RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os08g01100 View Network
Names	HMG type nucleosome/chromatin assembly factor (Os08g0101100 protein) (Putative HMG type nucleosome/chromatin assembly factor D) (cDNA clone:J023035E20, full insert sequence)
Function	HMG1/2, putative, expressed
Attributes	Length: 204 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 22326.4 pI: 4.8185 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os08g01100.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os09g08910 LOC_Os11g34305 LOC_Os08g42000 LOC_Os09g38020 LOC_Os10g39410 LOC_Os08g23710 LOC_Os09g32976 LOC_Os09g26340 LOC_Os09g08430 LOC_Os08g05840 LOC_Os11g16540 LOC_Os12g39070 LOC_Os12g07730 LOC_Os12g34510 LOC_Os11g36390 LOC_Os08g09200 LOC_Os09g17850 LOC_Os02g58410 LOC_Os02g10060 LOC_Os07g08729 LOC_Os05g05780 LOC_Os07g01870 LOC_Os01g62230 LOC_Os03g04410 LOC_Os04g30730 LOC_Os01g06010 LOC_Os02g30050 LOC_Os05g39050 LOC_Os01g05970 LOC_Os02g53680 LOC_Os06g38470 LOC_Os01g16900 LOC_Os07g43360 LOC_Os01g56980 LOC_Os05g38740 LOC_Os06g07210 LOC_Os03g28960 LOC_Os05g06840 LOC_Os04g33750 LOC_Os02g50370 LOC_Os01g73310 LOC_Os07g46540 LOC_Os02g30800 LOC_Os05g05230 LOC_Os05g41510 LOC_Os04g49420 LOC_Os04g47590 LOC_Os06g37180 LOC_Os02g39700 LOC_Os07g36140 LOC_Os01g57073 LOC_Os03g22900 LOC_Os01g62840 LOC_Os02g33140 LOC_Os07g02350 LOC_Os06g40840 LOC_Os03g08010 LOC_Os03g08050 LOC_Os01g36930 LOC_Os03g02450 LOC_Os06g05660 LOC_Os02g45940 LOC_Os07g49520 LOC_Os03g17310 LOC_Os04g32330 LOC_Os02g38200 LOC_Os04g31320 LOC_Os02g35100 LOC_Os03g08020 LOC_Os06g08480 LOC_Os01g61920 LOC_Os01g23620 LOC_Os05g30530 LOC_Os01g62244 LOC_Os02g11050 LOC_Os01g54870 LOC_Os07g08170 LOC_Os02g38060 LOC_Os03g53190 LOC_Os06g08770 LOC_Os05g49800 LOC_Os07g46660 LOC_Os02g29464 LOC_Os06g16280 LOC_Os03g02780 LOC_Os06g44030 LOC_Os06g51220 LOC_Os06g15990 LOC_Os07g36500 LOC_Os01g72880 LOC_Os04g41490 LOC_Os03g38000 LOC_Os03g53700 LOC_Os04g58580 LOC_Os05g01020

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os09g08910  LOC_Os11g34305  LOC_Os08g42000  LOC_Os09g38020  LOC_Os10g39410  LOC_Os08g23710
LOC_Os09g32976  LOC_Os09g26340  LOC_Os09g08430  LOC_Os08g05840  LOC_Os11g16540  LOC_Os12g39070
LOC_Os12g07730  LOC_Os12g34510  LOC_Os11g36390  LOC_Os08g09200  LOC_Os09g17850  LOC_Os02g58410
LOC_Os02g10060   LOC_Os07g08729   LOC_Os05g05780   LOC_Os07g01870   LOC_Os01g62230   LOC_Os03g04410
LOC_Os04g30730   LOC_Os01g06010   LOC_Os02g30050   LOC_Os05g39050   LOC_Os01g05970   LOC_Os02g53680
LOC_Os06g38470   LOC_Os01g16900   LOC_Os07g43360   LOC_Os01g56980   LOC_Os05g38740   LOC_Os06g07210
LOC_Os03g28960   LOC_Os05g06840   LOC_Os04g33750   LOC_Os02g50370   LOC_Os01g73310   LOC_Os07g46540
LOC_Os02g30800   LOC_Os05g05230   LOC_Os05g41510   LOC_Os04g49420   LOC_Os04g47590   LOC_Os06g37180
LOC_Os02g39700   LOC_Os07g36140   LOC_Os01g57073   LOC_Os03g22900   LOC_Os01g62840   LOC_Os02g33140
LOC_Os07g02350   LOC_Os06g40840   LOC_Os03g08010   LOC_Os03g08050   LOC_Os01g36930   LOC_Os03g02450
LOC_Os06g05660   LOC_Os02g45940   LOC_Os07g49520   LOC_Os03g17310   LOC_Os04g32330   LOC_Os02g38200
LOC_Os04g31320   LOC_Os02g35100   LOC_Os03g08020   LOC_Os06g08480   LOC_Os01g61920   LOC_Os01g23620
LOC_Os05g30530   LOC_Os01g62244   LOC_Os02g11050   LOC_Os01g54870   LOC_Os07g08170   LOC_Os02g38060
LOC_Os03g53190   LOC_Os06g08770   LOC_Os05g49800   LOC_Os07g46660   LOC_Os02g29464   LOC_Os06g16280
LOC_Os03g02780   LOC_Os06g44030   LOC_Os06g51220   LOC_Os06g15990   LOC_Os07g36500   LOC_Os01g72880
LOC_Os04g41490   LOC_Os03g38000   LOC_Os03g53700   LOC_Os04g58580   LOC_Os05g01020

Database Links
UniprotKB	Q6Z1Z2
Ensembl	LOC_Os08g01100.1
Refseq	NP_001060758.1
EMBL	EU847018 AP005406 AP008214 AK069900 CM000145
KEGG	osa:4344416 dosa:Os08t0101100-01