RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os03g13970 View Network
Names	26S proteasome regulatory particle non-ATPase subunit10 (Os03g0243300 protein) (OsS5a) (Ubiquitin interaction motif family protein, expressed) (cDNA clone:J033046D23, full insert sequence)
Function	26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, putative, expressed
Attributes	Length: 403 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 42383.1 pI: 4.2484 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os03g13970.1 LOC_Os03g13970.2

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os04g54340 LOC_Os06g19730 LOC_Os11g29190 LOC_Os05g24550 LOC_Os10g39620 LOC_Os09g36710 LOC_Os10g41450 LOC_Os09g20090 LOC_Os09g37000 LOC_Os03g48930 LOC_Os09g15320 LOC_Os11g04070 LOC_Os09g20820 LOC_Os11g05562 LOC_Os07g47580 LOC_Os06g02550 LOC_Os05g13300 LOC_Os05g22940 LOC_Os03g63940 LOC_Os10g39590 LOC_Os11g04220 LOC_Os11g40150 LOC_Os04g54940 LOC_Os03g18580 LOC_Os08g13690 LOC_Os04g58110 LOC_Os05g48030 LOC_Os05g06770 LOC_Os08g33340 LOC_Os08g05490 LOC_Os04g02820 LOC_Os06g37080 LOC_Os03g58050 LOC_Os05g42424 LOC_Os05g41060 LOC_Os03g46490 LOC_Os09g06560 LOC_Os08g05840 LOC_Os12g42140 LOC_Os06g51270 LOC_Os04g33750 LOC_Os03g46390 LOC_Os06g07878 LOC_Os05g05260 LOC_Os08g44530 LOC_Os04g51630 LOC_Os06g07630 LOC_Os09g32680 LOC_Os06g06460 LOC_Os03g55110 LOC_Os04g22240 LOC_Os12g35030 LOC_Os09g11450 LOC_Os10g34670 LOC_Os10g21910 LOC_Os05g38530 LOC_Os06g10340 LOC_Os08g19830 LOC_Os06g47840 LOC_Os08g23710 LOC_Os05g23620 LOC_Os03g18570 LOC_Os06g48750 LOC_Os07g03160 LOC_Os03g31090 LOC_Os04g55410 LOC_Os03g13970 LOC_Os05g39050 LOC_Os09g08660 LOC_Os04g31390 LOC_Os07g41180 LOC_Os08g41730 LOC_Os07g30300 LOC_Os04g10400 LOC_Os04g36700 LOC_Os08g02860 LOC_Os06g38470 LOC_Os03g51550 LOC_Os06g06030 LOC_Os09g32976 LOC_Os04g53760 LOC_Os05g01020 LOC_Os06g06510 LOC_Os03g28140 LOC_Os04g39040 LOC_Os03g16860 LOC_Os09g33986 LOC_Os12g05430 LOC_Os11g42790 LOC_Os06g45710 LOC_Os07g29420 LOC_Os03g44780 LOC_Os07g08660 LOC_Os07g29360 LOC_Os06g09170 LOC_Os04g56646 LOC_Os06g30970 LOC_Os11g05730 LOC_Os04g24180 LOC_Os12g31810 LOC_Os03g38000 LOC_Os05g29760 LOC_Os04g14654 LOC_Os05g27940 LOC_Os09g39500 LOC_Os06g07978 LOC_Os07g07240 LOC_Os07g47710 LOC_Os07g36500 LOC_Os06g15360 LOC_Os07g49150 LOC_Os05g33040 LOC_Os09g21110 LOC_Os05g36280 LOC_Os04g40850 LOC_Os05g46270 LOC_Os12g30060 LOC_Os12g36950 LOC_Os04g30730 LOC_Os05g32180 LOC_Os06g08380 LOC_Os06g04280 LOC_Os05g01500 LOC_Os03g63430 LOC_Os03g31400 LOC_Os06g02144 LOC_Os04g46000 LOC_Os05g46570 LOC_Os03g57870 LOC_Os07g32430 LOC_Os08g12820 LOC_Os06g41750 LOC_Os10g32920 LOC_Os12g37590 LOC_Os03g18690 LOC_Os08g43540 LOC_Os09g38020 LOC_Os08g08060 LOC_Os04g23890 LOC_Os11g40140 LOC_Os09g26340 LOC_Os05g34770 LOC_Os11g03400 LOC_Os10g42950 LOC_Os07g43360 LOC_Os07g08330 LOC_Os06g46770 LOC_Os05g09490 LOC_Os07g25420 LOC_Os09g30412 LOC_Os10g40140 LOC_Os08g23110 LOC_Os07g07709 LOC_Os03g15810 LOC_Os10g27190 LOC_Os04g46450 LOC_Os03g57790 LOC_Os03g58430 LOC_Os06g43570 LOC_Os05g11980 LOC_Os12g39070 LOC_Os10g39410 LOC_Os03g53700 