RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os03g38000 View Network
Names	40S ribosomal protein S3, putative, expressed (Os03g0577000 protein) (Putative ribosomal protein) (cDNA clone:006-205-G04, full insert sequence) (cDNA clone:J023061B16, full insert sequence)
Function	40S ribosomal protein S3-1, putative, expressed
Attributes	Length: 229 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 25434.7 pI: 10.0533 Subcellular Location (adjusted): Cytosol
Gene Model	LOC_Os03g38000.1 LOC_Os03g38000.2

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os03g40180 LOC_Os06g07580 LOC_Os06g48355 LOC_Os09g18320 LOC_Os05g42424 LOC_Os07g46500 LOC_Os03g62730 LOC_Os06g37660 LOC_Os04g35090 LOC_Os12g31380 LOC_Os08g37780 LOC_Os07g41180 LOC_Os03g58050 LOC_Os07g42910 LOC_Os08g23110 LOC_Os07g30300 LOC_Os07g36500 LOC_Os05g51700 LOC_Os06g43790 LOC_Os11g38959 LOC_Os09g38630 LOC_Os11g38949 LOC_Os07g46760 LOC_Os07g49520 LOC_Os04g49420 LOC_Os05g38520 LOC_Os05g42300 LOC_Os06g35050 LOC_Os12g42370 LOC_Os12g13950 LOC_Os05g39050 LOC_Os05g41100 LOC_Os10g27190 LOC_Os07g08330 LOC_Os06g02510 LOC_Os04g43540 LOC_Os09g32976 LOC_Os06g36160 LOC_Os06g48350 LOC_Os07g10720 LOC_Os09g26700 LOC_Os11g11390 LOC_Os08g05490 LOC_Os08g05880 LOC_Os09g26340 LOC_Os05g27940 LOC_Os04g39700 LOC_Os07g01870 LOC_Os09g31180 LOC_Os04g56350 LOC_Os04g42270 LOC_Os12g38000 LOC_Os08g04460 LOC_Os04g28180 LOC_Os10g32920 LOC_Os04g42380 LOC_Os10g41410 LOC_Os05g38740 LOC_Os09g08430 LOC_Os04g51630 LOC_Os04g57790 LOC_Os08g09210 LOC_Os05g19370 LOC_Os12g03822 LOC_Os05g13950 LOC_Os05g26890 LOC_Os03g38000 LOC_Os09g33876 LOC_Os05g44320 LOC_Os07g07709 LOC_Os06g46770 LOC_Os07g08660 LOC_Os10g28040 LOC_Os10g08930 LOC_Os04g33750 LOC_Os08g45010 LOC_Os03g59310 LOC_Os10g07994 LOC_Os03g51140 LOC_Os05g32180 LOC_Os03g49210 LOC_Os11g06750 LOC_Os05g05470 LOC_Os12g03090 LOC_Os04g33950 LOC_Os10g32820 LOC_Os11g04070 LOC_Os06g01980 LOC_Os09g19790 LOC_Os06g41750 LOC_Os07g34740 LOC_Os11g03990 LOC_Os08g02410 LOC_Os10g31520 LOC_Os05g51500 LOC_Os11g32280 LOC_Os08g02860 LOC_Os04g52200 LOC_Os08g23710 LOC_Os08g09350 LOC_Os03g58430 LOC_Os09g38020 LOC_Os09g29630 LOC_Os07g38760 LOC_Os04g54330 LOC_Os04g20220 LOC_Os04g55700 LOC_Os12g36950 LOC_Os06g38470 LOC_Os05g18770 LOC_Os08g02400 LOC_Os07g36140 LOC_Os10g39410 LOC_Os03g40070 LOC_Os07g23169 LOC_Os10g29220 LOC_Os10g32880 LOC_Os09g27420 LOC_Os12g34510 LOC_Os11g03400 LOC_Os07g46660 LOC_Os05g32580 LOC_Os03g40110 LOC_Os07g44940 LOC_Os07g43980 LOC_Os04g52960 LOC_Os07g42950 LOC_Os11g29190 LOC_Os05g30530 LOC_Os07g14830 LOC_Os08g01100 LOC_Os03g54091 LOC_Os09g07510 LOC_Os04g50990 