RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os08g02410 View Network
Names	40S ribosomal protein S13-2
Function	40S ribosomal protein S13, putative, expressed
Attributes	Length: 152 Status: Complete Existence: Evidence at protein level Molecular Weight: 17145.3 pI: 11.2145 Subcellular Location (adjusted): Cytosol
Gene Model	LOC_Os08g02410.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os11g38959 LOC_Os10g27174 LOC_Os09g16330 LOC_Os11g03400 LOC_Os11g06750 LOC_Os11g01420 LOC_Os10g10434 LOC_Os08g23110 LOC_Os10g41960 LOC_Os10g27190 LOC_Os10g31520 LOC_Os09g16380 LOC_Os09g08430 LOC_Os12g03090 LOC_Os09g32532 LOC_Os10g08930 LOC_Os08g05490 LOC_Os09g18320 LOC_Os11g11050 LOC_Os08g31810 LOC_Os08g02690 LOC_Os12g04010 LOC_Os10g28040 LOC_Os08g41300 LOC_Os10g07994 LOC_Os11g19250 LOC_Os09g02810 LOC_Os10g32880 LOC_Os09g31180 LOC_Os12g07300 LOC_Os11g11390 LOC_Os12g06910 LOC_Os12g38000 LOC_Os03g21530 LOC_Os03g37970 LOC_Os01g68940 LOC_Os06g36160 LOC_Os01g59730 LOC_Os05g44320 LOC_Os04g52200 LOC_Os04g30730 LOC_Os03g42770 LOC_Os04g42270 LOC_Os05g41100 LOC_Os03g23950 LOC_Os01g68950 LOC_Os07g12320 LOC_Os05g28370 LOC_Os02g40880 LOC_Os02g47140 LOC_Os03g10340 LOC_Os03g23020 LOC_Os03g05720 LOC_Os04g59494 LOC_Os02g48660 LOC_Os04g46110 LOC_Os01g66520 LOC_Os07g46660 LOC_Os04g39700 LOC_Os03g29460 LOC_Os03g18580 LOC_Os01g03070 LOC_Os01g62244 LOC_Os03g21940 LOC_Os01g72790 LOC_Os01g13730 LOC_Os01g71230 LOC_Os02g13530 LOC_Os02g30050 LOC_Os04g43540 LOC_Os04g46310 LOC_Os03g58430 LOC_Os02g32690 LOC_Os07g08660 LOC_Os03g22880 LOC_Os05g30530 LOC_Os02g18380 LOC_Os02g39350 LOC_Os05g32580 LOC_Os07g07709 LOC_Os07g01870 LOC_Os03g31090 LOC_Os01g49290 LOC_Os03g02420 LOC_Os07g41180 LOC_Os02g02360 LOC_Os07g33979 LOC_Os03g44900 LOC_Os02g12850 LOC_Os07g33898 LOC_Os02g50370 LOC_Os03g18570 LOC_Os04g42380 LOC_Os02g33140 LOC_Os05g19370 LOC_Os07g33880 LOC_Os06g46770 LOC_Os04g56670 LOC_Os01g73310 LOC_Os05g06450 LOC_Os03g56460 LOC_Os03g29540 LOC_Os07g33997 LOC_Os04g35700 LOC_Os07g33921 LOC_Os03g58050 LOC_Os02g27760 LOC_Os01g34200 LOC_Os02g14059 LOC_Os03g22740 LOC_Os01g64090 LOC_Os05g27940 LOC_Os03g38000 LOC_Os02g28810 LOC_Os07g26740 LOC_Os01g62350 LOC_Os07g46370 LOC_Os01g54870 LOC_Os03g05980 LOC_Os01g40250 LOC_Os05g51700 LOC_Os05g42424 LOC_Os03g40110 LOC_Os05g08360 LOC_Os02g54110 LOC_Os01g67134 LOC_Os02g06640 LOC_Os07g10720 LOC_Os01g08770 LOC_Os03g40180 LOC_Os06g02510 LOC_Os02g56014 LOC_Os04g50990 LOC_Os03g22180 LOC_Os04g33750 LOC_Os01g16190 LOC_Os03g07080 LOC_Os01g04730 LOC_Os02g50760 LOC_Os07g42950 LOC_Os02g18830 LOC_Os04g28180 LOC_Os03g49210 LOC_Os07g36940 LOC_Os05g38520 LOC_Os02g01490 LOC_Os03g19960 LOC_Os01g01060 LOC_Os03g14530 LOC_Os05g37330 LOC_Os03g50885 LOC_Os06g14510 LOC_Os06g03780

