RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os03g53700 View Network
Names	Os03g0748200 protein (PHD-finger family protein, expressed) (cDNA clone:001-207-H03, full insert sequence)
Function	PHD-finger domain containing protein, putative, expressed
Attributes	Length: 254 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 28805.3 pI: 4.6092 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os03g53700.1 LOC_Os03g53700.2

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os07g08729 LOC_Os07g43360 LOC_Os04g49860 LOC_Os09g24404 LOC_Os07g37640 LOC_Os06g04500 LOC_Os04g52940 LOC_Os04g54940 LOC_Os12g01160 LOC_Os04g43540 LOC_Os05g51490 LOC_Os04g54330 LOC_Os08g38570 LOC_Os04g02820 LOC_Os12g41930 LOC_Os11g32280 LOC_Os04g31950 LOC_Os08g05840 LOC_Os05g08410 LOC_Os10g28040 LOC_Os09g32810 LOC_Os07g19494 LOC_Os07g25420 LOC_Os06g11320 LOC_Os04g46450 LOC_Os07g22220 LOC_Os08g02640 LOC_Os07g06980 LOC_Os04g16776 LOC_Os05g05260 LOC_Os06g09850 LOC_Os05g19480 LOC_Os07g04240 LOC_Os07g34520 LOC_Os11g01154 LOC_Os06g36160 LOC_Os08g31460 LOC_Os03g64190 LOC_Os03g63940 LOC_Os09g06560 LOC_Os04g45930 LOC_Os04g41490 LOC_Os11g34305 LOC_Os07g07240 LOC_Os05g44350 LOC_Os12g03190 LOC_Os10g42950 LOC_Os12g06910 LOC_Os04g54340 LOC_Os03g56820 LOC_Os06g45640 LOC_Os07g25016 LOC_Os07g28280 LOC_Os03g62730 LOC_Os06g47840 LOC_Os12g35030 LOC_Os05g48030 LOC_Os08g25090 LOC_Os08g08040 LOC_Os03g53700 LOC_Os04g40650 LOC_Os10g41930 LOC_Os05g06350 LOC_Os04g42380 LOC_Os07g03160 LOC_Os03g53960 LOC_Os05g46560 LOC_Os04g46620 LOC_Os06g07860 LOC_Os09g02284 LOC_Os09g34010 LOC_Os07g31370 LOC_Os06g08480 LOC_Os11g05730 LOC_Os09g33500 LOC_Os12g38970 LOC_Os08g10470 LOC_Os07g49260 LOC_Os04g42060 LOC_Os05g46270 LOC_Os04g11880 LOC_Os05g46330 LOC_Os10g28600 LOC_Os06g04270 LOC_Os07g05570 LOC_Os07g31340 LOC_Os06g07960 LOC_Os06g06510 LOC_Os10g26660 LOC_Os10g31520 LOC_Os06g02620 LOC_Os06g06460 LOC_Os06g38470 LOC_Os07g07000 LOC_Os03g57760 LOC_Os05g36280 LOC_Os05g01020 LOC_Os12g07590 LOC_Os03g63730 LOC_Os12g28177 LOC_Os06g08800 LOC_Os10g35250 LOC_Os09g36920 LOC_Os11g40510 LOC_Os04g16814 LOC_Os11g08330 LOC_Os04g40840 LOC_Os04g43922 LOC_Os11g34350 LOC_Os10g10244 LOC_Os12g28137 LOC_Os06g48750 LOC_Os07g41800 LOC_Os05g08970 LOC_Os09g32680 LOC_Os08g02340 LOC_Os08g01100 LOC_Os04g47240 LOC_Os05g28950 LOC_Os05g23620 LOC_Os01g72980 LOC_Os02g05330 