RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os02g13990 View Network
Names	Os02g0234800 protein (Putative U2 snRNP protein A') (cDNA clone:J023062O22, full insert sequence)
Function	U2 small nuclear ribonucleoprotein A, putative, expressed
Attributes	Length: 285 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 31999.3 pI: 4.7854 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os02g13990.1 LOC_Os02g13990.2 LOC_Os02g13990.3

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os02g28810 LOC_Os05g07050 LOC_Os03g13760 LOC_Os02g14780 LOC_Os02g14860 LOC_Os03g52970 LOC_Os03g23909 LOC_Os04g41490 LOC_Os02g39050 LOC_Os03g08300 LOC_Os09g33980 LOC_Os03g61810 LOC_Os04g54330 LOC_Os12g38000 LOC_Os11g48030 LOC_Os07g38420 LOC_Os04g37690 LOC_Os06g04270 LOC_Os04g46890 LOC_Os05g30530 LOC_Os04g46450 LOC_Os11g40510 LOC_Os08g18110 LOC_Os02g57150 LOC_Os07g10256 LOC_Os08g05840 LOC_Os02g39300 LOC_Os10g34380 LOC_Os03g26440 LOC_Os02g39890 LOC_Os08g23110 LOC_Os11g45250 LOC_Os04g33750 LOC_Os06g48750 LOC_Os02g56014 LOC_Os05g22260 LOC_Os03g53190 LOC_Os10g35550 LOC_Os12g03090 LOC_Os08g08080 LOC_Os02g58090 LOC_Os04g45930 LOC_Os05g01440 LOC_Os03g21990 LOC_Os07g19494 LOC_Os04g41910 LOC_Os05g38810 LOC_Os03g22880 LOC_Os02g30730 LOC_Os08g01840 LOC_Os03g22570 LOC_Os03g61640 LOC_Os02g57040 LOC_Os08g37780 LOC_Os05g38710 LOC_Os03g50090 LOC_Os04g28180 LOC_Os08g08040 LOC_Os10g02630 LOC_Os07g10600 LOC_Os12g08280 LOC_Os07g33330 LOC_Os10g28040 LOC_Os03g29740 LOC_Os07g04850 LOC_Os05g13630 LOC_Os10g32880 LOC_Os07g10250 LOC_Os07g49520 LOC_Os07g07220 LOC_Os10g34520 LOC_Os12g35030 LOC_Os04g17064 LOC_Os06g09330 LOC_Os03g18720 LOC_Os06g30970 LOC_Os06g08800 LOC_Os09g21760 LOC_Os09g10850 LOC_Os04g20220 LOC_Os02g13990 LOC_Os06g02570 LOC_Os08g05490 LOC_Os03g61110 LOC_Os07g37650 LOC_Os02g37430 LOC_Os05g44350 LOC_Os07g06980 LOC_Os04g28090 LOC_Os03g25260 LOC_Os02g54070 LOC_Os10g31900 LOC_Os03g23970 LOC_Os09g04210 LOC_Os12g07050 LOC_Os03g15700 LOC_Os03g53960 LOC_Os03g44900 LOC_Os02g45180 LOC_Os08g34720 LOC_Os11g43620 LOC_Os06g21390 LOC_Os09g02700 LOC_Os06g04580 LOC_Os02g49360 LOC_Os03g56800 LOC_Os04g04320 LOC_Os05g24970 LOC_Os03g50850 LOC_Os05g06760 LOC_Os11g03400 LOC_Os02g30624 LOC_Os04g31950 LOC_Os02g33140 LOC_Os03g19960 LOC_Os02g52250 LOC_Os07g44970 LOC_Os12g42140 LOC_Os01g16190 LOC_Os02g11830 LOC_Os01g56620 LOC_Os01g40610 LOC_Os02g04480 LOC_Os01g54580 LOC_Os02g01250 LOC_Os01g69210 LOC_Os02g10060 LOC_Os02g01740 LOC_Os01g09890 LOC_Os02g05330 LOC_Os01g43030 LOC_Os01g60660 LOC_Os02g05310 LOC_Os02g03440 LOC_Os02g13990 LOC_Os01g61930 LOC_Os01g60410 LOC_Os01g64690 LOC_Os01g49330 LOC_Os01g13430 LOC_Os01g01120 LOC_Os01g60360

