RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os04g31950 View Network
Names	Os04g0388900 protein (cDNA clone:001-112-E09, full insert sequence)
Function	LSM domain containing protein, expressed
Attributes	Length: 98 Status: Complete Existence: Predicted Molecular Weight: 10238.5 pI: 9.0238 Subcellular Location (adjusted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os04g31950.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os05g05780 LOC_Os07g10256 LOC_Os08g31460 LOC_Os04g40840 LOC_Os07g07220 LOC_Os04g41490 LOC_Os07g08330 LOC_Os06g47840 LOC_Os07g31370 LOC_Os09g39420 LOC_Os12g06910 LOC_Os11g01450 LOC_Os07g30980 LOC_Os09g38020 LOC_Os04g49420 LOC_Os05g51650 LOC_Os04g36810 LOC_Os04g31950 LOC_Os04g40940 LOC_Os10g35550 LOC_Os12g07730 LOC_Os07g44940 LOC_Os07g43060 LOC_Os05g07050 LOC_Os06g51270 LOC_Os11g14220 LOC_Os07g46540 LOC_Os06g45710 LOC_Os05g24970 LOC_Os11g06890 LOC_Os05g06330 LOC_Os12g04290 LOC_Os07g36500 LOC_Os06g09850 LOC_Os10g39820 LOC_Os04g44890 LOC_Os08g09690 LOC_Os07g42450 LOC_Os07g41180 LOC_Os10g30100 LOC_Os07g46660 LOC_Os05g46270 LOC_Os09g06560 LOC_Os05g39050 LOC_Os10g40780 LOC_Os05g14550 LOC_Os04g32330 LOC_Os06g02570 LOC_Os08g38570 LOC_Os06g47300 LOC_Os07g03160 LOC_Os10g34520 LOC_Os05g22260 LOC_Os06g02510 LOC_Os06g44030 LOC_Os05g38710 LOC_Os09g32680 LOC_Os05g33390 LOC_Os09g33980 LOC_Os10g07270 LOC_Os06g30970 LOC_Os04g54330 LOC_Os05g05260 LOC_Os04g46890 LOC_Os11g03430 LOC_Os05g38740 LOC_Os04g51630 LOC_Os08g08200 LOC_Os06g07978 LOC_Os09g07500 LOC_Os07g42950 LOC_Os06g08380 LOC_Os10g39410 LOC_Os06g07878 LOC_Os04g54940 LOC_Os08g08040 LOC_Os10g32880 LOC_Os05g13630 LOC_Os05g48030 LOC_Os08g05850 LOC_Os04g47590 LOC_Os04g54340 LOC_Os09g26340 LOC_Os10g42950 LOC_Os08g05840 LOC_Os07g43360 LOC_Os05g32310 LOC_Os06g45640 LOC_Os05g03100 LOC_Os07g22220 LOC_Os10g41520 LOC_Os08g02130 LOC_Os11g40150 LOC_Os04g04320 LOC_Os03g26440 LOC_Os02g04480 LOC_Os03g05300 LOC_Os03g60130 LOC_Os01g05970 LOC_Os03g04950 LOC_Os03g37970 LOC_Os02g45940 LOC_Os03g56820 LOC_Os03g02260 LOC_Os02g01740 LOC_Os03g61640 LOC_Os01g62230 LOC_Os02g01250 LOC_Os03g22350 LOC_Os02g56130 LOC_Os03g53700 LOC_Os01g60360 LOC_Os02g40450 LOC_Os02g06500 LOC_Os01g56550 LOC_Os03g17310 LOC_Os04g31950 LOC_Os02g53420 LOC_Os01g16190 LOC_Os02g50620 LOC_Os02g42230 LOC_Os03g58640 LOC_Os03g01770 LOC_Os02g39700 LOC_Os03g51550 LOC_Os03g02780 LOC_Os02g26660 LOC_Os02g30730 LOC_Os03g23970 LOC_Os01g23630 LOC_Os03g13760 LOC_Os03g13850 LOC_Os03g07080 LOC_Os01g58240 LOC_Os01g15310 LOC_Os03g08440 LOC_Os03g23909 LOC_Os03g25260 LOC_Os01g43030 LOC_Os01g64690 LOC_Os02g07750 LOC_Os01g61920 LOC_Os01g08200 LOC_Os02g55300 LOC_Os01g06010 LOC_Os02g30624 LOC_Os03g43890 LOC_Os01g69110 LOC_Os01g60410 LOC_Os01g42950 LOC_Os02g43920 LOC_Os04g31320 LOC_Os02g34510 LOC_Os03g01216 LOC_Os01g36930 LOC_Os01g62840 LOC_Os03g57760 LOC_Os02g29464 LOC_Os03g16110 LOC_Os01g56320 LOC_Os03g04980 LOC_Os02g42860 LOC_Os03g50090 LOC_Os03g15810 LOC_Os02g52510 LOC_Os04g22240 LOC_Os03g53190 LOC_Os02g14000 LOC_Os03g62730 LOC_Os01g73310 LOC_Os03g09140 LOC_Os02g52940 LOC_Os02g13990

