RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os04g28180 View Network
Names	40S ribosomal protein S8
Function	ribosomal protein, putative, expressed
Attributes	Length: 222 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 24928.6 pI: 11.087 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os04g28180.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os04g33750 LOC_Os09g32976 LOC_Os04g50990 LOC_Os09g16330 LOC_Os10g07994 LOC_Os05g44320 LOC_Os09g40000 LOC_Os11g29190 LOC_Os12g07350 LOC_Os12g38380 LOC_Os11g26910 LOC_Os09g18320 LOC_Os11g38959 LOC_Os09g36920 LOC_Os11g19250 LOC_Os11g40510 LOC_Os05g42424 LOC_Os05g27940 LOC_Os04g43540 LOC_Os06g03780 LOC_Os11g06750 LOC_Os05g22670 LOC_Os05g06330 LOC_Os07g42450 LOC_Os05g43570 LOC_Os11g11390 LOC_Os11g41160 LOC_Os05g32580 LOC_Os12g04010 LOC_Os09g28590 LOC_Os09g16380 LOC_Os04g49420 LOC_Os10g30100 LOC_Os07g03160 LOC_Os12g38000 LOC_Os06g46770 LOC_Os07g12250 LOC_Os12g06910 LOC_Os04g40840 LOC_Os07g10720 LOC_Os04g32330 LOC_Os11g34350 LOC_Os05g51700 LOC_Os05g13300 LOC_Os08g23710 LOC_Os07g08330 LOC_Os10g27190 LOC_Os09g07820 LOC_Os07g10250 LOC_Os11g04220 LOC_Os05g19370 LOC_Os07g33340 LOC_Os06g36160 LOC_Os06g14190 LOC_Os04g42380 LOC_Os07g10350 LOC_Os09g08430 LOC_Os06g41750 LOC_Os04g37690 LOC_Os08g21660 LOC_Os05g39050 LOC_Os11g03400 LOC_Os08g31810 LOC_Os11g37080 LOC_Os08g43370 LOC_Os07g43980 LOC_Os07g31370 LOC_Os11g04070 LOC_Os09g31310 LOC_Os06g08800 LOC_Os10g41520 LOC_Os07g13270 LOC_Os10g41960 LOC_Os10g28040 LOC_Os07g49410 LOC_Os12g03090 LOC_Os08g02400 LOC_Os06g29790 LOC_Os10g39410 LOC_Os09g36440 LOC_Os05g38740 LOC_Os04g42270 LOC_Os11g01420 LOC_Os09g31180 LOC_Os04g39700 LOC_Os10g34670 LOC_Os07g42950 LOC_Os07g36500 LOC_Os06g37080 LOC_Os04g30730 LOC_Os12g41400 LOC_Os12g07300 LOC_Os04g43140 LOC_Os04g28180 LOC_Os08g39820 LOC_Os07g01870 LOC_Os05g41100 LOC_Os09g38020 LOC_Os10g08930 LOC_Os09g20090 LOC_Os11g06890 LOC_Os08g37350 LOC_Os06g02510 LOC_Os09g02810 LOC_Os12g27070 LOC_Os04g57790 LOC_Os07g46660 LOC_Os10g31520 LOC_Os07g16950 LOC_Os11g38949 LOC_Os08g02410 LOC_Os10g22520 LOC_Os05g08360 LOC_Os04g48060 LOC_Os07g41180 LOC_Os04g40730 LOC_Os05g51500 LOC_Os09g26340 LOC_Os04g51630 LOC_Os05g02650 LOC_Os05g51530 LOC_Os05g38520 LOC_Os07g12320 LOC_Os05g30530 LOC_Os03g63730 LOC_Os03g40180 LOC_Os03g05300 LOC_Os02g44810 LOC_Os02g27950 LOC_Os01g34200 LOC_Os03g10340 LOC_Os01g32080 LOC_Os02g06640 LOC_Os01g41040 LOC_Os01g67040 LOC_Os01g52490 LOC_Os01g68940 LOC_Os03g61790 LOC_Os02g27760 LOC_Os01g59850 LOC_Os03g19960 LOC_Os03g08440 LOC_Os02g30630 LOC_Os01g64970 LOC_Os02g14860 LOC_Os03g08300 LOC_Os02g39890 LOC_Os01g49290 LOC_Os02g01350 LOC_Os02g30050 LOC_Os01g62230 LOC_Os03g64190 LOC_Os03g58810 LOC_Os03g38000 LOC_Os01g55830 LOC_Os02g12850 LOC_Os02g34600 