LOC_Os02g13530 LOC_Os03g44900 LOC_Os03g08010 LOC_Os02g15220 LOC_Os02g10640 LOC_Os02g14110 LOC_Os02g14000 LOC_Os01g68940 LOC_Os03g08020 LOC_Os02g30730 LOC_Os01g74460 LOC_Os02g30624 LOC_Os03g50390 LOC_Os01g08560 LOC_Os03g21950 LOC_Os02g32490 LOC_Os02g45820 LOC_Os01g69130 LOC_Os01g49330 LOC_Os02g32120 LOC_Os01g57930 LOC_Os01g60660 LOC_Os03g26090 LOC_Os03g46390 LOC_Os01g68950 LOC_Os03g07850 LOC_Os03g15650 LOC_Os01g46580 LOC_Os03g01770 LOC_Os02g33450 LOC_Os02g45180 LOC_Os03g02680 LOC_Os01g27630 LOC_Os02g29464 LOC_Os01g64640 LOC_Os03g08770 LOC_Os01g72880 LOC_Os03g11440 LOC_Os02g10060 LOC_Os03g24900 LOC_Os03g05730 LOC_Os03g09140 LOC_Os03g48140 LOC_Os01g43030 LOC_Os03g10990 LOC_Os03g23909 LOC_Os03g53700 LOC_Os01g07910 LOC_Os03g25260 LOC_Os01g72790 LOC_Os02g06480 LOC_Os01g34390 LOC_Os01g23630 LOC_Os03g16110 LOC_Os02g50370 LOC_Os03g51550 LOC_Os03g53500 LOC_Os01g48990 LOC_Os02g02424 LOC_Os03g22350 LOC_Os02g48350 LOC_Os03g20560 LOC_Os01g39260 LOC_Os01g73310 LOC_Os03g22880 LOC_Os02g40880 LOC_Os01g48920 LOC_Os01g70060 LOC_Os02g54070 LOC_Os03g13970 LOC_Os03g04980 LOC_Os01g59500 LOC_Os01g36930 LOC_Os03g53190 LOC_Os02g18380 LOC_Os03g08050 LOC_Os02g57050 LOC_Os03g18160 LOC_Os01g16540

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os07g08729  LOC_Os07g43360  LOC_Os04g49860  LOC_Os09g24404  LOC_Os07g37640  LOC_Os06g04500
LOC_Os04g52940  LOC_Os04g54940  LOC_Os12g01160  LOC_Os04g43540  LOC_Os05g51490  LOC_Os04g54330
LOC_Os08g38570  LOC_Os04g02820  LOC_Os12g41930  LOC_Os11g32280  LOC_Os04g31950  LOC_Os08g05840
LOC_Os05g08410  LOC_Os10g28040  LOC_Os09g32810  LOC_Os07g19494  LOC_Os07g25420  LOC_Os06g11320
LOC_Os04g46450  LOC_Os07g22220  LOC_Os08g02640  LOC_Os07g06980  LOC_Os04g16776  LOC_Os05g05260
LOC_Os06g09850  LOC_Os05g19480  LOC_Os07g04240  LOC_Os07g34520  LOC_Os11g01154  LOC_Os06g36160
LOC_Os08g31460  LOC_Os03g64190  LOC_Os03g63940  LOC_Os09g06560  LOC_Os04g45930  LOC_Os04g41490
LOC_Os11g34305  LOC_Os07g07240  LOC_Os05g44350  LOC_Os12g03190  LOC_Os10g42950  LOC_Os12g06910
LOC_Os04g54340  LOC_Os03g56820  LOC_Os06g45640  LOC_Os07g25016  LOC_Os07g28280  LOC_Os03g62730
LOC_Os06g47840  LOC_Os12g35030  LOC_Os05g48030  LOC_Os08g25090  LOC_Os08g08040  LOC_Os03g53700
LOC_Os04g40650  LOC_Os10g41930  LOC_Os05g06350  LOC_Os04g42380  LOC_Os07g03160  LOC_Os03g53960
