RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os11g38959 View Network
Names	40S ribosomal protein S9, putative, expressed (Os03g0154700 protein) (Os11g0602600 protein) (cDNA clone:001-038-H02, full insert sequence) (cDNA clone:006-202-G08, full insert sequence) (cDNA clone:006-303-F09, full insert sequence) (cDNA clone:006-310-G01, full insert sequence) (cDNA clone:006-311-D11, full insert sequence) (cDNA clone:J023134P20, full insert sequence)
Function	tRNA-splicing endonuclease subunit Sen2, putative, expressed
Attributes	Length: 196 Status: Complete Existence: Evidence at protein level Molecular Weight: 22673.2 pI: 10.8995 Subcellular Location (adjusted): Cytosol
Gene Model	LOC_Os11g38959.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g01390 LOC_Os12g03090 LOC_Os11g41160 LOC_Os12g06910 LOC_Os12g07300 LOC_Os12g04010 LOC_Os12g25210 LOC_Os08g02410 LOC_Os05g38740 LOC_Os07g36500 LOC_Os03g58430 LOC_Os03g37970 LOC_Os02g54110 LOC_Os11g11390 LOC_Os03g21530 LOC_Os03g19960 LOC_Os05g14550 LOC_Os07g29630 LOC_Os03g10340 LOC_Os01g59990 LOC_Os05g30530 LOC_Os07g12250 LOC_Os03g38000 LOC_Os09g36920 LOC_Os04g28180 LOC_Os01g40110 LOC_Os07g41180 LOC_Os02g45940 LOC_Os06g36160 LOC_Os02g28810 LOC_Os05g44320 LOC_Os01g68940 LOC_Os07g10150 LOC_Os05g42424 LOC_Os03g56800 LOC_Os03g01810 LOC_Os03g58050 LOC_Os01g16190 LOC_Os03g22880 LOC_Os03g22180 LOC_Os03g02420 LOC_Os07g42950 LOC_Os01g61920 LOC_Os11g14220 LOC_Os01g59730 LOC_Os03g18570 LOC_Os07g10720 LOC_Os03g14530 LOC_Os04g35700 LOC_Os02g33140 LOC_Os01g06010 LOC_Os07g42450 LOC_Os09g38020 LOC_Os04g59494 LOC_Os11g19250 LOC_Os05g42300 LOC_Os01g05970 LOC_Os07g08660 LOC_Os03g56810 LOC_Os01g40250 LOC_Os08g09350 LOC_Os02g07060 LOC_Os05g37330 LOC_Os09g18320 LOC_Os04g50990 LOC_Os01g49290 LOC_Os03g51600 LOC_Os03g02780 LOC_Os10g10434 LOC_Os01g73880 LOC_Os02g14059 LOC_Os03g64190 LOC_Os02g47140 LOC_Os03g40110 LOC_Os04g33750 LOC_Os07g08330 LOC_Os11g06750 LOC_Os05g38520 LOC_Os01g68950 LOC_Os06g49140 LOC_Os01g62350 LOC_Os01g59930 LOC_Os08g37780 LOC_Os10g27190 LOC_Os02g01920 LOC_Os03g29460 LOC_Os01g62230 LOC_Os01g51200 LOC_Os03g50885 LOC_Os10g32880 LOC_Os05g51480 LOC_Os04g49420 LOC_Os01g43030 LOC_Os06g46770 LOC_Os03g40180 LOC_Os01g66520 LOC_Os05g27940 LOC_Os05g41100 LOC_Os02g02360 LOC_Os06g48350 LOC_Os02g13110 LOC_Os01g01060 LOC_Os07g34589 LOC_Os04g42270 LOC_Os02g50760 LOC_Os01g09890 LOC_Os11g34305 LOC_Os01g54870 LOC_Os09g31180 LOC_Os11g03400 LOC_Os05g19370 LOC_Os03g51900 LOC_Os02g06640 LOC_Os02g18830 LOC_Os06g48355 LOC_Os09g08430 LOC_Os09g26340 LOC_Os01g38970 LOC_Os05g08360 LOC_Os05g05470 LOC_Os07g07709 LOC_Os02g27760 LOC_Os06g46000 LOC_Os02g13530 LOC_Os01g67134 LOC_Os10g27174 LOC_Os01g64090 LOC_Os03g18580 LOC_Os07g01870 LOC_Os04g42380 LOC_Os10g08930 LOC_Os11g04070 LOC_Os03g08440 LOC_Os07g46660 LOC_Os07g10250 LOC_Os01g34200 LOC_Os01g73310 LOC_Os03g22740 LOC_Os10g39410 LOC_Os05g39050 LOC_Os02g18380 LOC_Os03g17310 LOC_Os08g02400