LOC_Os03g02780 LOC_Os01g62350 LOC_Os03g10510 LOC_Os02g50370 LOC_Os03g55280 LOC_Os03g22740 LOC_Os03g18570 LOC_Os01g67134 LOC_Os01g03070 LOC_Os01g73880 LOC_Os01g10820 LOC_Os01g61920 LOC_Os03g63400 LOC_Os03g51430 LOC_Os03g36780 LOC_Os01g40250 LOC_Os02g56014 LOC_Os01g16190 LOC_Os01g01120 LOC_Os03g05720 LOC_Os02g26660 LOC_Os02g40880 LOC_Os03g27450 LOC_Os02g22780 LOC_Os01g25240 LOC_Os02g14059 LOC_Os03g15810 LOC_Os03g52470 LOC_Os02g13990 LOC_Os02g04050 LOC_Os02g54110 LOC_Os03g29460 LOC_Os03g21530 LOC_Os03g09140 LOC_Os02g02360 LOC_Os03g14530 LOC_Os03g16110 LOC_Os02g18380 LOC_Os02g54700 LOC_Os01g13730 LOC_Os02g33140 LOC_Os01g51200 LOC_Os01g05970 LOC_Os02g03080 LOC_Os02g13530 LOC_Os02g32120 LOC_Os03g22880 LOC_Os01g46580 LOC_Os02g38060 LOC_Os01g06010 LOC_Os03g42900 LOC_Os01g54870 LOC_Os01g37770 LOC_Os03g56800 LOC_Os02g18830 LOC_Os03g49210 LOC_Os01g09890 LOC_Os03g40110 LOC_Os01g66520 LOC_Os04g28180 LOC_Os03g18580 LOC_Os01g21180 LOC_Os01g64090 LOC_Os03g53500 LOC_Os01g27390 LOC_Os02g32690 LOC_Os04g20220 LOC_Os03g50860 LOC_Os02g45940 LOC_Os03g34300 LOC_Os01g59730 LOC_Os02g48650 LOC_Os01g59990 LOC_Os03g05980 LOC_Os02g39350 LOC_Os01g56620 LOC_Os02g28810 LOC_Os01g01060 LOC_Os03g57280 LOC_Os02g47140 LOC_Os02g34510 LOC_Os01g57460 LOC_Os03g23970 LOC_Os01g68950 LOC_Os03g37970 LOC_Os03g24900

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os04g33750  LOC_Os09g32976  LOC_Os04g50990  LOC_Os09g16330  LOC_Os10g07994  LOC_Os05g44320
LOC_Os09g40000  LOC_Os11g29190  LOC_Os12g07350  LOC_Os12g38380  LOC_Os11g26910  LOC_Os09g18320
LOC_Os11g38959  LOC_Os09g36920  LOC_Os11g19250  LOC_Os11g40510  LOC_Os05g42424  LOC_Os05g27940
LOC_Os04g43540  LOC_Os06g03780  LOC_Os11g06750  LOC_Os05g22670  LOC_Os05g06330  LOC_Os07g42450
LOC_Os05g43570  LOC_Os11g11390  LOC_Os11g41160  LOC_Os05g32580  LOC_Os12g04010  LOC_Os09g28590
LOC_Os09g16380  LOC_Os04g49420  LOC_Os10g30100  LOC_Os07g03160  LOC_Os12g38000  LOC_Os06g46770
LOC_Os07g12250  LOC_Os12g06910  LOC_Os04g40840  LOC_Os07g10720  LOC_Os04g32330  LOC_Os11g34350
LOC_Os05g51700  LOC_Os05g13300  LOC_Os08g23710  LOC_Os07g08330  LOC_Os10g27190  LOC_Os09g07820
LOC_Os07g10250  LOC_Os11g04220  LOC_Os05g19370  LOC_Os07g33340  LOC_Os06g36160  LOC_Os06g14190
LOC_Os04g42380  LOC_Os07g10350  LOC_Os09g08430  LOC_Os06g41750  LOC_Os04g37690  LOC_Os08g21660
LOC_Os05g39050  LOC_Os11g03400  LOC_Os08g31810  LOC_Os11g37080  LOC_Os08g43370  LOC_Os07g43980
LOC_Os07g31370  LOC_Os11g04070  LOC_Os09g31310  LOC_Os06g08800  LOC_Os10g41520  LOC_Os07g13270
LOC_Os10g41960  LOC_Os10g28040  LOC_Os07g49410  LOC_Os12g03090  LOC_Os08g02400  LOC_Os06g29790
LOC_Os10g39410  LOC_Os09g36440  LOC_Os05g38740  LOC_Os04g42270  LOC_Os11g01420  LOC_Os09g31180
LOC_Os04g39700  LOC_Os10g34670  LOC_Os07g42950  LOC_Os07g36500  LOC_Os06g37080  LOC_Os04g30730
