RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os09g02810 View Network
Names	CCAAT-box-binding transcription factor-like protein (Os09g0116400 protein) (cDNA clone:J033034O16, full insert sequence)
Function	CCAAT/enhancer-binding protein, putative, expressed
Attributes	Length: 1005 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 110343 pI: 6.4887 Subcellular Location (adjusted): Cytosol Nucleus
Gene Model	LOC_Os09g02810.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os11g11390 LOC_Os12g31840 LOC_Os10g42430 LOC_Os12g29660 LOC_Os10g35280 LOC_Os09g33980 LOC_Os12g03090 LOC_Os12g41930 LOC_Os12g34510 LOC_Os11g06750 LOC_Os09g07820 LOC_Os11g03400 LOC_Os09g37860 LOC_Os10g27190 LOC_Os11g04070 LOC_Os10g25110 LOC_Os11g07500 LOC_Os11g19100 LOC_Os12g38000 LOC_Os09g02810 LOC_Os03g19960 LOC_Os02g33140 LOC_Os02g49270 LOC_Os04g39700 LOC_Os03g40180 LOC_Os08g32090 LOC_Os07g29320 LOC_Os08g28980 LOC_Os02g28810 LOC_Os06g19980 LOC_Os06g01980 LOC_Os05g28750 LOC_Os03g63730 LOC_Os06g47840 LOC_Os02g37870 LOC_Os07g47420 LOC_Os02g06500 LOC_Os06g37180 LOC_Os03g29460 LOC_Os02g13530 LOC_Os04g43140 LOC_Os03g22350 LOC_Os07g10720 LOC_Os03g08050 LOC_Os03g08440 LOC_Os01g19840 LOC_Os07g33340 LOC_Os07g41180 LOC_Os04g51630 LOC_Os05g01990 LOC_Os01g62840 LOC_Os03g61560 LOC_Os01g10820 LOC_Os01g64090 LOC_Os04g33750 LOC_Os02g56210 LOC_Os02g18380 LOC_Os02g54110 LOC_Os03g08020 LOC_Os04g50990 LOC_Os03g45920 LOC_Os07g10250 LOC_Os06g46770 LOC_Os04g56350 LOC_Os03g51600 LOC_Os01g33030 LOC_Os03g13800 LOC_Os01g54870 LOC_Os02g47140 LOC_Os07g44620 LOC_Os03g49210 LOC_Os03g58810 LOC_Os01g38970 LOC_Os05g08360 LOC_Os01g62350 LOC_Os08g31810 LOC_Os07g01870 LOC_Os07g40930 LOC_Os01g14040 LOC_Os02g27760 LOC_Os01g07080 LOC_Os06g02510 LOC_Os02g57070 LOC_Os02g48660 LOC_Os09g02700 LOC_Os07g36140 LOC_Os07g20580 LOC_Os06g36160 LOC_Os07g25440 LOC_Os05g30530 LOC_Os02g14059 LOC_Os03g22180 LOC_Os05g48220 LOC_Os07g46660 LOC_Os03g18580 LOC_Os02g06640 LOC_Os03g58700 LOC_Os03g60930 LOC_Os07g08330 LOC_Os03g58050 LOC_Os05g37330 LOC_Os08g02410 LOC_Os05g38530 LOC_Os07g41580 LOC_Os01g04730 LOC_Os07g10350 LOC_Os07g07709 LOC_Os07g42450 LOC_Os05g38520 LOC_Os05g19370 LOC_Os03g08010 LOC_Os01g59730 LOC_Os03g46490 LOC_Os02g34600 LOC_Os08g02400 LOC_Os03g37970 LOC_Os05g48422 LOC_Os06g30320 LOC_Os03g18570 LOC_Os06g04600 LOC_Os01g52490 LOC_Os06g09570 LOC_Os05g27940 LOC_Os03g58720 LOC_Os03g51900 LOC_Os04g28180 LOC_Os06g37440 LOC_Os04g46310 LOC_Os05g48310 LOC_Os03g16860 LOC_Os01g48920 LOC_Os05g42424 LOC_Os01g13460 LOC_Os01g40250 LOC_Os05g51500 LOC_Os01g27730 LOC_Os09g02810 LOC_Os01g64970 LOC_Os01g67134

