RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os01g70060 View Network
Names	Os01g0925000 protein (Pherophorin-dz1 protein-like) (cDNA clone:J033143H08, full insert sequence)
Function	protein of unknown function, DUF618 domain containing protein, expressed
Attributes	Length: 491 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 54929.6 pI: 6.5665 Subcellular Location (predicted): Mitochondria Nucleus
Gene Model	LOC_Os01g70060.1 LOC_Os01g70060.2

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g21890 LOC_Os08g44770 LOC_Os03g09140 LOC_Os04g54940 LOC_Os12g07350 LOC_Os03g18080 LOC_Os04g36700 LOC_Os03g53190 LOC_Os08g19850 LOC_Os06g37180 LOC_Os07g43060 LOC_Os02g07750 LOC_Os02g12570 LOC_Os03g28140 LOC_Os11g20384 LOC_Os07g31370 LOC_Os03g16110 LOC_Os03g48140 LOC_Os12g04010 LOC_Os07g41180 LOC_Os10g32880 LOC_Os11g07930 LOC_Os12g35030 LOC_Os04g46450 LOC_Os11g32240 LOC_Os05g32580 LOC_Os12g41400 LOC_Os05g05200 LOC_Os03g18500 LOC_Os07g10250 LOC_Os11g03970 LOC_Os02g56740 LOC_Os12g30060 LOC_Os12g37590 LOC_Os08g08200 LOC_Os03g21530 LOC_Os12g42150 LOC_Os12g13590 LOC_Os07g01150 LOC_Os03g10990 LOC_Os05g05860 LOC_Os02g04050 LOC_Os06g43690 LOC_Os07g49150 LOC_Os11g48020 LOC_Os05g28510 LOC_Os09g30412 LOC_Os10g29560 LOC_Os03g23909 LOC_Os03g43020 LOC_Os05g48320 LOC_Os12g04290 LOC_Os03g49710 LOC_Os03g44780 LOC_Os02g05630 LOC_Os04g42990 LOC_Os02g14860 LOC_Os06g08770 LOC_Os11g03430 LOC_Os02g05330 LOC_Os06g47840 LOC_Os02g18830 LOC_Os06g04500 LOC_Os07g08170 LOC_Os12g07050 LOC_Os08g31810 LOC_Os11g48080 LOC_Os05g45420 LOC_Os04g46620 LOC_Os12g03810 LOC_Os04g32550 LOC_Os02g02890 LOC_Os07g01020 LOC_Os08g33390 LOC_Os08g01070 LOC_Os11g45250 LOC_Os02g04160 LOC_Os05g06260 LOC_Os09g02700 LOC_Os03g11440 LOC_Os05g13630 LOC_Os12g04240 LOC_Os11g07922 LOC_Os06g41590 LOC_Os06g09850 LOC_Os03g57760 LOC_Os03g44310 LOC_Os03g21550 LOC_Os02g46150 LOC_Os02g10640 LOC_Os09g07500 LOC_Os07g32430 LOC_Os02g56130 LOC_Os09g24250 LOC_Os03g54091 LOC_Os07g46540 LOC_Os10g30100 LOC_Os05g43570 LOC_Os12g08280 LOC_Os02g53420 LOC_Os02g04270 LOC_Os06g38940 LOC_Os06g48750 LOC_Os03g15700 LOC_Os07g46660 LOC_Os05g28290 LOC_Os03g02260 LOC_Os08g10600 LOC_Os08g08080 LOC_Os12g38380 LOC_Os03g52470 LOC_Os04g20220 LOC_Os02g19860 LOC_Os04g38610 LOC_Os09g04210 LOC_Os02g40680 LOC_Os07g10600 LOC_Os09g31180 LOC_Os07g07240 LOC_Os06g30320 LOC_Os12g35360 LOC_Os05g06350 LOC_Os03g53700 LOC_Os07g19494 LOC_Os04g46890 LOC_Os02g49780 LOC_Os02g39300 LOC_Os11g34350 LOC_Os03g22690 LOC_Os02g32490 LOC_Os07g29360 LOC_Os02g37870 LOC_Os02g46130 LOC_Os11g19250 LOC_Os02g43920 LOC_Os03g08640 LOC_Os03g25260 LOC_Os04g45930 LOC_Os07g43360 LOC_Os04g49860 LOC_Os12g13950 LOC_Os03g26090 LOC_Os01g34870 LOC_Os01g67740 LOC_Os01g66520 LOC_Os01g09580 LOC_Os01g54010 LOC_Os01g65220 LOC_Os01g10290 LOC_Os01g15310 LOC_Os01g63270 LOC_Os01g63940 LOC_Os01g03070 LOC_Os01g13430 LOC_Os01g05670

