RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os01g62244 View Network
Names	Os01g0839700 protein (Putative ubiquitin carrier protein UBC7) (Ubiquitin carrier protein) (Uncharacterized protein) (cDNA clone:001-039-E11, full insert sequence) (cDNA clone:006-208-B05, full insert sequence) (cDNA clone:J013135H01, full insert sequence)
Function	ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed
Attributes	Length: 170 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 19013.6 pI: 5.2441 Subcellular Location (predicted): Mitochondria Nucleus
Gene Model	LOC_Os01g62244.1 LOC_Os01g62244.2 LOC_Os01g62244.3
Enzyme	6.3.2.19 ubiquitin---protein ligase

Reactions
OSR2941 OSR2942 OSR2943 OSR2966

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os05g43770 LOC_Os07g32430 LOC_Os08g34970 LOC_Os05g03610 LOC_Os03g29470 LOC_Os07g43020 LOC_Os11g48020 LOC_Os01g64820 LOC_Os02g51780 LOC_Os05g05260 LOC_Os05g15160 LOC_Os06g19680 LOC_Os03g14510 LOC_Os09g24412 LOC_Os02g39030 LOC_Os03g26090 LOC_Os06g03770 LOC_Os07g07000 LOC_Os03g51550 LOC_Os03g63590 LOC_Os05g37434 LOC_Os07g41180 LOC_Os04g53760 LOC_Os09g25310 LOC_Os07g25024 LOC_Os06g43210 LOC_Os03g55280 LOC_Os11g07922 LOC_Os03g56820 LOC_Os05g05860 LOC_Os11g07930 LOC_Os10g11620 LOC_Os02g47410 LOC_Os12g37590 LOC_Os05g44350 LOC_Os02g18380 LOC_Os08g05590 LOC_Os06g45100 LOC_Os01g73760 LOC_Os06g09910 LOC_Os03g10930 LOC_Os05g23260 LOC_Os03g23909 LOC_Os10g07994 LOC_Os01g67040 LOC_Os10g31000 LOC_Os03g42320 LOC_Os03g15350 LOC_Os06g41590 LOC_Os05g06840 LOC_Os10g11200 LOC_Os02g14790 LOC_Os08g01620 LOC_Os03g12810 LOC_Os02g14059 LOC_Os11g39670 LOC_Os06g29080 LOC_Os10g40140 LOC_Os03g02450 LOC_Os08g02640 LOC_Os02g44680 LOC_Os09g27960 LOC_Os03g60930 LOC_Os02g45180 LOC_Os12g40830 LOC_Os05g26660 LOC_Os06g05900 LOC_Os02g42040 LOC_Os02g55340 LOC_Os04g33750 LOC_Os03g11440 LOC_Os04g33060 LOC_Os05g25850 LOC_Os08g02410 LOC_Os08g19830 LOC_Os03g55620 LOC_Os04g49960 LOC_Os09g31130 LOC_Os04g51830 LOC_Os07g10830 LOC_Os05g32430 LOC_Os04g55960 LOC_Os02g40870 LOC_Os02g09810 LOC_Os02g47850 LOC_Os06g29180 LOC_Os09g39500 LOC_Os04g58800 LOC_Os12g25710 LOC_Os05g01990 LOC_Os03g10360 LOC_Os03g27450 LOC_Os02g43340 LOC_Os05g46620 LOC_Os04g42010 LOC_Os08g37444 LOC_Os05g04630 LOC_Os06g30970 LOC_Os10g21352 LOC_Os07g01930 LOC_Os05g05470 LOC_Os02g33450 LOC_Os01g62244 LOC_Os01g73310 LOC_Os07g49260 LOC_Os09g36530 LOC_Os06g07090 LOC_Os08g39140 