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os11g11390  LOC_Os12g31840  LOC_Os10g42430  LOC_Os12g29660  LOC_Os10g35280  LOC_Os09g33980
LOC_Os12g03090  LOC_Os12g41930  LOC_Os12g34510  LOC_Os11g06750  LOC_Os09g07820  LOC_Os11g03400
LOC_Os09g37860  LOC_Os10g27190  LOC_Os11g04070  LOC_Os10g25110  LOC_Os11g07500  LOC_Os11g19100
LOC_Os12g38000  LOC_Os09g02810  LOC_Os03g19960   LOC_Os02g33140   LOC_Os02g49270   LOC_Os04g39700
LOC_Os03g40180   LOC_Os08g32090   LOC_Os07g29320   LOC_Os08g28980   LOC_Os02g28810   LOC_Os06g19980
LOC_Os06g01980   LOC_Os05g28750   LOC_Os03g63730   LOC_Os06g47840   LOC_Os02g37870   LOC_Os07g47420
LOC_Os02g06500   LOC_Os06g37180   LOC_Os03g29460   LOC_Os02g13530   LOC_Os04g43140   LOC_Os03g22350
LOC_Os07g10720   LOC_Os03g08050   LOC_Os03g08440   LOC_Os01g19840   LOC_Os07g33340   LOC_Os07g41180
LOC_Os04g51630   LOC_Os05g01990   LOC_Os01g62840   LOC_Os03g61560   LOC_Os01g10820   LOC_Os01g64090
LOC_Os04g33750   LOC_Os02g56210   LOC_Os02g18380   LOC_Os02g54110   LOC_Os03g08020   LOC_Os04g50990
LOC_Os03g45920   LOC_Os07g10250   LOC_Os06g46770   LOC_Os04g56350   LOC_Os03g51600   LOC_Os01g33030
LOC_Os03g13800   LOC_Os01g54870   LOC_Os02g47140   LOC_Os07g44620   LOC_Os03g49210   LOC_Os03g58810
LOC_Os01g38970   LOC_Os05g08360   LOC_Os01g62350   LOC_Os08g31810   LOC_Os07g01870   LOC_Os07g40930
LOC_Os01g14040   LOC_Os02g27760   LOC_Os01g07080   LOC_Os06g02510   LOC_Os02g57070   LOC_Os02g48660
LOC_Os09g02700   LOC_Os07g36140   LOC_Os07g20580   LOC_Os06g36160   LOC_Os07g25440   LOC_Os05g30530
LOC_Os02g14059   LOC_Os03g22180   LOC_Os05g48220   LOC_Os07g46660   LOC_Os03g18580   LOC_Os02g06640
LOC_Os03g58700   LOC_Os03g60930   LOC_Os07g08330   LOC_Os03g58050   LOC_Os05g37330   LOC_Os08g02410
LOC_Os05g38530   LOC_Os07g41580   LOC_Os01g04730   LOC_Os07g10350   LOC_Os07g07709   LOC_Os07g42450
LOC_Os05g38520   LOC_Os05g19370   LOC_Os03g08010   LOC_Os01g59730   LOC_Os03g46490   LOC_Os02g34600
LOC_Os08g02400   LOC_Os03g37970   LOC_Os05g48422   LOC_Os06g30320   LOC_Os03g18570   LOC_Os06g04600
LOC_Os01g52490   LOC_Os06g09570   LOC_Os05g27940   LOC_Os03g58720   LOC_Os03g51900   LOC_Os04g28180
LOC_Os06g37440   LOC_Os04g46310   LOC_Os05g48310   LOC_Os03g16860   LOC_Os01g48920   LOC_Os05g42424
LOC_Os01g13460   LOC_Os01g40250   LOC_Os05g51500   LOC_Os01g27730   LOC_Os09g02810   LOC_Os01g64970
LOC_Os01g67134

Database Links
UniprotKB	Q6YU01
Ensembl	LOC_Os09g02810.1
Refseq	NP_001062588.1
EMBL	AP005789 AP005884 AP008215 AK101351
KEGG	osa:4346414 dosa:Os09t0116400-01