RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os01g68940 View Network
Names	Os01g0918200 protein (Putative SUMO protein) (cDNA clone:001-103-A02, full insert sequence) (cDNA clone:J033118J24, full insert sequence)
Function	ubiquitin family domain containing protein, expressed
Attributes	Length: 102 Status: Complete Existence: Predicted Molecular Weight: 11008.3 pI: 4.8786 Subcellular Location (adjusted): Cytosol Nucleus
Gene Model	LOC_Os01g68940.1
Enzyme	3.6.1.1 inorganic diphosphatase

Reactions
OSR1027

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os10g36470 LOC_Os03g28960 LOC_Os06g08480 LOC_Os07g27930 LOC_Os11g30410 LOC_Os02g05330 LOC_Os01g74000 LOC_Os08g02410 LOC_Os10g31520 LOC_Os08g43170 LOC_Os05g03430 LOC_Os04g55720 LOC_Os05g23940 LOC_Os10g10990 LOC_Os03g21620 LOC_Os08g41300 LOC_Os06g31210 LOC_Os03g42220 LOC_Os06g03940 LOC_Os02g10060 LOC_Os02g52250 LOC_Os06g40640 LOC_Os04g55960 LOC_Os12g39650 LOC_Os02g53230 LOC_Os08g44530 LOC_Os09g02284 LOC_Os03g05730 LOC_Os02g19860 LOC_Os11g38949 LOC_Os11g06750 LOC_Os08g36774 LOC_Os09g26340 LOC_Os06g45710 LOC_Os03g45920 LOC_Os11g04670 LOC_Os03g53960 LOC_Os06g07490 LOC_Os07g13280 LOC_Os02g48660 LOC_Os03g50885 LOC_Os04g54940 LOC_Os08g44770 LOC_Os09g39590 LOC_Os04g28180 LOC_Os12g03720 LOC_Os07g27310 LOC_Os03g40180 LOC_Os09g33500 LOC_Os05g02530 LOC_Os11g38959 LOC_Os03g16860 LOC_Os04g56640 LOC_Os07g25440 LOC_Os02g11830 LOC_Os03g53700 LOC_Os07g42450 LOC_Os02g33450 LOC_Os05g48810 LOC_Os05g38530 LOC_Os10g28040 LOC_Os03g58810 LOC_Os03g21940 LOC_Os05g05230 LOC_Os05g43610 LOC_Os11g05730 LOC_Os06g51270 LOC_Os07g44430 LOC_Os09g19734 LOC_Os04g56800 LOC_Os06g15990 LOC_Os11g48090 LOC_Os06g21340 LOC_Os02g08480 LOC_Os07g30980 LOC_Os07g06980 LOC_Os03g16020 LOC_Os12g41500 LOC_Os05g08360 LOC_Os02g34460 LOC_Os02g06592 LOC_Os03g03910 LOC_Os04g52200 LOC_Os03g52840 LOC_Os12g34510 LOC_Os02g03540 LOC_Os02g18380 LOC_Os02g05340 LOC_Os03g16030 LOC_Os12g36950 LOC_Os02g03260 LOC_Os03g25260 LOC_Os03g58050 LOC_Os03g44310 LOC_Os06g36160 LOC_Os09g06560 LOC_Os03g25450 LOC_Os04g42380 LOC_Os11g40150 LOC_Os10g11620 LOC_Os04g35090 LOC_Os04g31320 LOC_Os12g41400 LOC_Os06g08380 LOC_Os11g01380 LOC_Os03g60939 LOC_Os02g39700 LOC_Os07g39780 LOC_Os02g02410 LOC_Os04g32330 LOC_Os03g26440 LOC_Os02g54340 LOC_Os10g39410 LOC_Os06g19980 LOC_Os09g38020 LOC_Os01g68940 LOC_Os04g57520 LOC_Os03g16920 LOC_Os03g02780 LOC_Os03g50980 LOC_Os06g02144 LOC_Os11g38810 LOC_Os06g22140 LOC_Os03g22740 LOC_Os03g60550 LOC_Os10g30100 LOC_Os05g48030 LOC_Os11g29190 LOC_Os03g63410 LOC_Os03g08050 LOC_Os07g45064 LOC_Os05g28280 LOC_Os12g39070 LOC_Os07g30300 