RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os09g02284 View Network
Names	Os09g0110400 protein (Putative DNA-directed RNA polymerase II) (cDNA clone:006-305-H09, full insert sequence) (cDNA clone:J013163O03, full insert sequence) (cDNA clone:J033095G14, full insert sequence)
Function	DNA-directed RNA polymerase subunit, putative, expressed
Attributes	Length: 331 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 36460.2 pI: 4.4941 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os09g02284.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os10g10990 LOC_Os10g30100 LOC_Os12g43670 LOC_Os10g41520 LOC_Os09g36920 LOC_Os11g08940 LOC_Os09g35920 LOC_Os12g43940 LOC_Os12g37370 LOC_Os12g09280 LOC_Os10g41450 LOC_Os09g30412 LOC_Os09g02284 LOC_Os12g39070 LOC_Os01g36890 LOC_Os08g09240 LOC_Os03g46770 LOC_Os01g16240 LOC_Os05g04370 LOC_Os01g68940 LOC_Os03g28140 LOC_Os02g04160 LOC_Os03g26440 LOC_Os06g05660 LOC_Os07g22220 LOC_Os05g05780 LOC_Os03g54091 LOC_Os04g27860 LOC_Os01g05420 LOC_Os07g07610 LOC_Os01g36930 LOC_Os07g41180 LOC_Os05g41210 LOC_Os05g33240 LOC_Os06g48230 LOC_Os07g13280 LOC_Os03g53190 LOC_Os06g30970 LOC_Os07g27930 LOC_Os03g38960 LOC_Os05g01020 LOC_Os02g53230 LOC_Os08g39140 LOC_Os02g02510 LOC_Os03g64190 LOC_Os02g39890 LOC_Os01g13404 LOC_Os03g20370 LOC_Os02g39800 LOC_Os07g43060 LOC_Os03g47770 LOC_Os04g32710 LOC_Os01g48210 LOC_Os01g60410 LOC_Os01g73310 LOC_Os03g15810 LOC_Os08g09320 LOC_Os03g44484 LOC_Os04g25550 LOC_Os05g05860 LOC_Os08g40180 LOC_Os03g09140 LOC_Os06g08480 LOC_Os01g36920 LOC_Os04g53240 LOC_Os04g46450 LOC_Os06g11370 LOC_Os03g53700 LOC_Os07g25390 LOC_Os07g37640 LOC_Os03g51550 LOC_Os04g56640 LOC_Os01g34614 LOC_Os01g60360 LOC_Os01g59140 LOC_Os08g38570 LOC_Os03g10990 LOC_Os04g56800 LOC_Os08g25460 LOC_Os01g56590 LOC_Os01g56550 LOC_Os04g40840 LOC_Os07g10600 LOC_Os07g29360 LOC_Os06g37640 LOC_Os07g23200 LOC_Os02g27769 LOC_Os01g01960 LOC_Os07g48780 LOC_Os03g60130 LOC_Os02g10060 LOC_Os03g50390 LOC_Os03g01230 LOC_Os09g02284 LOC_Os04g01970 LOC_Os01g01312 LOC_Os05g05660 LOC_Os07g31370 LOC_Os01g68950 LOC_Os04g45930

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os10g10990  LOC_Os10g30100  LOC_Os12g43670  LOC_Os10g41520  LOC_Os09g36920  LOC_Os11g08940
LOC_Os09g35920  LOC_Os12g43940  LOC_Os12g37370  LOC_Os12g09280  LOC_Os10g41450  LOC_Os09g30412
LOC_Os09g02284  LOC_Os12g39070  LOC_Os01g36890   LOC_Os08g09240   LOC_Os03g46770   LOC_Os01g16240
LOC_Os05g04370   LOC_Os01g68940   LOC_Os03g28140   LOC_Os02g04160   LOC_Os03g26440   LOC_Os06g05660
LOC_Os07g22220   LOC_Os05g05780   LOC_Os03g54091   LOC_Os04g27860   LOC_Os01g05420   LOC_Os07g07610
LOC_Os01g36930   LOC_Os07g41180   LOC_Os05g41210   LOC_Os05g33240   LOC_Os06g48230   LOC_Os07g13280
LOC_Os03g53190   LOC_Os06g30970   LOC_Os07g27930   LOC_Os03g38960   LOC_Os05g01020   LOC_Os02g53230
LOC_Os08g39140   LOC_Os02g02510   LOC_Os03g64190   LOC_Os02g39890   LOC_Os01g13404   LOC_Os03g20370
LOC_Os02g39800   LOC_Os07g43060   LOC_Os03g47770   LOC_Os04g32710   LOC_Os01g48210   LOC_Os01g60410
LOC_Os01g73310   LOC_Os03g15810   LOC_Os08g09320   LOC_Os03g44484   LOC_Os04g25550   LOC_Os05g05860
LOC_Os08g40180   LOC_Os03g09140   LOC_Os06g08480   LOC_Os01g36920   LOC_Os04g53240   LOC_Os04g46450
LOC_Os06g11370   LOC_Os03g53700   LOC_Os07g25390   LOC_Os07g37640   LOC_Os03g51550   LOC_Os04g56640
LOC_Os01g34614   LOC_Os01g60360   LOC_Os01g59140   LOC_Os08g38570   LOC_Os03g10990   LOC_Os04g56800
LOC_Os08g25460   LOC_Os01g56590   LOC_Os01g56550   LOC_Os04g40840   LOC_Os07g10600   LOC_Os07g29360
LOC_Os06g37640   LOC_Os07g23200   LOC_Os02g27769   LOC_Os01g01960   LOC_Os07g48780   LOC_Os03g60130
LOC_Os02g10060   LOC_Os03g50390   LOC_Os03g01230   LOC_Os09g02284   LOC_Os04g01970   LOC_Os01g01312
LOC_Os05g05660   LOC_Os07g31370   LOC_Os01g68950   LOC_Os04g45930

Database Links
UniprotKB	Q6YX88
Ensembl	LOC_Os09g02284.1
Refseq	NP_001062572.1
EMBL	AP005709 AP008215 AK061402 AK068844 AK121793 CM000146
KEGG	osa:4346392 dosa:Os09t0110400-01