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os05g05780  LOC_Os07g10256  LOC_Os08g31460  LOC_Os04g40840  LOC_Os07g07220  LOC_Os04g41490
LOC_Os07g08330  LOC_Os06g47840  LOC_Os07g31370  LOC_Os09g39420  LOC_Os12g06910  LOC_Os11g01450
LOC_Os07g30980  LOC_Os09g38020  LOC_Os04g49420  LOC_Os05g51650  LOC_Os04g36810  LOC_Os04g31950
LOC_Os04g40940  LOC_Os10g35550  LOC_Os12g07730  LOC_Os07g44940  LOC_Os07g43060  LOC_Os05g07050
LOC_Os06g51270  LOC_Os11g14220  LOC_Os07g46540  LOC_Os06g45710  LOC_Os05g24970  LOC_Os11g06890
LOC_Os05g06330  LOC_Os12g04290  LOC_Os07g36500  LOC_Os06g09850  LOC_Os10g39820  LOC_Os04g44890
LOC_Os08g09690  LOC_Os07g42450  LOC_Os07g41180  LOC_Os10g30100  LOC_Os07g46660  LOC_Os05g46270
LOC_Os09g06560  LOC_Os05g39050  LOC_Os10g40780  LOC_Os05g14550  LOC_Os04g32330  LOC_Os06g02570
LOC_Os08g38570  LOC_Os06g47300  LOC_Os07g03160  LOC_Os10g34520  LOC_Os05g22260  LOC_Os06g02510
LOC_Os06g44030  LOC_Os05g38710  LOC_Os09g32680  LOC_Os05g33390  LOC_Os09g33980  LOC_Os10g07270
LOC_Os06g30970  LOC_Os04g54330  LOC_Os05g05260  LOC_Os04g46890  LOC_Os11g03430  LOC_Os05g38740
LOC_Os04g51630  LOC_Os08g08200  LOC_Os06g07978  LOC_Os09g07500  LOC_Os07g42950  LOC_Os06g08380
LOC_Os10g39410  LOC_Os06g07878  LOC_Os04g54940  LOC_Os08g08040  LOC_Os10g32880  LOC_Os05g13630
LOC_Os05g48030  LOC_Os08g05850  LOC_Os04g47590  LOC_Os04g54340  LOC_Os09g26340  LOC_Os10g42950
LOC_Os08g05840  LOC_Os07g43360  LOC_Os05g32310  LOC_Os06g45640  LOC_Os05g03100  LOC_Os07g22220
LOC_Os10g41520  LOC_Os08g02130  LOC_Os11g40150  LOC_Os04g04320   LOC_Os03g26440   LOC_Os02g04480
LOC_Os03g05300   LOC_Os03g60130   LOC_Os01g05970   LOC_Os03g04950   LOC_Os03g37970   LOC_Os02g45940
LOC_Os03g56820   LOC_Os03g02260   LOC_Os02g01740   LOC_Os03g61640   LOC_Os01g62230   LOC_Os02g01250
LOC_Os03g22350   LOC_Os02g56130   LOC_Os03g53700   LOC_Os01g60360   LOC_Os02g40450   LOC_Os02g06500
LOC_Os01g56550   LOC_Os03g17310   LOC_Os04g31950   LOC_Os02g53420   LOC_Os01g16190   LOC_Os02g50620
LOC_Os02g42230   LOC_Os03g58640   LOC_Os03g01770   LOC_Os02g39700   LOC_Os03g51550   LOC_Os03g02780
LOC_Os02g26660   LOC_Os02g30730   LOC_Os03g23970   LOC_Os01g23630   LOC_Os03g13760   LOC_Os03g13850
LOC_Os03g07080   LOC_Os01g58240   LOC_Os01g15310   LOC_Os03g08440   LOC_Os03g23909   LOC_Os03g25260
LOC_Os01g43030   LOC_Os01g64690   LOC_Os02g07750   LOC_Os01g61920   LOC_Os01g08200   LOC_Os02g55300
LOC_Os01g06010   LOC_Os02g30624   LOC_Os03g43890   LOC_Os01g69110   LOC_Os01g60410   LOC_Os01g42950
LOC_Os02g43920   LOC_Os04g31320   LOC_Os02g34510   LOC_Os03g01216   LOC_Os01g36930   LOC_Os01g62840
LOC_Os03g57760   LOC_Os02g29464   LOC_Os03g16110   LOC_Os01g56320   LOC_Os03g04980   LOC_Os02g42860
LOC_Os03g50090   LOC_Os03g15810   LOC_Os02g52510   LOC_Os04g22240   LOC_Os03g53190   LOC_Os02g14000
LOC_Os03g62730   LOC_Os01g73310   LOC_Os03g09140   LOC_Os02g52940   LOC_Os02g13990

Database Links
UniprotKB	Q0JDN9
Ensembl	LOC_Os04g31950.1
Refseq	NP_001052634.1
EMBL	AP008210 AK063224 CM000141
KEGG	osa:4335668 dosa:Os04t0388900-01