LOC_Os05g41180 LOC_Os09g20820 LOC_Os06g36700 LOC_Os03g59020 LOC_Os02g49610 LOC_Os03g14990 LOC_Os04g40940 LOC_Os07g40580 LOC_Os10g39120 LOC_Os08g41790 LOC_Os04g51630 LOC_Os08g01680 LOC_Os03g05300 LOC_Os07g48290 LOC_Os05g24770 LOC_Os07g25420 LOC_Os03g15780 LOC_Os02g27950 LOC_Os04g40870 LOC_Os11g29400 LOC_Os02g30630 LOC_Os02g45940 LOC_Os03g05980 LOC_Os03g17020 LOC_Os12g04440 LOC_Os06g30970 LOC_Os07g08330 LOC_Os12g25710 LOC_Os03g10340 LOC_Os05g16660 LOC_Os02g47150 LOC_Os04g41490 LOC_Os05g33240 LOC_Os07g08170 LOC_Os02g13140 LOC_Os05g41750 LOC_Os08g18150 LOC_Os06g09570 LOC_Os08g23150 LOC_Os03g18410 LOC_Os02g45180 LOC_Os05g30530 LOC_Os02g56130 LOC_Os05g28750 LOC_Os10g25320 LOC_Os07g36140 LOC_Os05g46330 LOC_Os10g40140 LOC_Os04g42010 LOC_Os03g22180 LOC_Os06g17840 LOC_Os06g48350 LOC_Os03g08440 LOC_Os04g36890 LOC_Os07g49150 LOC_Os05g05470 LOC_Os02g49270 LOC_Os10g11200 LOC_Os02g14929 LOC_Os06g06510 LOC_Os05g46560 LOC_Os10g31900 LOC_Os11g16580 LOC_Os06g04510 LOC_Os05g04630 LOC_Os05g25310 LOC_Os05g19370 LOC_Os02g50350 LOC_Os12g38970 LOC_Os03g02260 LOC_Os06g15420 LOC_Os04g01970 LOC_Os03g22900 LOC_Os07g34740 LOC_Os12g35030 LOC_Os03g45320 LOC_Os08g21660 LOC_Os03g13800 LOC_Os09g36920 LOC_Os08g04180 LOC_Os07g36500 LOC_Os06g09170 LOC_Os06g48355 LOC_Os02g03750 LOC_Os02g15220 LOC_Os04g38610 LOC_Os07g07709 LOC_Os08g06200 LOC_Os07g29320 LOC_Os03g58130 LOC_Os03g13000 LOC_Os12g30060 LOC_Os03g49210 LOC_Os09g07830 LOC_Os01g68950 LOC_Os07g39870 LOC_Os05g39050 LOC_Os10g32550 LOC_Os02g02890 LOC_Os03g02480 LOC_Os02g53420 LOC_Os09g02700 LOC_Os03g49220 LOC_Os03g08010 LOC_Os02g37870 LOC_Os08g23120 LOC_Os03g13170 LOC_Os04g58110 LOC_Os01g73310 LOC_Os10g41450 LOC_Os06g04270 LOC_Os02g03450 LOC_Os05g19970 LOC_Os10g27190 LOC_Os03g22550 LOC_Os03g21530 LOC_Os04g02820 LOC_Os02g07490 LOC_Os11g09280 LOC_Os11g29370 LOC_Os03g29460 LOC_Os08g42560 LOC_Os08g02400 LOC_Os03g55280 LOC_Os06g14620 LOC_Os10g41930 LOC_Os04g58580 LOC_Os12g06890 LOC_Os03g59040 LOC_Os05g45420 LOC_Os06g06460 LOC_Os05g08970 LOC_Os10g35290 LOC_Os12g25700 LOC_Os07g16950 LOC_Os04g39700 LOC_Os03g08020 LOC_Os08g39140 LOC_Os09g23150 LOC_Os08g05590 LOC_Os02g52940 LOC_Os10g33060 LOC_Os12g13320 LOC_Os11g14220 LOC_Os09g39500 LOC_Os12g38000 LOC_Os03g50380 LOC_Os05g01020 LOC_Os02g51590 LOC_Os04g49420 LOC_Os05g01440 LOC_Os08g05840 LOC_Os03g51900 LOC_Os05g36280 LOC_Os11g11070 LOC_Os12g07730 LOC_Os09g30412 LOC_Os03g55570 LOC_Os10g34380 LOC_Os04g36030 LOC_Os10g08550 LOC_Os09g32532 LOC_Os05g38740 LOC_Os09g12270 LOC_Os05g22260 LOC_Os02g34600 LOC_Os03g10510 LOC_Os10g10500 LOC_Os02g12850 LOC_Os11g20790 LOC_Os05g48510 LOC_Os03g64190 