RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os11g40510 View Network
Names	Os11g0620100 protein (RNA recognition motif family protein, expressed) (cDNA clone:J013098D14, full insert sequence)
Function	OsSigP7 - Putative Type I Signal Peptidase homologue; employs a putative Ser/Lys catalytic dyad, expressed
Attributes	Length: 442 Status: Complete Existence: Evidence at transcript level Molecular Weight: 47561.3 pI: 7.3565 Subcellular Location (predicted): Mitochondria Chloroplast
Gene Model	LOC_Os11g40510.1 LOC_Os11g40510.2

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os11g48090 LOC_Os12g21700 LOC_Os11g40510 LOC_Os12g31000 LOC_Os06g36160 LOC_Os08g05850 LOC_Os08g44770 LOC_Os08g40880 LOC_Os10g34670 LOC_Os03g59050 LOC_Os10g21910 LOC_Os07g10250 LOC_Os09g02700 LOC_Os06g07878 LOC_Os10g27174 LOC_Os04g53440 LOC_Os06g07978 LOC_Os04g42380 LOC_Os04g28180 LOC_Os02g01250 LOC_Os04g16776 LOC_Os11g37080 LOC_Os03g48930 LOC_Os06g06460 LOC_Os02g39700 LOC_Os04g45930 LOC_Os03g08050 LOC_Os02g13990 LOC_Os02g30800 LOC_Os05g37330 LOC_Os02g39890 LOC_Os03g50885 LOC_Os03g13760 LOC_Os11g19100 LOC_Os07g37790 LOC_Os04g16814 LOC_Os07g25016 LOC_Os11g40510 LOC_Os02g57390 LOC_Os03g46770 LOC_Os04g02000 LOC_Os01g56940 LOC_Os05g11850 LOC_Os04g52340 LOC_Os04g39040 LOC_Os08g39880 LOC_Os04g25360 LOC_Os04g54940 LOC_Os08g42600 LOC_Os03g08020 LOC_Os04g37690 LOC_Os01g32750 LOC_Os02g42860 LOC_Os05g30940 LOC_Os01g54010 LOC_Os02g27760 LOC_Os04g38610 LOC_Os03g05980 LOC_Os07g33340 LOC_Os03g08010 LOC_Os05g05230 LOC_Os03g18160 LOC_Os05g07050 LOC_Os02g51780 LOC_Os06g48750 LOC_Os07g31340 LOC_Os07g36940 LOC_Os03g56930 LOC_Os06g06510 LOC_Os01g15310 LOC_Os01g52490 LOC_Os11g01420 LOC_Os03g22570 LOC_Os05g30530 LOC_Os04g42010 LOC_Os01g64640 LOC_Os03g42900 LOC_Os09g24404 LOC_Os02g52140 LOC_Os05g01990 LOC_Os02g05330 LOC_Os10g39820 LOC_Os08g37350 LOC_Os03g53700 LOC_Os01g61930 LOC_Os03g18080 LOC_Os02g28810 LOC_Os11g20384 LOC_Os11g05730 LOC_Os02g13530 LOC_Os03g50890 LOC_Os02g10230 LOC_Os07g10350 LOC_Os02g10060 LOC_Os04g02820 LOC_Os04g59494 LOC_Os05g36280 LOC_Os02g13130 LOC_Os07g10720 LOC_Os07g43360 LOC_Os01g33040

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os11g48090  LOC_Os12g21700  LOC_Os11g40510  LOC_Os12g31000  LOC_Os06g36160   LOC_Os08g05850
LOC_Os08g44770   LOC_Os08g40880   LOC_Os10g34670   LOC_Os03g59050   LOC_Os10g21910   LOC_Os07g10250
LOC_Os09g02700   LOC_Os06g07878   LOC_Os10g27174   LOC_Os04g53440   LOC_Os06g07978   LOC_Os04g42380
LOC_Os04g28180   LOC_Os02g01250   LOC_Os04g16776   LOC_Os11g37080   LOC_Os03g48930   LOC_Os06g06460
LOC_Os02g39700   LOC_Os04g45930   LOC_Os03g08050   LOC_Os02g13990   LOC_Os02g30800   LOC_Os05g37330
LOC_Os02g39890   LOC_Os03g50885   LOC_Os03g13760   LOC_Os11g19100   LOC_Os07g37790   LOC_Os04g16814
LOC_Os07g25016   LOC_Os11g40510   LOC_Os02g57390   LOC_Os03g46770   LOC_Os04g02000   LOC_Os01g56940
LOC_Os05g11850   LOC_Os04g52340   LOC_Os04g39040   LOC_Os08g39880   LOC_Os04g25360   LOC_Os04g54940
LOC_Os08g42600   LOC_Os03g08020   LOC_Os04g37690   LOC_Os01g32750   LOC_Os02g42860   LOC_Os05g30940
LOC_Os01g54010   LOC_Os02g27760   LOC_Os04g38610   LOC_Os03g05980   LOC_Os07g33340   LOC_Os03g08010
LOC_Os05g05230   LOC_Os03g18160   LOC_Os05g07050   LOC_Os02g51780   LOC_Os06g48750   LOC_Os07g31340
LOC_Os07g36940   LOC_Os03g56930   LOC_Os06g06510   LOC_Os01g15310   LOC_Os01g52490   LOC_Os11g01420
LOC_Os03g22570   LOC_Os05g30530   LOC_Os04g42010   LOC_Os01g64640   LOC_Os03g42900   LOC_Os09g24404
LOC_Os02g52140   LOC_Os05g01990   LOC_Os02g05330   LOC_Os10g39820   LOC_Os08g37350   LOC_Os03g53700
LOC_Os01g61930   LOC_Os03g18080   LOC_Os02g28810   LOC_Os11g20384   LOC_Os11g05730   LOC_Os02g13530
LOC_Os03g50890   LOC_Os02g10230   LOC_Os07g10350   LOC_Os02g10060   LOC_Os04g02820   LOC_Os04g59494
LOC_Os05g36280   LOC_Os02g13130   LOC_Os07g10720   LOC_Os07g43360   LOC_Os01g33040

Database Links
UniprotKB	Q2R134
Ensembl	LOC_Os11g40510.1
Refseq	NP_001068292.1
EMBL	DP000010 AP008217 AK120437 CM000148
KEGG	osa:4350940 dosa:Os11t0620100-01