LOC_Os03g43020 LOC_Os05g06350 LOC_Os03g47949 LOC_Os04g43540 LOC_Os04g49420 LOC_Os07g06980 LOC_Os11g29400 LOC_Os03g26970 LOC_Os04g58580 LOC_Os03g50390 LOC_Os09g31180 LOC_Os08g05890 LOC_Os05g48320 LOC_Os03g19870 LOC_Os12g03720 LOC_Os03g62730 LOC_Os08g43640 LOC_Os05g38740 LOC_Os06g37660 LOC_Os12g03090 LOC_Os02g56960 LOC_Os01g64640 LOC_Os01g61920 LOC_Os03g03610 LOC_Os01g64090 LOC_Os02g58640 LOC_Os02g06640 LOC_Os01g04730 LOC_Os02g05330 LOC_Os03g08050 LOC_Os02g42230 LOC_Os02g54340 LOC_Os02g29464 LOC_Os02g56130 LOC_Os03g11570 LOC_Os01g70140 LOC_Os02g45940 LOC_Os01g01060 LOC_Os02g08300 LOC_Os03g02780 LOC_Os03g11440 LOC_Os02g27620 LOC_Os02g56300 LOC_Os01g60360 LOC_Os03g10990 LOC_Os02g33140 LOC_Os01g60660 LOC_Os03g04590 LOC_Os02g39890 LOC_Os02g47850 LOC_Os02g10640 LOC_Os03g08770 LOC_Os03g13970 LOC_Os01g18860 LOC_Os01g46980 LOC_Os01g24690 LOC_Os01g18320 LOC_Os01g60410 LOC_Os02g05340 LOC_Os02g35160 LOC_Os02g38300 LOC_Os02g30050 LOC_Os02g12740 LOC_Os03g08280 LOC_Os02g04100 LOC_Os02g58020 LOC_Os02g38810 LOC_Os01g70960 LOC_Os01g74000 LOC_Os01g54030 LOC_Os01g36930 LOC_Os02g48660 LOC_Os02g21970 LOC_Os02g51590 LOC_Os03g03920 LOC_Os01g59790 LOC_Os03g01810 LOC_Os02g13110 LOC_Os02g33450 LOC_Os01g01960 LOC_Os02g14860 LOC_Os01g46932 LOC_Os02g40880 LOC_Os02g52510 LOC_Os01g62840 LOC_Os01g32800 LOC_Os03g08010 LOC_Os01g56590 LOC_Os02g02510 LOC_Os02g42320 LOC_Os03g13170 LOC_Os01g59800 LOC_Os02g41590 LOC_Os03g05300 LOC_Os02g24134 LOC_Os03g08020 LOC_Os01g16190 LOC_Os03g05730 LOC_Os01g43020 LOC_Os02g11050 LOC_Os02g53060 LOC_Os02g38920 LOC_Os02g05630

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os04g54340  LOC_Os06g19730  LOC_Os11g29190  LOC_Os05g24550  LOC_Os10g39620  LOC_Os09g36710
LOC_Os10g41450  LOC_Os09g20090  LOC_Os09g37000  LOC_Os03g48930  LOC_Os09g15320  LOC_Os11g04070
LOC_Os09g20820  LOC_Os11g05562  LOC_Os07g47580  LOC_Os06g02550  LOC_Os05g13300  LOC_Os05g22940
LOC_Os03g63940  LOC_Os10g39590  LOC_Os11g04220  LOC_Os11g40150  LOC_Os04g54940  LOC_Os03g18580
LOC_Os08g13690  LOC_Os04g58110  LOC_Os05g48030  LOC_Os05g06770  LOC_Os08g33340  LOC_Os08g05490
LOC_Os04g02820  LOC_Os06g37080  LOC_Os03g58050  LOC_Os05g42424  LOC_Os05g41060  LOC_Os03g46490
LOC_Os09g06560  LOC_Os08g05840  LOC_Os12g42140  LOC_Os06g51270  LOC_Os04g33750  LOC_Os03g46390
LOC_Os06g07878  LOC_Os05g05260  LOC_Os08g44530  LOC_Os04g51630  LOC_Os06g07630  LOC_Os09g32680
LOC_Os06g06460  LOC_Os03g55110  LOC_Os04g22240  LOC_Os12g35030  LOC_Os09g11450  LOC_Os10g34670
LOC_Os10g21910  LOC_Os05g38530  LOC_Os06g10340  LOC_Os08g19830  LOC_Os06g47840  LOC_Os08g23710
LOC_Os05g23620  LOC_Os03g18570  LOC_Os06g48750  LOC_Os07g03160  LOC_Os03g31090  LOC_Os04g55410
LOC_Os03g13970  LOC_Os05g39050  LOC_Os09g08660  LOC_Os04g31390  LOC_Os07g41180  LOC_Os08g41730
LOC_Os07g30300  LOC_Os04g10400  LOC_Os04g36700  LOC_Os08g02860  LOC_Os06g38470  LOC_Os03g51550
LOC_Os06g06030  LOC_Os09g32976  LOC_Os04g53760  LOC_Os05g01020  LOC_Os06g06510  LOC_Os03g28140
LOC_Os04g39040  LOC_Os03g16860  LOC_Os09g33986  LOC_Os12g05430  LOC_Os11g42790  LOC_Os06g45710
