RiceNetDB

RiceNetDB is currently the most comprehensive regulatory database on Oryza Sativa based on genome annotation. It was displayed in three levels: GEM, PPIs and GRNs to facilitate biomolecular regulatory analysis and gene-metabolite mapping.

General Information
Protein ID	LOC_Os02g53230 View Network
Names	Os02g0772000 protein
Function	transcription elongation factor SPT5 homolog 1, putative, expressed
Attributes	Length: 1028 Status: Complete Existence: Predicted Molecular Weight: 112620 pI: 5.1631 Subcellular Location (predicted): Nucleus
Gene Model	LOC_Os02g53230.1

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )
LOC_Os12g30020 LOC_Os11g01420 LOC_Os07g34740 LOC_Os05g08970 LOC_Os03g45920 LOC_Os04g25550 LOC_Os12g38970 LOC_Os12g37370 LOC_Os07g07610 LOC_Os10g10434 LOC_Os06g08480 LOC_Os03g52750 LOC_Os11g34350 LOC_Os05g32430 LOC_Os12g06490 LOC_Os03g01230 LOC_Os06g48230 LOC_Os07g13280 LOC_Os04g02820 LOC_Os09g36440 LOC_Os06g06460 LOC_Os03g08020 LOC_Os06g06510 LOC_Os09g19560 LOC_Os05g05860 LOC_Os05g08360 LOC_Os03g60130 LOC_Os09g26340 LOC_Os07g30300 LOC_Os07g49270 LOC_Os09g02284 LOC_Os05g41510 LOC_Os05g43280 LOC_Os03g08010 LOC_Os12g43370 LOC_Os03g51900 LOC_Os11g07500 LOC_Os04g45930 LOC_Os11g05730 LOC_Os03g51600 LOC_Os12g03720 LOC_Os11g19250 LOC_Os06g48355 LOC_Os05g36280 LOC_Os06g21470 LOC_Os07g29360 LOC_Os03g61560 LOC_Os04g43922 LOC_Os10g35290 LOC_Os03g02780 LOC_Os04g58110 LOC_Os07g02350 LOC_Os06g48350 LOC_Os05g38740 LOC_Os06g48310 LOC_Os06g36770 LOC_Os08g32090 LOC_Os05g39050 LOC_Os11g36390 LOC_Os05g32600 LOC_Os07g43060 LOC_Os03g08050 LOC_Os06g09570 LOC_Os09g02700 LOC_Os06g51220 LOC_Os09g38020 LOC_Os03g40110 LOC_Os03g46770 LOC_Os04g56800 LOC_Os09g37860 LOC_Os08g08200 LOC_Os09g07900 LOC_Os05g33240 LOC_Os10g35190 LOC_Os12g42140 LOC_Os03g26630 LOC_Os10g42950 LOC_Os07g45360 LOC_Os03g44484 LOC_Os07g27930 LOC_Os04g56350 LOC_Os12g07300 LOC_Os03g32526 LOC_Os10g10990 LOC_Os10g41450 LOC_Os07g07040 LOC_Os03g49210 LOC_Os03g25450 LOC_Os03g50510 LOC_Os07g36500 LOC_Os11g04950 LOC_Os03g18410 LOC_Os10g39410 LOC_Os03g02420 LOC_Os04g49420 LOC_Os07g10350 LOC_Os07g41180 LOC_Os11g11070 LOC_Os07g46660 LOC_Os03g56800 LOC_Os10g41520 LOC_Os05g19970 LOC_Os09g39590 LOC_Os06g37180 LOC_Os09g10930 LOC_Os03g07080 LOC_Os12g38000 LOC_Os03g56944 LOC_Os07g37640 LOC_Os03g55270 LOC_Os12g38380 LOC_Os07g20580 LOC_Os07g33340 LOC_Os05g32580 LOC_Os10g40780 LOC_Os12g35030 LOC_Os02g04660 LOC_Os01g09890 LOC_Os01g62410 LOC_Os01g05420 LOC_Os01g68940 LOC_Os02g45940 LOC_Os01g61920 LOC_Os02g02510 LOC_Os02g39030 LOC_Os01g68950 LOC_Os01g72790 LOC_Os01g01312 LOC_Os02g04160 LOC_Os01g34614 LOC_Os01g32750 LOC_Os01g56550 LOC_Os01g23590 LOC_Os01g74610 LOC_Os02g49270 LOC_Os01g56980 LOC_Os01g64820 LOC_Os02g39350 LOC_Os02g30800 LOC_Os01g16190 LOC_Os02g04050 LOC_Os01g59140 LOC_Os01g62840 LOC_Os01g64640 LOC_Os01g67740 LOC_Os02g34950

