os04g40840 LOC_Os05g45420 LOC_Os07g22220 LOC_Os06g04500 LOC_Os05g28950 LOC_Os11g34305 LOC_Os09g33980 LOC_Os08g39140 LOC_Os05g37330 LOC_Os04g47580 LOC_Os05g05260 LOC_Os11g03050 LOC_Os05g48030 LOC_Os07g37640 LOC_Os08g08080 LOC_Os05g33390 LOC_Os06g10650 LOC_Os10g42950 LOC_Os07g10830 LOC_Os04g43540 LOC_Os09g34040 LOC_Os08g18110 LOC_Os09g34970 LOC_Os10g35580 LOC_Os12g03190 LOC_Os10g11620 LOC_Os06g08800 LOC_Os03g57790 LOC_Os03g63940 LOC_Os07g19060 LOC_Os05g24770 LOC_Os11g43640 LOC_Os06g09850 LOC_Os05g29010 LOC_Os05g44310 LOC_Os06g46770 LOC_Os03g63710 LOC_Os04g48520 LOC_Os05g13630 LOC_Os07g28280 LOC_Os05g44210 LOC_Os04g23890 LOC_Os08g05840 LOC_Os12g41500 LOC_Os07g32800 LOC_Os07g37790 LOC_Os07g44630 LOC_Os10g42420 LOC_Os05g24594 LOC_Os10g41450 LOC_Os05g23720 LOC_Os08g05590 LOC_Os04g04020 LOC_Os03g59070 LOC_Os05g42424 LOC_Os09g06560 LOC_Os06g04280 LOC_Os05g38610 LOC_Os05g37980 LOC_Os06g08770 LOC_Os11g41160 LOC_Os06g04820 LOC_Os11g07280 LOC_Os07g06980 LOC_Os04g52940 LOC_Os06g40630 LOC_Os04g31320 LOC_Os04g54940 LOC_Os12g36950 LOC_Os04g27060 LOC_Os06g38470 LOC_Os03g62730 LOC_Os05g15160 LOC_Os11g20384 LOC_Os03g57760 LOC_Os04g46450 LOC_Os07g07240 LOC_Os04g51120 LOC_Os04g47240 LOC_Os09g08660 LOC_Os04g38340 LOC_Os04g31950 LOC_Os04g54330 LOC_Os09g21770 LOC_Os11g03430 LOC_Os07g03160 LOC_Os10g37410 LOC_Os07g41180 LOC_Os10g35250 LOC_Os12g35360 LOC_Os12g35030 LOC_Os12g07950 LOC_Os06g21340 LOC_Os05g51490 LOC_Os07g31340 LOC_Os05g38810 LOC_Os12g39840 LOC_Os05g29050 LOC_Os05g01020 LOC_Os06g04580 LOC_Os08g34970 LOC_Os12g38970 LOC_Os11g01450 LOC_Os04g32330 LOC_Os04g26910 LOC_Os07g44790 LOC_Os03g60130 LOC_Os09g39500 LOC_Os08g25624 LOC_Os07g08170 LOC_Os07g29360 LOC_Os12g30060 LOC_Os11g24560 LOC_Os06g37440 LOC_Os07g46370 LOC_Os07g10150 LOC_Os07g07000 LOC_Os04g01130 LOC_Os08g08040 LOC_Os08g38570 LOC_Os08g09320 LOC_Os04g52340 LOC_Os03g51430 LOC_Os01g23620 LOC_Os03g06960 LOC_Os01g33020 LOC_Os01g01960 LOC_Os02g06640 LOC_Os02g23890 LOC_Os03g51140 LOC_Os02g40880 LOC_Os01g67960 LOC_Os03g20460 LOC_Os02g27110 LOC_Os02g04160 LOC_Os02g07870 LOC_Os01g73310 LOC_Os02g03450 LOC_Os03g43020 LOC_Os03g18310 LOC_Os02g52470 LOC_Os03g29470 LOC_Os03g26440 LOC_Os02g39800 LOC_Os03g27450 LOC_Os03g15350 LOC_Os03g42320 LOC_Os03g10990 LOC_Os01g56550 LOC_Os02g45650 LOC_Os02g42230 LOC_Os03g42900 LOC_Os02g45180 LOC_Os02g42040 LOC_Os01g53600 LOC_Os03g05300 LOC_Os01g61710 LOC_Os03g18080 LOC_Os02g30624 LOC_Os01g01312 LOC_Os03g13170 LOC_Os03g17310 LOC_Os03g11100 LOC_Os01g70060 LOC_Os01g05420 LOC_Os02g56130 LOC_Os01g07730 LOC_Os03g28140 LOC_Os03g57760 LOC_Os03g10080 LOC_Os03g24900 LOC_Os02g57220 LOC_Os02g11830 LOC_Os01g64650 LOC_Os01g33040 LOC_Os01g54580 LOC_Os03g15650 LOC_Os01g56590 LOC_Os03g53720 LOC_Os03g17020 LOC_Os03g25260 LOC_Os01g08400 LOC_Os03g57310 LOC_Os01g37800 LOC_Os03g50350 LOC_Os03g53700 LOC_Os01g43020 LOC_Os02g52940 LOC_Os03g56820 LOC_Os02g30730 LOC_Os03g01810 LOC_Os03g28400 LOC_Os02g54070

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os04g40840  LOC_Os05g45420  LOC_Os07g22220  LOC_Os06g04500  LOC_Os05g28950  LOC_Os11g34305
LOC_Os09g33980  LOC_Os08g39140  LOC_Os05g37330  LOC_Os04g47580  LOC_Os05g05260  LOC_Os11g03050
