RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os02g32490 View Network
Names	Os02g0525900 protein (Putative acetyl-CoA synthetase) (cDNA clone:J013058P13, full insert sequence)
Function	AMP-binding enzyme, putative, expressed
Attributes	Length: 706 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 77592.2 pI: 5.8443 Subcellular Location (adjusted): Cytosol Chloroplast
Gene Model	LOC_Os02g32490.1 LOC_Os02g32490.2
Enzyme	6.2.1.1 acetate---CoA ligase

Reactions
OSR2500 OSR0927 OSR0975 OSR2339 OSR2388

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os08g23710 LOC_Os04g01130 LOC_Os05g46330 LOC_Os10g02630 LOC_Os03g50510 LOC_Os07g46660 LOC_Os10g06540 LOC_Os05g41210 LOC_Os05g30530 LOC_Os07g43980 LOC_Os06g06510 LOC_Os03g56820 LOC_Os10g35550 LOC_Os02g53420 LOC_Os07g43360 LOC_Os07g42300 LOC_Os10g21910 LOC_Os07g12250 LOC_Os05g37330 LOC_Os10g10500 LOC_Os03g53700 LOC_Os08g09320 LOC_Os07g07010 LOC_Os10g28040 LOC_Os07g08170 LOC_Os08g45010 LOC_Os11g04070 LOC_Os06g06460 LOC_Os11g11390 LOC_Os12g35570 LOC_Os07g48780 LOC_Os03g08050 LOC_Os07g31340 LOC_Os04g40840 LOC_Os07g44710 LOC_Os06g38470 LOC_Os06g19680 LOC_Os03g51600 LOC_Os12g07950 LOC_Os06g07210 LOC_Os11g05730 LOC_Os09g01640 LOC_Os03g59620 LOC_Os11g01380 LOC_Os05g01020 LOC_Os04g02820 LOC_Os03g45920 LOC_Os03g08010 LOC_Os04g19990 LOC_Os10g31864 LOC_Os05g36280 LOC_Os03g50350 LOC_Os02g51590 LOC_Os03g10990 LOC_Os02g55340 LOC_Os03g02260 LOC_Os03g53190 LOC_Os03g08020 LOC_Os12g12860 LOC_Os04g38610 LOC_Os04g11880 LOC_Os02g33450 LOC_Os07g46750 LOC_Os03g20370 LOC_Os11g14220 LOC_Os06g37180 LOC_Os06g36160 LOC_Os05g51530 LOC_Os04g14654 LOC_Os06g04270 LOC_Os05g22940 LOC_Os07g41180 LOC_Os07g06980 LOC_Os03g53960 LOC_Os07g37640 LOC_Os05g05470 LOC_Os03g08440 LOC_Os04g58110 LOC_Os03g51550 LOC_Os05g23720 LOC_Os03g50390 LOC_Os07g42450 LOC_Os05g41900 LOC_Os08g38570 LOC_Os11g06750 LOC_Os03g57790 LOC_Os03g04980 LOC_Os11g34305 LOC_Os05g33390 LOC_Os04g31390 LOC_Os12g35030 LOC_Os06g04580 LOC_Os04g46450 LOC_Os02g38920 LOC_Os04g35090 LOC_Os06g45640 LOC_Os08g09940 LOC_Os04g56160 LOC_Os10g27050 LOC_Os03g38000 LOC_Os05g42424 LOC_Os11g01420 LOC_Os06g37440 LOC_Os03g14690 LOC_Os09g32976 LOC_Os03g26440 LOC_Os10g32550 LOC_Os06g46770 LOC_Os03g25260 LOC_Os07g07240 LOC_Os02g34460 LOC_Os03g61110 LOC_Os03g44484 LOC_Os01g38970 LOC_Os01g54030 LOC_Os01g08200 LOC_Os01g08560 LOC_Os01g06590 LOC_Os01g16240 LOC_Os01g67134 LOC_Os01g64640 LOC_Os01g59360 LOC_Os02g06640 LOC_Os02g14110 LOC_Os01g40470 LOC_Os01g16190 LOC_Os01g16900 LOC_Os02g24134 LOC_Os01g59990 LOC_Os02g11830 LOC_Os01g49290 LOC_Os01g42530 LOC_Os01g54870 LOC_Os02g13530 LOC_Os01g54580 LOC_Os02g15220 LOC_Os01g61860 LOC_Os02g05340 LOC_Os02g22780 LOC_Os01g01960 LOC_Os01g18860 LOC_Os01g62840 LOC_Os01g70060 LOC_Os01g56590