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g21890  LOC_Os08g44770  LOC_Os03g09140  LOC_Os04g54940  LOC_Os12g07350  LOC_Os03g18080
LOC_Os04g36700  LOC_Os03g53190  LOC_Os08g19850  LOC_Os06g37180  LOC_Os07g43060  LOC_Os02g07750
LOC_Os02g12570  LOC_Os03g28140  LOC_Os11g20384  LOC_Os07g31370  LOC_Os03g16110  LOC_Os03g48140
LOC_Os12g04010  LOC_Os07g41180  LOC_Os10g32880  LOC_Os11g07930  LOC_Os12g35030  LOC_Os04g46450
LOC_Os11g32240  LOC_Os05g32580  LOC_Os12g41400  LOC_Os05g05200  LOC_Os03g18500  LOC_Os07g10250
LOC_Os11g03970  LOC_Os02g56740  LOC_Os12g30060  LOC_Os12g37590  LOC_Os08g08200  LOC_Os03g21530
LOC_Os12g42150  LOC_Os12g13590  LOC_Os07g01150  LOC_Os03g10990  LOC_Os05g05860  LOC_Os02g04050
LOC_Os06g43690  LOC_Os07g49150  LOC_Os11g48020  LOC_Os05g28510  LOC_Os09g30412  LOC_Os10g29560
LOC_Os03g23909  LOC_Os03g43020  LOC_Os05g48320  LOC_Os12g04290  LOC_Os03g49710  LOC_Os03g44780
LOC_Os02g05630  LOC_Os04g42990  LOC_Os02g14860  LOC_Os06g08770  LOC_Os11g03430  LOC_Os02g05330
LOC_Os06g47840  LOC_Os02g18830  LOC_Os06g04500  LOC_Os07g08170  LOC_Os12g07050  LOC_Os08g31810
LOC_Os11g48080  LOC_Os05g45420  LOC_Os04g46620  LOC_Os12g03810  LOC_Os04g32550  LOC_Os02g02890
LOC_Os07g01020  LOC_Os08g33390  LOC_Os08g01070  LOC_Os11g45250  LOC_Os02g04160  LOC_Os05g06260
LOC_Os09g02700  LOC_Os03g11440  LOC_Os05g13630  LOC_Os12g04240  LOC_Os11g07922  LOC_Os06g41590
LOC_Os06g09850  LOC_Os03g57760  LOC_Os03g44310  LOC_Os03g21550  LOC_Os02g46150  LOC_Os02g10640
LOC_Os09g07500  LOC_Os07g32430  LOC_Os02g56130  LOC_Os09g24250  LOC_Os03g54091  LOC_Os07g46540
LOC_Os10g30100  LOC_Os05g43570  LOC_Os12g08280  LOC_Os02g53420  LOC_Os02g04270  LOC_Os06g38940
LOC_Os06g48750  LOC_Os03g15700  LOC_Os07g46660  LOC_Os05g28290  LOC_Os03g02260  LOC_Os08g10600
LOC_Os08g08080  LOC_Os12g38380  LOC_Os03g52470  LOC_Os04g20220  LOC_Os02g19860  LOC_Os04g38610
LOC_Os09g04210  LOC_Os02g40680  LOC_Os07g10600  LOC_Os09g31180  LOC_Os07g07240  LOC_Os06g30320
LOC_Os12g35360  LOC_Os05g06350  LOC_Os03g53700  LOC_Os07g19494  LOC_Os04g46890  LOC_Os02g49780
LOC_Os02g39300  LOC_Os11g34350  LOC_Os03g22690  LOC_Os02g32490  LOC_Os07g29360  LOC_Os02g37870
LOC_Os02g46130  LOC_Os11g19250  LOC_Os02g43920  LOC_Os03g08640  LOC_Os03g25260  LOC_Os04g45930
LOC_Os07g43360  LOC_Os04g49860  LOC_Os12g13950  LOC_Os03g26090  LOC_Os01g34870   LOC_Os01g67740
LOC_Os01g66520   LOC_Os01g09580   LOC_Os01g54010   LOC_Os01g65220   LOC_Os01g10290   LOC_Os01g15310
LOC_Os01g63270   LOC_Os01g63940   LOC_Os01g03070   LOC_Os01g13430   LOC_Os01g05670

Database Links
UniprotKB	Q5JKG7
Ensembl	LOC_Os01g70060.1 LOC_Os01g70060.2
Refseq	NP_001045252.1
EMBL	AP004223 AP008207 AK103764
KEGG	osa:4327230 dosa:Os01t0925000-01