RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os07g06980 View Network
Names	Os07g0164100 protein
Function	histone deacetylase, putative, expressed
Attributes	Length: 624 Status: Complete Existence: Predicted Molecular Weight: 67066.3 pI: 5.6467 Subcellular Location (predicted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os07g06980.1 LOC_Os07g06980.2

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g30060 LOC_Os08g39820 LOC_Os12g35360 LOC_Os07g36130 LOC_Os11g40150 LOC_Os10g34670 LOC_Os07g44710 LOC_Os09g21770 LOC_Os07g49150 LOC_Os10g28040 LOC_Os11g34305 LOC_Os12g07950 LOC_Os09g19750 LOC_Os07g12250 LOC_Os12g37590 LOC_Os12g35030 LOC_Os09g10720 LOC_Os09g12710 LOC_Os11g48020 LOC_Os11g05730 LOC_Os07g31370 LOC_Os10g35250 LOC_Os09g30412 LOC_Os12g38970 LOC_Os08g09320 LOC_Os08g08040 LOC_Os07g06980 LOC_Os07g43360 LOC_Os09g32680 LOC_Os12g40780 LOC_Os08g05840 LOC_Os07g37640 LOC_Os08g44770 LOC_Os08g38570 LOC_Os07g44620 LOC_Os12g12860 LOC_Os09g08660 LOC_Os07g46660 LOC_Os02g10060 LOC_Os04g48410 LOC_Os06g04820 LOC_Os01g55300 LOC_Os02g04160 LOC_Os01g06010 LOC_Os01g56590 LOC_Os02g07750 LOC_Os03g25260 LOC_Os06g47210 LOC_Os05g48030 LOC_Os04g46620 LOC_Os04g46450 LOC_Os06g38470 LOC_Os02g53770 LOC_Os01g59360 LOC_Os01g68940 LOC_Os02g50620 LOC_Os01g04814 LOC_Os02g37880 LOC_Os06g49140 LOC_Os05g36280 LOC_Os03g09140 LOC_Os02g10640 LOC_Os03g53700 LOC_Os04g39040 LOC_Os03g63940 LOC_Os05g45420 LOC_Os06g06460 LOC_Os06g30970 LOC_Os04g10750 LOC_Os01g60410 LOC_Os01g05970 LOC_Os01g64640 LOC_Os05g01020 LOC_Os02g38300 LOC_Os03g02830 LOC_Os01g32750 LOC_Os05g37330 LOC_Os03g17020 LOC_Os06g09850 LOC_Os01g46932 LOC_Os03g20560 LOC_Os03g59660 LOC_Os02g12740 LOC_Os07g03160 LOC_Os04g32550 LOC_Os06g04600 LOC_Os05g39760 LOC_Os03g53960 LOC_Os07g01150 LOC_Os04g14654 LOC_Os01g59800 LOC_Os02g48740 LOC_Os05g46330 LOC_Os02g47210 LOC_Os01g73310 LOC_Os03g37984 LOC_Os03g57760 LOC_Os04g09860 LOC_Os01g60360 LOC_Os03g36780 LOC_Os01g59990 LOC_Os03g30460 LOC_Os03g50330 LOC_Os02g58640 LOC_Os05g30530 LOC_Os02g35100 LOC_Os01g08200 LOC_Os04g01130 LOC_Os02g52510 LOC_Os06g04580 LOC_Os05g08810 LOC_Os02g32490 LOC_Os03g08640 LOC_Os01g68950 LOC_Os02g45180 LOC_Os06g07090 LOC_Os03g53650 LOC_Os03g63420 LOC_Os05g38150 LOC_Os03g23950 LOC_Os02g39800 LOC_Os03g57040 LOC_Os05g08970 LOC_Os07g06980 LOC_Os03g53190 LOC_Os02g13990 LOC_Os02g14000 LOC_Os01g33080 LOC_Os06g06510 LOC_Os04g54940 LOC_Os04g40840 LOC_Os01g62230 LOC_Os03g04980 LOC_Os04g42990 LOC_Os01g60660 LOC_Os03g60130 LOC_Os03g13970 LOC_Os01g01960 LOC_Os05g05780 LOC_Os04g31390 LOC_Os05g19270