LOC_Os05g49800 LOC_Os06g07878 LOC_Os05g06440 LOC_Os08g05890 LOC_Os05g51790 LOC_Os03g50880 LOC_Os02g28810 LOC_Os02g38920 LOC_Os03g04750 LOC_Os05g05860 LOC_Os06g06030 LOC_Os03g63590 LOC_Os05g06350 LOC_Os03g27970 LOC_Os06g37180 LOC_Os01g71230 LOC_Os03g51600 LOC_Os12g21890 LOC_Os08g08220 LOC_Os03g18510 LOC_Os02g57220 LOC_Os12g19590 LOC_Os08g32650 LOC_Os06g08770 LOC_Os10g32820 LOC_Os03g38000 LOC_Os02g13530 LOC_Os06g07978 LOC_Os06g48750 LOC_Os05g22670 LOC_Os06g49110 LOC_Os04g52900 LOC_Os11g36390 LOC_Os06g01990 LOC_Os06g43760 LOC_Os03g61670 LOC_Os02g37000 LOC_Os02g56740 LOC_Os05g11770 LOC_Os07g29360 LOC_Os01g38970 LOC_Os01g05970 LOC_Os01g15260 LOC_Os01g42530 LOC_Os01g37832 LOC_Os01g18860 LOC_Os01g05490 LOC_Os01g34200 LOC_Os01g64970 LOC_Os01g47540 LOC_Os01g36890 LOC_Os01g51410 LOC_Os01g06010 LOC_Os01g40840 LOC_Os01g19170 LOC_Os01g62840 LOC_Os01g36920 LOC_Os01g13190 LOC_Os01g68940 LOC_Os01g62230 LOC_Os01g56550 LOC_Os01g46580 LOC_Os01g63270 LOC_Os01g67134 LOC_Os01g16900 LOC_Os01g62410 LOC_Os01g34870 LOC_Os01g01060 LOC_Os01g64640 LOC_Os01g54370 LOC_Os01g60410 LOC_Os01g01510 LOC_Os01g47410 LOC_Os01g67860 LOC_Os01g62080 LOC_Os01g19840 LOC_Os01g49190 LOC_Os01g05420 LOC_Os01g64900 LOC_Os01g43020 LOC_Os01g59360 LOC_Os01g61920 LOC_Os01g08560 LOC_Os01g67250 LOC_Os01g60360

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os10g36470  LOC_Os03g28960  LOC_Os06g08480  LOC_Os07g27930  LOC_Os11g30410  LOC_Os02g05330
LOC_Os01g74000  LOC_Os08g02410  LOC_Os10g31520  LOC_Os08g43170  LOC_Os05g03430  LOC_Os04g55720
LOC_Os05g23940  LOC_Os10g10990  LOC_Os03g21620  LOC_Os08g41300  LOC_Os06g31210  LOC_Os03g42220
LOC_Os06g03940  LOC_Os02g10060  LOC_Os02g52250  LOC_Os06g40640  LOC_Os04g55960  LOC_Os12g39650
LOC_Os02g53230  LOC_Os08g44530  LOC_Os09g02284  LOC_Os03g05730  LOC_Os02g19860  LOC_Os11g38949
LOC_Os11g06750  LOC_Os08g36774  LOC_Os09g26340  LOC_Os06g45710  LOC_Os03g45920  LOC_Os11g04670
LOC_Os03g53960  LOC_Os06g07490  LOC_Os07g13280  LOC_Os02g48660  LOC_Os03g50885  LOC_Os04g54940
LOC_Os08g44770  LOC_Os09g39590  LOC_Os04g28180  LOC_Os12g03720  LOC_Os07g27310  LOC_Os03g40180
LOC_Os09g33500  LOC_Os05g02530  LOC_Os11g38959  LOC_Os03g16860  LOC_Os04g56640  LOC_Os07g25440
LOC_Os02g11830  LOC_Os03g53700  LOC_Os07g42450  LOC_Os02g33450  LOC_Os05g48810  LOC_Os05g38530
LOC_Os10g28040  LOC_Os03g58810  LOC_Os03g21940  LOC_Os05g05230  LOC_Os05g43610  LOC_Os11g05730
LOC_Os06g51270  LOC_Os07g44430  LOC_Os09g19734  LOC_Os04g56800  LOC_Os06g15990  LOC_Os11g48090
LOC_Os06g21340  LOC_Os02g08480  LOC_Os07g30980  LOC_Os07g06980  LOC_Os03g16020  LOC_Os12g41500
