RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os07g42950 View Network
Names	40S ribosomal protein S6
Function	40S ribosomal protein S6, putative, expressed
Attributes	Length: 251 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 28472.2 pI: 11.3492 Subcellular Location (adjusted): Cytosol Nucleus
Gene Model	LOC_Os07g42950.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g13950 LOC_Os12g36950 LOC_Os10g32820 LOC_Os10g27190 LOC_Os09g07510 LOC_Os08g31460 LOC_Os11g38959 LOC_Os10g41410 LOC_Os10g07994 LOC_Os08g02400 LOC_Os12g38000 LOC_Os09g18320 LOC_Os08g08200 LOC_Os08g23710 LOC_Os09g07900 LOC_Os08g05880 LOC_Os08g37444 LOC_Os12g34510 LOC_Os08g31810 LOC_Os10g32550 LOC_Os09g24404 LOC_Os12g07300 LOC_Os11g38949 LOC_Os11g07930 LOC_Os10g28040 LOC_Os07g49410 LOC_Os11g32240 LOC_Os07g46660 LOC_Os07g42950 LOC_Os10g31000 LOC_Os08g41300 LOC_Os09g32976 LOC_Os07g48290 LOC_Os08g21660 LOC_Os11g29190 LOC_Os11g03400 LOC_Os11g04070 LOC_Os12g31000 LOC_Os08g02860 LOC_Os09g36440 LOC_Os11g07922 LOC_Os12g04010 LOC_Os08g15040 LOC_Os11g19250 LOC_Os09g32532 LOC_Os12g03090 LOC_Os09g31180 LOC_Os08g02410 LOC_Os08g28230 LOC_Os11g11390 LOC_Os11g06750 LOC_Os12g05430 LOC_Os09g08430 LOC_Os06g44030 LOC_Os03g23950 LOC_Os03g25450 LOC_Os07g01870 LOC_Os01g10820 LOC_Os03g05730 LOC_Os02g56014 LOC_Os02g19860 LOC_Os03g18580 LOC_Os07g41180 LOC_Os01g36930 LOC_Os01g60660 LOC_Os04g20220 LOC_Os06g48355 LOC_Os03g10340 LOC_Os03g49210 LOC_Os03g58640 LOC_Os05g32310 LOC_Os01g59730 LOC_Os03g05980 LOC_Os06g07580 LOC_Os01g11070 LOC_Os04g39700 LOC_Os01g64090 LOC_Os01g61820 LOC_Os06g05660 LOC_Os06g35814 LOC_Os03g29470 LOC_Os07g12250 LOC_Os01g43020 LOC_Os03g56830 LOC_Os07g33898 LOC_Os05g06840 LOC_Os03g23970 LOC_Os02g22780 LOC_Os03g18570 LOC_Os03g15810 LOC_Os01g05970 LOC_Os01g08850 LOC_Os05g51700 LOC_Os05g19370 LOC_Os01g62230 LOC_Os03g04750 LOC_Os06g36160 LOC_Os01g04730 LOC_Os05g42424 LOC_Os04g42270 LOC_Os04g55040 LOC_Os01g61814 LOC_Os04g48520 LOC_Os02g47140 LOC_Os05g27940 LOC_Os01g54870 LOC_Os04g50864 LOC_Os02g28810 LOC_Os01g09890 LOC_Os04g45930 LOC_Os07g16950 LOC_Os07g36140 LOC_Os06g46770 LOC_Os06g02510 LOC_Os02g13530 LOC_Os06g04280 LOC_Os07g10250 LOC_Os02g54700 LOC_Os03g49710 LOC_Os04g56480 LOC_Os02g14059 LOC_Os07g42950 LOC_Os02g06640 LOC_Os02g38200 LOC_Os07g33979 LOC_Os03g62730 LOC_Os04g04320 LOC_Os06g48350 LOC_Os02g40880 LOC_Os07g33921 LOC_Os02g30050 LOC_Os01g36920 LOC_Os03g38980 LOC_Os03g29460 LOC_Os06g36170 LOC_Os03g21620 LOC_Os01g25240 LOC_Os03g60400 LOC_Os01g16190 LOC_Os04g26841 LOC_Os05g32580 LOC_Os07g26740 LOC_Os03g52750 LOC_Os03g22180 LOC_Os03g21940 LOC_Os03g54091 LOC_Os05g38520 LOC_Os04g30730 LOC_Os04g28180 LOC_Os01g06010 LOC_Os01g52790 LOC_Os04g43540 LOC_Os03g50740 LOC_Os07g33880 LOC_Os03g40180 LOC_Os02g06480 LOC_Os04g31950 LOC_Os03g42900 LOC_Os07g33997 LOC_Os02g33140 LOC_Os02g48660 LOC_Os04g16814 LOC_Os02g12740 LOC_Os04g50990 LOC_Os04g51630 LOC_Os01g36890 LOC_Os02g05330 LOC_Os01g01060 LOC_Os02g18380 LOC_Os03g22900 LOC_Os01g59990 LOC_Os07g04240 LOC_Os01g16170 LOC_Os01g64690 LOC_Os07g08330 LOC_Os03g37970 LOC_Os02g45180 LOC_Os05g30530 LOC_Os01g67250 LOC_Os02g06500 LOC_Os03g24900 LOC_Os01g62350 LOC_Os06g51220 LOC_Os06g05400 LOC_Os05g37434 LOC_Os03g38000 LOC_Os01g34390 LOC_Os07g25016 LOC_Os01g49290 LOC_Os02g30624 LOC_Os01g16146 LOC_Os04g33750 LOC_Os01g52490 LOC_Os03g59310 LOC_Os03g02150 LOC_Os03g58430 LOC_Os04g42380 LOC_Os06g48750 LOC_Os07g08660 LOC_Os04g16776