LOC_Os06g04450 LOC_Os06g49890 LOC_Os12g42850 LOC_Os03g51140 LOC_Os07g44660 LOC_Os02g03540 LOC_Os07g03160 LOC_Os04g58210 LOC_Os06g31210 LOC_Os02g03450 LOC_Os03g48850 LOC_Os10g30090 LOC_Os02g03110 LOC_Os12g41390 LOC_Os12g14080 LOC_Os03g49230 LOC_Os10g40780 LOC_Os03g09140 LOC_Os07g32480 LOC_Os03g60700 LOC_Os03g17790 LOC_Os05g28290 LOC_Os05g10770 LOC_Os06g16420 LOC_Os07g31370 LOC_Os08g09320 LOC_Os08g40180 LOC_Os07g39780 LOC_Os02g45650 LOC_Os03g22880 LOC_Os06g38470 LOC_Os06g29844 LOC_Os02g37920 LOC_Os02g39700 LOC_Os03g02390 LOC_Os03g59050 LOC_Os05g50550 LOC_Os04g53210 LOC_Os03g45320 LOC_Os02g36960 LOC_Os07g01150 LOC_Os11g29400 LOC_Os04g26910 LOC_Os12g06870 LOC_Os04g16818 LOC_Os12g08280 LOC_Os03g50390 LOC_Os09g28940 LOC_Os03g44780 LOC_Os07g41800 LOC_Os08g05890 LOC_Os08g29170 LOC_Os02g10070 LOC_Os08g33488 LOC_Os07g44060 LOC_Os07g44330 LOC_Os12g03430 LOC_Os07g43120 LOC_Os07g44710 LOC_Os03g05300 LOC_Os04g56760 LOC_Os02g53500 LOC_Os03g25400 LOC_Os08g22864 LOC_Os05g39390 LOC_Os12g31810 LOC_Os03g61200 LOC_Os04g34984 LOC_Os02g04660 LOC_Os12g01160 LOC_Os06g48810 LOC_Os04g51370 LOC_Os09g11450 LOC_Os02g54910 LOC_Os04g24180 LOC_Os03g13800 LOC_Os01g67590 LOC_Os06g06030 LOC_Os08g31410 LOC_Os09g36920 LOC_Os11g16410 LOC_Os08g36774 LOC_Os03g02260 LOC_Os06g02550 LOC_Os02g13870 LOC_Os12g40880 LOC_Os03g61920 LOC_Os03g53960 LOC_Os03g01018 LOC_Os01g67740 LOC_Os10g39620 LOC_Os12g07350 LOC_Os09g20640 LOC_Os11g34860 LOC_Os10g17280 LOC_Os06g02620 LOC_Os05g46550 LOC_Os01g74520 LOC_Os03g53400 LOC_Os09g06499 LOC_Os08g15266 LOC_Os05g39240 LOC_Os11g04180 LOC_Os02g39300 LOC_Os11g33330 LOC_Os02g44690 LOC_Os01g67970 LOC_Os02g06480 LOC_Os05g06770 LOC_Os06g16280 LOC_Os04g09800 LOC_Os08g14580 LOC_Os02g06640 LOC_Os04g17064 LOC_Os03g14260 LOC_Os04g45950 LOC_Os05g19270 LOC_Os09g12570 LOC_Os05g44922 LOC_Os01g72690 LOC_Os10g37410 LOC_Os02g52920 LOC_Os03g49180 LOC_Os03g08010 LOC_Os03g58160 LOC_Os02g07830 LOC_Os03g45170 LOC_Os03g08020 LOC_Os03g36930 LOC_Os02g32570 LOC_Os04g55800 LOC_Os06g46770 LOC_Os04g58630 LOC_Os08g41250 LOC_Os11g32240 LOC_Os03g16670 LOC_Os02g53420 LOC_Os08g03390 LOC_Os07g37640 LOC_Os04g38340 LOC_Os08g02340 LOC_Os12g30060 LOC_Os05g42424 LOC_Os02g49780 LOC_Os04g47120 LOC_Os05g43576 LOC_Os06g29790 LOC_Os10g30100 LOC_Os12g39840 LOC_Os07g07040 LOC_Os03g13170 LOC_Os05g32210 LOC_Os02g04560 LOC_Os06g42860 LOC_Os03g08050 LOC_Os02g43920 LOC_Os06g43680 LOC_Os07g10600 