LOC_Os12g41400  LOC_Os12g07300  LOC_Os04g43140  LOC_Os04g28180  LOC_Os08g39820  LOC_Os07g01870
LOC_Os05g41100  LOC_Os09g38020  LOC_Os10g08930  LOC_Os09g20090  LOC_Os11g06890  LOC_Os08g37350
LOC_Os06g02510  LOC_Os09g02810  LOC_Os12g27070  LOC_Os04g57790  LOC_Os07g46660  LOC_Os10g31520
LOC_Os07g16950  LOC_Os11g38949  LOC_Os08g02410  LOC_Os10g22520  LOC_Os05g08360  LOC_Os04g48060
LOC_Os07g41180  LOC_Os04g40730  LOC_Os05g51500  LOC_Os09g26340  LOC_Os04g51630  LOC_Os05g02650
LOC_Os05g51530  LOC_Os05g38520  LOC_Os07g12320  LOC_Os05g30530  LOC_Os03g63730   LOC_Os03g40180
LOC_Os03g05300   LOC_Os02g44810   LOC_Os02g27950   LOC_Os01g34200   LOC_Os03g10340   LOC_Os01g32080
LOC_Os02g06640   LOC_Os01g41040   LOC_Os01g67040   LOC_Os01g52490   LOC_Os01g68940   LOC_Os03g61790
LOC_Os02g27760   LOC_Os01g59850   LOC_Os03g19960   LOC_Os03g08440   LOC_Os02g30630   LOC_Os01g64970
LOC_Os02g14860   LOC_Os03g08300   LOC_Os02g39890   LOC_Os01g49290   LOC_Os02g01350   LOC_Os02g30050
LOC_Os01g62230   LOC_Os03g64190   LOC_Os03g58810   LOC_Os03g38000   LOC_Os01g55830   LOC_Os02g12850
LOC_Os02g34600   LOC_Os03g02780   LOC_Os01g62350   LOC_Os03g10510   LOC_Os02g50370   LOC_Os03g55280
LOC_Os03g22740   LOC_Os03g18570   LOC_Os01g67134   LOC_Os01g03070   LOC_Os01g73880   LOC_Os01g10820
LOC_Os01g61920   LOC_Os03g63400   LOC_Os03g51430   LOC_Os03g36780   LOC_Os01g40250   LOC_Os02g56014
LOC_Os01g16190   LOC_Os01g01120   LOC_Os03g05720   LOC_Os02g26660   LOC_Os02g40880   LOC_Os03g27450
LOC_Os02g22780   LOC_Os01g25240   LOC_Os02g14059   LOC_Os03g15810   LOC_Os03g52470   LOC_Os02g13990
LOC_Os02g04050   LOC_Os02g54110   LOC_Os03g29460   LOC_Os03g21530   LOC_Os03g09140   LOC_Os02g02360
LOC_Os03g14530   LOC_Os03g16110   LOC_Os02g18380   LOC_Os02g54700   LOC_Os01g13730   LOC_Os02g33140
LOC_Os01g51200   LOC_Os01g05970   LOC_Os02g03080   LOC_Os02g13530   LOC_Os02g32120   LOC_Os03g22880
LOC_Os01g46580   LOC_Os02g38060   LOC_Os01g06010   LOC_Os03g42900   LOC_Os01g54870   LOC_Os01g37770
LOC_Os03g56800   LOC_Os02g18830   LOC_Os03g49210   LOC_Os01g09890   LOC_Os03g40110   LOC_Os01g66520
LOC_Os04g28180   LOC_Os03g18580   LOC_Os01g21180   LOC_Os01g64090   LOC_Os03g53500   LOC_Os01g27390
LOC_Os02g32690   LOC_Os04g20220   LOC_Os03g50860   LOC_Os02g45940   LOC_Os03g34300   LOC_Os01g59730
LOC_Os02g48650   LOC_Os01g59990   LOC_Os03g05980   LOC_Os02g39350   LOC_Os01g56620   LOC_Os02g28810
LOC_Os01g01060   LOC_Os03g57280   LOC_Os02g47140   LOC_Os02g34510   LOC_Os01g57460   LOC_Os03g23970
LOC_Os01g68950   LOC_Os03g37970   LOC_Os03g24900

Database Links
UniprotKB	Q0JDZ7
Ensembl	LOC_Os04g28180.1
Refseq	NP_001052526.1
EMBL	AP008210 AK068316 AL731588 CM000141
KEGG	osa:4335547 dosa:Os04t0349500-01