RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os06g48350 View Network
Names	Os06g0698674 protein (Putative eukaryotic translation initiation factor 5) (cDNA, clone: J100063D05, full insert sequence)
Function	CPuORF14 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed
Attributes	Length: 451 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 48869.3 pI: 6.305 Subcellular Location (predicted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os06g48350.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os10g25320 LOC_Os07g36940 LOC_Os11g13694 LOC_Os10g41520 LOC_Os06g48350 LOC_Os06g48750 LOC_Os09g37120 LOC_Os08g21660 LOC_Os10g41960 LOC_Os07g48290 LOC_Os11g03050 LOC_Os10g37660 LOC_Os07g42950 LOC_Os09g36440 LOC_Os07g01870 LOC_Os06g48355 LOC_Os10g07994 LOC_Os11g34350 LOC_Os10g40140 LOC_Os11g38959 LOC_Os07g08330 LOC_Os07g33330 LOC_Os12g41400 LOC_Os12g42370 LOC_Os11g38949 LOC_Os08g05890 LOC_Os07g10250 LOC_Os11g29190 LOC_Os06g48350 LOC_Os03g21530 LOC_Os06g23440 LOC_Os03g49210 LOC_Os03g18570 LOC_Os02g03080 LOC_Os03g38000 LOC_Os04g39700 LOC_Os05g27940 LOC_Os02g56740 LOC_Os06g09570 LOC_Os02g39890 LOC_Os01g13190 LOC_Os03g18580 LOC_Os03g40180 LOC_Os02g01350 LOC_Os01g01060 LOC_Os06g21340 LOC_Os02g19770 LOC_Os03g21550 LOC_Os03g03420 LOC_Os04g42380 LOC_Os03g10990 LOC_Os05g30940 LOC_Os05g30530 LOC_Os01g05950 LOC_Os03g05980 LOC_Os03g18510 LOC_Os01g68940 LOC_Os05g41900 LOC_Os01g68950 LOC_Os06g02510 LOC_Os02g53230 LOC_Os01g16190 LOC_Os01g05970 LOC_Os05g51500 LOC_Os04g51630 LOC_Os01g03070 LOC_Os02g54700 LOC_Os05g19370 LOC_Os03g37970 LOC_Os02g05330 LOC_Os01g01312 LOC_Os03g22180 LOC_Os04g11880 LOC_Os01g06010 LOC_Os03g21620 LOC_Os01g62230

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os10g25320  LOC_Os07g36940  LOC_Os11g13694  LOC_Os10g41520  LOC_Os06g48350  LOC_Os06g48750
LOC_Os09g37120  LOC_Os08g21660  LOC_Os10g41960  LOC_Os07g48290  LOC_Os11g03050  LOC_Os10g37660
LOC_Os07g42950  LOC_Os09g36440  LOC_Os07g01870  LOC_Os06g48355  LOC_Os10g07994  LOC_Os11g34350
LOC_Os10g40140  LOC_Os11g38959  LOC_Os07g08330  LOC_Os07g33330  LOC_Os12g41400  LOC_Os12g42370
LOC_Os11g38949  LOC_Os08g05890  LOC_Os07g10250  LOC_Os11g29190  LOC_Os06g48350   LOC_Os03g21530
LOC_Os06g23440   LOC_Os03g49210   LOC_Os03g18570   LOC_Os02g03080   LOC_Os03g38000   LOC_Os04g39700
LOC_Os05g27940   LOC_Os02g56740   LOC_Os06g09570   LOC_Os02g39890   LOC_Os01g13190   LOC_Os03g18580
LOC_Os03g40180   LOC_Os02g01350   LOC_Os01g01060   LOC_Os06g21340   LOC_Os02g19770   LOC_Os03g21550
LOC_Os03g03420   LOC_Os04g42380   LOC_Os03g10990   LOC_Os05g30940   LOC_Os05g30530   LOC_Os01g05950
LOC_Os03g05980   LOC_Os03g18510   LOC_Os01g68940   LOC_Os05g41900   LOC_Os01g68950   LOC_Os06g02510
LOC_Os02g53230   LOC_Os01g16190   LOC_Os01g05970   LOC_Os05g51500   LOC_Os04g51630   LOC_Os01g03070
LOC_Os02g54700   LOC_Os05g19370   LOC_Os03g37970   LOC_Os02g05330   LOC_Os01g01312   LOC_Os03g22180
LOC_Os04g11880   LOC_Os01g06010   LOC_Os03g21620   LOC_Os01g62230

Database Links
UniprotKB	Q5Z4V2
Ensembl	LOC_Os06g48350.1 LOC_Os06g48355.1
Refseq	NP_001174974.1
EMBL	AP005931 AK243382 AP008212 CM000143
KEGG	osa:9272123 dosa:Os06t0698674-01