LOC_Os12g07300 LOC_Os02g35160 LOC_Os01g51200 LOC_Os03g21940 LOC_Os01g66520 LOC_Os02g44810 LOC_Os03g02150 LOC_Os01g10820 LOC_Os01g67250 LOC_Os03g04590 LOC_Os03g04750 LOC_Os02g06640 LOC_Os01g61920 LOC_Os01g47600 LOC_Os02g02570 LOC_Os01g68950 LOC_Os02g45940 LOC_Os01g64090 LOC_Os02g38020 LOC_Os03g05980 LOC_Os03g23950 LOC_Os03g19960 LOC_Os02g54910 LOC_Os01g09890 LOC_Os01g42530 LOC_Os03g10340 LOC_Os02g33140 LOC_Os03g19280 LOC_Os01g71230 LOC_Os01g01060 LOC_Os03g29460 LOC_Os02g07070 LOC_Os01g03144 LOC_Os02g08364 LOC_Os03g22180 LOC_Os02g13530 LOC_Os03g38000 LOC_Os02g18380 LOC_Os02g39800 LOC_Os01g42470 LOC_Os02g27760 LOC_Os01g57570 LOC_Os01g34200 LOC_Os01g62350 LOC_Os01g03070 LOC_Os02g28810 LOC_Os02g56014 LOC_Os02g30630 LOC_Os01g62230 LOC_Os02g02360 LOC_Os03g13970 LOC_Os03g37970 LOC_Os01g05970 LOC_Os03g27210 LOC_Os02g38080 LOC_Os02g06592 LOC_Os02g14059 LOC_Os03g14530 LOC_Os01g74410 LOC_Os02g50760 LOC_Os02g54700 LOC_Os03g18580 LOC_Os01g43020 LOC_Os01g67960 LOC_Os03g27290 LOC_Os02g40880 LOC_Os03g21530 LOC_Os01g02090 LOC_Os01g43030 LOC_Os01g67134 LOC_Os01g52490 LOC_Os01g06010 LOC_Os02g47140 LOC_Os02g32490 LOC_Os02g33450 LOC_Os03g02780 LOC_Os02g42690 LOC_Os03g18570 LOC_Os02g17970 LOC_Os02g56960 LOC_Os01g64690 LOC_Os01g16190 LOC_Os01g05950 LOC_Os01g04730 LOC_Os01g68940 LOC_Os01g21180 LOC_Os03g02680 LOC_Os01g51390 LOC_Os01g54870

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os03g40180  LOC_Os06g07580  LOC_Os06g48355  LOC_Os09g18320  LOC_Os05g42424  LOC_Os07g46500
LOC_Os03g62730  LOC_Os06g37660  LOC_Os04g35090  LOC_Os12g31380  LOC_Os08g37780  LOC_Os07g41180
LOC_Os03g58050  LOC_Os07g42910  LOC_Os08g23110  LOC_Os07g30300  LOC_Os07g36500  LOC_Os05g51700
LOC_Os06g43790  LOC_Os11g38959  LOC_Os09g38630  LOC_Os11g38949  LOC_Os07g46760  LOC_Os07g49520
LOC_Os04g49420  LOC_Os05g38520  LOC_Os05g42300  LOC_Os06g35050  LOC_Os12g42370  LOC_Os12g13950
LOC_Os05g39050  LOC_Os05g41100  LOC_Os10g27190  LOC_Os07g08330  LOC_Os06g02510  LOC_Os04g43540
LOC_Os09g32976  LOC_Os06g36160  LOC_Os06g48350  LOC_Os07g10720  LOC_Os09g26700  LOC_Os11g11390
LOC_Os08g05490  LOC_Os08g05880  LOC_Os09g26340  LOC_Os05g27940  LOC_Os04g39700  LOC_Os07g01870
LOC_Os09g31180  LOC_Os04g56350  LOC_Os04g42270  LOC_Os12g38000  LOC_Os08g04460  LOC_Os04g28180
LOC_Os10g32920  LOC_Os04g42380  LOC_Os10g41410  LOC_Os05g38740  LOC_Os09g08430  LOC_Os04g51630
LOC_Os04g57790  LOC_Os08g09210  LOC_Os05g19370  LOC_Os12g03822  LOC_Os05g13950  LOC_Os05g26890
LOC_Os03g38000  LOC_Os09g33876  LOC_Os05g44320  LOC_Os07g07709  LOC_Os06g46770  LOC_Os07g08660
LOC_Os10g28040  LOC_Os10g08930  LOC_Os04g33750  LOC_Os08g45010  LOC_Os03g59310  LOC_Os10g07994
