RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os05g27940 View Network
Names	40S ribosomal protein S7
Function	DUF538 domain containing protein, putative, expressed
Attributes	Length: 193 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 22306.9 pI: 10.2985 Subcellular Location (adjusted): Cytosol
Gene Model	LOC_Os05g27940.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os11g03400 LOC_Os10g41960 LOC_Os06g36160 LOC_Os07g33979 LOC_Os10g27190 LOC_Os12g07300 LOC_Os10g32820 LOC_Os07g10720 LOC_Os07g12320 LOC_Os08g41300 LOC_Os07g46760 LOC_Os12g06910 LOC_Os10g31520 LOC_Os10g40590 LOC_Os07g26740 LOC_Os07g39870 LOC_Os08g02400 LOC_Os12g04010 LOC_Os06g48350 LOC_Os07g10150 LOC_Os07g33340 LOC_Os11g11390 LOC_Os08g09350 LOC_Os05g28750 LOC_Os06g03780 LOC_Os07g08660 LOC_Os07g46660 LOC_Os10g07994 LOC_Os07g33880 LOC_Os09g36440 LOC_Os07g42950 LOC_Os07g08330 LOC_Os11g06750 LOC_Os07g33997 LOC_Os10g34750 LOC_Os09g32532 LOC_Os12g36950 LOC_Os09g08430 LOC_Os07g46370 LOC_Os07g41180 LOC_Os12g38000 LOC_Os09g18320 LOC_Os10g27174 LOC_Os09g07900 LOC_Os07g07709 LOC_Os05g27940 LOC_Os09g36920 LOC_Os12g03090 LOC_Os11g38959 LOC_Os11g29400 LOC_Os05g37330 LOC_Os11g19250 LOC_Os08g02410 LOC_Os08g23710 LOC_Os07g33921 LOC_Os06g50910 LOC_Os06g45070 LOC_Os05g42300 LOC_Os09g31180 LOC_Os06g46770 LOC_Os06g48355 LOC_Os09g07510 LOC_Os07g33898 LOC_Os06g05400 LOC_Os12g42370 LOC_Os09g02810 LOC_Os07g01870 LOC_Os05g38520 LOC_Os09g32976 LOC_Os05g44320 LOC_Os07g49520 LOC_Os10g08930 LOC_Os06g02144 LOC_Os06g02510 LOC_Os05g30530 LOC_Os10g32880 LOC_Os05g42424 LOC_Os12g07950 LOC_Os11g34350 LOC_Os01g62230 LOC_Os03g58810 LOC_Os02g33140 LOC_Os02g47140 LOC_Os01g27730 LOC_Os03g10340 LOC_Os02g56014 LOC_Os01g15310 LOC_Os01g06010 LOC_Os05g05220 LOC_Os04g40730 LOC_Os01g59730 LOC_Os03g58050 LOC_Os03g29460 LOC_Os02g02360 LOC_Os02g30050 LOC_Os02g48660 LOC_Os01g05970 LOC_Os01g64090 LOC_Os04g28180 LOC_Os02g18380 LOC_Os01g08770 LOC_Os03g38000 LOC_Os02g03080 LOC_Os04g39700 LOC_Os03g58430 LOC_Os01g67134 LOC_Os03g22880 LOC_Os03g21530 LOC_Os01g71300 LOC_Os04g33750 LOC_Os01g62350 LOC_Os01g34200 LOC_Os04g51630 LOC_Os04g56670 LOC_Os03g49730 LOC_Os02g28810 LOC_Os04g43540 LOC_Os04g53370 LOC_Os01g01060 LOC_Os02g14059 LOC_Os03g14530 LOC_Os01g33030 LOC_Os01g21180 LOC_Os01g49290 LOC_Os02g40880 LOC_Os01g43020 LOC_Os04g42380 LOC_Os03g21940 LOC_Os03g04750 LOC_Os03g18580 LOC_Os04g42270 LOC_Os04g50990 LOC_Os05g27940 LOC_Os02g18830 LOC_Os03g13970 LOC_Os03g62730 LOC_Os03g05980 LOC_Os03g49770 LOC_Os03g29740 LOC_Os04g30730 LOC_Os04g25360 LOC_Os01g16190 LOC_Os01g64690 LOC_Os02g13530 LOC_Os01g19840 LOC_Os02g50370 LOC_Os01g03070 LOC_Os03g42900 LOC_Os03g17310 LOC_Os02g54110 LOC_Os05g19370 LOC_Os03g40180 LOC_Os02g08364 LOC_Os03g19960 LOC_Os03g18570 LOC_Os01g54870 LOC_Os02g06640 LOC_Os03g40110 LOC_Os03g23950 LOC_Os03g22180 LOC_Os02g54700 LOC_Os02g27760 LOC_Os03g22740 LOC_Os03g37970 LOC_Os01g40250 LOC_Os01g04730 LOC_Os05g08360 LOC_Os01g71230 LOC_Os03g64190 LOC_Os02g50760 LOC_Os01g62840