Protein-Protein Interaction ( Show in Viewer )

LOC_Os12g30020  LOC_Os11g01420  LOC_Os07g34740  LOC_Os05g08970  LOC_Os03g45920  LOC_Os04g25550
LOC_Os12g38970  LOC_Os12g37370  LOC_Os07g07610  LOC_Os10g10434  LOC_Os06g08480  LOC_Os03g52750
LOC_Os11g34350  LOC_Os05g32430  LOC_Os12g06490  LOC_Os03g01230  LOC_Os06g48230  LOC_Os07g13280
LOC_Os04g02820  LOC_Os09g36440  LOC_Os06g06460  LOC_Os03g08020  LOC_Os06g06510  LOC_Os09g19560
LOC_Os05g05860  LOC_Os05g08360  LOC_Os03g60130  LOC_Os09g26340  LOC_Os07g30300  LOC_Os07g49270
LOC_Os09g02284  LOC_Os05g41510  LOC_Os05g43280  LOC_Os03g08010  LOC_Os12g43370  LOC_Os03g51900
LOC_Os11g07500  LOC_Os04g45930  LOC_Os11g05730  LOC_Os03g51600  LOC_Os12g03720  LOC_Os11g19250
LOC_Os06g48355  LOC_Os05g36280  LOC_Os06g21470  LOC_Os07g29360  LOC_Os03g61560  LOC_Os04g43922
LOC_Os10g35290  LOC_Os03g02780  LOC_Os04g58110  LOC_Os07g02350  LOC_Os06g48350  LOC_Os05g38740
LOC_Os06g48310  LOC_Os06g36770  LOC_Os08g32090  LOC_Os05g39050  LOC_Os11g36390  LOC_Os05g32600
LOC_Os07g43060  LOC_Os03g08050  LOC_Os06g09570  LOC_Os09g02700  LOC_Os06g51220  LOC_Os09g38020
LOC_Os03g40110  LOC_Os03g46770  LOC_Os04g56800  LOC_Os09g37860  LOC_Os08g08200  LOC_Os09g07900
LOC_Os05g33240  LOC_Os10g35190  LOC_Os12g42140  LOC_Os03g26630  LOC_Os10g42950  LOC_Os07g45360
LOC_Os03g44484  LOC_Os07g27930  LOC_Os04g56350  LOC_Os12g07300  LOC_Os03g32526  LOC_Os10g10990
LOC_Os10g41450  LOC_Os07g07040  LOC_Os03g49210  LOC_Os03g25450  LOC_Os03g50510  LOC_Os07g36500
LOC_Os11g04950  LOC_Os03g18410  LOC_Os10g39410  LOC_Os03g02420  LOC_Os04g49420  LOC_Os07g10350
LOC_Os07g41180  LOC_Os11g11070  LOC_Os07g46660  LOC_Os03g56800  LOC_Os10g41520  LOC_Os05g19970
LOC_Os09g39590  LOC_Os06g37180  LOC_Os09g10930  LOC_Os03g07080  LOC_Os12g38000  LOC_Os03g56944
LOC_Os07g37640  LOC_Os03g55270  LOC_Os12g38380  LOC_Os07g20580  LOC_Os07g33340  LOC_Os05g32580
LOC_Os10g40780  LOC_Os12g35030  LOC_Os02g04660   LOC_Os01g09890   LOC_Os01g62410   LOC_Os01g05420
LOC_Os01g68940   LOC_Os02g45940   LOC_Os01g61920   LOC_Os02g02510   LOC_Os02g39030   LOC_Os01g68950
LOC_Os01g72790   LOC_Os01g01312   LOC_Os02g04160   LOC_Os01g34614   LOC_Os01g32750   LOC_Os01g56550
LOC_Os01g23590   LOC_Os01g74610   LOC_Os02g49270   LOC_Os01g56980   LOC_Os01g64820   LOC_Os02g39350
LOC_Os02g30800   LOC_Os01g16190   LOC_Os02g04050   LOC_Os01g59140   LOC_Os01g62840   LOC_Os01g64640
LOC_Os01g67740   LOC_Os02g34950

Database Links
UniprotKB	C7IY85
Refseq	NP_001173159.1
EMBL	AP008208
KEGG	osa:9267296 dosa:Os02t0772000-00