RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os03g04980 View Network
Names	Os03g0143600 protein (PHD-finger family protein, expressed) (Putative PHD-finger protein) (cDNA clone:J013154F02, full insert sequence)
Function	PHD-finger domain containing protein, putative, expressed
Attributes	Length: 254 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 27616.1 pI: 5.721 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os03g04980.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os04g52690 LOC_Os06g06460 LOC_Os04g40940 LOC_Os03g43890 LOC_Os04g38870 LOC_Os03g46390 LOC_Os07g36140 LOC_Os07g22220 LOC_Os08g01680 LOC_Os09g19734 LOC_Os05g46330 LOC_Os03g55620 LOC_Os08g05840 LOC_Os03g53960 LOC_Os05g51500 LOC_Os03g16130 LOC_Os07g43360 LOC_Os03g10990 LOC_Os09g34970 LOC_Os07g45064 LOC_Os06g30970 LOC_Os03g57790 LOC_Os05g06350 LOC_Os07g08729 LOC_Os03g64190 LOC_Os04g36810 LOC_Os08g08080 LOC_Os03g25260 LOC_Os08g09320 LOC_Os07g13270 LOC_Os12g35030 LOC_Os09g28900 LOC_Os08g04280 LOC_Os03g06760 LOC_Os10g41520 LOC_Os06g37180 LOC_Os07g44710 LOC_Os03g22570 LOC_Os03g44200 LOC_Os07g07240 LOC_Os07g47710 LOC_Os10g34750 LOC_Os06g08770 LOC_Os09g21770 LOC_Os09g36920 LOC_Os06g43860 LOC_Os08g08020 LOC_Os03g50330 LOC_Os03g51550 LOC_Os04g40830 LOC_Os04g54340 LOC_Os07g30300 LOC_Os03g10510 LOC_Os07g41800 LOC_Os06g36990 LOC_Os12g12860 LOC_Os04g31390 LOC_Os11g34300 LOC_Os12g07950 LOC_Os05g36280 LOC_Os04g19990 LOC_Os05g01030 LOC_Os12g34510 LOC_Os10g30100 LOC_Os04g01130 LOC_Os08g38570 LOC_Os08g25130 LOC_Os09g32680 LOC_Os09g33980 LOC_Os03g57210 LOC_Os09g01640 LOC_Os09g11270 LOC_Os12g38970 LOC_Os05g28510 LOC_Os07g28280 LOC_Os06g06510 LOC_Os03g53720 LOC_Os08g08060 LOC_Os04g14654 LOC_Os04g31950 LOC_Os05g48030 LOC_Os03g15810 LOC_Os09g08910 LOC_Os03g53190 LOC_Os10g28040 LOC_Os10g35580 LOC_Os04g40840 LOC_Os11g05730 LOC_Os06g04580 LOC_Os07g37640 LOC_Os07g13280 LOC_Os06g04450 LOC_Os07g06980 LOC_Os06g38470 LOC_Os03g19059 LOC_Os05g01020 LOC_Os03g63420 LOC_Os03g53700 LOC_Os07g36130 LOC_Os12g44330 LOC_Os07g41180 LOC_Os05g38710 LOC_Os05g33390 LOC_Os11g34305 LOC_Os04g09800 LOC_Os07g44630 LOC_Os07g08170 LOC_Os04g46450 LOC_Os10g42950 LOC_Os10g39030 LOC_Os03g50390 LOC_Os12g08740 LOC_Os05g05780 LOC_Os04g54940 LOC_Os03g07080 LOC_Os03g03150 LOC_Os01g40470 LOC_Os01g46980 LOC_Os03g02980 LOC_Os02g42314 LOC_Os02g07750 LOC_Os02g29464 LOC_Os01g59800 LOC_Os02g14110 LOC_Os01g60410 LOC_Os02g58640 LOC_Os01g60360 LOC_Os02g21460 LOC_Os02g38300 LOC_Os02g57854 LOC_Os01g59360 LOC_Os02g43920 LOC_Os02g04160 LOC_Os02g58510 LOC_Os02g13130 LOC_Os01g36930 LOC_Os01g48920 LOC_Os01g01960 LOC_Os02g30624 LOC_Os01g48210 LOC_Os02g39800 LOC_Os02g05630 LOC_Os02g32490 LOC_Os02g55300 LOC_Os01g09580 LOC_Os01g73310 LOC_Os01g43030 LOC_Os01g72790 LOC_Os02g07870 LOC_Os02g15220 LOC_Os02g24134 LOC_Os03g01810 LOC_Os01g64640