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os11g03400  LOC_Os10g41960  LOC_Os06g36160  LOC_Os07g33979  LOC_Os10g27190  LOC_Os12g07300
LOC_Os10g32820  LOC_Os07g10720  LOC_Os07g12320  LOC_Os08g41300  LOC_Os07g46760  LOC_Os12g06910
LOC_Os10g31520  LOC_Os10g40590  LOC_Os07g26740  LOC_Os07g39870  LOC_Os08g02400  LOC_Os12g04010
LOC_Os06g48350  LOC_Os07g10150  LOC_Os07g33340  LOC_Os11g11390  LOC_Os08g09350  LOC_Os05g28750
LOC_Os06g03780  LOC_Os07g08660  LOC_Os07g46660  LOC_Os10g07994  LOC_Os07g33880  LOC_Os09g36440
LOC_Os07g42950  LOC_Os07g08330  LOC_Os11g06750  LOC_Os07g33997  LOC_Os10g34750  LOC_Os09g32532
LOC_Os12g36950  LOC_Os09g08430  LOC_Os07g46370  LOC_Os07g41180  LOC_Os12g38000  LOC_Os09g18320
LOC_Os10g27174  LOC_Os09g07900  LOC_Os07g07709  LOC_Os05g27940  LOC_Os09g36920  LOC_Os12g03090
LOC_Os11g38959  LOC_Os11g29400  LOC_Os05g37330  LOC_Os11g19250  LOC_Os08g02410  LOC_Os08g23710
LOC_Os07g33921  LOC_Os06g50910  LOC_Os06g45070  LOC_Os05g42300  LOC_Os09g31180  LOC_Os06g46770
LOC_Os06g48355  LOC_Os09g07510  LOC_Os07g33898  LOC_Os06g05400  LOC_Os12g42370  LOC_Os09g02810
LOC_Os07g01870  LOC_Os05g38520  LOC_Os09g32976  LOC_Os05g44320  LOC_Os07g49520  LOC_Os10g08930
LOC_Os06g02144  LOC_Os06g02510  LOC_Os05g30530  LOC_Os10g32880  LOC_Os05g42424  LOC_Os12g07950
LOC_Os11g34350  LOC_Os01g62230   LOC_Os03g58810   LOC_Os02g33140   LOC_Os02g47140   LOC_Os01g27730
LOC_Os03g10340   LOC_Os02g56014   LOC_Os01g15310   LOC_Os01g06010   LOC_Os05g05220   LOC_Os04g40730
LOC_Os01g59730   LOC_Os03g58050   LOC_Os03g29460   LOC_Os02g02360   LOC_Os02g30050   LOC_Os02g48660
LOC_Os01g05970   LOC_Os01g64090   LOC_Os04g28180   LOC_Os02g18380   LOC_Os01g08770   LOC_Os03g38000
LOC_Os02g03080   LOC_Os04g39700   LOC_Os03g58430   LOC_Os01g67134   LOC_Os03g22880   LOC_Os03g21530
LOC_Os01g71300   LOC_Os04g33750   LOC_Os01g62350   LOC_Os01g34200   LOC_Os04g51630   LOC_Os04g56670
LOC_Os03g49730   LOC_Os02g28810   LOC_Os04g43540   LOC_Os04g53370   LOC_Os01g01060   LOC_Os02g14059
LOC_Os03g14530   LOC_Os01g33030   LOC_Os01g21180   LOC_Os01g49290   LOC_Os02g40880   LOC_Os01g43020
LOC_Os04g42380   LOC_Os03g21940   LOC_Os03g04750   LOC_Os03g18580   LOC_Os04g42270   LOC_Os04g50990
LOC_Os05g27940   LOC_Os02g18830   LOC_Os03g13970   LOC_Os03g62730   LOC_Os03g05980   LOC_Os03g49770
LOC_Os03g29740   LOC_Os04g30730   LOC_Os04g25360   LOC_Os01g16190   LOC_Os01g64690   LOC_Os02g13530
LOC_Os01g19840   LOC_Os02g50370   LOC_Os01g03070   LOC_Os03g42900   LOC_Os03g17310   LOC_Os02g54110
LOC_Os05g19370   LOC_Os03g40180   LOC_Os02g08364   LOC_Os03g19960   LOC_Os03g18570   LOC_Os01g54870
LOC_Os02g06640   LOC_Os03g40110   LOC_Os03g23950   LOC_Os03g22180   LOC_Os02g54700   LOC_Os02g27760
LOC_Os03g22740   LOC_Os03g37970   LOC_Os01g40250   LOC_Os01g04730   LOC_Os05g08360   LOC_Os01g71230
LOC_Os03g64190   LOC_Os02g50760   LOC_Os01g62840

Database Links
UniprotKB	Q8LJU5
Ensembl	LOC_Os05g27940.1
Refseq	NP_001055261.1
EMBL	AF529175 AC134927 AC134928
KEGG	osa:4338485 dosa:Os05t0346300-01