LOC_Os05g08360  LOC_Os02g34460  LOC_Os02g06592  LOC_Os03g03910  LOC_Os04g52200  LOC_Os03g52840
LOC_Os12g34510  LOC_Os02g03540  LOC_Os02g18380  LOC_Os02g05340  LOC_Os03g16030  LOC_Os12g36950
LOC_Os02g03260  LOC_Os03g25260  LOC_Os03g58050  LOC_Os03g44310  LOC_Os06g36160  LOC_Os09g06560
LOC_Os03g25450  LOC_Os04g42380  LOC_Os11g40150  LOC_Os10g11620  LOC_Os04g35090  LOC_Os04g31320
LOC_Os12g41400  LOC_Os06g08380  LOC_Os11g01380  LOC_Os03g60939  LOC_Os02g39700  LOC_Os07g39780
LOC_Os02g02410  LOC_Os04g32330  LOC_Os03g26440  LOC_Os02g54340  LOC_Os10g39410  LOC_Os06g19980
LOC_Os09g38020  LOC_Os01g68940  LOC_Os04g57520  LOC_Os03g16920  LOC_Os03g02780  LOC_Os03g50980
LOC_Os06g02144  LOC_Os11g38810  LOC_Os06g22140  LOC_Os03g22740  LOC_Os03g60550  LOC_Os10g30100
LOC_Os05g48030  LOC_Os11g29190  LOC_Os03g63410  LOC_Os03g08050  LOC_Os07g45064  LOC_Os05g28280
LOC_Os12g39070  LOC_Os07g30300  LOC_Os05g41180  LOC_Os09g20820  LOC_Os06g36700  LOC_Os03g59020
LOC_Os02g49610  LOC_Os03g14990  LOC_Os04g40940  LOC_Os07g40580  LOC_Os10g39120  LOC_Os08g41790
LOC_Os04g51630  LOC_Os08g01680  LOC_Os03g05300  LOC_Os07g48290  LOC_Os05g24770  LOC_Os07g25420
LOC_Os03g15780  LOC_Os02g27950  LOC_Os04g40870  LOC_Os11g29400  LOC_Os02g30630  LOC_Os02g45940
LOC_Os03g05980  LOC_Os03g17020  LOC_Os12g04440  LOC_Os06g30970  LOC_Os07g08330  LOC_Os12g25710
LOC_Os03g10340  LOC_Os05g16660  LOC_Os02g47150  LOC_Os04g41490  LOC_Os05g33240  LOC_Os07g08170
LOC_Os02g13140  LOC_Os05g41750  LOC_Os08g18150  LOC_Os06g09570  LOC_Os08g23150  LOC_Os03g18410
LOC_Os02g45180  LOC_Os05g30530  LOC_Os02g56130  LOC_Os05g28750  LOC_Os10g25320  LOC_Os07g36140
LOC_Os05g46330  LOC_Os10g40140  LOC_Os04g42010  LOC_Os03g22180  LOC_Os06g17840  LOC_Os06g48350
LOC_Os03g08440  LOC_Os04g36890  LOC_Os07g49150  LOC_Os05g05470  LOC_Os02g49270  LOC_Os10g11200
LOC_Os02g14929  LOC_Os06g06510  LOC_Os05g46560  LOC_Os10g31900  LOC_Os11g16580  LOC_Os06g04510
LOC_Os05g04630  LOC_Os05g25310  LOC_Os05g19370  LOC_Os02g50350  LOC_Os12g38970  LOC_Os03g02260
LOC_Os06g15420  LOC_Os04g01970  LOC_Os03g22900  LOC_Os07g34740  LOC_Os12g35030  LOC_Os03g45320
LOC_Os08g21660  LOC_Os03g13800  LOC_Os09g36920  LOC_Os08g04180  LOC_Os07g36500  LOC_Os06g09170
LOC_Os06g48355  LOC_Os02g03750  LOC_Os02g15220  LOC_Os04g38610  LOC_Os07g07709  LOC_Os08g06200
LOC_Os07g29320  LOC_Os03g58130  LOC_Os03g13000  LOC_Os12g30060  LOC_Os03g49210  LOC_Os09g07830
LOC_Os01g68950  LOC_Os07g39870  LOC_Os05g39050  LOC_Os10g32550  LOC_Os02g02890  LOC_Os03g02480
LOC_Os02g53420  LOC_Os09g02700  LOC_Os03g49220  LOC_Os03g08010  LOC_Os02g37870  LOC_Os08g23120