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os11g38959  LOC_Os10g27174  LOC_Os09g16330  LOC_Os11g03400  LOC_Os11g06750  LOC_Os11g01420
LOC_Os10g10434  LOC_Os08g23110  LOC_Os10g41960  LOC_Os10g27190  LOC_Os10g31520  LOC_Os09g16380
LOC_Os09g08430  LOC_Os12g03090  LOC_Os09g32532  LOC_Os10g08930  LOC_Os08g05490  LOC_Os09g18320
LOC_Os11g11050  LOC_Os08g31810  LOC_Os08g02690  LOC_Os12g04010  LOC_Os10g28040  LOC_Os08g41300
LOC_Os10g07994  LOC_Os11g19250  LOC_Os09g02810  LOC_Os10g32880  LOC_Os09g31180  LOC_Os12g07300
LOC_Os11g11390  LOC_Os12g06910  LOC_Os12g38000  LOC_Os03g21530   LOC_Os03g37970   LOC_Os01g68940
LOC_Os06g36160   LOC_Os01g59730   LOC_Os05g44320   LOC_Os04g52200   LOC_Os04g30730   LOC_Os03g42770
LOC_Os04g42270   LOC_Os05g41100   LOC_Os03g23950   LOC_Os01g68950   LOC_Os07g12320   LOC_Os05g28370
LOC_Os02g40880   LOC_Os02g47140   LOC_Os03g10340   LOC_Os03g23020   LOC_Os03g05720   LOC_Os04g59494
LOC_Os02g48660   LOC_Os04g46110   LOC_Os01g66520   LOC_Os07g46660   LOC_Os04g39700   LOC_Os03g29460
LOC_Os03g18580   LOC_Os01g03070   LOC_Os01g62244   LOC_Os03g21940   LOC_Os01g72790   LOC_Os01g13730
LOC_Os01g71230   LOC_Os02g13530   LOC_Os02g30050   LOC_Os04g43540   LOC_Os04g46310   LOC_Os03g58430
LOC_Os02g32690   LOC_Os07g08660   LOC_Os03g22880   LOC_Os05g30530   LOC_Os02g18380   LOC_Os02g39350
LOC_Os05g32580   LOC_Os07g07709   LOC_Os07g01870   LOC_Os03g31090   LOC_Os01g49290   LOC_Os03g02420
LOC_Os07g41180   LOC_Os02g02360   LOC_Os07g33979   LOC_Os03g44900   LOC_Os02g12850   LOC_Os07g33898
LOC_Os02g50370   LOC_Os03g18570   LOC_Os04g42380   LOC_Os02g33140   LOC_Os05g19370   LOC_Os07g33880
LOC_Os06g46770   LOC_Os04g56670   LOC_Os01g73310   LOC_Os05g06450   LOC_Os03g56460   LOC_Os03g29540
LOC_Os07g33997   LOC_Os04g35700   LOC_Os07g33921   LOC_Os03g58050   LOC_Os02g27760   LOC_Os01g34200
LOC_Os02g14059   LOC_Os03g22740   LOC_Os01g64090   LOC_Os05g27940   LOC_Os03g38000   LOC_Os02g28810
LOC_Os07g26740   LOC_Os01g62350   LOC_Os07g46370   LOC_Os01g54870   LOC_Os03g05980   LOC_Os01g40250
LOC_Os05g51700   LOC_Os05g42424   LOC_Os03g40110   LOC_Os05g08360   LOC_Os02g54110   LOC_Os01g67134
LOC_Os02g06640   LOC_Os07g10720   LOC_Os01g08770   LOC_Os03g40180   LOC_Os06g02510   LOC_Os02g56014
LOC_Os04g50990   LOC_Os03g22180   LOC_Os04g33750   LOC_Os01g16190   LOC_Os03g07080   LOC_Os01g04730
LOC_Os02g50760   LOC_Os07g42950   LOC_Os02g18830   LOC_Os04g28180   LOC_Os03g49210   LOC_Os07g36940
LOC_Os05g38520   LOC_Os02g01490   LOC_Os03g19960   LOC_Os01g01060   LOC_Os03g14530   LOC_Os05g37330
LOC_Os03g50885   LOC_Os06g14510   LOC_Os06g03780

Database Links
UniprotKB	Q69UI1
Ensembl	LOC_Os08g02410.1
Refseq	NP_001060861.1
EMBL	AP004562 AP008214
KEGG	osa:4344524 dosa:Os08t0117300-01