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g01390  LOC_Os12g03090  LOC_Os11g41160  LOC_Os12g06910  LOC_Os12g07300  LOC_Os12g04010
LOC_Os12g25210  LOC_Os08g02410   LOC_Os05g38740   LOC_Os07g36500   LOC_Os03g58430   LOC_Os03g37970
LOC_Os02g54110   LOC_Os11g11390   LOC_Os03g21530   LOC_Os03g19960   LOC_Os05g14550   LOC_Os07g29630
LOC_Os03g10340   LOC_Os01g59990   LOC_Os05g30530   LOC_Os07g12250   LOC_Os03g38000   LOC_Os09g36920
LOC_Os04g28180   LOC_Os01g40110   LOC_Os07g41180   LOC_Os02g45940   LOC_Os06g36160   LOC_Os02g28810
LOC_Os05g44320   LOC_Os01g68940   LOC_Os07g10150   LOC_Os05g42424   LOC_Os03g56800   LOC_Os03g01810
LOC_Os03g58050   LOC_Os01g16190   LOC_Os03g22880   LOC_Os03g22180   LOC_Os03g02420   LOC_Os07g42950
LOC_Os01g61920   LOC_Os11g14220   LOC_Os01g59730   LOC_Os03g18570   LOC_Os07g10720   LOC_Os03g14530
LOC_Os04g35700   LOC_Os02g33140   LOC_Os01g06010   LOC_Os07g42450   LOC_Os09g38020   LOC_Os04g59494
LOC_Os11g19250   LOC_Os05g42300   LOC_Os01g05970   LOC_Os07g08660   LOC_Os03g56810   LOC_Os01g40250
LOC_Os08g09350   LOC_Os02g07060   LOC_Os05g37330   LOC_Os09g18320   LOC_Os04g50990   LOC_Os01g49290
LOC_Os03g51600   LOC_Os03g02780   LOC_Os10g10434   LOC_Os01g73880   LOC_Os02g14059   LOC_Os03g64190
LOC_Os02g47140   LOC_Os03g40110   LOC_Os04g33750   LOC_Os07g08330   LOC_Os11g06750   LOC_Os05g38520
LOC_Os01g68950   LOC_Os06g49140   LOC_Os01g62350   LOC_Os01g59930   LOC_Os08g37780   LOC_Os10g27190
LOC_Os02g01920   LOC_Os03g29460   LOC_Os01g62230   LOC_Os01g51200   LOC_Os03g50885   LOC_Os10g32880
LOC_Os05g51480   LOC_Os04g49420   LOC_Os01g43030   LOC_Os06g46770   LOC_Os03g40180   LOC_Os01g66520
LOC_Os05g27940   LOC_Os05g41100   LOC_Os02g02360   LOC_Os06g48350   LOC_Os02g13110   LOC_Os01g01060
LOC_Os07g34589   LOC_Os04g42270   LOC_Os02g50760   LOC_Os01g09890   LOC_Os11g34305   LOC_Os01g54870
LOC_Os09g31180   LOC_Os11g03400   LOC_Os05g19370   LOC_Os03g51900   LOC_Os02g06640   LOC_Os02g18830
LOC_Os06g48355   LOC_Os09g08430   LOC_Os09g26340   LOC_Os01g38970   LOC_Os05g08360   LOC_Os05g05470
LOC_Os07g07709   LOC_Os02g27760   LOC_Os06g46000   LOC_Os02g13530   LOC_Os01g67134   LOC_Os10g27174
LOC_Os01g64090   LOC_Os03g18580   LOC_Os07g01870   LOC_Os04g42380   LOC_Os10g08930   LOC_Os11g04070
LOC_Os03g08440   LOC_Os07g46660   LOC_Os07g10250   LOC_Os01g34200   LOC_Os01g73310   LOC_Os03g22740
LOC_Os10g39410   LOC_Os05g39050   LOC_Os02g18380   LOC_Os03g17310   LOC_Os08g02400

Database Links
UniprotKB	Q2R1J8
Ensembl	LOC_Os03g05980.1 LOC_Os11g38959.1
Refseq	NP_001049004.1 NP_001068233.1
EMBL	DP000010 DP000010 DP000009 DP000010 AP008209 AP008217 AK061350 AK072671 AK104111 AK104265 AK104660 AK104761 CM000148 CM000148 CM000140
KEGG	osa:4350869 dosa:Os11t0602600-01