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os02g28810  LOC_Os05g07050  LOC_Os03g13760  LOC_Os02g14780  LOC_Os02g14860  LOC_Os03g52970
LOC_Os03g23909  LOC_Os04g41490  LOC_Os02g39050  LOC_Os03g08300  LOC_Os09g33980  LOC_Os03g61810
LOC_Os04g54330  LOC_Os12g38000  LOC_Os11g48030  LOC_Os07g38420  LOC_Os04g37690  LOC_Os06g04270
LOC_Os04g46890  LOC_Os05g30530  LOC_Os04g46450  LOC_Os11g40510  LOC_Os08g18110  LOC_Os02g57150
LOC_Os07g10256  LOC_Os08g05840  LOC_Os02g39300  LOC_Os10g34380  LOC_Os03g26440  LOC_Os02g39890
LOC_Os08g23110  LOC_Os11g45250  LOC_Os04g33750  LOC_Os06g48750  LOC_Os02g56014  LOC_Os05g22260
LOC_Os03g53190  LOC_Os10g35550  LOC_Os12g03090  LOC_Os08g08080  LOC_Os02g58090  LOC_Os04g45930
LOC_Os05g01440  LOC_Os03g21990  LOC_Os07g19494  LOC_Os04g41910  LOC_Os05g38810  LOC_Os03g22880
LOC_Os02g30730  LOC_Os08g01840  LOC_Os03g22570  LOC_Os03g61640  LOC_Os02g57040  LOC_Os08g37780
LOC_Os05g38710  LOC_Os03g50090  LOC_Os04g28180  LOC_Os08g08040  LOC_Os10g02630  LOC_Os07g10600
LOC_Os12g08280  LOC_Os07g33330  LOC_Os10g28040  LOC_Os03g29740  LOC_Os07g04850  LOC_Os05g13630
LOC_Os10g32880  LOC_Os07g10250  LOC_Os07g49520  LOC_Os07g07220  LOC_Os10g34520  LOC_Os12g35030
LOC_Os04g17064  LOC_Os06g09330  LOC_Os03g18720  LOC_Os06g30970  LOC_Os06g08800  LOC_Os09g21760
LOC_Os09g10850  LOC_Os04g20220  LOC_Os02g13990  LOC_Os06g02570  LOC_Os08g05490  LOC_Os03g61110
LOC_Os07g37650  LOC_Os02g37430  LOC_Os05g44350  LOC_Os07g06980  LOC_Os04g28090  LOC_Os03g25260
LOC_Os02g54070  LOC_Os10g31900  LOC_Os03g23970  LOC_Os09g04210  LOC_Os12g07050  LOC_Os03g15700
LOC_Os03g53960  LOC_Os03g44900  LOC_Os02g45180  LOC_Os08g34720  LOC_Os11g43620  LOC_Os06g21390
LOC_Os09g02700  LOC_Os06g04580  LOC_Os02g49360  LOC_Os03g56800  LOC_Os04g04320  LOC_Os05g24970
LOC_Os03g50850  LOC_Os05g06760  LOC_Os11g03400  LOC_Os02g30624  LOC_Os04g31950  LOC_Os02g33140
LOC_Os03g19960  LOC_Os02g52250  LOC_Os07g44970  LOC_Os12g42140  LOC_Os01g16190   LOC_Os02g11830
LOC_Os01g56620   LOC_Os01g40610   LOC_Os02g04480   LOC_Os01g54580   LOC_Os02g01250   LOC_Os01g69210
LOC_Os02g10060   LOC_Os02g01740   LOC_Os01g09890   LOC_Os02g05330   LOC_Os01g43030   LOC_Os01g60660
LOC_Os02g05310   LOC_Os02g03440   LOC_Os02g13990   LOC_Os01g61930   LOC_Os01g60410   LOC_Os01g64690
LOC_Os01g49330   LOC_Os01g13430   LOC_Os01g01120   LOC_Os01g60360

Database Links
UniprotKB	Q6EUK2
Ensembl	LOC_Os02g13990.1
Refseq	NP_001046383.1
EMBL	AP004030 AP008208 AK070679 CM000139
KEGG	osa:4328823 dosa:Os02t0234800-01