RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os06g51220 View Network
Names	HMG protein (HMGB1) (Os06g0728000 protein) (cDNA clone:001-047-C12, full insert sequence)
Function	HMG1/2, putative, expressed
Attributes	Length: 158 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 17099.9 pI: 5.5894 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os06g51220.2 LOC_Os06g51220.3 LOC_Os06g51220.4

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os11g05730 LOC_Os12g34510 LOC_Os07g08710 LOC_Os07g43060 LOC_Os09g28900 LOC_Os11g16540 LOC_Os12g07730 LOC_Os07g08170 LOC_Os07g36130 LOC_Os08g25060 LOC_Os09g36440 LOC_Os07g36500 LOC_Os12g39070 LOC_Os07g47510 LOC_Os08g06330 LOC_Os11g11390 LOC_Os12g43670 LOC_Os12g38970 LOC_Os07g09310 LOC_Os10g39030 LOC_Os11g04070 LOC_Os07g36140 LOC_Os07g41180 LOC_Os09g38020 LOC_Os08g25460 LOC_Os09g26340 LOC_Os07g27930 LOC_Os12g01190 LOC_Os07g08729 LOC_Os10g41310 LOC_Os10g39410 LOC_Os07g42950 LOC_Os08g05840 LOC_Os08g01100 LOC_Os12g37590 LOC_Os10g28040 LOC_Os02g30624 LOC_Os02g53680 LOC_Os04g58110 LOC_Os04g49420 LOC_Os03g58470 LOC_Os06g44030 LOC_Os04g01970 LOC_Os03g63410 LOC_Os05g05780 LOC_Os06g06460 LOC_Os03g43020 LOC_Os05g38740 LOC_Os03g53190 LOC_Os06g08770 LOC_Os06g14620 LOC_Os06g47840 LOC_Os01g73310 LOC_Os02g14860 LOC_Os02g03340 LOC_Os01g63940 LOC_Os02g10060 LOC_Os02g35100 LOC_Os01g56590 LOC_Os03g07080 LOC_Os03g54770 LOC_Os06g43790 LOC_Os03g44900 LOC_Os01g62230 LOC_Os02g45940 LOC_Os05g30530 LOC_Os03g08020 LOC_Os01g54870 LOC_Os01g64640 LOC_Os04g39040 LOC_Os03g08010 LOC_Os05g22670 LOC_Os01g62840 LOC_Os06g46770 LOC_Os01g56550 LOC_Os02g53230 LOC_Os06g06510 LOC_Os01g59140 LOC_Os05g39050 LOC_Os01g06010 LOC_Os05g08970 LOC_Os05g01020 LOC_Os03g02780 LOC_Os01g61920 LOC_Os06g37180 LOC_Os02g57660 LOC_Os04g25550 LOC_Os05g36280 LOC_Os03g22900 LOC_Os04g41490 LOC_Os03g28960 LOC_Os05g29010 LOC_Os03g08050 LOC_Os02g02510 LOC_Os04g54940 LOC_Os05g05230 LOC_Os03g18410 LOC_Os02g06592 LOC_Os05g23940 LOC_Os01g05950 LOC_Os04g31320 LOC_Os01g05970

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os11g05730  LOC_Os12g34510  LOC_Os07g08710  LOC_Os07g43060  LOC_Os09g28900  LOC_Os11g16540
LOC_Os12g07730  LOC_Os07g08170  LOC_Os07g36130  LOC_Os08g25060  LOC_Os09g36440  LOC_Os07g36500
LOC_Os12g39070  LOC_Os07g47510  LOC_Os08g06330  LOC_Os11g11390  LOC_Os12g43670  LOC_Os12g38970
LOC_Os07g09310  LOC_Os10g39030  LOC_Os11g04070  LOC_Os07g36140  LOC_Os07g41180  LOC_Os09g38020
LOC_Os08g25460  LOC_Os09g26340  LOC_Os07g27930  LOC_Os12g01190  LOC_Os07g08729  LOC_Os10g41310
LOC_Os10g39410  LOC_Os07g42950  LOC_Os08g05840  LOC_Os08g01100  LOC_Os12g37590  LOC_Os10g28040
LOC_Os02g30624   LOC_Os02g53680   LOC_Os04g58110   LOC_Os04g49420   LOC_Os03g58470   LOC_Os06g44030
LOC_Os04g01970   LOC_Os03g63410   LOC_Os05g05780   LOC_Os06g06460   LOC_Os03g43020   LOC_Os05g38740
LOC_Os03g53190   LOC_Os06g08770   LOC_Os06g14620   LOC_Os06g47840   LOC_Os01g73310   LOC_Os02g14860
LOC_Os02g03340   LOC_Os01g63940   LOC_Os02g10060   LOC_Os02g35100   LOC_Os01g56590   LOC_Os03g07080
LOC_Os03g54770   LOC_Os06g43790   LOC_Os03g44900   LOC_Os01g62230   LOC_Os02g45940   LOC_Os05g30530
LOC_Os03g08020   LOC_Os01g54870   LOC_Os01g64640   LOC_Os04g39040   LOC_Os03g08010   LOC_Os05g22670
LOC_Os01g62840   LOC_Os06g46770   LOC_Os01g56550   LOC_Os02g53230   LOC_Os06g06510   LOC_Os01g59140
LOC_Os05g39050   LOC_Os01g06010   LOC_Os05g08970   LOC_Os05g01020   LOC_Os03g02780   LOC_Os01g61920
LOC_Os06g37180   LOC_Os02g57660   LOC_Os04g25550   LOC_Os05g36280   LOC_Os03g22900   LOC_Os04g41490
LOC_Os03g28960   LOC_Os05g29010   LOC_Os03g08050   LOC_Os02g02510   LOC_Os04g54940   LOC_Os05g05230
LOC_Os03g18410   LOC_Os02g06592   LOC_Os05g23940   LOC_Os01g05950   LOC_Os04g31320   LOC_Os01g05970

Reference
PubMed	12909345

Database Links
UniprotKB	Q5Z7N3
Ensembl	LOC_Os06g51220.2 LOC_Os06g51220.3 LOC_Os06g51220.4
Refseq	NP_001058640.1
EMBL	EU847026 AP004685 AP008212 AK062226 CM000143
KEGG	osa:4342129 dosa:Os06t0728000-01