RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os04g40940 View Network
Names	Os04g0486500 protein (cDNA clone:001-007-B02, full insert sequence)
Function	mitotic spindle checkpoint protein MAD2, putative, expressed
Attributes	Length: 208 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 23562.1 pI: 4.5774 Subcellular Location (predicted): Mitochondria
Gene Model	LOC_Os04g40940.1 LOC_Os04g40940.2

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os05g13300 LOC_Os04g42880 LOC_Os08g40140 LOC_Os09g38020 LOC_Os06g40840 LOC_Os10g42420 LOC_Os12g13390 LOC_Os05g29870 LOC_Os09g30412 LOC_Os06g51270 LOC_Os08g08080 LOC_Os08g37350 LOC_Os06g20090 LOC_Os09g06560 LOC_Os06g04580 LOC_Os07g36500 LOC_Os06g06510 LOC_Os08g44520 LOC_Os09g16380 LOC_Os11g07450 LOC_Os04g53760 LOC_Os10g39410 LOC_Os11g03990 LOC_Os05g03610 LOC_Os04g40940 LOC_Os08g33340 LOC_Os04g56070 LOC_Os05g32720 LOC_Os07g43360 LOC_Os04g47580 LOC_Os07g44620 LOC_Os12g03810 LOC_Os08g36150 LOC_Os11g05730 LOC_Os06g14310 LOC_Os12g37590 LOC_Os05g37980 LOC_Os04g49420 LOC_Os08g36490 LOC_Os11g03430 LOC_Os04g54940 LOC_Os12g44330 LOC_Os06g46990 LOC_Os06g06460 LOC_Os12g37370 LOC_Os05g39050 LOC_Os07g32480 LOC_Os07g08840 LOC_Os05g01500 LOC_Os08g39140 LOC_Os11g36060 LOC_Os10g35580 LOC_Os12g35290 LOC_Os08g09320 LOC_Os05g28190 LOC_Os07g08729 LOC_Os05g44310 LOC_Os06g50910 LOC_Os12g03822 LOC_Os05g39850 LOC_Os09g37280 LOC_Os12g30030 LOC_Os05g38740 LOC_Os06g15360 LOC_Os09g20820 LOC_Os05g06450 LOC_Os04g54340 LOC_Os06g07090 LOC_Os08g42000 LOC_Os12g02820 LOC_Os11g03970 LOC_Os05g36280 LOC_Os09g28900 LOC_Os12g39070 LOC_Os10g34670 LOC_Os12g30060 LOC_Os06g08380 LOC_Os06g41750 LOC_Os11g26910 LOC_Os08g37140 LOC_Os08g42410 LOC_Os09g16330 LOC_Os09g26340 LOC_Os05g05210 LOC_Os07g07220 LOC_Os10g37490 LOC_Os12g36950 LOC_Os05g42300 LOC_Os09g28050 LOC_Os12g35560 LOC_Os06g01630 LOC_Os06g45710 LOC_Os07g30300 LOC_Os02g45940 LOC_Os03g03150 LOC_Os01g37800 LOC_Os03g04980 LOC_Os01g23630 LOC_Os03g49230 LOC_Os01g08560 LOC_Os01g55490 LOC_Os03g08140 LOC_Os01g64640 LOC_Os02g24330 LOC_Os03g60090 LOC_Os01g01312 LOC_Os03g52840 LOC_Os03g16920 LOC_Os02g42590 LOC_Os04g31950 LOC_Os01g43580 LOC_Os01g69110 LOC_Os03g58630 LOC_Os04g40940 LOC_Os03g13370 LOC_Os03g31400 LOC_Os01g61920 LOC_Os02g14000 LOC_Os02g08300 LOC_Os03g13614 LOC_Os03g51600 LOC_Os03g25620 LOC_Os03g03650 LOC_Os01g68940 LOC_Os01g64820 LOC_Os02g53680 LOC_Os02g30624 LOC_Os03g13850 LOC_Os03g45920 LOC_Os02g32690 LOC_Os03g57870 LOC_Os03g25260 LOC_Os03g15810 LOC_Os03g33580 LOC_Os03g02290 LOC_Os02g10020 LOC_Os02g02360 LOC_Os03g54091 LOC_Os03g59700 LOC_Os04g39040 LOC_Os03g43020 LOC_Os04g40830 LOC_Os02g40680 LOC_Os03g63710 LOC_Os01g16650 LOC_Os02g57690 LOC_Os03g01100 LOC_Os01g40840 LOC_Os02g08480 LOC_Os02g19860 LOC_Os01g33040 LOC_Os01g43020 LOC_Os03g56260 LOC_Os01g60040 LOC_Os01g54010 LOC_Os02g38920 LOC_Os01g67250 LOC_Os03g17020 LOC_Os02g47180 LOC_Os03g05730 LOC_Os01g68950 LOC_Os03g08640 LOC_Os02g43920 LOC_Os03g02680 LOC_Os03g03610 LOC_Os03g02780 LOC_Os03g53190 LOC_Os03g57040 LOC_Os02g14860 LOC_Os03g16110