LOC_Os03g51140  LOC_Os05g32180  LOC_Os03g49210  LOC_Os11g06750  LOC_Os05g05470  LOC_Os12g03090
LOC_Os04g33950  LOC_Os10g32820  LOC_Os11g04070  LOC_Os06g01980  LOC_Os09g19790  LOC_Os06g41750
LOC_Os07g34740  LOC_Os11g03990  LOC_Os08g02410  LOC_Os10g31520  LOC_Os05g51500  LOC_Os11g32280
LOC_Os08g02860  LOC_Os04g52200  LOC_Os08g23710  LOC_Os08g09350  LOC_Os03g58430  LOC_Os09g38020
LOC_Os09g29630  LOC_Os07g38760  LOC_Os04g54330  LOC_Os04g20220  LOC_Os04g55700  LOC_Os12g36950
LOC_Os06g38470  LOC_Os05g18770  LOC_Os08g02400  LOC_Os07g36140  LOC_Os10g39410  LOC_Os03g40070
LOC_Os07g23169  LOC_Os10g29220  LOC_Os10g32880  LOC_Os09g27420  LOC_Os12g34510  LOC_Os11g03400
LOC_Os07g46660  LOC_Os05g32580  LOC_Os03g40110  LOC_Os07g44940  LOC_Os07g43980  LOC_Os04g52960
LOC_Os07g42950  LOC_Os11g29190  LOC_Os05g30530  LOC_Os07g14830  LOC_Os08g01100  LOC_Os03g54091
LOC_Os09g07510  LOC_Os04g50990  LOC_Os12g07300  LOC_Os02g35160   LOC_Os01g51200   LOC_Os03g21940
LOC_Os01g66520   LOC_Os02g44810   LOC_Os03g02150   LOC_Os01g10820   LOC_Os01g67250   LOC_Os03g04590
LOC_Os03g04750   LOC_Os02g06640   LOC_Os01g61920   LOC_Os01g47600   LOC_Os02g02570   LOC_Os01g68950
LOC_Os02g45940   LOC_Os01g64090   LOC_Os02g38020   LOC_Os03g05980   LOC_Os03g23950   LOC_Os03g19960
LOC_Os02g54910   LOC_Os01g09890   LOC_Os01g42530   LOC_Os03g10340   LOC_Os02g33140   LOC_Os03g19280
LOC_Os01g71230   LOC_Os01g01060   LOC_Os03g29460   LOC_Os02g07070   LOC_Os01g03144   LOC_Os02g08364
LOC_Os03g22180   LOC_Os02g13530   LOC_Os03g38000   LOC_Os02g18380   LOC_Os02g39800   LOC_Os01g42470
LOC_Os02g27760   LOC_Os01g57570   LOC_Os01g34200   LOC_Os01g62350   LOC_Os01g03070   LOC_Os02g28810
LOC_Os02g56014   LOC_Os02g30630   LOC_Os01g62230   LOC_Os02g02360   LOC_Os03g13970   LOC_Os03g37970
LOC_Os01g05970   LOC_Os03g27210   LOC_Os02g38080   LOC_Os02g06592   LOC_Os02g14059   LOC_Os03g14530
LOC_Os01g74410   LOC_Os02g50760   LOC_Os02g54700   LOC_Os03g18580   LOC_Os01g43020   LOC_Os01g67960
LOC_Os03g27290   LOC_Os02g40880   LOC_Os03g21530   LOC_Os01g02090   LOC_Os01g43030   LOC_Os01g67134
LOC_Os01g52490   LOC_Os01g06010   LOC_Os02g47140   LOC_Os02g32490   LOC_Os02g33450   LOC_Os03g02780
LOC_Os02g42690   LOC_Os03g18570   LOC_Os02g17970   LOC_Os02g56960   LOC_Os01g64690   LOC_Os01g16190
LOC_Os01g05950   LOC_Os01g04730   LOC_Os01g68940   LOC_Os01g21180   LOC_Os03g02680   LOC_Os01g51390
LOC_Os01g54870

Database Links
UniprotKB	Q75G91
Ensembl	LOC_Os03g38000.1
Refseq	NP_001050539.1
EMBL	AC146468 DP000009 AP008209 AK061051 AK099146 CM000140
KEGG	osa:4333308 dosa:Os03t0577000-01