RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os10g40780 View Network
Names	Putative transcription regulatory protein (Transcriptional regulator, putative, expressed)
Function	CCR4-Not complex component, Not1domain containing protein, expressed
Attributes	Length: 2407 Status: Complete Existence: Predicted Molecular Weight: 266964 pI: 5.8131 Subcellular Location (adjusted): Cytosol Plasma membrane
Gene Model	LOC_Os10g40780.1 LOC_Os10g40780.3

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g39070 LOC_Os10g40780 LOC_Os10g42190 LOC_Os11g34840 LOC_Os10g42950 LOC_Os12g42140 LOC_Os12g31000 LOC_Os12g01190 LOC_Os07g02780 LOC_Os01g40470 LOC_Os02g30624 LOC_Os08g36774 LOC_Os03g07080 LOC_Os02g47870 LOC_Os01g63940 LOC_Os03g50350 LOC_Os02g06640 LOC_Os07g46660 LOC_Os04g36810 LOC_Os02g47410 LOC_Os06g47300 LOC_Os10g40780 LOC_Os06g08770 LOC_Os09g26180 LOC_Os03g52594 LOC_Os07g08170 LOC_Os05g22670 LOC_Os02g42860 LOC_Os03g08020 LOC_Os01g62244 LOC_Os01g38970 LOC_Os04g52340 LOC_Os01g01700 LOC_Os01g48810 LOC_Os03g08050 LOC_Os03g46650 LOC_Os04g31950 LOC_Os05g42424 LOC_Os06g43790 LOC_Os02g21460 LOC_Os03g08010 LOC_Os07g37790 LOC_Os03g63400 LOC_Os02g11830 LOC_Os04g55360 LOC_Os01g15310 LOC_Os03g53650 LOC_Os04g51370 LOC_Os01g32750 LOC_Os08g12820 LOC_Os07g41180 LOC_Os02g55300 LOC_Os08g05850 LOC_Os06g07210 LOC_Os06g14620 LOC_Os02g17700 LOC_Os09g32680 LOC_Os03g44900 LOC_Os01g64690 LOC_Os02g07750 LOC_Os06g37180 LOC_Os10g07994 LOC_Os03g12290 LOC_Os01g51170 LOC_Os02g54120 LOC_Os06g46770 LOC_Os10g15390 LOC_Os04g35060 LOC_Os10g22450 LOC_Os02g11050 LOC_Os02g53230 LOC_Os02g52940

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g39070  LOC_Os10g40780  LOC_Os10g42190  LOC_Os11g34840  LOC_Os10g42950  LOC_Os12g42140
LOC_Os12g31000  LOC_Os12g01190  LOC_Os07g02780   LOC_Os01g40470   LOC_Os02g30624   LOC_Os08g36774
LOC_Os03g07080   LOC_Os02g47870   LOC_Os01g63940   LOC_Os03g50350   LOC_Os02g06640   LOC_Os07g46660
LOC_Os04g36810   LOC_Os02g47410   LOC_Os06g47300   LOC_Os10g40780   LOC_Os06g08770   LOC_Os09g26180
LOC_Os03g52594   LOC_Os07g08170   LOC_Os05g22670   LOC_Os02g42860   LOC_Os03g08020   LOC_Os01g62244
LOC_Os01g38970   LOC_Os04g52340   LOC_Os01g01700   LOC_Os01g48810   LOC_Os03g08050   LOC_Os03g46650
LOC_Os04g31950   LOC_Os05g42424   LOC_Os06g43790   LOC_Os02g21460   LOC_Os03g08010   LOC_Os07g37790
LOC_Os03g63400   LOC_Os02g11830   LOC_Os04g55360   LOC_Os01g15310   LOC_Os03g53650   LOC_Os04g51370
LOC_Os01g32750   LOC_Os08g12820   LOC_Os07g41180   LOC_Os02g55300   LOC_Os08g05850   LOC_Os06g07210
LOC_Os06g14620   LOC_Os02g17700   LOC_Os09g32680   LOC_Os03g44900   LOC_Os01g64690   LOC_Os02g07750
LOC_Os06g37180   LOC_Os10g07994   LOC_Os03g12290   LOC_Os01g51170   LOC_Os02g54120   LOC_Os06g46770
LOC_Os10g15390   LOC_Os04g35060   LOC_Os10g22450   LOC_Os02g11050   LOC_Os02g53230   LOC_Os02g52940

Database Links
UniprotKB	Q94LQ9
EMBL	AC069300 DP000086
KEGG	osa:9272729 osa:9268359 osa:9271006 dosa:Os10t0556600-00 dosa:Os10t0556700-00