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os05g13300  LOC_Os04g42880  LOC_Os08g40140  LOC_Os09g38020  LOC_Os06g40840  LOC_Os10g42420
LOC_Os12g13390  LOC_Os05g29870  LOC_Os09g30412  LOC_Os06g51270  LOC_Os08g08080  LOC_Os08g37350
LOC_Os06g20090  LOC_Os09g06560  LOC_Os06g04580  LOC_Os07g36500  LOC_Os06g06510  LOC_Os08g44520
LOC_Os09g16380  LOC_Os11g07450  LOC_Os04g53760  LOC_Os10g39410  LOC_Os11g03990  LOC_Os05g03610
LOC_Os04g40940  LOC_Os08g33340  LOC_Os04g56070  LOC_Os05g32720  LOC_Os07g43360  LOC_Os04g47580
LOC_Os07g44620  LOC_Os12g03810  LOC_Os08g36150  LOC_Os11g05730  LOC_Os06g14310  LOC_Os12g37590
LOC_Os05g37980  LOC_Os04g49420  LOC_Os08g36490  LOC_Os11g03430  LOC_Os04g54940  LOC_Os12g44330
LOC_Os06g46990  LOC_Os06g06460  LOC_Os12g37370  LOC_Os05g39050  LOC_Os07g32480  LOC_Os07g08840
LOC_Os05g01500  LOC_Os08g39140  LOC_Os11g36060  LOC_Os10g35580  LOC_Os12g35290  LOC_Os08g09320
LOC_Os05g28190  LOC_Os07g08729  LOC_Os05g44310  LOC_Os06g50910  LOC_Os12g03822  LOC_Os05g39850
LOC_Os09g37280  LOC_Os12g30030  LOC_Os05g38740  LOC_Os06g15360  LOC_Os09g20820  LOC_Os05g06450
LOC_Os04g54340  LOC_Os06g07090  LOC_Os08g42000  LOC_Os12g02820  LOC_Os11g03970  LOC_Os05g36280
LOC_Os09g28900  LOC_Os12g39070  LOC_Os10g34670  LOC_Os12g30060  LOC_Os06g08380  LOC_Os06g41750
LOC_Os11g26910  LOC_Os08g37140  LOC_Os08g42410  LOC_Os09g16330  LOC_Os09g26340  LOC_Os05g05210
LOC_Os07g07220  LOC_Os10g37490  LOC_Os12g36950  LOC_Os05g42300  LOC_Os09g28050  LOC_Os12g35560
LOC_Os06g01630  LOC_Os06g45710  LOC_Os07g30300  LOC_Os02g45940   LOC_Os03g03150   LOC_Os01g37800
LOC_Os03g04980   LOC_Os01g23630   LOC_Os03g49230   LOC_Os01g08560   LOC_Os01g55490   LOC_Os03g08140
LOC_Os01g64640   LOC_Os02g24330   LOC_Os03g60090   LOC_Os01g01312   LOC_Os03g52840   LOC_Os03g16920
LOC_Os02g42590   LOC_Os04g31950   LOC_Os01g43580   LOC_Os01g69110   LOC_Os03g58630   LOC_Os04g40940
LOC_Os03g13370   LOC_Os03g31400   LOC_Os01g61920   LOC_Os02g14000   LOC_Os02g08300   LOC_Os03g13614
LOC_Os03g51600   LOC_Os03g25620   LOC_Os03g03650   LOC_Os01g68940   LOC_Os01g64820   LOC_Os02g53680
LOC_Os02g30624   LOC_Os03g13850   LOC_Os03g45920   LOC_Os02g32690   LOC_Os03g57870   LOC_Os03g25260
LOC_Os03g15810   LOC_Os03g33580   LOC_Os03g02290   LOC_Os02g10020   LOC_Os02g02360   LOC_Os03g54091
LOC_Os03g59700   LOC_Os04g39040   LOC_Os03g43020   LOC_Os04g40830   LOC_Os02g40680   LOC_Os03g63710
LOC_Os01g16650   LOC_Os02g57690   LOC_Os03g01100   LOC_Os01g40840   LOC_Os02g08480   LOC_Os02g19860
LOC_Os01g33040   LOC_Os01g43020   LOC_Os03g56260   LOC_Os01g60040   LOC_Os01g54010   LOC_Os02g38920
LOC_Os01g67250   LOC_Os03g17020   LOC_Os02g47180   LOC_Os03g05730   LOC_Os01g68950   LOC_Os03g08640
LOC_Os02g43920   LOC_Os03g02680   LOC_Os03g03610   LOC_Os03g02780   LOC_Os03g53190   LOC_Os03g57040
LOC_Os02g14860   LOC_Os03g16110

Database Links
UniprotKB	Q0JC85
Ensembl	LOC_Os04g40940.1
Refseq	NP_001053138.1
EMBL	AP008210 AK111976
KEGG	osa:4336215 dosa:Os04t0486500-01