LOC_Os08g01100 LOC_Os02g07040 LOC_Os10g34670 LOC_Os06g02144 LOC_Os08g43370 LOC_Os07g34610 LOC_Os04g16772 LOC_Os07g19460 LOC_Os08g25624 LOC_Os11g42790 LOC_Os04g01600 LOC_Os04g56800 LOC_Os12g13590 LOC_Os05g13300 LOC_Os10g32550 LOC_Os03g22890 LOC_Os07g29360 LOC_Os12g07590 LOC_Os02g53680 LOC_Os03g01810 LOC_Os08g45040 LOC_Os02g48670 LOC_Os08g37874 LOC_Os03g01216 LOC_Os04g26841 LOC_Os03g58720 LOC_Os06g19980 LOC_Os10g28040 LOC_Os07g41730 LOC_Os02g55630 LOC_Os06g09330 LOC_Os02g47210 LOC_Os05g03100 LOC_Os04g42060 LOC_Os03g37984 LOC_Os02g33140 LOC_Os10g32030 LOC_Os04g25360 LOC_Os03g05730 LOC_Os08g02400 LOC_Os03g64190 LOC_Os03g22570 LOC_Os07g10540 LOC_Os07g40790 LOC_Os12g12860 LOC_Os05g30410 LOC_Os11g01154 LOC_Os01g08960 LOC_Os01g01080 LOC_Os01g60410 LOC_Os01g11070 LOC_Os01g04260 LOC_Os01g59360 LOC_Os01g60360 LOC_Os01g45190 LOC_Os01g56620 LOC_Os01g36890 LOC_Os01g08780 LOC_Os01g27990 LOC_Os01g36920 LOC_Os01g06020 LOC_Os01g51200 LOC_Os01g47650 LOC_Os01g62244 LOC_Os01g05420 LOC_Os01g13430 LOC_Os01g47410 LOC_Os01g55300 LOC_Os01g47600 LOC_Os01g62230 LOC_Os01g14040 LOC_Os01g48420 LOC_Os01g39260 LOC_Os01g07730 LOC_Os01g34390 LOC_Os01g56590 LOC_Os01g58730 LOC_Os01g05970 LOC_Os01g10820 LOC_Os01g34870 LOC_Os01g06010 LOC_Os01g36930 LOC_Os01g61830 LOC_Os01g09580 LOC_Os01g37800

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os05g43770  LOC_Os07g32430  LOC_Os08g34970  LOC_Os05g03610  LOC_Os03g29470  LOC_Os07g43020
LOC_Os11g48020  LOC_Os01g64820  LOC_Os02g51780  LOC_Os05g05260  LOC_Os05g15160  LOC_Os06g19680
LOC_Os03g14510  LOC_Os09g24412  LOC_Os02g39030  LOC_Os03g26090  LOC_Os06g03770  LOC_Os07g07000
LOC_Os03g51550  LOC_Os03g63590  LOC_Os05g37434  LOC_Os07g41180  LOC_Os04g53760  LOC_Os09g25310
LOC_Os07g25024  LOC_Os06g43210  LOC_Os03g55280  LOC_Os11g07922  LOC_Os03g56820  LOC_Os05g05860
LOC_Os11g07930  LOC_Os10g11620  LOC_Os02g47410  LOC_Os12g37590  LOC_Os05g44350  LOC_Os02g18380
LOC_Os08g05590  LOC_Os06g45100  LOC_Os01g73760  LOC_Os06g09910  LOC_Os03g10930  LOC_Os05g23260
LOC_Os03g23909  LOC_Os10g07994  LOC_Os01g67040  LOC_Os10g31000  LOC_Os03g42320  LOC_Os03g15350
LOC_Os06g41590  LOC_Os05g06840  LOC_Os10g11200  LOC_Os02g14790  LOC_Os08g01620  LOC_Os03g12810
LOC_Os02g14059  LOC_Os11g39670  LOC_Os06g29080  LOC_Os10g40140  LOC_Os03g02450  LOC_Os08g02640
LOC_Os02g44680  LOC_Os09g27960  LOC_Os03g60930  LOC_Os02g45180  LOC_Os12g40830  LOC_Os05g26660
