RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os07g22220 View Network
Names	Os07g0405100 protein (cDNA clone:J033048J08, full insert sequence)
Function	F-box-like/WD repeat-containing protein TBL1XR1-A, putative, expressed
Attributes	Length: 556 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 62141.6 pI: 5.7847 Subcellular Location (adjusted): Plasma membrane
Gene Model	LOC_Os07g22220.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os11g05730 LOC_Os10g10990 LOC_Os10g34670 LOC_Os09g02284 LOC_Os09g38020 LOC_Os08g36150 LOC_Os07g43360 LOC_Os08g37444 LOC_Os07g46540 LOC_Os08g09320 LOC_Os09g26340 LOC_Os07g22220 LOC_Os12g43940 LOC_Os07g36500 LOC_Os12g37590 LOC_Os10g21234 LOC_Os12g30060 LOC_Os08g12680 LOC_Os12g38380 LOC_Os11g26910 LOC_Os10g31900 LOC_Os12g38970 LOC_Os12g42876 LOC_Os12g35030 LOC_Os07g31370 LOC_Os08g09690 LOC_Os12g07050 LOC_Os10g28600 LOC_Os09g36830 LOC_Os11g06890 LOC_Os10g39410 LOC_Os12g44180 LOC_Os11g34860 LOC_Os09g21770 LOC_Os11g20384 LOC_Os10g38278 LOC_Os09g20820 LOC_Os05g08970 LOC_Os02g45180 LOC_Os06g48750 LOC_Os03g47780 LOC_Os03g57760 LOC_Os03g16020 LOC_Os01g61920 LOC_Os06g43680 LOC_Os04g33950 LOC_Os01g72980 LOC_Os02g15220 LOC_Os03g44620 LOC_Os05g06350 LOC_Os01g27730 LOC_Os06g06460 LOC_Os07g19494 LOC_Os03g10990 LOC_Os07g09010 LOC_Os03g04980 LOC_Os03g17700 LOC_Os02g10060 LOC_Os04g19990 LOC_Os04g53760 LOC_Os05g39050 LOC_Os03g36780 LOC_Os06g43700 LOC_Os03g43020 LOC_Os04g45930 LOC_Os03g53700 LOC_Os07g22220 LOC_Os06g04580 LOC_Os05g46560 LOC_Os05g29010 LOC_Os02g39800 LOC_Os01g10050 LOC_Os03g02780 LOC_Os06g09850 LOC_Os03g63940 LOC_Os04g32330 LOC_Os03g51550 LOC_Os04g46620 LOC_Os04g49420 LOC_Os05g05260 LOC_Os03g09140 LOC_Os03g18080 LOC_Os02g30730 LOC_Os03g25260 LOC_Os02g14860 LOC_Os05g38740 LOC_Os02g45940 LOC_Os01g55270 LOC_Os02g03620 LOC_Os02g07870 LOC_Os03g05760 LOC_Os03g53190 LOC_Os03g57040 LOC_Os03g15700 LOC_Os03g23909 LOC_Os06g38940 LOC_Os02g38060 LOC_Os06g08800 LOC_Os03g01810 LOC_Os04g20220 LOC_Os05g01020 LOC_Os02g24612 LOC_Os04g36700 LOC_Os02g30624 LOC_Os04g38610 LOC_Os03g51600 LOC_Os01g48700 LOC_Os05g28510 LOC_Os05g36280 LOC_Os03g59660 LOC_Os06g06090 LOC_Os06g43690 LOC_Os03g45320 LOC_Os04g37690 LOC_Os06g08480 LOC_Os05g45420 LOC_Os06g38470 LOC_Os02g02890 LOC_Os03g51140 LOC_Os06g06510 LOC_Os01g27630 LOC_Os01g01960 LOC_Os03g16030 LOC_Os02g34510 LOC_Os05g47980 LOC_Os03g06760 LOC_Os01g69130 LOC_Os04g54940 LOC_Os01g33040 LOC_Os02g40680 LOC_Os02g05330 LOC_Os01g64640 LOC_Os04g31950

