General Information
Protein IDLOC_Os02g39890        View Network
NamesNuclear cap-binding protein subunit 2 (20 kDa nuclear cap-binding protein) (NCBP 20 kDa subunit) (CBP20)
FunctionComponent of the cap-binding complex (CBC), which binds co-transcriptionally to the 5' cap of pre-mRNAs and is involved in various processes such as pre-mRNA splicing and RNA-mediated gene silencing (RNAi) by microRNAs (miRNAs). The CBC complex is involved in miRNA-mediated RNA interference and is required for primary miRNA processing. In the CBC complex, CBP20 recognizes and binds capped RNAs (m7GpppG-capped RNA) but requires ABH1/CBP80 to stabilize the movement of its N-terminal loop and lock the CBC into a high affinity cap-binding state with the cap structure. CBP20 also plays a role in stabilization of ABH1/CBP80 and ABH1/CBP80 localization to the nucleus (By similarity).
AttributesLength: 244
Status: Complete
Existence: Evidence at transcript level
Molecular Weight: 28573.2
pI: 5.185
Subcellular Location (adjusted): Nucleus    
Gene ModelLOC_Os02g39890.1  LOC_Os02g39890.2  
Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os07g13280  LOC_Os06g48355  LOC_Os03g60130  LOC_Os03g63730  LOC_Os04g54330  LOC_Os08g23440  
LOC_Os02g44810  LOC_Os07g30090  LOC_Os04g46450  LOC_Os10g34380  LOC_Os09g30412  LOC_Os04g45930  
LOC_Os03g26440  LOC_Os10g28040  LOC_Os07g07240  LOC_Os11g44940  LOC_Os03g44780  LOC_Os04g28180  
LOC_Os03g31090  LOC_Os08g18110  LOC_Os03g25260  LOC_Os05g13630  LOC_Os11g40510  LOC_Os06g48350  
LOC_Os07g33330  LOC_Os03g51250  LOC_Os12g09280  LOC_Os03g43020  LOC_Os05g28510  LOC_Os03g13970  
LOC_Os08g08080  LOC_Os09g02284  LOC_Os03g17700  LOC_Os03g15700  LOC_Os03g54091  LOC_Os04g41490  
LOC_Os04g47590  LOC_Os05g38820  LOC_Os03g16860  LOC_Os03g61110  LOC_Os03g01216  LOC_Os08g38240  
LOC_Os03g08300  LOC_Os07g07220  LOC_Os05g06350  LOC_Os05g07050  LOC_Os03g25450  LOC_Os09g29980  
LOC_Os09g21760  LOC_Os03g51540  LOC_Os03g22570  LOC_Os03g03150  LOC_Os07g49410  LOC_Os09g19560  
LOC_Os03g05730  LOC_Os04g38610  LOC_Os02g51780  LOC_Os10g34120  LOC_Os10g02630  LOC_Os06g06090  
LOC_Os03g27970  LOC_Os03g09140  LOC_Os09g02700  LOC_Os12g04180  LOC_Os05g30940  LOC_Os02g39890  
LOC_Os07g33340  LOC_Os05g34770  LOC_Os03g53720  LOC_Os12g04290  LOC_Os05g24970  LOC_Os04g04320  
LOC_Os03g13850  LOC_Os05g38530  LOC_Os07g36940  LOC_Os07g25420  LOC_Os03g56800  LOC_Os07g31370  
LOC_Os10g22520  LOC_Os03g53190  LOC_Os03g22740  LOC_Os03g46770  LOC_Os03g13760  LOC_Os06g04580  
LOC_Os01g43030   LOC_Os02g21970   LOC_Os01g61810   LOC_Os01g73880   LOC_Os02g14860   LOC_Os02g13990   
LOC_Os02g10640   LOC_Os02g04480   LOC_Os02g39300   LOC_Os02g01250   LOC_Os01g70380   LOC_Os02g27950   
LOC_Os02g39890   LOC_Os01g16170   LOC_Os02g30730   LOC_Os02g36960   LOC_Os01g29070   LOC_Os02g13640   
LOC_Os02g28810   LOC_Os02g06500   
Database Links
UniprotKBQ84L14
EnsemblLOC_Os02g39890.1  
RefseqNP_001047412.1  
EMBLAY278997  AP005286  AP008208  AK101546  
KEGGosa:4329963  dosa:Os02t0612300-01