LOC_Os06g05900  LOC_Os02g42040  LOC_Os02g55340  LOC_Os04g33750  LOC_Os03g11440  LOC_Os04g33060
LOC_Os05g25850  LOC_Os08g02410  LOC_Os08g19830  LOC_Os03g55620  LOC_Os04g49960  LOC_Os09g31130
LOC_Os04g51830  LOC_Os07g10830  LOC_Os05g32430  LOC_Os04g55960  LOC_Os02g40870  LOC_Os02g09810
LOC_Os02g47850  LOC_Os06g29180  LOC_Os09g39500  LOC_Os04g58800  LOC_Os12g25710  LOC_Os05g01990
LOC_Os03g10360  LOC_Os03g27450  LOC_Os02g43340  LOC_Os05g46620  LOC_Os04g42010  LOC_Os08g37444
LOC_Os05g04630  LOC_Os06g30970  LOC_Os10g21352  LOC_Os07g01930  LOC_Os05g05470  LOC_Os02g33450
LOC_Os01g62244  LOC_Os01g73310  LOC_Os07g49260  LOC_Os09g36530  LOC_Os06g07090  LOC_Os08g39140
LOC_Os06g04450  LOC_Os06g49890  LOC_Os12g42850  LOC_Os03g51140  LOC_Os07g44660  LOC_Os02g03540
LOC_Os07g03160  LOC_Os04g58210  LOC_Os06g31210  LOC_Os02g03450  LOC_Os03g48850  LOC_Os10g30090
LOC_Os02g03110  LOC_Os12g41390  LOC_Os12g14080  LOC_Os03g49230  LOC_Os10g40780  LOC_Os03g09140
LOC_Os07g32480  LOC_Os03g60700  LOC_Os03g17790  LOC_Os05g28290  LOC_Os05g10770  LOC_Os06g16420
LOC_Os07g31370  LOC_Os08g09320  LOC_Os08g40180  LOC_Os07g39780  LOC_Os02g45650  LOC_Os03g22880
LOC_Os06g38470  LOC_Os06g29844  LOC_Os02g37920  LOC_Os02g39700  LOC_Os03g02390  LOC_Os03g59050
LOC_Os05g50550  LOC_Os04g53210  LOC_Os03g45320  LOC_Os02g36960  LOC_Os07g01150  LOC_Os11g29400
LOC_Os04g26910  LOC_Os12g06870  LOC_Os04g16818  LOC_Os12g08280  LOC_Os03g50390  LOC_Os09g28940
LOC_Os03g44780  LOC_Os07g41800  LOC_Os08g05890  LOC_Os08g29170  LOC_Os02g10070  LOC_Os08g33488
LOC_Os07g44060  LOC_Os07g44330  LOC_Os12g03430  LOC_Os07g43120  LOC_Os07g44710  LOC_Os03g05300
LOC_Os04g56760  LOC_Os02g53500  LOC_Os03g25400  LOC_Os08g22864  LOC_Os05g39390  LOC_Os12g31810
LOC_Os03g61200  LOC_Os04g34984  LOC_Os02g04660  LOC_Os12g01160  LOC_Os06g48810  LOC_Os04g51370
LOC_Os09g11450  LOC_Os02g54910  LOC_Os04g24180  LOC_Os03g13800  LOC_Os01g67590  LOC_Os06g06030
LOC_Os08g31410  LOC_Os09g36920  LOC_Os11g16410  LOC_Os08g36774  LOC_Os03g02260  LOC_Os06g02550
LOC_Os02g13870  LOC_Os12g40880  LOC_Os03g61920  LOC_Os03g53960  LOC_Os03g01018  LOC_Os01g67740
LOC_Os10g39620  LOC_Os12g07350  LOC_Os09g20640  LOC_Os11g34860  LOC_Os10g17280  LOC_Os06g02620
LOC_Os05g46550  LOC_Os01g74520  LOC_Os03g53400  LOC_Os09g06499  LOC_Os08g15266  LOC_Os05g39240
LOC_Os11g04180  LOC_Os02g39300  LOC_Os11g33330  LOC_Os02g44690  LOC_Os01g67970  LOC_Os02g06480