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os08g23710  LOC_Os04g01130  LOC_Os05g46330  LOC_Os10g02630  LOC_Os03g50510  LOC_Os07g46660
LOC_Os10g06540  LOC_Os05g41210  LOC_Os05g30530  LOC_Os07g43980  LOC_Os06g06510  LOC_Os03g56820
LOC_Os10g35550  LOC_Os02g53420  LOC_Os07g43360  LOC_Os07g42300  LOC_Os10g21910  LOC_Os07g12250
LOC_Os05g37330  LOC_Os10g10500  LOC_Os03g53700  LOC_Os08g09320  LOC_Os07g07010  LOC_Os10g28040
LOC_Os07g08170  LOC_Os08g45010  LOC_Os11g04070  LOC_Os06g06460  LOC_Os11g11390  LOC_Os12g35570
LOC_Os07g48780  LOC_Os03g08050  LOC_Os07g31340  LOC_Os04g40840  LOC_Os07g44710  LOC_Os06g38470
LOC_Os06g19680  LOC_Os03g51600  LOC_Os12g07950  LOC_Os06g07210  LOC_Os11g05730  LOC_Os09g01640
LOC_Os03g59620  LOC_Os11g01380  LOC_Os05g01020  LOC_Os04g02820  LOC_Os03g45920  LOC_Os03g08010
LOC_Os04g19990  LOC_Os10g31864  LOC_Os05g36280  LOC_Os03g50350  LOC_Os02g51590  LOC_Os03g10990
LOC_Os02g55340  LOC_Os03g02260  LOC_Os03g53190  LOC_Os03g08020  LOC_Os12g12860  LOC_Os04g38610
LOC_Os04g11880  LOC_Os02g33450  LOC_Os07g46750  LOC_Os03g20370  LOC_Os11g14220  LOC_Os06g37180
LOC_Os06g36160  LOC_Os05g51530  LOC_Os04g14654  LOC_Os06g04270  LOC_Os05g22940  LOC_Os07g41180
LOC_Os07g06980  LOC_Os03g53960  LOC_Os07g37640  LOC_Os05g05470  LOC_Os03g08440  LOC_Os04g58110
LOC_Os03g51550  LOC_Os05g23720  LOC_Os03g50390  LOC_Os07g42450  LOC_Os05g41900  LOC_Os08g38570
LOC_Os11g06750  LOC_Os03g57790  LOC_Os03g04980  LOC_Os11g34305  LOC_Os05g33390  LOC_Os04g31390
LOC_Os12g35030  LOC_Os06g04580  LOC_Os04g46450  LOC_Os02g38920  LOC_Os04g35090  LOC_Os06g45640
LOC_Os08g09940  LOC_Os04g56160  LOC_Os10g27050  LOC_Os03g38000  LOC_Os05g42424  LOC_Os11g01420
LOC_Os06g37440  LOC_Os03g14690  LOC_Os09g32976  LOC_Os03g26440  LOC_Os10g32550  LOC_Os06g46770
LOC_Os03g25260  LOC_Os07g07240  LOC_Os02g34460  LOC_Os03g61110  LOC_Os03g44484  LOC_Os01g38970
LOC_Os01g54030   LOC_Os01g08200   LOC_Os01g08560   LOC_Os01g06590   LOC_Os01g16240   LOC_Os01g67134
LOC_Os01g64640   LOC_Os01g59360   LOC_Os02g06640   LOC_Os02g14110   LOC_Os01g40470   LOC_Os01g16190
LOC_Os01g16900   LOC_Os02g24134   LOC_Os01g59990   LOC_Os02g11830   LOC_Os01g49290   LOC_Os01g42530
LOC_Os01g54870   LOC_Os02g13530   LOC_Os01g54580   LOC_Os02g15220   LOC_Os01g61860   LOC_Os02g05340
LOC_Os02g22780   LOC_Os01g01960   LOC_Os01g18860   LOC_Os01g62840   LOC_Os01g70060   LOC_Os01g56590

Pathways
KEGG Pathway	rn00010 rn00680 rn00720 rn01100 rn01110 rn01120 rn00620 rn00640
Metacyc Pathway	GLUDEG-II-PWY PWY66-21 PWY66-162

Database Links
UniprotKB	Q6H798
Ensembl	LOC_Os02g32490.1
Refseq	NP_001046995.1
EMBL	AP004772 AP004777 AP008208 AK066073 CM000139
KEGG	osa:4329518 dosa:Os02t0525900-01