LOC_Os03g13170  LOC_Os04g58110  LOC_Os01g73310  LOC_Os10g41450  LOC_Os06g04270  LOC_Os02g03450
LOC_Os05g19970  LOC_Os10g27190  LOC_Os03g22550  LOC_Os03g21530  LOC_Os04g02820  LOC_Os02g07490
LOC_Os11g09280  LOC_Os11g29370  LOC_Os03g29460  LOC_Os08g42560  LOC_Os08g02400  LOC_Os03g55280
LOC_Os06g14620  LOC_Os10g41930  LOC_Os04g58580  LOC_Os12g06890  LOC_Os03g59040  LOC_Os05g45420
LOC_Os06g06460  LOC_Os05g08970  LOC_Os10g35290  LOC_Os12g25700  LOC_Os07g16950  LOC_Os04g39700
LOC_Os03g08020  LOC_Os08g39140  LOC_Os09g23150  LOC_Os08g05590  LOC_Os02g52940  LOC_Os10g33060
LOC_Os12g13320  LOC_Os11g14220  LOC_Os09g39500  LOC_Os12g38000  LOC_Os03g50380  LOC_Os05g01020
LOC_Os02g51590  LOC_Os04g49420  LOC_Os05g01440  LOC_Os08g05840  LOC_Os03g51900  LOC_Os05g36280
LOC_Os11g11070  LOC_Os12g07730  LOC_Os09g30412  LOC_Os03g55570  LOC_Os10g34380  LOC_Os04g36030
LOC_Os10g08550  LOC_Os09g32532  LOC_Os05g38740  LOC_Os09g12270  LOC_Os05g22260  LOC_Os02g34600
LOC_Os03g10510  LOC_Os10g10500  LOC_Os02g12850  LOC_Os11g20790  LOC_Os05g48510  LOC_Os03g64190
LOC_Os05g49800  LOC_Os06g07878  LOC_Os05g06440  LOC_Os08g05890  LOC_Os05g51790  LOC_Os03g50880
LOC_Os02g28810  LOC_Os02g38920  LOC_Os03g04750  LOC_Os05g05860  LOC_Os06g06030  LOC_Os03g63590
LOC_Os05g06350  LOC_Os03g27970  LOC_Os06g37180  LOC_Os01g71230  LOC_Os03g51600  LOC_Os12g21890
LOC_Os08g08220  LOC_Os03g18510  LOC_Os02g57220  LOC_Os12g19590  LOC_Os08g32650  LOC_Os06g08770
LOC_Os10g32820  LOC_Os03g38000  LOC_Os02g13530  LOC_Os06g07978  LOC_Os06g48750  LOC_Os05g22670
LOC_Os06g49110  LOC_Os04g52900  LOC_Os11g36390  LOC_Os06g01990  LOC_Os06g43760  LOC_Os03g61670
LOC_Os02g37000  LOC_Os02g56740  LOC_Os05g11770  LOC_Os07g29360  LOC_Os01g38970   LOC_Os01g05970
LOC_Os01g15260   LOC_Os01g42530   LOC_Os01g37832   LOC_Os01g18860   LOC_Os01g05490   LOC_Os01g34200
LOC_Os01g64970   LOC_Os01g47540   LOC_Os01g36890   LOC_Os01g51410   LOC_Os01g06010   LOC_Os01g40840
LOC_Os01g19170   LOC_Os01g62840   LOC_Os01g36920   LOC_Os01g13190   LOC_Os01g68940   LOC_Os01g62230
LOC_Os01g56550   LOC_Os01g46580   LOC_Os01g63270   LOC_Os01g67134   LOC_Os01g16900   LOC_Os01g62410
LOC_Os01g34870   LOC_Os01g01060   LOC_Os01g64640   LOC_Os01g54370   LOC_Os01g60410   LOC_Os01g01510
LOC_Os01g47410   LOC_Os01g67860   LOC_Os01g62080   LOC_Os01g19840   LOC_Os01g49190   LOC_Os01g05420
LOC_Os01g64900   LOC_Os01g43020   LOC_Os01g59360   LOC_Os01g61920   LOC_Os01g08560   LOC_Os01g67250
LOC_Os01g60360

Pathways
Metacyc Pathway	P61-PWY

Database Links
UniprotKB	Q8RZU9
Ensembl	LOC_Os01g68940.1
Refseq	NP_001045206.1
EMBL	AP003451 AP008207 AK062434 AK103092
KEGG	osa:4324359 dosa:Os01t0918200-01