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g30060  LOC_Os08g39820  LOC_Os12g35360  LOC_Os07g36130  LOC_Os11g40150  LOC_Os10g34670
LOC_Os07g44710  LOC_Os09g21770  LOC_Os07g49150  LOC_Os10g28040  LOC_Os11g34305  LOC_Os12g07950
LOC_Os09g19750  LOC_Os07g12250  LOC_Os12g37590  LOC_Os12g35030  LOC_Os09g10720  LOC_Os09g12710
LOC_Os11g48020  LOC_Os11g05730  LOC_Os07g31370  LOC_Os10g35250  LOC_Os09g30412  LOC_Os12g38970
LOC_Os08g09320  LOC_Os08g08040  LOC_Os07g06980  LOC_Os07g43360  LOC_Os09g32680  LOC_Os12g40780
LOC_Os08g05840  LOC_Os07g37640  LOC_Os08g44770  LOC_Os08g38570  LOC_Os07g44620  LOC_Os12g12860
LOC_Os09g08660  LOC_Os07g46660  LOC_Os02g10060   LOC_Os04g48410   LOC_Os06g04820   LOC_Os01g55300
LOC_Os02g04160   LOC_Os01g06010   LOC_Os01g56590   LOC_Os02g07750   LOC_Os03g25260   LOC_Os06g47210
LOC_Os05g48030   LOC_Os04g46620   LOC_Os04g46450   LOC_Os06g38470   LOC_Os02g53770   LOC_Os01g59360
LOC_Os01g68940   LOC_Os02g50620   LOC_Os01g04814   LOC_Os02g37880   LOC_Os06g49140   LOC_Os05g36280
LOC_Os03g09140   LOC_Os02g10640   LOC_Os03g53700   LOC_Os04g39040   LOC_Os03g63940   LOC_Os05g45420
LOC_Os06g06460   LOC_Os06g30970   LOC_Os04g10750   LOC_Os01g60410   LOC_Os01g05970   LOC_Os01g64640
LOC_Os05g01020   LOC_Os02g38300   LOC_Os03g02830   LOC_Os01g32750   LOC_Os05g37330   LOC_Os03g17020
LOC_Os06g09850   LOC_Os01g46932   LOC_Os03g20560   LOC_Os03g59660   LOC_Os02g12740   LOC_Os07g03160
LOC_Os04g32550   LOC_Os06g04600   LOC_Os05g39760   LOC_Os03g53960   LOC_Os07g01150   LOC_Os04g14654
LOC_Os01g59800   LOC_Os02g48740   LOC_Os05g46330   LOC_Os02g47210   LOC_Os01g73310   LOC_Os03g37984
LOC_Os03g57760   LOC_Os04g09860   LOC_Os01g60360   LOC_Os03g36780   LOC_Os01g59990   LOC_Os03g30460
LOC_Os03g50330   LOC_Os02g58640   LOC_Os05g30530   LOC_Os02g35100   LOC_Os01g08200   LOC_Os04g01130
LOC_Os02g52510   LOC_Os06g04580   LOC_Os05g08810   LOC_Os02g32490   LOC_Os03g08640   LOC_Os01g68950
LOC_Os02g45180   LOC_Os06g07090   LOC_Os03g53650   LOC_Os03g63420   LOC_Os05g38150   LOC_Os03g23950
LOC_Os02g39800   LOC_Os03g57040   LOC_Os05g08970   LOC_Os07g06980   LOC_Os03g53190   LOC_Os02g13990
LOC_Os02g14000   LOC_Os01g33080   LOC_Os06g06510   LOC_Os04g54940   LOC_Os04g40840   LOC_Os01g62230
LOC_Os03g04980   LOC_Os04g42990   LOC_Os01g60660   LOC_Os03g60130   LOC_Os03g13970   LOC_Os01g01960
LOC_Os05g05780   LOC_Os04g31390   LOC_Os05g19270

Database Links
UniprotKB	Q0D8F2
Ensembl	LOC_Os07g06980.1
Refseq	NP_001058957.1
EMBL	AP008213 CM000144
KEGG	osa:4342472 dosa:Os07t0164100-01