LOC_Os05g46560  LOC_Os04g46620  LOC_Os06g07860  LOC_Os09g02284  LOC_Os09g34010  LOC_Os07g31370
LOC_Os06g08480  LOC_Os11g05730  LOC_Os09g33500  LOC_Os12g38970  LOC_Os08g10470  LOC_Os07g49260
LOC_Os04g42060  LOC_Os05g46270  LOC_Os04g11880  LOC_Os05g46330  LOC_Os10g28600  LOC_Os06g04270
LOC_Os07g05570  LOC_Os07g31340  LOC_Os06g07960  LOC_Os06g06510  LOC_Os10g26660  LOC_Os10g31520
LOC_Os06g02620  LOC_Os06g06460  LOC_Os06g38470  LOC_Os07g07000  LOC_Os03g57760  LOC_Os05g36280
LOC_Os05g01020  LOC_Os12g07590  LOC_Os03g63730  LOC_Os12g28177  LOC_Os06g08800  LOC_Os10g35250
LOC_Os09g36920  LOC_Os11g40510  LOC_Os04g16814  LOC_Os11g08330  LOC_Os04g40840  LOC_Os04g43922
LOC_Os11g34350  LOC_Os10g10244  LOC_Os12g28137  LOC_Os06g48750  LOC_Os07g41800  LOC_Os05g08970
LOC_Os09g32680  LOC_Os08g02340  LOC_Os08g01100  LOC_Os04g47240  LOC_Os05g28950  LOC_Os05g23620
LOC_Os01g72980   LOC_Os02g05330   LOC_Os02g13530   LOC_Os03g44900   LOC_Os03g08010   LOC_Os02g15220
LOC_Os02g10640   LOC_Os02g14110   LOC_Os02g14000   LOC_Os01g68940   LOC_Os03g08020   LOC_Os02g30730
LOC_Os01g74460   LOC_Os02g30624   LOC_Os03g50390   LOC_Os01g08560   LOC_Os03g21950   LOC_Os02g32490
LOC_Os02g45820   LOC_Os01g69130   LOC_Os01g49330   LOC_Os02g32120   LOC_Os01g57930   LOC_Os01g60660
LOC_Os03g26090   LOC_Os03g46390   LOC_Os01g68950   LOC_Os03g07850   LOC_Os03g15650   LOC_Os01g46580
LOC_Os03g01770   LOC_Os02g33450   LOC_Os02g45180   LOC_Os03g02680   LOC_Os01g27630   LOC_Os02g29464
LOC_Os01g64640   LOC_Os03g08770   LOC_Os01g72880   LOC_Os03g11440   LOC_Os02g10060   LOC_Os03g24900
LOC_Os03g05730   LOC_Os03g09140   LOC_Os03g48140   LOC_Os01g43030   LOC_Os03g10990   LOC_Os03g23909
LOC_Os03g53700   LOC_Os01g07910   LOC_Os03g25260   LOC_Os01g72790   LOC_Os02g06480   LOC_Os01g34390
LOC_Os01g23630   LOC_Os03g16110   LOC_Os02g50370   LOC_Os03g51550   LOC_Os03g53500   LOC_Os01g48990
LOC_Os02g02424   LOC_Os03g22350   LOC_Os02g48350   LOC_Os03g20560   LOC_Os01g39260   LOC_Os01g73310
LOC_Os03g22880   LOC_Os02g40880   LOC_Os01g48920   LOC_Os01g70060   LOC_Os02g54070   LOC_Os03g13970
LOC_Os03g04980   LOC_Os01g59500   LOC_Os01g36930   LOC_Os03g53190   LOC_Os02g18380   LOC_Os03g08050
LOC_Os02g57050   LOC_Os03g18160   LOC_Os01g16540

Database Links
UniprotKB	Q10CW4
Ensembl	LOC_Os03g53700.1
Refseq	NP_001051266.1
EMBL	DP000009 AP008209 AK106146
KEGG	osa:4334105 dosa:Os03t0748200-01