RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os08g05890 View Network
Names	Os08g0155100 protein (Putative 27k vesicle-associated membrane protein-associated protein) (cDNA clone:001-045-A07, full insert sequence) (cDNA clone:J023037M15, full insert sequence)
Function	MSP domain containing protein, expressed
Attributes	Length: 238 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 26139.9 pI: 7.9461 Subcellular Location (predicted): Cytosol Nucleus
Gene Model	LOC_Os08g05890.1 LOC_Os08g05890.2

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g30060 LOC_Os08g06040 LOC_Os10g40140 LOC_Os09g34970 LOC_Os12g36950 LOC_Os10g28610 LOC_Os12g07950 LOC_Os12g40780 LOC_Os08g44260 LOC_Os11g01450 LOC_Os08g37444 LOC_Os12g44330 LOC_Os09g24404 LOC_Os09g30412 LOC_Os12g03190 LOC_Os11g20384 LOC_Os10g22450 LOC_Os08g05890 LOC_Os08g39140 LOC_Os10g40590 LOC_Os10g07994 LOC_Os07g31370 LOC_Os06g51270 LOC_Os01g68950 LOC_Os03g50320 LOC_Os06g50910 LOC_Os04g53760 LOC_Os02g05630 LOC_Os07g39870 LOC_Os07g10830 LOC_Os06g04580 LOC_Os01g43020 LOC_Os01g16190 LOC_Os03g46750 LOC_Os03g50390 LOC_Os04g16776 LOC_Os01g13430 LOC_Os04g56640 LOC_Os06g40840 LOC_Os07g46540 LOC_Os06g37180 LOC_Os07g25016 LOC_Os03g16860 LOC_Os03g09140 LOC_Os03g03610 LOC_Os07g49150 LOC_Os01g61710 LOC_Os06g48355 LOC_Os02g06640 LOC_Os03g09920 LOC_Os06g46770 LOC_Os07g13270 LOC_Os01g62244 LOC_Os03g02680 LOC_Os05g42424 LOC_Os03g17310 LOC_Os03g15810 LOC_Os04g16814 LOC_Os02g04160 LOC_Os05g01030 LOC_Os03g48000 LOC_Os02g03450 LOC_Os08g05890 LOC_Os06g36990 LOC_Os07g28280 LOC_Os02g45180 LOC_Os03g23909 LOC_Os03g18080 LOC_Os07g08330 LOC_Os06g48350 LOC_Os05g24594 LOC_Os01g49290 LOC_Os01g68940 LOC_Os02g12740 LOC_Os06g08380 LOC_Os03g53720 LOC_Os02g23890 LOC_Os02g04660 LOC_Os06g11290 LOC_Os03g49770 LOC_Os03g13970 LOC_Os05g38530 LOC_Os03g01810 LOC_Os07g25440

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g30060  LOC_Os08g06040  LOC_Os10g40140  LOC_Os09g34970  LOC_Os12g36950  LOC_Os10g28610
LOC_Os12g07950  LOC_Os12g40780  LOC_Os08g44260  LOC_Os11g01450  LOC_Os08g37444  LOC_Os12g44330
LOC_Os09g24404  LOC_Os09g30412  LOC_Os12g03190  LOC_Os11g20384  LOC_Os10g22450  LOC_Os08g05890
LOC_Os08g39140  LOC_Os10g40590  LOC_Os10g07994  LOC_Os07g31370   LOC_Os06g51270   LOC_Os01g68950
LOC_Os03g50320   LOC_Os06g50910   LOC_Os04g53760   LOC_Os02g05630   LOC_Os07g39870   LOC_Os07g10830
LOC_Os06g04580   LOC_Os01g43020   LOC_Os01g16190   LOC_Os03g46750   LOC_Os03g50390   LOC_Os04g16776
LOC_Os01g13430   LOC_Os04g56640   LOC_Os06g40840   LOC_Os07g46540   LOC_Os06g37180   LOC_Os07g25016
LOC_Os03g16860   LOC_Os03g09140   LOC_Os03g03610   LOC_Os07g49150   LOC_Os01g61710   LOC_Os06g48355
LOC_Os02g06640   LOC_Os03g09920   LOC_Os06g46770   LOC_Os07g13270   LOC_Os01g62244   LOC_Os03g02680
LOC_Os05g42424   LOC_Os03g17310   LOC_Os03g15810   LOC_Os04g16814   LOC_Os02g04160   LOC_Os05g01030
LOC_Os03g48000   LOC_Os02g03450   LOC_Os08g05890   LOC_Os06g36990   LOC_Os07g28280   LOC_Os02g45180
LOC_Os03g23909   LOC_Os03g18080   LOC_Os07g08330   LOC_Os06g48350   LOC_Os05g24594   LOC_Os01g49290
LOC_Os01g68940   LOC_Os02g12740   LOC_Os06g08380   LOC_Os03g53720   LOC_Os02g23890   LOC_Os02g04660
LOC_Os06g11290   LOC_Os03g49770   LOC_Os03g13970   LOC_Os05g38530   LOC_Os03g01810   LOC_Os07g25440

Database Links
UniprotKB	Q6ZJR5
Ensembl	LOC_Os08g05890.1
Refseq	NP_001061019.1
EMBL	AP003905 AP008214 AK069865 AK104886
KEGG	osa:4344689 dosa:Os08t0155100-01