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os04g52690  LOC_Os06g06460  LOC_Os04g40940  LOC_Os03g43890  LOC_Os04g38870  LOC_Os03g46390
LOC_Os07g36140  LOC_Os07g22220  LOC_Os08g01680  LOC_Os09g19734  LOC_Os05g46330  LOC_Os03g55620
LOC_Os08g05840  LOC_Os03g53960  LOC_Os05g51500  LOC_Os03g16130  LOC_Os07g43360  LOC_Os03g10990
LOC_Os09g34970  LOC_Os07g45064  LOC_Os06g30970  LOC_Os03g57790  LOC_Os05g06350  LOC_Os07g08729
LOC_Os03g64190  LOC_Os04g36810  LOC_Os08g08080  LOC_Os03g25260  LOC_Os08g09320  LOC_Os07g13270
LOC_Os12g35030  LOC_Os09g28900  LOC_Os08g04280  LOC_Os03g06760  LOC_Os10g41520  LOC_Os06g37180
LOC_Os07g44710  LOC_Os03g22570  LOC_Os03g44200  LOC_Os07g07240  LOC_Os07g47710  LOC_Os10g34750
LOC_Os06g08770  LOC_Os09g21770  LOC_Os09g36920  LOC_Os06g43860  LOC_Os08g08020  LOC_Os03g50330
LOC_Os03g51550  LOC_Os04g40830  LOC_Os04g54340  LOC_Os07g30300  LOC_Os03g10510  LOC_Os07g41800
LOC_Os06g36990  LOC_Os12g12860  LOC_Os04g31390  LOC_Os11g34300  LOC_Os12g07950  LOC_Os05g36280
LOC_Os04g19990  LOC_Os05g01030  LOC_Os12g34510  LOC_Os10g30100  LOC_Os04g01130  LOC_Os08g38570
LOC_Os08g25130  LOC_Os09g32680  LOC_Os09g33980  LOC_Os03g57210  LOC_Os09g01640  LOC_Os09g11270
LOC_Os12g38970  LOC_Os05g28510  LOC_Os07g28280  LOC_Os06g06510  LOC_Os03g53720  LOC_Os08g08060
LOC_Os04g14654  LOC_Os04g31950  LOC_Os05g48030  LOC_Os03g15810  LOC_Os09g08910  LOC_Os03g53190
LOC_Os10g28040  LOC_Os10g35580  LOC_Os04g40840  LOC_Os11g05730  LOC_Os06g04580  LOC_Os07g37640
LOC_Os07g13280  LOC_Os06g04450  LOC_Os07g06980  LOC_Os06g38470  LOC_Os03g19059  LOC_Os05g01020
LOC_Os03g63420  LOC_Os03g53700  LOC_Os07g36130  LOC_Os12g44330  LOC_Os07g41180  LOC_Os05g38710
LOC_Os05g33390  LOC_Os11g34305  LOC_Os04g09800  LOC_Os07g44630  LOC_Os07g08170  LOC_Os04g46450
LOC_Os10g42950  LOC_Os10g39030  LOC_Os03g50390  LOC_Os12g08740  LOC_Os05g05780  LOC_Os04g54940
LOC_Os03g07080  LOC_Os03g03150   LOC_Os01g40470   LOC_Os01g46980   LOC_Os03g02980   LOC_Os02g42314
LOC_Os02g07750   LOC_Os02g29464   LOC_Os01g59800   LOC_Os02g14110   LOC_Os01g60410   LOC_Os02g58640
LOC_Os01g60360   LOC_Os02g21460   LOC_Os02g38300   LOC_Os02g57854   LOC_Os01g59360   LOC_Os02g43920
LOC_Os02g04160   LOC_Os02g58510   LOC_Os02g13130   LOC_Os01g36930   LOC_Os01g48920   LOC_Os01g01960
LOC_Os02g30624   LOC_Os01g48210   LOC_Os02g39800   LOC_Os02g05630   LOC_Os02g32490   LOC_Os02g55300
LOC_Os01g09580   LOC_Os01g73310   LOC_Os01g43030   LOC_Os01g72790   LOC_Os02g07870   LOC_Os02g15220
LOC_Os02g24134   LOC_Os03g01810   LOC_Os01g64640

Database Links
UniprotKB	Q84J54
Ensembl	LOC_Os03g04980.1
Refseq	NP_001048939.1
EMBL	AY224464 AY224545 DP000009 AB110188 AP008209 AK068424 CM000140
KEGG	osa:4331591 dosa:Os03t0143600-01