RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os12g38970 View Network
Names	Leo1, expressed (Os12g0579000 protein) (cDNA clone:002-108-C04, full insert sequence)
Function	VIP4, putative, expressed
Attributes	Length: 664 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 75955.8 pI: 4.3204 Subcellular Location (predicted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os12g38970.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g41400 LOC_Os12g38970 LOC_Os12g44330 LOC_Os05g38740 LOC_Os12g35030 LOC_Os02g53230 LOC_Os07g10600 LOC_Os08g44770 LOC_Os12g07050 LOC_Os05g05260 LOC_Os03g13850 LOC_Os07g43360 LOC_Os05g19480 LOC_Os02g56130 LOC_Os09g26340 LOC_Os10g39410 LOC_Os04g36700 LOC_Os01g05420 LOC_Os02g02424 LOC_Os05g08970 LOC_Os06g38470 LOC_Os07g02350 LOC_Os05g48030 LOC_Os07g49260 LOC_Os02g34600 LOC_Os06g47840 LOC_Os02g21460 LOC_Os05g36280 LOC_Os02g54340 LOC_Os06g48750 LOC_Os02g39550 LOC_Os03g51550 LOC_Os01g68950 LOC_Os09g21770 LOC_Os06g10340 LOC_Os01g59360 LOC_Os04g49420 LOC_Os09g32700 LOC_Os02g38060 LOC_Os11g05730 LOC_Os01g11300 LOC_Os01g64640 LOC_Os03g48930 LOC_Os10g41520 LOC_Os07g31370 LOC_Os05g45420 LOC_Os09g11450 LOC_Os11g20384 LOC_Os07g36500 LOC_Os06g49110 LOC_Os10g28600 LOC_Os04g20220 LOC_Os11g42790 LOC_Os09g34010 LOC_Os03g53190 LOC_Os03g18080 LOC_Os07g07240 LOC_Os01g01960 LOC_Os08g09320 LOC_Os03g63730 LOC_Os07g22220 LOC_Os06g04580 LOC_Os02g39800 LOC_Os07g41180 LOC_Os02g18830 LOC_Os01g08200 LOC_Os08g25060 LOC_Os06g06510 LOC_Os04g37690 LOC_Os01g68940 LOC_Os08g06070 LOC_Os07g08170 LOC_Os06g06460 LOC_Os02g45180 LOC_Os12g30060 LOC_Os05g29010 LOC_Os09g19750 LOC_Os01g72790 LOC_Os03g26090 LOC_Os03g15650 LOC_Os06g08480 LOC_Os03g02980 LOC_Os06g09850 LOC_Os05g46560 LOC_Os07g38560 LOC_Os03g07850 LOC_Os02g13640 LOC_Os03g53720 LOC_Os03g46190 LOC_Os07g06980 LOC_Os11g03430 LOC_Os03g53700 LOC_Os09g38020 LOC_Os03g17700 LOC_Os06g51220 LOC_Os03g10990 LOC_Os07g29360 LOC_Os12g04290 LOC_Os03g09140 LOC_Os03g04980 LOC_Os12g12860 LOC_Os08g08830 LOC_Os03g60130 LOC_Os01g33040 LOC_Os07g43060 LOC_Os03g57450 LOC_Os03g02780 LOC_Os03g05300 LOC_Os02g14860 LOC_Os01g64690 LOC_Os02g58090 LOC_Os08g34970 LOC_Os05g03020 LOC_Os05g01020 LOC_Os07g44710 LOC_Os09g39420 LOC_Os02g04160 LOC_Os03g27450 LOC_Os12g29990 LOC_Os03g57760 LOC_Os05g39050 LOC_Os05g46570 LOC_Os06g06090 LOC_Os12g38970 LOC_Os02g54070 LOC_Os01g61920 LOC_Os04g39040 LOC_Os04g25360 LOC_Os03g51140 LOC_Os02g05330 LOC_Os01g32080 LOC_Os04g25550 LOC_Os03g16130 LOC_Os10g34670 LOC_Os03g43020 LOC_Os01g64970 LOC_Os05g32430 LOC_Os03g23909 LOC_Os02g45940 LOC_Os09g33980 LOC_Os03g25260 LOC_Os10g34750