LOC_Os05g06770  LOC_Os06g16280  LOC_Os04g09800  LOC_Os08g14580  LOC_Os02g06640  LOC_Os04g17064
LOC_Os03g14260  LOC_Os04g45950  LOC_Os05g19270  LOC_Os09g12570  LOC_Os05g44922  LOC_Os01g72690
LOC_Os10g37410  LOC_Os02g52920  LOC_Os03g49180  LOC_Os03g08010  LOC_Os03g58160  LOC_Os02g07830
LOC_Os03g45170  LOC_Os03g08020  LOC_Os03g36930  LOC_Os02g32570  LOC_Os04g55800  LOC_Os06g46770
LOC_Os04g58630  LOC_Os08g41250  LOC_Os11g32240  LOC_Os03g16670  LOC_Os02g53420  LOC_Os08g03390
LOC_Os07g37640  LOC_Os04g38340  LOC_Os08g02340  LOC_Os12g30060  LOC_Os05g42424  LOC_Os02g49780
LOC_Os04g47120  LOC_Os05g43576  LOC_Os06g29790  LOC_Os10g30100  LOC_Os12g39840  LOC_Os07g07040
LOC_Os03g13170  LOC_Os05g32210  LOC_Os02g04560  LOC_Os06g42860  LOC_Os03g08050  LOC_Os02g43920
LOC_Os06g43680  LOC_Os07g10600  LOC_Os08g01100  LOC_Os02g07040  LOC_Os10g34670  LOC_Os06g02144
LOC_Os08g43370  LOC_Os07g34610  LOC_Os04g16772  LOC_Os07g19460  LOC_Os08g25624  LOC_Os11g42790
LOC_Os04g01600  LOC_Os04g56800  LOC_Os12g13590  LOC_Os05g13300  LOC_Os10g32550  LOC_Os03g22890
LOC_Os07g29360  LOC_Os12g07590  LOC_Os02g53680  LOC_Os03g01810  LOC_Os08g45040  LOC_Os02g48670
LOC_Os08g37874  LOC_Os03g01216  LOC_Os04g26841  LOC_Os03g58720  LOC_Os06g19980  LOC_Os10g28040
LOC_Os07g41730  LOC_Os02g55630  LOC_Os06g09330  LOC_Os02g47210  LOC_Os05g03100  LOC_Os04g42060
LOC_Os03g37984  LOC_Os02g33140  LOC_Os10g32030  LOC_Os04g25360  LOC_Os03g05730  LOC_Os08g02400
LOC_Os03g64190  LOC_Os03g22570  LOC_Os07g10540  LOC_Os07g40790  LOC_Os12g12860  LOC_Os05g30410
LOC_Os11g01154  LOC_Os01g08960   LOC_Os01g01080   LOC_Os01g60410   LOC_Os01g11070   LOC_Os01g04260
LOC_Os01g59360   LOC_Os01g60360   LOC_Os01g45190   LOC_Os01g56620   LOC_Os01g36890   LOC_Os01g08780
LOC_Os01g27990   LOC_Os01g36920   LOC_Os01g06020   LOC_Os01g51200   LOC_Os01g47650   LOC_Os01g62244
LOC_Os01g05420   LOC_Os01g13430   LOC_Os01g47410   LOC_Os01g55300   LOC_Os01g47600   LOC_Os01g62230
LOC_Os01g14040   LOC_Os01g48420   LOC_Os01g39260   LOC_Os01g07730   LOC_Os01g34390   LOC_Os01g56590
LOC_Os01g58730   LOC_Os01g05970   LOC_Os01g10820   LOC_Os01g34870   LOC_Os01g06010   LOC_Os01g36930
LOC_Os01g61830   LOC_Os01g09580   LOC_Os01g37800

Database Links
UniprotKB	Q943L1
Ensembl	LOC_Os01g62244.1
Refseq	NP_001044755.1
EMBL	HQ013290 AP003231 AP003241 AP008207 AK099038 AK104148 AK112030 CM000138
KEGG	osa:4327386 dosa:Os01t0839700-01