RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os01g60660 View Network
Names	Methionyl-tRNA synthetase-like protein (Os01g0821800 protein) (Uncharacterized protein) (cDNA clone:001-036-F11, full insert sequence) (cDNA clone:J033121G11, full insert sequence)
Function	methionyl-tRNA synthetase, putative, expressed
Attributes	Length: 410 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 43955.8 pI: 8.2271 Subcellular Location (predicted): Mitochondria
Gene Model	LOC_Os01g60660.1 LOC_Os01g60660.2

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os11g01420 LOC_Os03g42900 LOC_Os08g08080 LOC_Os10g30100 LOC_Os07g42950 LOC_Os03g42220 LOC_Os10g37490 LOC_Os05g32330 LOC_Os07g30980 LOC_Os01g60660 LOC_Os08g34970 LOC_Os06g08800 LOC_Os03g08050 LOC_Os05g05470 LOC_Os02g22780 LOC_Os03g22350 LOC_Os05g01020 LOC_Os03g53720 LOC_Os12g34860 LOC_Os08g39820 LOC_Os03g27210 LOC_Os02g05330 LOC_Os12g12860 LOC_Os02g51490 LOC_Os06g48750 LOC_Os03g36780 LOC_Os01g64690 LOC_Os03g51550 LOC_Os03g48850 LOC_Os07g44330 LOC_Os04g47240 LOC_Os03g16130 LOC_Os04g42380 LOC_Os03g09920 LOC_Os03g63730 LOC_Os07g37640 LOC_Os03g55620 LOC_Os03g53700 LOC_Os03g13970 LOC_Os03g09140 LOC_Os04g02820 LOC_Os07g37790 LOC_Os07g41180 LOC_Os02g39700 LOC_Os03g08020 LOC_Os03g02980 LOC_Os07g42180 LOC_Os07g28280 LOC_Os12g39840 LOC_Os02g38020 LOC_Os04g46450 LOC_Os12g13590 LOC_Os08g39140 LOC_Os12g06870 LOC_Os03g11120 LOC_Os02g13990 LOC_Os08g38570 LOC_Os03g08010 LOC_Os02g07040 LOC_Os04g59494 LOC_Os07g44710 LOC_Os12g44330 LOC_Os11g10100 LOC_Os03g57450 LOC_Os07g36940 LOC_Os03g25400 LOC_Os04g40840 LOC_Os05g08360 LOC_Os02g07630 LOC_Os05g13630 LOC_Os12g08740 LOC_Os12g03190 LOC_Os06g45500 LOC_Os02g38060 LOC_Os09g07900 LOC_Os07g31370 LOC_Os03g10990 LOC_Os06g47300 LOC_Os08g19830 LOC_Os04g52340 LOC_Os02g57390 LOC_Os08g37780 LOC_Os04g52130 LOC_Os02g07790 LOC_Os07g06980 LOC_Os06g31210 LOC_Os03g61560 LOC_Os06g10340 LOC_Os12g41930 LOC_Os06g36170 LOC_Os02g44810 LOC_Os09g19560 LOC_Os09g31130 LOC_Os07g46660 LOC_Os02g39350 LOC_Os01g60660 LOC_Os01g60440 LOC_Os01g59360 LOC_Os01g49290 LOC_Os01g03830 LOC_Os01g16520 LOC_Os01g56620 LOC_Os01g06020 LOC_Os01g09580

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os11g01420  LOC_Os03g42900  LOC_Os08g08080  LOC_Os10g30100  LOC_Os07g42950  LOC_Os03g42220
LOC_Os10g37490  LOC_Os05g32330  LOC_Os07g30980  LOC_Os01g60660  LOC_Os08g34970  LOC_Os06g08800
LOC_Os03g08050  LOC_Os05g05470  LOC_Os02g22780  LOC_Os03g22350  LOC_Os05g01020  LOC_Os03g53720
LOC_Os12g34860  LOC_Os08g39820  LOC_Os03g27210  LOC_Os02g05330  LOC_Os12g12860  LOC_Os02g51490
LOC_Os06g48750  LOC_Os03g36780  LOC_Os01g64690  LOC_Os03g51550  LOC_Os03g48850  LOC_Os07g44330
LOC_Os04g47240  LOC_Os03g16130  LOC_Os04g42380  LOC_Os03g09920  LOC_Os03g63730  LOC_Os07g37640
LOC_Os03g55620  LOC_Os03g53700  LOC_Os03g13970  LOC_Os03g09140  LOC_Os04g02820  LOC_Os07g37790
LOC_Os07g41180  LOC_Os02g39700  LOC_Os03g08020  LOC_Os03g02980  LOC_Os07g42180  LOC_Os07g28280
LOC_Os12g39840  LOC_Os02g38020  LOC_Os04g46450  LOC_Os12g13590  LOC_Os08g39140  LOC_Os12g06870
LOC_Os03g11120  LOC_Os02g13990  LOC_Os08g38570  LOC_Os03g08010  LOC_Os02g07040  LOC_Os04g59494
LOC_Os07g44710  LOC_Os12g44330  LOC_Os11g10100  LOC_Os03g57450  LOC_Os07g36940  LOC_Os03g25400
LOC_Os04g40840  LOC_Os05g08360  LOC_Os02g07630  LOC_Os05g13630  LOC_Os12g08740  LOC_Os12g03190
LOC_Os06g45500  LOC_Os02g38060  LOC_Os09g07900  LOC_Os07g31370  LOC_Os03g10990  LOC_Os06g47300
LOC_Os08g19830  LOC_Os04g52340  LOC_Os02g57390  LOC_Os08g37780  LOC_Os04g52130  LOC_Os02g07790
LOC_Os07g06980  LOC_Os06g31210  LOC_Os03g61560  LOC_Os06g10340  LOC_Os12g41930  LOC_Os06g36170
LOC_Os02g44810  LOC_Os09g19560  LOC_Os09g31130  LOC_Os07g46660  LOC_Os02g39350  LOC_Os01g60660
LOC_Os01g60440   LOC_Os01g59360   LOC_Os01g49290   LOC_Os01g03830   LOC_Os01g16520   LOC_Os01g56620
LOC_Os01g06020   LOC_Os01g09580

Database Links
UniprotKB	Q8RUP8
Ensembl	LOC_Os01g60660.1
Refseq	NP_001044650.1
EMBL	AP003302 AP003348 AP008207 AK103171 AK119168 CM000138
KEGG	osa:4327613 dosa:Os01t0821800-01