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g13950  LOC_Os12g36950  LOC_Os10g32820  LOC_Os10g27190  LOC_Os09g07510  LOC_Os08g31460
LOC_Os11g38959  LOC_Os10g41410  LOC_Os10g07994  LOC_Os08g02400  LOC_Os12g38000  LOC_Os09g18320
LOC_Os08g08200  LOC_Os08g23710  LOC_Os09g07900  LOC_Os08g05880  LOC_Os08g37444  LOC_Os12g34510
LOC_Os08g31810  LOC_Os10g32550  LOC_Os09g24404  LOC_Os12g07300  LOC_Os11g38949  LOC_Os11g07930
LOC_Os10g28040  LOC_Os07g49410  LOC_Os11g32240  LOC_Os07g46660  LOC_Os07g42950  LOC_Os10g31000
LOC_Os08g41300  LOC_Os09g32976  LOC_Os07g48290  LOC_Os08g21660  LOC_Os11g29190  LOC_Os11g03400
LOC_Os11g04070  LOC_Os12g31000  LOC_Os08g02860  LOC_Os09g36440  LOC_Os11g07922  LOC_Os12g04010
LOC_Os08g15040  LOC_Os11g19250  LOC_Os09g32532  LOC_Os12g03090  LOC_Os09g31180  LOC_Os08g02410
LOC_Os08g28230  LOC_Os11g11390  LOC_Os11g06750  LOC_Os12g05430  LOC_Os09g08430  LOC_Os06g44030
LOC_Os03g23950   LOC_Os03g25450   LOC_Os07g01870   LOC_Os01g10820   LOC_Os03g05730   LOC_Os02g56014
LOC_Os02g19860   LOC_Os03g18580   LOC_Os07g41180   LOC_Os01g36930   LOC_Os01g60660   LOC_Os04g20220
LOC_Os06g48355   LOC_Os03g10340   LOC_Os03g49210   LOC_Os03g58640   LOC_Os05g32310   LOC_Os01g59730
LOC_Os03g05980   LOC_Os06g07580   LOC_Os01g11070   LOC_Os04g39700   LOC_Os01g64090   LOC_Os01g61820
LOC_Os06g05660   LOC_Os06g35814   LOC_Os03g29470   LOC_Os07g12250   LOC_Os01g43020   LOC_Os03g56830
LOC_Os07g33898   LOC_Os05g06840   LOC_Os03g23970   LOC_Os02g22780   LOC_Os03g18570   LOC_Os03g15810
LOC_Os01g05970   LOC_Os01g08850   LOC_Os05g51700   LOC_Os05g19370   LOC_Os01g62230   LOC_Os03g04750
LOC_Os06g36160   LOC_Os01g04730   LOC_Os05g42424   LOC_Os04g42270   LOC_Os04g55040   LOC_Os01g61814
LOC_Os04g48520   LOC_Os02g47140   LOC_Os05g27940   LOC_Os01g54870   LOC_Os04g50864   LOC_Os02g28810
LOC_Os01g09890   LOC_Os04g45930   LOC_Os07g16950   LOC_Os07g36140   LOC_Os06g46770   LOC_Os06g02510
LOC_Os02g13530   LOC_Os06g04280   LOC_Os07g10250   LOC_Os02g54700   LOC_Os03g49710   LOC_Os04g56480
LOC_Os02g14059   LOC_Os07g42950   LOC_Os02g06640   LOC_Os02g38200   LOC_Os07g33979   LOC_Os03g62730
LOC_Os04g04320   LOC_Os06g48350   LOC_Os02g40880   LOC_Os07g33921   LOC_Os02g30050   LOC_Os01g36920
LOC_Os03g38980   LOC_Os03g29460   LOC_Os06g36170   LOC_Os03g21620   LOC_Os01g25240   LOC_Os03g60400
LOC_Os01g16190   LOC_Os04g26841   LOC_Os05g32580   LOC_Os07g26740   LOC_Os03g52750   LOC_Os03g22180
LOC_Os03g21940   LOC_Os03g54091   LOC_Os05g38520   LOC_Os04g30730   LOC_Os04g28180   LOC_Os01g06010
LOC_Os01g52790   LOC_Os04g43540   LOC_Os03g50740   LOC_Os07g33880   LOC_Os03g40180   LOC_Os02g06480
LOC_Os04g31950   LOC_Os03g42900   LOC_Os07g33997   LOC_Os02g33140   LOC_Os02g48660   LOC_Os04g16814
LOC_Os02g12740   LOC_Os04g50990   LOC_Os04g51630   LOC_Os01g36890   LOC_Os02g05330   LOC_Os01g01060
LOC_Os02g18380   LOC_Os03g22900   LOC_Os01g59990   LOC_Os07g04240   LOC_Os01g16170   LOC_Os01g64690
LOC_Os07g08330   LOC_Os03g37970   LOC_Os02g45180   LOC_Os05g30530   LOC_Os01g67250   LOC_Os02g06500
LOC_Os03g24900   LOC_Os01g62350   LOC_Os06g51220   LOC_Os06g05400   LOC_Os05g37434   LOC_Os03g38000
LOC_Os01g34390   LOC_Os07g25016   LOC_Os01g49290   LOC_Os02g30624   LOC_Os01g16146   LOC_Os04g33750
LOC_Os01g52490   LOC_Os03g59310   LOC_Os03g02150   LOC_Os03g58430   LOC_Os04g42380   LOC_Os06g48750
LOC_Os07g08660   LOC_Os04g16776

Database Links
UniprotKB	Q8LH97
Ensembl	LOC_Os07g42950.1
Refseq	NP_001060313.1
EMBL	AP004380 AP008213 AK069465 CM000144
KEGG	osa:4343945 dosa:Os07t0622100-01