LOC_Os05g48030  LOC_Os07g37640  LOC_Os08g08080  LOC_Os05g33390  LOC_Os06g10650  LOC_Os10g42950
LOC_Os07g10830  LOC_Os04g43540  LOC_Os09g34040  LOC_Os08g18110  LOC_Os09g34970  LOC_Os10g35580
LOC_Os12g03190  LOC_Os10g11620  LOC_Os06g08800  LOC_Os03g57790  LOC_Os03g63940  LOC_Os07g19060
LOC_Os05g24770  LOC_Os11g43640  LOC_Os06g09850  LOC_Os05g29010  LOC_Os05g44310  LOC_Os06g46770
LOC_Os03g63710  LOC_Os04g48520  LOC_Os05g13630  LOC_Os07g28280  LOC_Os05g44210  LOC_Os04g23890
LOC_Os08g05840  LOC_Os12g41500  LOC_Os07g32800  LOC_Os07g37790  LOC_Os07g44630  LOC_Os10g42420
LOC_Os05g24594  LOC_Os10g41450  LOC_Os05g23720  LOC_Os08g05590  LOC_Os04g04020  LOC_Os03g59070
LOC_Os05g42424  LOC_Os09g06560  LOC_Os06g04280  LOC_Os05g38610  LOC_Os05g37980  LOC_Os06g08770
LOC_Os11g41160  LOC_Os06g04820  LOC_Os11g07280  LOC_Os07g06980  LOC_Os04g52940  LOC_Os06g40630
LOC_Os04g31320  LOC_Os04g54940  LOC_Os12g36950  LOC_Os04g27060  LOC_Os06g38470  LOC_Os03g62730
LOC_Os05g15160  LOC_Os11g20384  LOC_Os03g57760  LOC_Os04g46450  LOC_Os07g07240  LOC_Os04g51120
LOC_Os04g47240  LOC_Os09g08660  LOC_Os04g38340  LOC_Os04g31950  LOC_Os04g54330  LOC_Os09g21770
LOC_Os11g03430  LOC_Os07g03160  LOC_Os10g37410  LOC_Os07g41180  LOC_Os10g35250  LOC_Os12g35360
LOC_Os12g35030  LOC_Os12g07950  LOC_Os06g21340  LOC_Os05g51490  LOC_Os07g31340  LOC_Os05g38810
LOC_Os12g39840  LOC_Os05g29050  LOC_Os05g01020  LOC_Os06g04580  LOC_Os08g34970  LOC_Os12g38970
LOC_Os11g01450  LOC_Os04g32330  LOC_Os04g26910  LOC_Os07g44790  LOC_Os03g60130  LOC_Os09g39500
LOC_Os08g25624  LOC_Os07g08170  LOC_Os07g29360  LOC_Os12g30060  LOC_Os11g24560  LOC_Os06g37440
LOC_Os07g46370  LOC_Os07g10150  LOC_Os07g07000  LOC_Os04g01130  LOC_Os08g08040  LOC_Os08g38570
LOC_Os08g09320  LOC_Os04g52340  LOC_Os03g51430   LOC_Os01g23620   LOC_Os03g06960   LOC_Os01g33020
LOC_Os01g01960   LOC_Os02g06640   LOC_Os02g23890   LOC_Os03g51140   LOC_Os02g40880   LOC_Os01g67960
LOC_Os03g20460   LOC_Os02g27110   LOC_Os02g04160   LOC_Os02g07870   LOC_Os01g73310   LOC_Os02g03450
LOC_Os03g43020   LOC_Os03g18310   LOC_Os02g52470   LOC_Os03g29470   LOC_Os03g26440   LOC_Os02g39800
LOC_Os03g27450   LOC_Os03g15350   LOC_Os03g42320   LOC_Os03g10990   LOC_Os01g56550   LOC_Os02g45650
LOC_Os02g42230   LOC_Os03g42900   LOC_Os02g45180   LOC_Os02g42040   LOC_Os01g53600   LOC_Os03g05300
LOC_Os01g61710   LOC_Os03g18080   LOC_Os02g30624   LOC_Os01g01312   LOC_Os03g13170   LOC_Os03g17310
LOC_Os03g11100   LOC_Os01g70060   LOC_Os01g05420   LOC_Os02g56130   LOC_Os01g07730   LOC_Os03g28140
LOC_Os03g57760   LOC_Os03g10080   LOC_Os03g24900   LOC_Os02g57220   LOC_Os02g11830   LOC_Os01g64650
LOC_Os01g33040   LOC_Os01g54580   LOC_Os03g15650   LOC_Os01g56590   LOC_Os03g53720   LOC_Os03g17020
LOC_Os03g25260   LOC_Os01g08400   LOC_Os03g57310   LOC_Os01g37800   LOC_Os03g50350   LOC_Os03g53700
LOC_Os01g43020   LOC_Os02g52940   LOC_Os03g56820   LOC_Os02g30730   LOC_Os03g01810   LOC_Os03g28400
LOC_Os02g54070

Database Links
UniprotKB	Q852J3
Ensembl	LOC_Os03g57760.1 LOC_Os03g57760.2
EMBL	AC090871 DP000009 DP000009 AK243541 CM000140
KEGG	osa:4334384 dosa:Os03t0791500-01