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os11g05730  LOC_Os10g10990  LOC_Os10g34670  LOC_Os09g02284  LOC_Os09g38020  LOC_Os08g36150
LOC_Os07g43360  LOC_Os08g37444  LOC_Os07g46540  LOC_Os08g09320  LOC_Os09g26340  LOC_Os07g22220
LOC_Os12g43940  LOC_Os07g36500  LOC_Os12g37590  LOC_Os10g21234  LOC_Os12g30060  LOC_Os08g12680
LOC_Os12g38380  LOC_Os11g26910  LOC_Os10g31900  LOC_Os12g38970  LOC_Os12g42876  LOC_Os12g35030
LOC_Os07g31370  LOC_Os08g09690  LOC_Os12g07050  LOC_Os10g28600  LOC_Os09g36830  LOC_Os11g06890
LOC_Os10g39410  LOC_Os12g44180  LOC_Os11g34860  LOC_Os09g21770  LOC_Os11g20384  LOC_Os10g38278
LOC_Os09g20820  LOC_Os05g08970   LOC_Os02g45180   LOC_Os06g48750   LOC_Os03g47780   LOC_Os03g57760
LOC_Os03g16020   LOC_Os01g61920   LOC_Os06g43680   LOC_Os04g33950   LOC_Os01g72980   LOC_Os02g15220
LOC_Os03g44620   LOC_Os05g06350   LOC_Os01g27730   LOC_Os06g06460   LOC_Os07g19494   LOC_Os03g10990
LOC_Os07g09010   LOC_Os03g04980   LOC_Os03g17700   LOC_Os02g10060   LOC_Os04g19990   LOC_Os04g53760
LOC_Os05g39050   LOC_Os03g36780   LOC_Os06g43700   LOC_Os03g43020   LOC_Os04g45930   LOC_Os03g53700
LOC_Os07g22220   LOC_Os06g04580   LOC_Os05g46560   LOC_Os05g29010   LOC_Os02g39800   LOC_Os01g10050
LOC_Os03g02780   LOC_Os06g09850   LOC_Os03g63940   LOC_Os04g32330   LOC_Os03g51550   LOC_Os04g46620
LOC_Os04g49420   LOC_Os05g05260   LOC_Os03g09140   LOC_Os03g18080   LOC_Os02g30730   LOC_Os03g25260
LOC_Os02g14860   LOC_Os05g38740   LOC_Os02g45940   LOC_Os01g55270   LOC_Os02g03620   LOC_Os02g07870
LOC_Os03g05760   LOC_Os03g53190   LOC_Os03g57040   LOC_Os03g15700   LOC_Os03g23909   LOC_Os06g38940
LOC_Os02g38060   LOC_Os06g08800   LOC_Os03g01810   LOC_Os04g20220   LOC_Os05g01020   LOC_Os02g24612
LOC_Os04g36700   LOC_Os02g30624   LOC_Os04g38610   LOC_Os03g51600   LOC_Os01g48700   LOC_Os05g28510
LOC_Os05g36280   LOC_Os03g59660   LOC_Os06g06090   LOC_Os06g43690   LOC_Os03g45320   LOC_Os04g37690
LOC_Os06g08480   LOC_Os05g45420   LOC_Os06g38470   LOC_Os02g02890   LOC_Os03g51140   LOC_Os06g06510
LOC_Os01g27630   LOC_Os01g01960   LOC_Os03g16030   LOC_Os02g34510   LOC_Os05g47980   LOC_Os03g06760
LOC_Os01g69130   LOC_Os04g54940   LOC_Os01g33040   LOC_Os02g40680   LOC_Os02g05330   LOC_Os01g64640
LOC_Os04g31950

Database Links
UniprotKB	Q0D730
Ensembl	LOC_Os07g22220.1
Refseq	NP_001059429.1
EMBL	AP008213 AK111882
KEGG	osa:4342987 dosa:Os07t0405100-01