LOC_Os07g29420  LOC_Os03g44780  LOC_Os07g08660  LOC_Os07g29360  LOC_Os06g09170  LOC_Os04g56646
LOC_Os06g30970  LOC_Os11g05730  LOC_Os04g24180  LOC_Os12g31810  LOC_Os03g38000  LOC_Os05g29760
LOC_Os04g14654  LOC_Os05g27940  LOC_Os09g39500  LOC_Os06g07978  LOC_Os07g07240  LOC_Os07g47710
LOC_Os07g36500  LOC_Os06g15360  LOC_Os07g49150  LOC_Os05g33040  LOC_Os09g21110  LOC_Os05g36280
LOC_Os04g40850  LOC_Os05g46270  LOC_Os12g30060  LOC_Os12g36950  LOC_Os04g30730  LOC_Os05g32180
LOC_Os06g08380  LOC_Os06g04280  LOC_Os05g01500  LOC_Os03g63430  LOC_Os03g31400  LOC_Os06g02144
LOC_Os04g46000  LOC_Os05g46570  LOC_Os03g57870  LOC_Os07g32430  LOC_Os08g12820  LOC_Os06g41750
LOC_Os10g32920  LOC_Os12g37590  LOC_Os03g18690  LOC_Os08g43540  LOC_Os09g38020  LOC_Os08g08060
LOC_Os04g23890  LOC_Os11g40140  LOC_Os09g26340  LOC_Os05g34770  LOC_Os11g03400  LOC_Os10g42950
LOC_Os07g43360  LOC_Os07g08330  LOC_Os06g46770  LOC_Os05g09490  LOC_Os07g25420  LOC_Os09g30412
LOC_Os10g40140  LOC_Os08g23110  LOC_Os07g07709  LOC_Os03g15810  LOC_Os10g27190  LOC_Os04g46450
LOC_Os03g57790  LOC_Os03g58430  LOC_Os06g43570  LOC_Os05g11980  LOC_Os12g39070  LOC_Os10g39410
LOC_Os03g53700  LOC_Os03g43020  LOC_Os05g06350  LOC_Os03g47949  LOC_Os04g43540  LOC_Os04g49420
LOC_Os07g06980  LOC_Os11g29400  LOC_Os03g26970  LOC_Os04g58580  LOC_Os03g50390  LOC_Os09g31180
LOC_Os08g05890  LOC_Os05g48320  LOC_Os03g19870  LOC_Os12g03720  LOC_Os03g62730  LOC_Os08g43640
LOC_Os05g38740  LOC_Os06g37660  LOC_Os12g03090  LOC_Os02g56960   LOC_Os01g64640   LOC_Os01g61920
LOC_Os03g03610   LOC_Os01g64090   LOC_Os02g58640   LOC_Os02g06640   LOC_Os01g04730   LOC_Os02g05330
LOC_Os03g08050   LOC_Os02g42230   LOC_Os02g54340   LOC_Os02g29464   LOC_Os02g56130   LOC_Os03g11570
LOC_Os01g70140   LOC_Os02g45940   LOC_Os01g01060   LOC_Os02g08300   LOC_Os03g02780   LOC_Os03g11440
LOC_Os02g27620   LOC_Os02g56300   LOC_Os01g60360   LOC_Os03g10990   LOC_Os02g33140   LOC_Os01g60660
LOC_Os03g04590   LOC_Os02g39890   LOC_Os02g47850   LOC_Os02g10640   LOC_Os03g08770   LOC_Os03g13970
LOC_Os01g18860   LOC_Os01g46980   LOC_Os01g24690   LOC_Os01g18320   LOC_Os01g60410   LOC_Os02g05340
LOC_Os02g35160   LOC_Os02g38300   LOC_Os02g30050   LOC_Os02g12740   LOC_Os03g08280   LOC_Os02g04100
LOC_Os02g58020   LOC_Os02g38810   LOC_Os01g70960   LOC_Os01g74000   LOC_Os01g54030   LOC_Os01g36930
LOC_Os02g48660   LOC_Os02g21970   LOC_Os02g51590   LOC_Os03g03920   LOC_Os01g59790   LOC_Os03g01810
LOC_Os02g13110   LOC_Os02g33450   LOC_Os01g01960   LOC_Os02g14860   LOC_Os01g46932   LOC_Os02g40880
LOC_Os02g52510   LOC_Os01g62840   LOC_Os01g32800   LOC_Os03g08010   LOC_Os01g56590   LOC_Os02g02510
LOC_Os02g42320   LOC_Os03g13170   LOC_Os01g59800   LOC_Os02g41590   LOC_Os03g05300   LOC_Os02g24134
LOC_Os03g08020   LOC_Os01g16190   LOC_Os03g05730   LOC_Os01g43020   LOC_Os02g11050   LOC_Os02g53060
LOC_Os02g38920   LOC_Os02g05630

Database Links
UniprotKB	O82143
Ensembl	LOC_Os03g13970.1 LOC_Os03g13970.2
Refseq	NP_001049527.1
EMBL	DP000009 DP000009 AB010740 AB037151 AP008209 AK073601 CM000140
KEGG	osa:4332222 dosa:Os03t0243300-01