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g41400  LOC_Os12g38970  LOC_Os12g44330  LOC_Os05g38740   LOC_Os12g35030   LOC_Os02g53230
LOC_Os07g10600   LOC_Os08g44770   LOC_Os12g07050   LOC_Os05g05260   LOC_Os03g13850   LOC_Os07g43360
LOC_Os05g19480   LOC_Os02g56130   LOC_Os09g26340   LOC_Os10g39410   LOC_Os04g36700   LOC_Os01g05420
LOC_Os02g02424   LOC_Os05g08970   LOC_Os06g38470   LOC_Os07g02350   LOC_Os05g48030   LOC_Os07g49260
LOC_Os02g34600   LOC_Os06g47840   LOC_Os02g21460   LOC_Os05g36280   LOC_Os02g54340   LOC_Os06g48750
LOC_Os02g39550   LOC_Os03g51550   LOC_Os01g68950   LOC_Os09g21770   LOC_Os06g10340   LOC_Os01g59360
LOC_Os04g49420   LOC_Os09g32700   LOC_Os02g38060   LOC_Os11g05730   LOC_Os01g11300   LOC_Os01g64640
LOC_Os03g48930   LOC_Os10g41520   LOC_Os07g31370   LOC_Os05g45420   LOC_Os09g11450   LOC_Os11g20384
LOC_Os07g36500   LOC_Os06g49110   LOC_Os10g28600   LOC_Os04g20220   LOC_Os11g42790   LOC_Os09g34010
LOC_Os03g53190   LOC_Os03g18080   LOC_Os07g07240   LOC_Os01g01960   LOC_Os08g09320   LOC_Os03g63730
LOC_Os07g22220   LOC_Os06g04580   LOC_Os02g39800   LOC_Os07g41180   LOC_Os02g18830   LOC_Os01g08200
LOC_Os08g25060   LOC_Os06g06510   LOC_Os04g37690   LOC_Os01g68940   LOC_Os08g06070   LOC_Os07g08170
LOC_Os06g06460   LOC_Os02g45180   LOC_Os12g30060   LOC_Os05g29010   LOC_Os09g19750   LOC_Os01g72790
LOC_Os03g26090   LOC_Os03g15650   LOC_Os06g08480   LOC_Os03g02980   LOC_Os06g09850   LOC_Os05g46560
LOC_Os07g38560   LOC_Os03g07850   LOC_Os02g13640   LOC_Os03g53720   LOC_Os03g46190   LOC_Os07g06980
LOC_Os11g03430   LOC_Os03g53700   LOC_Os09g38020   LOC_Os03g17700   LOC_Os06g51220   LOC_Os03g10990
LOC_Os07g29360   LOC_Os12g04290   LOC_Os03g09140   LOC_Os03g04980   LOC_Os12g12860   LOC_Os08g08830
LOC_Os03g60130   LOC_Os01g33040   LOC_Os07g43060   LOC_Os03g57450   LOC_Os03g02780   LOC_Os03g05300
LOC_Os02g14860   LOC_Os01g64690   LOC_Os02g58090   LOC_Os08g34970   LOC_Os05g03020   LOC_Os05g01020
LOC_Os07g44710   LOC_Os09g39420   LOC_Os02g04160   LOC_Os03g27450   LOC_Os12g29990   LOC_Os03g57760
LOC_Os05g39050   LOC_Os05g46570   LOC_Os06g06090   LOC_Os12g38970   LOC_Os02g54070   LOC_Os01g61920
LOC_Os04g39040   LOC_Os04g25360   LOC_Os03g51140   LOC_Os02g05330   LOC_Os01g32080   LOC_Os04g25550
LOC_Os03g16130   LOC_Os10g34670   LOC_Os03g43020   LOC_Os01g64970   LOC_Os05g32430   LOC_Os03g23909
LOC_Os02g45940   LOC_Os09g33980   LOC_Os03g25260   LOC_Os10g34750

Database Links
UniprotKB	Q2QN51
Ensembl	LOC_Os12g38970.1
Refseq	NP_001067127.1
EMBL	DP000011 AP008218 AK106536 CM000149
KEGG	osa:4352631 dosa:Os12t0579000-01